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牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析
被引量：
1
1
作者
肖景莹
蔡连顺
+5 位作者
長瀧充
德弘慎治
Jarilla Blanca R.
嶋田雅暁
David Blair
吾妻健
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期252-256,共5页
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经...
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经纯化后克隆于pGEM1T质粒载体,并转化大肠埃希菌。抽提和纯化阳性质粒DNA,并测序。以纯化后的阳性质粒DNA为模板,根据已获得的序列设计内部特异引物,采用引物步移法获得全长目的片段。在GenBank中查找曼氏血吸虫等相关血吸虫线粒体基因序列,作基因排序及比较分析后,以邻接法绘制系统发生树。结果测定了牛裂体吸虫线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ～Ⅰ基因序列(nicotinamide adeninedinucleotide dehydrogenase subunit4-1gene,nad4-nad1),其长度为2214bp。分析该编码区基因排序为nad4-trnQ(Gln)-trnK(Lys)-nad3-trnD(Asp)-nad1。牛裂体吸虫在该区域的线粒体基因排序与非洲支系血吸虫相似,与亚洲支系血吸虫有很大的不同;根据牛裂体吸虫与其他8种吸虫部分nad4,nad3,部分nad1和部分nad4+nad3+nad1基因序列比对结果,分别构建系统发生树。结果表明,牛裂体吸虫与埃及血吸虫位于同一簇,归属于非洲血吸虫支系,这与由基因排序推测的牛裂体吸虫的系统发生位置结果相一致。结论牛裂体吸虫属于非洲支系而非亚洲支系血吸虫。
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关键词
牛裂体吸虫
nad
4
nad
3
nad
1
基因排序
系统发生关系
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职称材料
红麻线粒体基因NAD3和COB的RNA编辑与表达分析
被引量：
2
2
作者
刁勇
廖小芳
+4 位作者
郑杰
孔祥军
陈鹏
赵艳红
周瑞阳
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期10-16,共7页
以红麻细胞质线粒体近等基因系UG93A(不育系)、UG93B(保持系)及UG93A×福红992(恢复系)的F1代为材料,研究花药线粒体基因NAD3和COB的转录与表达。结果发现,在3种供试材料中,基因NAD3的CDS区在DNA水平和RNA编辑水平上均无差异;不育...
以红麻细胞质线粒体近等基因系UG93A(不育系)、UG93B(保持系)及UG93A×福红992(恢复系)的F1代为材料,研究花药线粒体基因NAD3和COB的转录与表达。结果发现,在3种供试材料中,基因NAD3的CDS区在DNA水平和RNA编辑水平上均无差异;不育系与保持系的COB基因DNA编码序列无差异,但在RNA水平上发生了编辑,8个位点的编辑均发生于密码子的第一或第二位碱基,且导致氨基酸种类变化,主要为亲水性氨基酸转变为疏水性氨基酸;COB基因在UG93A中的RNA编辑频率低于UG93B;NAD3和COB基因在3种材料中的转录本大小基本相同,但在表达水平上表现为不育系显著低于保持系和F1代。由此推测NAD3和COB基因在红麻花药发育过程中有着重要的作用。
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关键词
红麻
RNA编辑
nad
3
COB
表达分析
原文传递
MP3播放程序测试
3
作者
软硬
《新潮电子》
1998年第10期21-24,共4页
关键词
MP
3
播放软件
程序测试
音质测试
nad
-MP
3
-Player0.9
3
WINAMP
Yamp
3
.0
XingMPEG
3
.
3
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职称材料
题名
牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析
被引量：
1
1
作者
肖景莹
蔡连顺
長瀧充
德弘慎治
Jarilla Blanca R.
