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‘蜂糖李’果实发育过程中有机酸含量变化及其与苹果酸代谢相关酶的关系 被引量:30
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作者 王小红 陈红 董晓庆 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期293-300,共8页
【目的】明确‘蜂糖李’果实有机酸组成与含量特点,揭示其发育过程中有机酸含量的变化规律及其与苹果酸代谢相关酶的关系,阐明有机酸积累的关键时期和关键酶。【方法】以‘蜂糖李’及对照‘四月李’为材料,采用高效液相色谱法(high perf... 【目的】明确‘蜂糖李’果实有机酸组成与含量特点,揭示其发育过程中有机酸含量的变化规律及其与苹果酸代谢相关酶的关系,阐明有机酸积累的关键时期和关键酶。【方法】以‘蜂糖李’及对照‘四月李’为材料,采用高效液相色谱法(high performance liquid chromatograph,HPLC)分析测试李果实发育过程中有机酸组分及含量,并测定苹果酸代谢相关酶的活性。【结果】利用高效液相色谱分析李果实中有机酸组分及含量,发现‘蜂糖李’果实成熟时总酸含量(ω,后同)为5.94 mg·g-1,包括苹果酸、酒石酸、柠檬酸、草酸、莽草酸和琥珀酸6种,其中以苹果酸含量最高(占总酸含量的88%),‘四月李’果实中有机酸组分与‘蜂糖李’一致,均属于苹果酸型。2个李品种果实中总酸含量的差异主要是由苹果酸含量的差异所致。通过分析李果实发育过程中有机酸含量的变化,发现‘蜂糖李’果实中苹果酸含量大量积累的关键时期在果实发育前期,整体呈先增加后降低的趋势,草酸、酒石酸含量逐渐降低,而柠檬酸含量逐渐升高。与‘四月李’相比,‘蜂糖李’果实中苹果酸、草酸、酒石酸及总酸含量的变化趋势与之一致,且苹果酸及总酸含量在整个过程中均显著低于‘四月李’,而柠檬酸含量的变化趋势与之相反。最后通过分析苹果酸含量与相关代谢酶活性之间的相关性,表明‘蜂糖李’果实中苹果酸在果实发育前期大量积累主要是该时期磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)活性增强促进了苹果酸的大量合成以及NADP-苹果酸酶(NADP-ME)活性降低减少苹果酸的分解,与NAD-苹果酸脱氢酶(NAD-MDH)关系不大,而‘四月李’苹果酸积累的关键酶是NAD-MDH。在果实发育后期,‘蜂糖李’及‘四月李’NADP-ME活性迅速升高,前者PEPC活性减弱,后者NAD-MDH活性下降,使得2者果实中苹果酸的降解大于合成而呈降低趋� 展开更多
关键词 李果实 有机酸 苹果酸 磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶 nadp-苹果酸酶 NAD-苹果酸脱氢酶 高效液相色谱
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小麦和谷子C_4光合途径关键酶活性及其与光合和蒸腾的关系 被引量:8
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作者 罗璇 郭彤 胡银岗 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期1083-1091,共9页
为了解小麦和谷子叶片中C4光合途径关键酶磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)、NADP-苹果酸酶(NADP-ME)、磷酸丙酮酸二激酶(PPDK)和苹果酸脱氢酶(MDH)的活性差异及其与光合速率和蒸腾速率的关系,以4个小麦品种(中国春、晋麦47、绵阳11、小偃6... 为了解小麦和谷子叶片中C4光合途径关键酶磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)、NADP-苹果酸酶(NADP-ME)、磷酸丙酮酸二激酶(PPDK)和苹果酸脱氢酶(MDH)的活性差异及其与光合速率和蒸腾速率的关系,以4个小麦品种(中国春、晋麦47、绵阳11、小偃6号)和4个谷子品种(豫谷1号、吨谷1号、冀谷19、冀谷20)为材料,在苗期、拔节期、抽穗期、开花期和灌浆期,分别测定了小麦和谷子叶片中四种光合酶的活性、净光合速率和蒸腾速率。结果表明,在小麦生育期,叶片中均可检测到这四种光合酶的活性,且酶活性与净光合速率变化趋势一致;谷子叶片中四种光合酶活性均远高于小麦;不同小麦和谷子品种间四种光合酶活性存在显著差异。小麦的PPDK和NADP-ME活性均与净光合速率呈显著正相关,与蒸腾速率相关不显著;谷子的MDH、PEPC和PPDK活性均与净光合速率呈显著正相关,仅豫谷1号的PEPC活性、冀谷20和吨谷1号的MDH活性与蒸腾速率呈显著正相关。 展开更多
