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应用抑制性消减杂交技术克隆丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3反式激活的相关基因 被引量:20
1
作者 牟劲松 刘妍 +6 位作者 王刚 成军 段惠娟 李克 陆荫英 王琳 王惠芬 《世界华人消化杂志》 CAS 2003年第4期399-403,共5页
目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活的相关基因cDNA消减文库,克隆HCV NS3反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后... 目的:应用抑制性消减杂交技术(SSH)构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白3(NS3)反式激活的相关基因cDNA消减文库,克隆HCV NS3反式激活相关基因。方法:以HCV NS3表达质粒pcDNA3.1(-)-NS3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,提取mRNA并逆转录为cDNA,经RsaI酶切后,将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR扩增后进行测序及同源性分析。结果:文库扩增后得到70个白色克隆,经菌落PCR分析,得到56个200-1000 b插入片段。对所得片段测序,并进行同源性分析,获得6个差异表达的未知序列,可能是NS3反式激活的新的靶基因。结论:成功构建HCV NS3反式激活的相关基因cDNA消减文库,为今后进一步分析、研究病毒蛋白的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 抑制性消减杂交技术 非结构蛋白3 克隆 细胞裂解液 病毒蛋白 ns3 反式激活 基因
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新型网络模拟器NS-3研究 被引量:23
2
作者 张登银 张保峰 《计算机技术与发展》 2009年第11期80-84,共5页
网络模拟器是现代通信网络领域的重要研究工具。文中追踪国际上最新研究进展,从现有网络模拟领域需要解决的问题出发,通过对现有主流网络模拟器进行简要的对比分析,揭示了NS-3产生的技术背景和设计目标,然后详细分析了NS-3的主要技术特... 网络模拟器是现代通信网络领域的重要研究工具。文中追踪国际上最新研究进展,从现有网络模拟领域需要解决的问题出发,通过对现有主流网络模拟器进行简要的对比分析,揭示了NS-3产生的技术背景和设计目标,然后详细分析了NS-3的主要技术特点和系统功能,并从内核和组件两个层面剖析NS-3的体系结构,着重分析了NS-3中网络节点(Node)和数据分组(Packet)这两个主要网络模块的组成和作用。论文无论是对网络模拟器本身还是网络技术的研究,均具有较好的理论指导意义和应用参考价值。 展开更多
关键词 网络模拟 网络仿真 ns-3 体系结构 网络组件
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NS398对人卵巢癌细胞系CAOV3和OVCAR3生长抑制作用的研究 被引量:13
3
作者 王纯雁 王敏 +3 位作者 王欣彦 张淑兰 王伊洵 李联昆 《中华妇产科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第7期415-418,i002,共5页
目的 观察环氧合酶 2 (cyclooxygenase 2 ,COX 2 )选择性抑制剂———氮 2 ,环己氧 4 ,硝基苯 甲基磺胺 (NS398) ,对人卵巢癌细胞系CAOV3和OVCAR3生长的抑制作用。方法 应用免疫组织化学 (免疫组化 )链霉菌抗生物素蛋白 过氧化物... 目的 观察环氧合酶 2 (cyclooxygenase 2 ,COX 2 )选择性抑制剂———氮 2 ,环己氧 4 ,硝基苯 甲基磺胺 (NS398) ,对人卵巢癌细胞系CAOV3和OVCAR3生长的抑制作用。方法 应用免疫组织化学 (免疫组化 )链霉菌抗生物素蛋白 过氧化物酶连接 (SP)法 ,在蛋白水平 ,对人卵巢上皮浆液性癌细胞系CAOV3、OVCAR3的COX 2表达情况进行检测 ;采用四甲基偶氮唑蓝 (MTT)快速比色法 ,观察NS398对CAOV3、OVCAR3生长的抑制作用 ,并通过倒置相差显微镜及电子显微镜观察细胞形态学的变化 ;通过DNA梯形电泳和末端脱氧核苷转移酶 (TdT)介导的脱氧尿嘧啶三磷酸(dUTP)缺口末端标记 (TUNEL)实验 ,对细胞凋亡情况进行检测。结果 CAOV3、OVCAR3的COX 2蛋白表达均为阳性。NS398对CAOV3、OVCAR3增殖的抑制率 ,均随着作用时间的延长和药物浓度的增加而增加。NS398作用后 ,CAOV3、OVCAR3细胞胞浆空泡化 ,可见凋亡小体 ,细胞表面的微绒毛消失。DNA梯形电泳显示特征性的梯形谱带 ,TUNEL实验可见凋亡细胞。结论 COX 2很可能成为卵巢癌化学药物治疗 (化疗 )的有效靶点 ,COX 展开更多
关键词 ns398 卵巢癌细胞系 CAOV3 OVCAR3 生长抑制作用 卵巢肿瘤 细胞凋亡
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NS-3油溶性缓蚀剂的合成研究 被引量:13
4
作者 孟祥胜 牛春革 《精细石油化工》 CAS CSCD 北大核心 1999年第5期17-20,共4页
以环烷酸和有机胺为原料 ,研制咪唑啉型缓蚀剂。探讨了反应温度、投料比对反应产物的影响。并对缓蚀剂在 10 0 0 mg/ L HCl+10 0 0 mg/ L H2 S腐蚀介质中对 A3
关键词 缓蚀剂 合成 缓蚀性能 油溶性 ns-3
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Daclatasvir plus asunaprevir in treatment-na?ve patients with hepatitis C virus genotype 1b infection 被引量:17
5
作者 Lai Wei Fu-Sheng Wang +21 位作者 Ming-Xiang Zhang Ji-Dong Jia Alexey A Yakovlev Wen Xie Eduard Burnevich Jun-Qi Niu Yong Jin Jung Xiang-Jun Jiang Min Xu Xin-Yue Chen Qing Xie Jun Li Jin-Lin Hou Hong Tang Xiao-guang Dou Yash Gandhi Wen-Hua Hu Fiona McPhee Stephanie Noviello Michelle Treitel Ling Mo Jun Deng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2018年第12期1361-1372,共12页