嶋田雅暁
David Blair
吾妻健
机构
日本高知大学医学部
佳木斯大学基础医学院
日本长崎大学热带医学研究所
澳大利亚詹姆斯库克大学热带生物学院
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期252-256,共5页
基金
日本学术振兴会科学研究费补助金(No.16406010)
黑龙江省科技厅科学技术研究项目(No.LC2009C15)
佳木斯大学科学技术研究项目(No.S2009-066)~~
文摘
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经纯化后克隆于pGEM1T质粒载体,并转化大肠埃希菌。抽提和纯化阳性质粒DNA,并测序。以纯化后的阳性质粒DNA为模板,根据已获得的序列设计内部特异引物,采用引物步移法获得全长目的片段。在GenBank中查找曼氏血吸虫等相关血吸虫线粒体基因序列,作基因排序及比较分析后,以邻接法绘制系统发生树。结果测定了牛裂体吸虫线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ～Ⅰ基因序列(nicotinamide adeninedinucleotide dehydrogenase subunit4-1gene,nad4-nad1),其长度为2214bp。分析该编码区基因排序为nad4-trnQ(Gln)-trnK(Lys)-nad3-trnD(Asp)-nad1。牛裂体吸虫在该区域的线粒体基因排序与非洲支系血吸虫相似,与亚洲支系血吸虫有很大的不同;根据牛裂体吸虫与其他8种吸虫部分nad4,nad3,部分nad1和部分nad4+nad3+nad1基因序列比对结果,分别构建系统发生树。结果表明,牛裂体吸虫与埃及血吸虫位于同一簇,归属于非洲血吸虫支系,这与由基因排序推测的牛裂体吸虫的系统发生位置结果相一致。结论牛裂体吸虫属于非洲支系而非亚洲支系血吸虫。
关键词
牛裂体吸虫
nad
4
nad
3
nad
1
基因排序
系统发生关系
Keywords
Schistosoma bovis
nad
H dehydrogenase 4
nad
H dehydrogenase
3
nad
H dehydroge-nase 1
Gene order
Phylogenetic relationship
分类号
R383.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
红麻线粒体基因NAD3和COB的RNA编辑与表达分析
被引量：
2
2
作者
刁勇
廖小芳
郑杰
孔祥军
陈鹏
赵艳红
周瑞阳
机构
广西大学农学院/广西高校植物遗传育种重点实验室
广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所
出处
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第11期10-16,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(31171600)
文摘
以红麻细胞质线粒体近等基因系UG93A(不育系)、UG93B(保持系)及UG93A×福红992(恢复系)的F1代为材料,研究花药线粒体基因NAD3和COB的转录与表达。结果发现,在3种供试材料中,基因NAD3的CDS区在DNA水平和RNA编辑水平上均无差异;不育系与保持系的COB基因DNA编码序列无差异,但在RNA水平上发生了编辑,8个位点的编辑均发生于密码子的第一或第二位碱基,且导致氨基酸种类变化,主要为亲水性氨基酸转变为疏水性氨基酸;COB基因在UG93A中的RNA编辑频率低于UG93B;NAD3和COB基因在3种材料中的转录本大小基本相同,但在表达水平上表现为不育系显著低于保持系和F1代。由此推测NAD3和COB基因在红麻花药发育过程中有着重要的作用。
关键词
红麻
RNA编辑
nad
3
COB
表达分析
Keywords
kenaf
RNA editing
nad
3
COB
expression analysis
分类号
S563.5 [农业科学—作物学]
S311
原文传递
题名
MP3播放程序测试
3
作者
软硬
出处
《新潮电子》
1998年第10期21-24,共4页
关键词
MP
3
播放软件
程序测试
音质测试
nad
-MP
3
-Player0.9
3
WINAMP
Yamp
3
.0
XingMPEG
3
.
3
分类号
TP391.4 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
TN912.3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析
肖景莹
蔡连顺
長瀧充
德弘慎治
Jarilla Blanca R.
嶋田雅暁
David Blair
吾妻健
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
下载PDF
职称材料
2
红麻线粒体基因NAD3和COB的RNA编辑与表达分析
刁勇
廖小芳
郑杰
孔祥军
陈鹏
赵艳红
周瑞阳
《中国农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
原文传递
3
MP3播放程序测试
软硬
《新潮电子》
1998
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
引证文献
统计分析
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