关键词 小麦 谷子 PEPC PPDK nadp-me MDH 光合速率 蒸腾速率
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毛果杨NADP-苹果酸酶基因家族分析 被引量:5
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作者 程玉祥 杨茹 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期249-255,共7页
本文分析C3树木毛果杨NADP-苹果酸酶(Populus trichocarpa NADP-malic enzyme,PtNADP-ME)基因家族及其表达特性。NADP-ME同源性检索表明,毛果杨基因组上存在5个PtNADP-ME基因,其中PtNADP-ME4编码区不完整。RT-PCR及DNA测序结果表明,PtNA... 本文分析C3树木毛果杨NADP-苹果酸酶(Populus trichocarpa NADP-malic enzyme,PtNADP-ME)基因家族及其表达特性。NADP-ME同源性检索表明,毛果杨基因组上存在5个PtNADP-ME基因,其中PtNADP-ME4编码区不完整。RT-PCR及DNA测序结果表明,PtNADP-ME家族5个基因均转录表达。进化树构建显示,毛果杨PtNADP-ME家族5个成员分属于植物NADP-ME家族的3个进化分枝。半定量RT-PCR表明,5个PtNADP-ME家族基因没有明显的组织特异表达模式。然而,不同的PtNADP-ME基因转录表达对NaCl、PEG及甘露醇3种逆境胁迫应答与否以及应答方式存在明显的差异。 展开更多
关键词 毛果杨 nadpme 基因家族 逆境
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植物光合碳同化途径关键酶基因研究 被引量:5
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作者 徐明怡 柴春荣 +1 位作者 钟海秀 倪红伟 《黑龙江科学》 2016年第10期1-4,7,共5页
植物按照碳同化方式的不同可分为C_3途径、C_4途径和CAM途径。C4植物通过长期的进化形成了特有的高效光合基因。在高温、高光强和低CO_2浓度等条件下,C_4植物的光合速率较C_3植物更高。本文阐述了高等植物光合碳同化途径中PEPC、PPDK、N... 植物按照碳同化方式的不同可分为C_3途径、C_4途径和CAM途径。C4植物通过长期的进化形成了特有的高效光合基因。在高温、高光强和低CO_2浓度等条件下,C_4植物的光合速率较C_3植物更高。本文阐述了高等植物光合碳同化途径中PEPC、PPDK、NADP-ME、RCA、SBPase 5个关键酶基因研究进展。 展开更多
关键词 C4途径 C3途径 PEPC PPDK nadp-me RCA SBPase
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谷子NADP-ME的鉴定及其对逆境胁迫的响应 被引量:3
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作者 赵晋锋 杜艳伟 +6 位作者 王高鸿 李颜方 赵根有 王振华 成凯 王玉文 余爱丽 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第22期3950-3963,共14页
【目的】鉴定谷子NADP-ME家族成员,研究不同成员对非生物逆境胁迫的响应,为揭示SiNADP-ME在谷子逆境应答信号途径中的作用奠定基础。【方法】利用生物信息学方法鉴定谷子基因组中的NADP-ME家族成员。采用GSDS2.0、plantCARE、Clustalx、... 【目的】鉴定谷子NADP-ME家族成员,研究不同成员对非生物逆境胁迫的响应,为揭示SiNADP-ME在谷子逆境应答信号途径中的作用奠定基础。【方法】利用生物信息学方法鉴定谷子基因组中的NADP-ME家族成员。采用GSDS2.0、plantCARE、Clustalx、MEGA6.0等软件及网站ExPASy对鉴定成员蛋白和基因序列进行生物信息学分析。采用qRT-PCR方法检测SiNADP-ME在苗期不同逆境、不同生育期干旱胁迫及不同光照强度下的表达情况。【结果】谷子NADP-ME家族由7个成员组成,它们在谷子的第2、3、5、7染色体上呈不均匀分布。保守功能域分析显示7个基因都含有NADP-ME特征保守功能域。