AIM To assess daclatasvir plus asunaprevir(d UAL) in treatment-na?ve patients from China's Mainland, Russia and South Korea with hepatitis C virus(HCV) genotype 1 b infection. METHODS Patients were randomly assign... AIM To assess daclatasvir plus asunaprevir(d UAL) in treatment-na?ve patients from China's Mainland, Russia and South Korea with hepatitis C virus(HCV) genotype 1 b infection. METHODS Patients were randomly assigned(3:1) to receive 24 wk of treatment with d UAL(daclatasvir 60 mg once daily and asunaprevir 100 mg twice daily) beginning on day 1 of the treatment period(immediate treatment arm) or following 12 wk of matching placebo(placebodeferred treatment arm). The primary endpoint was a comparison of sustained virologic response at posttreatment week 12(SVR12) compared with the historical SVR rate for peg-interferon plus ribavirin(70%) among patients in the immediate treatment arm. The first 12 wk of the study were blinded. Safety was assessed in d UAL-treated patients compared with placebo patients during the first 12 wk(doubleblind phase), and during 24 wk of d UAL in both arms combined.RESULTS In total, 207 patients were randomly assigned to immediate(n = 155) or placebo-deferred(n = 52) treatment. Most patients were Asian(86%), female(59%) and aged < 65 years(90%). Among them, 13% had cirrhosis, 32% had IL28 B non-CC genotypes and 53% had baseline HCV RNA levels of ≥ 6 million IU/m L. Among patients in the immediate treatment arm, SVR12 was achieved by 92%(95% confidence interval: 87.2-96.0), which was significantly higher than the historical comparator rate(70%). SVR12 was largely unaffected by cirrhosis(89%), age ≥ 65 years(92%), male sex(90%), baseline HCV RNA ≥ 6 million(89%) or IL28 B non-CC genotypes(96%), although SVR12 was higher among patients without(96%) than among those with(53%) baseline NS5 A resistanceassociated polymorphisms(at L31 or Y93 H). during the double-blind phase, aminotransferase elevations were more common among placebo recipients than among patients receiving d UAL. during 24 wk of d UAL therapy(combined arms), the most common adverse events(≥ 10%) were elevated alanine aminotransferase and upper respiratory tract infection; emergent grade 3-4 laboratory abnormalities were 展开更多
关键词 Asunaprevir Daclatasvir Direct-acting ANTIVIRAL Chronic HEPATITIS C Liver disease ns3 ns5A GENOTYPE 1b
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丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3与乙型肝炎病毒X蛋白协同反式激活作用的研究 被引量:15
6
作者 刘妍 成军 +5 位作者 牟劲松 陆荫英 王建军 杨倩 王琳 张玲霞 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第1期47-49,共3页
