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耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌种群结构和耐药机制研究 被引量:23
1
作者 陈东科 周海健 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 2018年第5期507-512,共6页
耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)是临床常见的耐药菌之一。本研究对88株全国49家医院收集的CRKP菌株进行碳青霉烯类耐药基因检测,其中65株(73.9%)检出bla_(KPC)类基因(64株检出bla_(K... 耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)是临床常见的耐药菌之一。本研究对88株全国49家医院收集的CRKP菌株进行碳青霉烯类耐药基因检测,其中65株(73.9%)检出bla_(KPC)类基因(64株检出bla_(KPC-2)、1株检出bla_(KPC-3))、9株(10.2%)检出bla_(NDM)类基因(均为bla_(NDM-1))、7株(8.0%)检出bla_(IMP)类基因(均为bla_(IMP-4))。通过多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)将88株CRKP分为25个MLST型,其中ST11型为优势型别,包含48株菌。88株CRKP通过脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分为79个PFGE型,呈现高度多态性。本研究揭示了我国blaKPC-2阳性CRKP菌株存在克隆化现象,存在ST11型流行克隆;而bla_(NDM-1)和bla_(IMP-4)阳性CRKP菌株分子型别多态性大,还没形成流行克隆。需要密切监测并采取措施控制携带blaKPC-2基因的ST11型CRKP的传播扩散。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类抗生素肺炎克雷伯菌 耐药基因 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 种群结构
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深圳市南山区腹泻患者弯曲菌感染及病原学特征分析 被引量:13
2
作者 刘敏 鞠长燕 +4 位作者 马艳萍 段永翔 俞慕华 张茂俊 王国庆 《疾病监测》 CAS 2020年第1期16-20,共5页
目的获得本地区秋季腹泻患者弯曲菌的感染现状及病原学特征。方法收集深圳市南山区2018年9—11月腹泻患者的粪便标本,采用双孔滤膜法分离培养弯曲菌并应用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行菌种鉴定。应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点... 目的获得本地区秋季腹泻患者弯曲菌的感染现状及病原学特征。方法收集深圳市南山区2018年9—11月腹泻患者的粪便标本,采用双孔滤膜法分离培养弯曲菌并应用荧光聚合酶链式反应(PCR)方法进行菌种鉴定。应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)对分离菌株进行分子分型,应用琼脂稀释法获得菌株对11种抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。根据菌株的序列分型(ST)结果,结合既往菌株分型数据进行本地区菌株的遗传聚类分析。结果共采集腹泻患者粪便标本150份,其中男性患者74例,女性患者76例,年龄在1~86岁之间。150份粪便标本中共分离到弯曲菌18株,检出率为12.00%(18/150)。菌种鉴定发现,空肠弯曲菌占77.78%(14/18),结肠弯曲菌占22.22%(4/18)。14株空肠弯曲菌可分为11种PFGE带型,8个ST型别,以ST9763最多(35.71%,5/14),是本研究新发现ST型别。14株空肠弯曲菌对四环素全部耐药,对红霉素、阿奇霉素、泰利霉素、庆大霉素、链霉素及克林霉素100.00%敏感。ST型别最小生成树聚类分析结果表明,不同宿主来源菌株没有显著聚集性,腹泻患者分离菌株分布在不同来源的组群中。结论采用双孔滤膜法提高了腹泻患者中弯曲菌的检出率。本地区弯曲菌的感染仍以空肠弯曲菌为主,分离菌株对四环素类、喹诺酮类抗生素呈现较高的耐药特征,分离的空肠弯曲菌ST呈弥散分布特点。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 双孔滤膜法 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 抗生素敏感性
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌基因分型研究 被引量:10
3
作者 李囡 范红 +5 位作者 陈慧莉 谢轶 陆小军 张磊 王军 应斌武 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第15期2122-2126,2130,共6页