序列比对发现谷子NADP-ME成员之间序列非常保守,相似性较高,7个谷子成员序列一致性为77.30%,而不同物种NADP-ME序列之间相似性为56.52%。序列分析显示SiNADP-ME1、SiNADP-ME4、SiNADP-ME5、SiNADP-ME6序列较长,分别编码576、639、652和636个氨基酸,而SiNADP-ME2、SiNADP-ME3、SiNADP-ME7序列较短,分别编码213、265和149个氨基酸。基因结构分析显示SiNADP-ME1有2个可变剪切,SiNADP-ME5有3个可变剪切,其他基因无可变剪切。SiNADP-ME1、SiNADP-ME2、SiNADP-ME3、SiNADP-ME7含内含子较少,而SiNADP-ME4、SiNADP-ME5、SiNADP-ME6含内含子较多。蛋白参数预测显示谷子NADP-ME成员间分子量跨度较大,在161.94—725.43 kD,等电点为5.32—8.05,不稳定指数为23.01—45.01,脂肪系数介于89.19—107.77,平均疏水指数介于-0.218—0.004。亚细胞定位预测显示SiNADP-ME成员主要被定位在叶绿体、线粒体和细胞质中。顺式元件分析显示SiNADP-ME成员启动子区域主要包括激素类应答、逆境应答、光应答以及其他类生长调控相关的顺式元件。聚类分析发现谷子SiNADP-ME基因在单、双子叶植物分离之前就已存在。不同物种同源基因对在进化树中广泛存在揭示它们在进化上可能存在共同祖先,也暗示它们在某 展开更多
关键词 谷子 nadp依赖型苹果酸酶 基因表达 非生物逆境
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盐碱地土壤改良对银中杨叶片、树枝和树皮绿色组织色素和C_4光合酶的影响 被引量:3
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作者 王文杰 许慧男 +3 位作者 王莹 于兴洋 郑广宇 祖元刚 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期299-304,共6页
在松嫩平原重度盐碱地上,选择通过土壤改良使得盐碱成分降低、结构显著改善的土壤作为处理样地(pH值9.17;电导率388μscm-1;土壤紧实度1170kPa),邻近未改良重度盐碱地为对照样地(pH值10.15;电导率1220μscm-1;土壤紧实度2199kPa),对生... 在松嫩平原重度盐碱地上,选择通过土壤改良使得盐碱成分降低、结构显著改善的土壤作为处理样地(pH值9.17;电导率388μscm-1;土壤紧实度1170kPa),邻近未改良重度盐碱地为对照样地(pH值10.15;电导率1220μscm-1;土壤紧实度2199kPa),对生长在对照和处理样地上的银中杨不同器官叶绿素和C4光合相关酶研究发现:1)生长在处理样地的银中杨叶片叶绿素a+b、叶绿素a/b、类胡萝卜素含量显著高于对照未处理,但树枝和树皮绿色组织内这些指标的差异远小于叶片;2)所测定3种C4光合酶结果显示,当以单位鲜重表示时,3种器官以及盐碱化程度对结果影响较小;3)当以单位叶绿素酶活性表示时,不同器官以及盐碱化程度对酶活性影响显著:树皮和树枝磷酸烯醇式丙酮酸酶(PEPC)活性是叶片的4.4和3.1倍,盐碱地改良使这一差异变成8.6和2.6倍;对照样地内树皮、树枝的苹果酸酶(NADP-ME)活性是叶片的1.7和2.1倍,盐碱地土壤改良使得这一差异达到17.2和6.4倍;与此类似,在对照盐碱地上,树皮和树枝内苹果酸脱氢酶(NADP-MDH)活性是叶片的1.7和1.4倍,盐碱地土壤改良使得这一差异变为6.4和13.7倍。上述结果说明,银中杨树干和树枝绿色组织内C4相关酶含量较叶片高出很多,而且受盐碱胁迫程度影响显著,盐碱化程度轻的情况下,这种差异会增大,这些酶的变化可以作为植物响应土壤盐碱程度变化的一种生理生化指示指标。 展开更多
关键词 磷酸烯醇式丙酮酸酶 苹果酸脱氢酶 苹果酸酶 叶绿素 非同化器官
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巴西橡胶树中2个NADP-苹果酸酶基因的克隆和表达特性分析 被引量:1
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作者 曹冰 龙翔宇 +1 位作者 肖小虎 唐朝荣 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期872-881,共10页