构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白 3(NS3)的重组表达质粒pcDNA3 1(- ) NS3和表达乙型肝炎病毒 (HBV)X蛋白的重组质粒pcDNA3 1(- ) X ,分别瞬时转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,用免疫印记 (Westernblotting)方法鉴定病毒基因的表达。... 构建丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白 3(NS3)的重组表达质粒pcDNA3 1(- ) NS3和表达乙型肝炎病毒 (HBV)X蛋白的重组质粒pcDNA3 1(- ) X ,分别瞬时转染肝母细胞瘤细胞系HepG2细胞 ,用免疫印记 (Westernblotting)方法鉴定病毒基因的表达。两个表达质粒分别及同时与报告质粒pCAT3 promoter共转染HepG2细胞 ,检测报告基因氯霉素乙酰转移酶 (CAT)的表达水平 ,酶的活性反映了表达的肝炎病毒蛋白对SV4 0病毒早期启动子功能的影响。结果显示 ,两个重组表达载体pcDNA3 1(- ) NS3及pcDNA3 1(- ) X在HepG2细胞均能瞬时表达相应的肝炎病毒蛋白 ;单独共转染实验中 pcDNA3 1(- ) NS3、pcDNA3 1(- ) X组的CAT的表达分别是对照的 3 5倍和 4 4倍 ,两种质粒共同转染时酶的表达是对照的 8 5倍 ;表达质粒对CAT酶表达的激活作用呈剂量依赖性。研究表明 ,HepG2细胞中表达的HCVNS3蛋白和HBVX蛋白均具有反式激活SV4 0早期启动子的功能 ,并且两种蛋白的反式激活功能具有协同特性。本实验有助于解释HCV、HBV感染 ,尤其是共同感染的致病 (癌 ) 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白 ns3 乙型肝炎病毒 X蛋白 协同反式激活 研究
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基于NS3的分布式消息系统Kafka的仿真实现 被引量:18
7
作者 马浩然 《软件》 2015年第1期94-99,共6页
在数据已渗透到我们生活的各个领域的时代,人们对于数据的挖掘和使用愈发频繁。作为以消息为单位进行数据共享的分布式架构,分布式消息系统成为数据处理的核心技术。传统的分布式消息系统大多用于处理数据量小的关键性数据,然而在信息... 在数据已渗透到我们生活的各个领域的时代,人们对于数据的挖掘和使用愈发频繁。作为以消息为单位进行数据共享的分布式架构,分布式消息系统成为数据处理的核心技术。传统的分布式消息系统大多用于处理数据量小的关键性数据,然而在信息剧增的今天,人们对信息的关注领域在不断扩大,挖掘的信息量在不断增多,传统的消息处理架构已不能满足我们对数据的处理需求,一个高吞吐量,可实时消费的高性能分布式消息系统成为必需。Kafka即是一种处理海量数据的分布式消息系统[1]。本文总结了Kafka系统的特征和架构策略,对其进行抽象建模,通过网络仿真工具NS3[2],设计实际系统的场景部署,最后运行仿真系统,得出数据并分析,以帮助我们理解和评估Kafka分布式消息系统。 展开更多
关键词 计算机软件 分布式消息系统 卡夫卡 网络仿真模拟器
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丙型肝炎病毒非结构区NS3基因在大肠埃希菌中的可诱导性表达 被引量:12
8
作者 成军 钟彦伟 +3 位作者 刘妍 董菁 杨继珍 杨守纯 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期85-87,共3页
目的 构建丙型肝炎病毒 (HCV)NS3基因的原核细胞表达载体 ,实现在大肠埃希菌中的可诱导性表达。方法 应用聚合酶链反应 (PCR)技术 ,以美国HCV H株全长cDNA质粒为模板 ,扩增获得NS3基因片段 ,克隆到原核表达载体pET 30C(+)中 ,构建原... 目的 构建丙型肝炎病毒 (HCV)NS3基因的原核细胞表达载体 ,实现在大肠埃希菌中的可诱导性表达。方法 应用聚合酶链反应 (PCR)技术 ,以美国HCV H株全长cDNA质粒为模板 ,扩增获得NS3基因片段 ,克隆到原核表达载体pET 30C(+)中 ,构建原核表达载体pET NS3,转化BL2 1(DE3)宿主菌 ,以IPTG诱导 ,获得NS3蛋白的可诱导性表达 ,以HCVNS3的单链可变区抗体 (ScFv)证实表达的NS3蛋白的特异性。结果 以HCVNS3基因序列特异性引物 ,PCR扩增获得 1893bp的NS3DNA片段 ,插入pET 30C(+)表达载体。转化BL 2 1(DE3)受体菌 ,经培养、IPTG诱导 ,获得了重组HCVNS3蛋白的表达 ,以HCVNS3的ScFv证实了表达的重组蛋白HCVNS3的特异性。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 ns3 基因表达 聚合酶链反应 大肠埃希菌
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猪瘟病毒NS3基因克隆、原核表达及间接ELISA方法初步建立 被引量:11
9
作者 蒋大良 余兴龙 +6 位作者 李润成 葛猛 罗维 颜爱 李杰 刘春红 涂长春 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期78-84,共7页
采用PCR方法从携带猪瘟病毒兔化弱毒(Hog cholera lapinized virus,HCLV)全长基因组cDNA的质粒pPOHCLV中扩增到长度为2000bp左右NS3基因序列,并将其克隆至原核表达载体pET-32a(+),构建成重组原核表达载体pETNS3。将pETNS3在大肠杆菌Rose... 采用PCR方法从携带猪瘟病毒兔化弱毒(Hog cholera lapinized virus,HCLV)全长基因组cDNA的质粒pPOHCLV中扩增到长度为2000bp左右NS3基因序列,并将其克隆至原核表达载体pET-32a(+),构建成重组原核表达载体pETNS3。将pETNS3在大肠杆菌Rosetta(DE3)中进行优化表达,SDS-PAGE分析重组蛋白NS3主要以包涵体形式表达,分子大小约95kD。Western Blotting分析表明重组蛋白NS3具有免疫原性。采用Ni+亲和层析方法纯化得到重组蛋白NS3(90%)。以纯化的重组蛋白NS3为抗原初步建立了检测CSFVNS3抗体的间接ELISA方法,检测221份不同猪群和年龄猪的血清样品。检测结果与IDEXX公司CSFV-Ab检测试剂盒检测结果进行对比,阳性符合率为83.33%,阴性符合率为89.38%,总符合率为86.43%。30份存在差异的血清样品用间接免疫荧光法(Indirect immunofluorescence assay,IFA)进行检测,结果显示IFA检测结果与NS3间接ELISA和IDEXX公司CSFV-Ab检测试剂盒符合率分别为56.67%和43.33%。 展开更多
关键词 CSF V ns3 基因克隆 原核表达 蛋白纯化 免疫印迹 间接ELISA IFA