目的了解本地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)流行株的来源和遗传背景。方法回顾分析华西医院127例MRSA感染者的病例资料,用SCCmec多重PCR技术、葡萄球菌A蛋白(spa)分型技术和多位点测序分型技术对其中10株MRSA临床分离株进行基因分型... 目的了解本地区耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)流行株的来源和遗传背景。方法回顾分析华西医院127例MRSA感染者的病例资料,用SCCmec多重PCR技术、葡萄球菌A蛋白(spa)分型技术和多位点测序分型技术对其中10株MRSA临床分离株进行基因分型,并检测其杀白细胞毒素基因。结果病例资料显示127株MRSA中3株为社区获得性MRSA(CA-MRSA),其余均为医院获得性MRSA(HA-MRSA)。进行分型研究的10株MRSA中,7株HA-MRSA为SCCmec Ⅲ-ST239-PVL(-),呈现高度的克隆一致性,spa分型进一步显示4株为t030,另外3株为t037;CA-MRSAs19165分型为ST8-t008,与USA300属同一克隆,并且携带SCCmecⅣa和PVL基因,符合USA300一般基因特征。另外2株CA-MRSAs35301、s29635均为SCCmecⅣa-ST59-t437,与我国其他地区的报道不同。结论该院分离的MRSA仍以医院获得性为主(124/127),HA-MRSA呈现高度的克隆一致性,并与我国的主要流行株为同一克隆;分离到与美国主要CA-MRSA流行株USA300相同克隆的菌株,另外分离到的CA-MRSAST59-t437克隆株在我国其他地区未有报道。MLST和spa分型技术是金黄色葡萄球菌分子流行病学研究的更为简便快速的方法。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 多住点测序分型 葡萄球菌A蛋白
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子特征研究 被引量:10
4
作者 王金波 李海英 +1 位作者 张亚妮 孙敏 《检验医学与临床》 CAS 2021年第12期1728-1732,1735,共6页
目的了解该地区2018年1月至2019年12月耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子分型特点、耐药基因和毒力基因的携带特征,为后续MRSA分子分型研究提供科学依据。方法采用布鲁克质谱鉴定系统对临床分离的MRSA进行细菌鉴定并行药敏试验,使用... 目的了解该地区2018年1月至2019年12月耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的分子分型特点、耐药基因和毒力基因的携带特征,为后续MRSA分子分型研究提供科学依据。方法采用布鲁克质谱鉴定系统对临床分离的MRSA进行细菌鉴定并行药敏试验,使用PCR技术对MRSA的管家基因、耐药基因和毒力基因进行检测并进行分组分析。采用WHONET5.0等软件对MRSA的临床分布等临床特点和药敏结果等进行统计分析。结果2018年1月至2019年12月临床分离的MRSA菌株共124株,其中来自于创面等分泌物标本50株,痰液、灌洗液标本27株,尿液等标本31株,胸腔积液等无菌体液标本7株,血液标本等9株。124株MRSA进行药敏结果分析,发现对青霉素G、苯唑西林、红霉素、克林霉素和四环素的耐药率均较高,对喹诺酮类抗菌药物的耐药性亦处在较高水平,但是对利奈唑胺、万古霉素、替考拉宁和奎奴普丁/达托霉素均100%敏感,有1株对呋喃妥因耐药。结论MRSA菌株对多种抗菌药物具有较高的耐药性,应加强MRSA预防观念的强化培训和监督院内感染措施的执行,以减少院内MRSA感染的发生。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 耐药 多位点序列分型 毒力基因
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湖南省新发X群Y群流行性脑脊髓膜炎病例菌株的病原学特征分析 被引量:9
5
作者 夏昕 方明礼 +3 位作者 覃迪 贺子翔 高立冬 湛志飞 《实用预防医学》 CAS 2021年第11期1295-1298,共4页
目的了解2019—2020年本省分离到的新发X群和Y群脑膜炎奈瑟菌病例菌株的药物敏感性及分子分型特征。方法从病人血液和脑脊液中分离到的脑膜炎奈瑟菌经生化鉴定后,进行血清学分群、药敏试验以及多位点序列分型分析。结果新发的X群、Y群... 目的了解2019—2020年本省分离到的新发X群和Y群脑膜炎奈瑟菌病例菌株的药物敏感性及分子分型特征。方法从病人血液和脑脊液中分离到的脑膜炎奈瑟菌经生化鉴定后,进行血清学分群、药敏试验以及多位点序列分型分析。结果新发的X群、Y群脑膜炎奈瑟菌药敏试验中对青霉素、氨苄青霉素、米诺环素、头孢曲松、头孢噻肟、氯霉素、阿奇霉素、美罗培南和利福平全部敏感;对复方磺胺甲噁唑耐药;与B群菌株的药物敏感性比较具有对青霉素、氨苄青霉素以及氟喹诺酮类抗菌药物更高的敏感性,多位点序列分型结果显示X菌株为ST-5克隆群,两株Y群菌株为ST-23克隆群。结论 X群有可能是从A群菌株荚膜转换而来,Y群菌株与国际高致病流行ST克隆群一致,二者均有可能成为新的流脑流行群并引起暴发疫情,需引起重视。 展开更多