从橡胶树中克隆2个NADP-ME(苹果酸酶)基因的全长cDNA,分别命名为HbNADP-ME1和HbNADP-ME2。HbNADP-ME1和HbNADP-ME2 cDNA全长分别为2 428、2 139 bp,分别编码643、593个氨基酸组成的蛋白,二者的氨基酸序列一致性高达87.25%,且分别与蓖麻... 从橡胶树中克隆2个NADP-ME(苹果酸酶)基因的全长cDNA,分别命名为HbNADP-ME1和HbNADP-ME2。HbNADP-ME1和HbNADP-ME2 cDNA全长分别为2 428、2 139 bp,分别编码643、593个氨基酸组成的蛋白,二者的氨基酸序列一致性高达87.25%,且分别与蓖麻和杨树的一个NADP-ME序列具有较高的序列一致性。2个HbNADP-ME蛋白都含有典型的植物NADP-ME蛋白的保守结构域,均富含亮氨酸(Leu),同属于非分泌型稳定蛋白。2个HbNADP-ME基因在橡胶树不同组织中的表达存在明显差异,在根中的表达量最高,种子和花中的表达量次之;另外,HbNADP-ME1基因在胶乳中受机械伤害有下调表达趋势,HbNADP-ME2基因在胶乳中受割胶处理也表现出下调表达趋势,而低温胁迫则显著诱导2个基因在叶片和根中的表达。结果说明,HbNADP-ME基因可能参与橡胶树的抗逆应答及代谢调控(包括胶乳代谢调控)。此结果为深入揭示橡胶树中NADP-ME基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 巴西橡胶树 nadp-me 基因克隆 表达分析 胁迫 代谢
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玉米C_4型NADP-ME的生物信息学分析 被引量:1
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作者 李振华 张立军 +4 位作者 崔震海 朱延姝 樊金娟 阮燕晔 汪澈 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期61-64,共4页
利用生物信息学软件对GeneBank上注册的玉米C4型NADP-ME进行氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、导肽、亚细胞定位、蛋白质功能及系统进化分析和预测。结果表明,NADP-ME蛋白是等电点为6.09的亲水性不稳定蛋白,包含一个结合NAD(P)的... 利用生物信息学软件对GeneBank上注册的玉米C4型NADP-ME进行氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、导肽、亚细胞定位、蛋白质功能及系统进化分析和预测。结果表明,NADP-ME蛋白是等电点为6.09的亲水性不稳定蛋白,包含一个结合NAD(P)的结构域和一个N-末端区域,属于裂解酶类,具有能量代谢的功能,定位于叶绿体中;α螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,β折叠和伸展链散布其中;玉米C4型NADP-ME与高粱、水稻等植物的NADP-ME基因有较高的同源性。 展开更多
关键词 玉米 nadpme 结构与功能预测 进化树
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The receptor-like cytosolic kinase RIPK activates NADP-malic enzyme 2 to generate NADPH for fueling ROS production 被引量:5
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作者 Binyan Wu Ping Li +3 位作者 Xiufang Hong Cuihong Xu Ran Wang Yan Liang 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2022年第5期887-903,共17页
Reactive oxygen species(ROS)production is a conserved immune response in Arabidopsis primarily medi-ated by respiratory burst oxidase homolog D(RBOHD),a nicotinamide adenine dinucleotide phosphate(NADPH)oxidase associ... Reactive oxygen species(ROS)production is a conserved immune response in Arabidopsis primarily