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无线通信与网络系统性仿真实验设计 被引量:10
10
作者 孙彦景 陈岩 +3 位作者 芦楠楠 李松 王艳芬 张晓光 《实验技术与管理》 CAS 北大核心 2018年第11期111-116,共6页
为培养学生系统性、工程性思维,采用NS3中的WiFi模块设计了MAC协议性能分析仿真实验,围绕一个整体的电子信息系统、通信系统与计算机网络系统,构建了科学、系统和相对独立的系统性教学实验体系,完成自底层的器件到高层网络和系统的逐步... 为培养学生系统性、工程性思维,采用NS3中的WiFi模块设计了MAC协议性能分析仿真实验,围绕一个整体的电子信息系统、通信系统与计算机网络系统,构建了科学、系统和相对独立的系统性教学实验体系,完成自底层的器件到高层网络和系统的逐步递增模式的全过程工程实践环节。通过实验说明系统性软件在无线通信与网络课程群实验设置中的意义。 展开更多
关键词 无线通信网络 仿真实验 实验教学 ns3 MAC
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HCVNS3基因片段酵母展示文库的构建和鉴定 被引量:8
11
作者 贾帅争 孙红琰 +4 位作者 刘晓达 杜芝燕 杜勇 王全立 章扬培 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期56-60,共5页
HCV NS3特异的 CD4+T细胞反应与 HCV感染的良性转归相关 .为了筛选其 CD4+T细胞表位 ,构建了 HCV NS3基因片段酵母展示文库 .首先 DNase 不完全酶切 HCV NS3基因产生长度为 1 0 0~ 30 0 bp的随机片段 ,然后在它们两端加上含限制性内切... HCV NS3特异的 CD4+T细胞反应与 HCV感染的良性转归相关 .为了筛选其 CD4+T细胞表位 ,构建了 HCV NS3基因片段酵母展示文库 .首先 DNase 不完全酶切 HCV NS3基因产生长度为 1 0 0~ 30 0 bp的随机片段 ,然后在它们两端加上含限制性内切酶 Bam H 作用位点的接头 ,再以接头序列作引物进行 PCR扩增 .最后扩增产物用 Bam H 酶切后与 Bam H 线性化的穿梭载体 p YD1连接 ,转化大肠杆菌 (E.coli) DH5α,共得到 2× 1 0 6个转化子 .转化菌落的 PCR扩增结果表明 ,约 50 %转化子含插入片段 .随机选择 5个插入片段测序 ,然后与 DNA序列数据库中的序列比较 .结果显示它们分别与 HCV NS3序列有 96%~ 99%的同源性 .用从转化菌落中提取的质粒转化酵母 (S.cerevisiae)菌株 EBY1 0 0 ,得到含 2× 1 0 5个插入片段的 HCV NS3基因片段酵母展示文库 .半乳糖诱导的酵母细胞通过和 FITC标记的抗体结合 ,用 FACS可以在 2 0 %的细胞表面检测到融合蛋白的表达 . 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 非结构蛋白3 酵母展示 基因片段随机文库
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Quasispecies evolution in NS5A region of hepatitis C virus genotype 1b during interferon or combined interferon-ribavirin therapy 被引量:9
12
作者 Pascal Veillon Christopher Payan +2 位作者 Hélène Le Guillou-Guillemette Catherine Gaudy Franoise Lunel 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2007年第8期1195-1203,共9页
AIM: To evaluate the implication of substitutions in the hepatitis C virus (HCV) non-structural 5A (NS5A) protein in the resistance of HCV during mono-interferon (IFN) or combined IFN-ribavirin (IFN-R) therapy. Althou... AIM: To evaluate the implication of substitutions in the hepatitis C virus (HCV) non-structural 5A (NS5A) protein in the resistance of HCV during mono-interferon (IFN) or combined IFN-ribavirin (IFN-R) therapy. Although NS5A has been reported to interact with the HCV RNA- dependent RNA polymerase, NS5B, as well as with many cellular proteins, the function of NS5A in the life cycle of HCV remains unclear. METHODS: HCV quasispecies were studied by clon- ing and sequencing of sequential isolates from patients infected by HCV genotype 1b. Patients were treated by IFN-α2b for 3 mo followed by IFN-α2b alone or com- bined IFN-R therapy for 9 additional months. Patients were categorized intro two groups based on their re- sponse to the treatments: 7 with sustained virological re- sponse (SVR) (quasispecies = 150) and 3 non-respond- ers (NR) to IFN-R (quasispecies = 106). RESULTS: Prior to treatment, SVR patients displayed a lower complexity of quasispecies than NR patients. Most patients had a decrease in the complexity of quasispe- cies during therapy. Analysis of amino acids substitu- tions showed that the degree of the complexity of the interferon sensitivity-determining region (ISDR) and the V3 domain of NS5A protein was able to discriminate thetwo groups of patients. Moreover, SVR patients displayed more variability in the NS5A region than NR patients. CONCLUSION: These results suggest that detailed mo- lecular analysis of the NS5A region may be important for understanding its function in IFN response during HCV 1b infection. 展开更多
关键词 Hepatitis C virus QUASISPECIES ns5A region Interferon sensitivity-determining region V3 domain
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The interferon inducing pathways and the hepatitis C virus 被引量:8
13
作者 Eliane F Meurs Adrien Breiman 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2007年第17期2446-2454,共9页
The innate immune response is triggered by a variety of pathogens, including viruses, and requires rapid induction of typeⅠ?interferons (IFN), such as IFNβ and IFNα. IFN induction occurs when specific pathogen moti... The innate immune response is triggered by a variety of pathogens, including viruses, and requires rapid induction of typeⅠ?interferons (IFN), such as IFNβ and IFNα. IFN induction occurs when specific pathogen motifs bind to specific cellular receptors. In non-professional immune, virally-infected cells, IFN induction is essentially initiated after the binding of dsRNA structures to TLR3 receptors or to intracytosolic RNA helicases, such as RIG-Ⅰ/MDA5. This leads to the recruitment of specific adaptors, such as TRIF for TLR3 and the mitochondrial-associated IPS-1/VISA/MAVS/CARDIF adapter protein for the RNA helicases, and the ultimate recruitment of kinases, such as MAPKs, the canonical IKK complex and the TBK1/IKKε kinases, which activate the transcription factors ATF-2/ c-jun, NF-κB and IRF3, respectively. The coordinated action of these transcription factors leads to induction of IFN and of pro-inflammatory cytokines and to the establishment of the innate immune response. HCV can cleave both the adapters TRIF and IPS-1/VISA/MAVS/ CARDIF through the action of its NS3/4A protease. This provokes abrogation of the induction of the IFN and cytokine pathways and favours viral propagation and presumably HCV chronic infection. 展开更多
关键词 Toll-like receptor RNA helicase Mitochondrialadapter Cardif TBK1/IKKepsilon Interferon induction HCV ns3A protease
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Effect of hepatitis C virus nonstructural protein NS3 on proliferation and MAPK phosphorylation of normal hepatocyte line 被引量:8
14
作者 De-YunFeng YiSun Rui-XueCheng Xiao-MingOuyang HuiZheng 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第14期2157-2161,共5页