medi-ated by respiratory burst oxidase homolog D(RBOHD),a nicotinamide adenine dinucleotide phosphate(NADPH)oxidase associated with the plasma membrane.A rapid increase in NADPH is necessary to fuel RBOHD proteins and thus maintain ROS production.However,the molecular mechanism by which NADPH is generated to fuel RBOHD remains unclear.In this study,we isolated a new mutant allele of FLAGELLIN-INSENSITIVE 4(FIN4),which encodes the first enzyme in de novo NAD biosynthesis.fin4 mu-tants show reduced NADPH levels and impaired ROS production.However,FIN4 and other genes involved in NAD-and NADPH-generating pathways are not highly upregulated upon elicitor treatment,raising a pos-sibility that a cytosolic NADP-linked dehydrogenase might be post-transcriptionally activated to maintain the NADPH supply close to RBOHD.To verify this possibility,we isolated the proteins associated with RPM1-INDUCED PROTEIN KINASE(RIPK),a receptor-like cytoplasmic kinase that regulates broad-spectrum ROS signaling in plant immunity,and identified NADP-malic enzyme 2(NADP-ME2),an NADPH-generating enzyme.Compared with wild-type plants,nadp-me2 mutants display decreased NADP-ME activity,lower NADPH levels,and reduced ROS production in response to immune elicitors.Furthermore,we found that RIPK can directly phosphorylate NADP-ME2 and enhance its activity in vitro.The phosphorylation of the NADP-ME2 S371 residue contributes to ROS production upon immune elicitor treatment and susceptibility to the necrotrophic bacterium Pectobacterium carotovorum.Collectively,our study suggests that RIPK phosphorylates and activates NADP-ME2 to rapidly increase cytosolic NADPH,thus fueling RBOHD to sustain ROS production in plant immunity. 展开更多
关键词 nadp-me2 nadpH RBOHD reactive oxygen species plant immunity
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水稻NADP-苹果酸酶的原核表达、纯化和抗体制备 被引量:2
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作者 程玉祥 柳参奎 《植物生理学通讯》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期847-851,共5页