AIM:To study the effect of hepatitis C virus nonstructural region 3 (HCV NS3) protein on proliferation and transformation of normal human liver cell line. METHODS: QSG7701 cells were transfected with pRcHCNS3-5', ... AIM:To study the effect of hepatitis C virus nonstructural region 3 (HCV NS3) protein on proliferation and transformation of normal human liver cell line. METHODS: QSG7701 cells were transfected with pRcHCNS3-5', pRcHCNS3-3'and pRcCMV using lipofectamine transfecting technique and selected with G418 method. Expression of HCV NS3 protein was determined by immunohistochemistry. Biologic characteristics of transfected cells were evaluated by population doubling time and soft agar assays. Activation of MAPK was analyzed using Western blot with phosphospecific monoclonal antibody against dually phosphorylated MAPK. RESULTS: QSG7701 cells transfected with pRcHCNS3-5' showed strong intracellular expression of HCVNS3 protein, and the positive signal was localized in cytoplasm.The expressing strength of HCVNS3 protein in pRcHCNS3-3'-transfected cells was weaker than that in pRcHCNS3-5'-transfected cells. The population doubling time in the transfected cells with pRcHCNS3-5' (12 h) was much shorter than those with pRcHCNS3-3', pRcCMV and normal cells (24, 26, 28 h, respectively) (P<0.01). The transfected cells with pRcHCNS3-5' showed much more anchorage independent colonies than that in those with pRcHCNS3-3' and pRcCMV (P<0.01). The cloning efficiencies of transfected cells with pRcHCNS3-5', pRcHCNS3-3', pRcCMV and controls were 33%, 1.33%, 1.46%, 1.11% respectively. The level of phosphorylated MAPK in the cells with pRcHCNS3-5' was much higher than that in those with pRcHCNS3-3'and pRcCMV and normal cells (P<0.01). CONCLUSION: The results suggest that (1) QSG7701 cells are a better human liver cell line for investigating' the pathogenesis of HCV NS3 protein. (2) 5' region of the HCV genome segment encoding HCV NS3 is involved in cell growth and cell phenotype. (3) HCV NS3 N-terminal peptide may up-regulate the activation of MAPK, but not affect the expression of MAPK. 展开更多
关键词 HCV ns3 Cell proliferation QSG7701 strain TRAnsFECTION Mitogen-activated protein kinase
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Genetic diversity of the hepatitis C virus: Impact and issues inthe antiviral therapy 被引量:6
15
作者 H Le Guillou-Guillemette S Vallet +4 位作者 C Gaudy-Graffin C Payan A Pivert A Goudeau F Lunel-Fabiani 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2007年第17期2416-2426,共11页
The hepatitis C Virus (HCV) presents a high degree of genetic variability which is explained by the combination of a lack of proof reading by the RNA dependant RNA polymerase and a high level of viral replication. The... The hepatitis C Virus (HCV) presents a high degree of genetic variability which is explained by the combination of a lack of proof reading by the RNA dependant RNA polymerase and a high level of viral replication. The re- sulting genetic polymorphism defines a classification in clades, genotypes, subtypes, isolates and quasispecies. This diversity is known to reflect the range of responses to Interferon therapy. The genotype is one of the pre- dictive parameters currently used to define the antiviral treatment strategy and the chance of therapeutic suc- cess. Studies have also reported the potential impact of the viral genetic polymorphism in the outcome of antivi- ral therapy in patients infected by the same HCV geno- type. Both structural and non structural genomic regions of HCV have been suggested to be involved in the Inter- feron pathway and the resistance to antiviral therapy. In this review, we first detail the viral basis of HCV diversity. Then, the HCV genetic regions that may be implicated in resistance to therapy are described, with a focus on the structural region encoded by the E2 gene and the non- structural genes NS3, NS5A and NS5B. Both mechanisms of the Interferon resistance and of the new antiviral drugs are described in this review. 展开更多
关键词 Hepatitis C virus Genetic diversity Therapyresistance E2 ns3 nsSA nsSB
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Expression of non-structural protein NS3 gene of Bombyx mori densovirus (China isolate) 被引量:7
16
作者 Huijuan Yin Qin Yao Zhongjian Guo Fang Bao Wei Yu Jun Li Keping Chen 《Journal of Genetics and Genomics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第4期239-244,共6页
The invertebrate parvovirus Bombyx mori Densonucleosis Virus type 3 (China isolate), named BmDNV-3, is a kind of bidensovirus. It is a new type of virus with unique replication mechanisms. To investigate the effects... The invertebrate parvovirus Bombyx mori Densonucleosis Virus type 3 (China isolate), named BmDNV-3, is a kind of bidensovirus. It is a new type of virus with unique replication mechanisms. To investigate the effects of the NS3 gene during viral DNA replication, a pair of primers was designed for amplifying NS3 gene of Bombyx mori densovirus (China isolate). Gene NS3 amplified was cloned into a prokaryotic expression vector pET-30a and the donor plasmid pFastBacHTe, respectively. The NS3 protein was expressed in Escherichia coli BL21. The pFastBacHTe-NS3 was transformed to E. coli DHIOBac. The recombinant bacmid baculoviruses (rBacmid-EGFP-NS3) isolated from the white colonies were transfected into BmN-4 cells using a transfection reagent. BraN-4 cells were infected with recombinant virus to express fusion proteins. The expression of fusion protein around 30 kDa in E. coli BL21 was identified by SDS-PAGE, Western blotting, and mass spectrometry. The expressed NS3 protein by B. mori nucleopolyhedrovirus bacmid system was confirmed by Western blotting using an anti-NS3 polyclonal antibody. And about 45 kDa protein was found. The expressed fusion protein was smaller than the expected size of EGFP-NS3, 55 kDa. Western blotting analysis indicated that EGFP-NS3 protein was expressed in infected larvae with smaller molecular size. 展开更多
关键词 BmDNV ns3 protein expression
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Cloning and expression of NS3 cDNA fragment of HCV genome of Hebei isolate in E.coli 被引量:7