构建了水稻NADP-ME_2基因cDNA的原核表达载体pQE30,并诱导表达出有生物学功能的融合蛋白。用Ni-NTA琼脂糖亲和层析纯化出NADP-ME_2融合蛋白,并测定了融合蛋白酶学特性(V_(max)、K_m、K_(cat)、底物特异性)。用纯化的NADP- ME_2融合蛋白... 构建了水稻NADP-ME_2基因cDNA的原核表达载体pQE30,并诱导表达出有生物学功能的融合蛋白。用Ni-NTA琼脂糖亲和层析纯化出NADP-ME_2融合蛋白,并测定了融合蛋白酶学特性(V_(max)、K_m、K_(cat)、底物特异性)。用纯化的NADP- ME_2融合蛋白免疫家兔,制备出抗水稻NADP-ME特异性抗体。全蛋白双向电泳后Western印迹表明水稻中至少有4个NADP-ME家族蛋白质成员。 展开更多
关键词 水稻 nadp-me2 原核表达 酶学特性 抗体
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水稻(Oryza sativa L.)苹果酸酶(OsNADP-ME3)基因在逆境下的表达特性研究 被引量:5
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作者 李秀峰 张欣欣 +1 位作者 高野哲夫 柳参奎 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期327-332,共6页
水稻苹果酸酶(NADP-ME)是多基因家族,由3个胞质型NADP-ME和1个质体型NADP-ME构成。本研究针对水稻胞质型成员(命名为NADP-ME3)(NM_001061367)进行初步的功能解析。克隆获得的NADP-ME3基因的cDNA序列全长为2240bp,其中5'非翻译区为15... 水稻苹果酸酶(NADP-ME)是多基因家族,由3个胞质型NADP-ME和1个质体型NADP-ME构成。本研究针对水稻胞质型成员(命名为NADP-ME3)(NM_001061367)进行初步的功能解析。克隆获得的NADP-ME3基因的cDNA序列全长为2240bp,其中5'非翻译区为151bp,3'非翻译区为376bp,开放读码框(ORF)长1713bp,编码570个氨基酸。为研究NADP-ME3在逆境胁迫下的表达量变化,Northern blot检测结果显示,在NaCl、NaHCO3和PEG胁迫条件下,NADP-ME3随胁迫处理时间的不同表达量呈现不同程度的变化,推断NADP-ME3可能与非生物胁迫有应答关系,将NADP-ME3转入拟南芥中并通过观察转基因拟南芥在非生物胁迫下表型变化,发现NADP-ME3能够在一定程度上提高植物对非生物胁迫的耐受性。 展开更多
关键词 水稻 nadp-me3 基因表达 转基因植物
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松叶猪毛菜NADP-苹果酸酶基因家族及启动子克隆分析 被引量:2
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作者 张玉慧 王玉兰 +1 位作者 夏春兰 闻志彬 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期760-769,共10页
NADP-苹果酸酶(NADP-ME)是C_(4)植物的关键光合酶,在生物和非生物胁迫中发挥了重要的作用。为了进一步研究该酶编码基因的功能,该研究以典型荒漠C_(3)-C_(4)中间型植物松叶猪毛菜为研究对象,在克隆得到NADP-ME家族基因序列的基础上,研... NADP-苹果酸酶(NADP-ME)是C_(4)植物的关键光合酶,在生物和非生物胁迫中发挥了重要的作用。为了进一步研究该酶编码基因的功能,该研究以典型荒漠C_(3)-C_(4)中间型植物松叶猪毛菜为研究对象,在克隆得到NADP-ME家族基因序列的基础上,研究其表达部位及在非生物胁迫下的表达模式,并克隆其启动子序列分析响应非生物胁迫的元件差异。结果表明:(1)成功获得松叶猪毛菜3个NADP-MEs,命名为SaNADP-ME1、SaNADP-ME2和SaNADP-ME4,CDS序列长度分别为1755、1758和1941 bp。(2)SaNADP-ME1主要在根中表达,SaNADP-ME2和SaNADP-ME4主要在叶中表达;在ABA、NaCl、NAHCO_(3)和PEG_(6000)胁迫下松叶猪毛菜幼苗中3个NADP-MEs均可被诱导表达,且SaNADP-ME2和SaNADP-ME4的响应表达模式相似。(3)成功克隆得到SaNADP-ME1、SaNADP-ME2和SaNADP-ME4启动子区域2351、1655和2887 bp。生物信息学分析发现它们都含有基本启动子元件以及响应外界刺激的元件。 展开更多
关键词 nadp-me家族 C_(4)基因表达 C_(3)-C_(4)中间型植物 松叶猪毛菜
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转高粱C4型NADP-ME基因水稻植株的光合生理特征 被引量:3
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作者 迟伟 周劲松 +1 位作者 张方 吴乃虎 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2004年第7期873-882,共10页
NADP-苹果酸酶(NADP-ME)是C4型植物C4光合途径的一个关键酶。利用RT-PCR结合筛选cDNA文库技术,分离得到了编码高粱(Sorghum vulgareL.)C4型NADP-ME的全长cDNA。该cDNA全长为2139bp,其开放可读框为1911bp,共编码636个氨基酸和一个终... NADP-苹果酸酶(NADP-ME)是C4型植物C4光合途径的一个关键酶。利用RT-PCR结合筛选cDNA文库技术,分离得到了编码高粱(Sorghum vulgareL.)C4型NADP-ME的全长cDNA。该cDNA全长为2139bp,其开放可读框为1911bp,共编码636个氨基酸和一个终止密码子(GenBank登求号为AY274836)。利用农杆菌介导的转化系统将其转入水稻品种“农垦58”。经Southern杂交、Northern杂交和酶活性检测表明,高粱C4型NADP-ME可以在水稻中有效表达,酶活性可被提高1~7倍。对转基因水稻进行光合生理检测表明,转NADP-ME基因水稻CO2交换特征没有明显改变,但是在中午强光条件下光抑制加剧。 展开更多
关键词 nadp-苹果酸酶(nadp-me) 高粱 转基因水稻 光合生理
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甜菜NADP-ME基因家族的生物信息学分析
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作者 李思琪 迪娜尔·叶尔兰 +5 位作者 周婉婷 汪曼 李佳佳 刘大丽 兴旺 常广玉 《中国糖料》 2021年第4期17-25,共9页
烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸-苹果酸酶(NADP-malic enzyme,NADP-ME)由小基因家族编码,在植物生长发育和应对逆境胁迫中发挥重要作用。为了进一步筛选甜菜NADP-ME基因并分析其功能,本研究对该家族成员进行了详细的生物信息学分析。结果显示... 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸-苹果酸酶(NADP-malic enzyme,NADP-ME)由小基因家族编码,在植物生长发育和应对逆境胁迫中发挥重要作用。为了进一步筛选甜菜NADP-ME基因并分析其功能,本研究对该家族成员进行了详细的生物信息学分析。结果显示,甜菜基因组共有5个NADPME基因,基因长度介于6537 bp~19759 bp,并且所有BvNADP-ME均为亲水性蛋白,主要定位于线粒体、质膜、内质网和细胞核上,无信号肽,不存在跨膜结构域,不属于跨膜蛋白。除BvNADP-ME5外,其它家族成员均为酸性蛋白质;其中BvNADP-ME2、3、4皆为不稳定蛋白;导肽分析表明BvNADP-ME3含有叶绿体转运肽,BvNADP-ME4、5均含有线粒体靶向肽。染色体定位分析发现,BvNADP-ME5、2、1主要分布在1、2、8号染色体上。蛋白二三级结构预测具有相似的特征,α-螺旋和无规则卷曲为BvNADP-MEs的主要结构元件。系统进化分析表明BvNADP-MEs可分为6个亚组(I~VI),其中甜菜与菠菜NADP-ME亲缘关系最近,其次是藜麦,最远是拟南芥。蛋白质保守基序分析表明甜菜NADP-ME家族蛋白包含14个基序,其中Motif4、Motif6、7、8和Motif11、12可能与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)的结合有关。分析BvNADP-ME基因家族启动子区域的顺式作用元件,结果显示各成员启动子均含有植物激素响应元件和非生物胁迫响应元件。本研究对5个BvNADP-ME基因家族成员的生物信息学进行分析,为深入研究甜菜NADP-ME基因功能提供参考依据,也为分子抗性育种以及提高甜菜的品质和产量提供新思路。 展开更多
关键词 甜菜 nadp-me基因家族 生物信息学 逆境防御
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