17
作者 Zhu, FL Lu, HY +1 位作者 Li, Z Qi, ZT 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第2期73-76,共4页
AIM To obtain greater antigenicity of HCV NS3 protein. METHODS The HCV NS3 cDNA fragment was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction from the sera of the HCV infected patients. The DNA sequence... AIM To obtain greater antigenicity of HCV NS3 protein. METHODS The HCV NS3 cDNA fragment was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction from the sera of the HCV infected patients. The DNA sequence was determined by dideoxy mediated chain termination method using T7 polymerase. HCV NS3 protein was expressed in E. coli . RESULTS Sequence analysis indicated that the HCV isolate of this study belongs to HCV Ⅱ; SDS PAGE demonstrated an M r 23800 and an M r 22000 recombinant protein band which amount to 14% and 11% of the total bacterial proteins separately. Western blotting and ELISA showed NS3 protein possessed greater antigenicity. CONCLUSION Recombinant HCV NS3 protein was expressed successfully, which provided the basis for developing HCV diagnostic reagents. 展开更多
关键词 hepatitis C virus ns3 GENE GENE EXPRESSION DNA VIRAL VIRAL proteins sequence analysis polymerase chain reaction enzyme linked IMMUNOSORBENT assay ESCHERICHIA coli
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基于NS-3的MQTT协议仿真研究 被引量:7
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作者 赵靖 王如武 周皓 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2021年第23期137-145,共9页
如今,制造业数字化转型中采用消息队列遥测传输(MQTT)协议已成为趋势,而工业场景中往往存在大量的传感器等设备。考虑到实际部署的复杂性,在工业场景中实际部署MQTT前,进行必要的模拟以获取网络性能等数据是不可或缺的,这将更有利于工... 如今,制造业数字化转型中采用消息队列遥测传输(MQTT)协议已成为趋势,而工业场景中往往存在大量的传感器等设备。考虑到实际部署的复杂性,在工业场景中实际部署MQTT前,进行必要的模拟以获取网络性能等数据是不可或缺的,这将更有利于工业场景中的链路设计和网络规划。而NS-3作为当前最流行的网络仿真器之一,提供了丰富的网络模型,非常适合像工业场景这种大型复杂网络的仿真,但目前利用其模拟部署MQTT仍是一项困难的工作。针对该问题,提出了一个适用于NS-3的扩展仿真框架ns3-mqtt,该框架由多个MQTT组件构成,能够以软件包的形式集成到NS-3中,并且提供简洁易用的仿真接口,使得扩展后的NS-3可较容易地对MQTT进行模拟部署并获取相关数据,以此研究不同工业场景下MQTT协议的性能,指导MQTT的实际部署。仿真测试结果证明了提出的ns3-mqtt框架的正确性和有效性。 展开更多
关键词 MQTT协议 ns-3 工业互联网
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献血者血清中HCV NS3和核心蛋白抗原的检测及临床意义 被引量:7
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作者 郭满盈 李谋深 +1 位作者 李保仝 杨毓华 《中国输血杂志》 CAS CSCD 2001年第2期78-79,共2页
关键词 献血者 丙型肝炎病毒 ns3 核心蛋白 抗原 检测
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基于IEEE 802.11的无线组播网络性能研究与验证 被引量:6
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作者 王金涛 李明齐 蔡青春 《现代电子技术》 北大核心 2018年第17期20-24,共5页
现有的关于IEEE 802.11无线传输协议性能的研究集中于基于IEEE 802.11协议的单播传输,鲜有对于基于IEEE 802.11协议的组播传输性能理论研究。基于此,采用理论分析建模与仿真实验验证相结合的方法,建立组播分布式协调功能(DCF)模型,并结... 现有的关于IEEE 802.11无线传输协议性能的研究集中于基于IEEE 802.11协议的单播传输,鲜有对于基于IEEE 802.11协议的组播传输性能理论研究。基于此,采用理论分析建模与仿真实验验证相结合的方法,建立组播分布式协调功能(DCF)模型,并结合物理层调制及信道模型,研究网络吞吐量、传输距离等IEEE 802.11无线组播传输的性能,并计算无线组播的吞吐量门限。NS-3仿真实验结果表明,此模型能够较为准确地描述基于IEEE 802.11协议无线组播的数据传输特性,提高建立模型研究基于IEEE 802.11无线组播的准确性;同时给出的无线网络传输门限能够为网络设计和网络优化提供参考。 展开更多
关键词 IEEE802.11 无线局域网 组播 吞吐量 信噪比 ns.3
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