关键词 流行性脑脊髓膜炎 脑膜炎奈瑟球菌 药物敏感性 多位点序列分型
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江苏省首例人感染ST1型猪链球菌的快速检测及分子特征分析 被引量:9
6
作者 谈忠鸣 姜仁杰 +4 位作者 周伟忠 顾玲 鲍倡俊 汤奋扬 朱叶飞 《江苏预防医学》 CAS 2015年第1期19-22,共4页
目的对2014年江苏省一起疑似人感染猪链球菌病的病原菌进行实验室快速检测并分析其分子特征。方法采用实时荧光PCR方法对病人标本中提取的DNA进行猪链球菌血清2型特异基因检测,运用PCR方法进行猪链球菌毒力基因鉴定及多位点序列分析。... 目的对2014年江苏省一起疑似人感染猪链球菌病的病原菌进行实验室快速检测并分析其分子特征。方法采用实时荧光PCR方法对病人标本中提取的DNA进行猪链球菌血清2型特异基因检测,运用PCR方法进行猪链球菌毒力基因鉴定及多位点序列分析。结果病人标本中检测到猪链球菌种特异基因(16srRNA)和血清2型荚膜多糖编码基因(cps-2J),5种毒力基因(mrp,sly,ef,gapdh,fbps)全部阳性,多位点序列分析结果为ST1型。结论该病例的病原菌为携带5种毒力基因的ST1型猪链球菌血清2型菌株,该型别在江苏省尚属首次报道。 展开更多
关键词 猪链球菌血清2型 毒力基因 多位点序列分析
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杭州地区单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子型别研究 被引量:8
7
作者 俞骅 潘劲草 +5 位作者 汪皓秋 斯国静 刘涛 楼秀芹 张蔚 严杰 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期264-270,共7页
目的研究杭州地区单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)食品分离株的分子分型情况,了解当地流行株的型别特征。方法用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)的方法对单核细胞增生李斯特菌进行分子分型。PFGE结果进行聚... 目的研究杭州地区单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)食品分离株的分子分型情况,了解当地流行株的型别特征。方法用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)的方法对单核细胞增生李斯特菌进行分子分型。PFGE结果进行聚类分析,并绘制MLST数据的最小生成树。结果 6个血清型组成的133株杭州食品分离株共获得19个MLST型别,并发现1个新的ST型ST767。ST9和ST121是数量最多的型别。用AscI和ApaI酶切分别获得33和45个PFGE带型。结论杭州地区单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子型别分布广泛,大部分菌株是可引起人李斯特菌病的Lineage I和Lineage II菌株。食品中单核细胞增生李斯特菌的污染比较严重,应加强监测与管理以防食源性疾病的发生。 展开更多
关键词 单核细胞增生李斯特菌 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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北京市昌平区2012—2016年肠集聚性黏附大肠埃希氏菌耐药性、毒力基因及分子特征 被引量:8
8
作者 舒高林 李东迅 +3 位作者 闻艳红 彭华 徐代庆 吴杨 《江苏预防医学》 CAS 2017年第2期128-132,共5页
目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位... 目的了解昌平区肠集聚性黏附大肠埃希氏菌(EAEC)耐药性、毒力基因携带情况及分子特征。方法对2012—2016年北京市昌平区分离的15株EAEC毒株进行复核;以药敏实验检测菌株对16种抗菌药物的耐药性;以PCR法检测8种毒力的携带情况;采用多位点序列分型(MLST)及脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)进行分子分型分析。结果 15株EAEC耐药率为100.0%,耐多药率为80.0%。每株携带2~5个毒力基因,共有10种毒力基因谱;8个毒力基因阳性率由高到低分别为aap(100.0%)、CVD432(93.3%)、aggA(60.0%)、agg3A(40.0%)、astA(33.3%)、pic(20.0%)、aafA(13.3%),未检出pet阳性。MLST分型分析将15株EAEC菌分为9个ST型,其中有4个新ST型(STcpEC1、STcpEC2、STcpEC3、STcpEC4),以STcpEC1为优势ST型(占33.3%)。PFGE分析得到13种PFGE带型,相同ST型菌株PFGE带型、毒力基因相似系数均较高。结论北京市昌平区近5年EAEC菌耐药率、多重耐药率较高,毒力基因aap、CVD432、aggA检出率高,STcpEC1为优势ST型,PFGE带型具有高度多态性。 展开更多
关键词 肠集聚性黏附大肠埃希氏菌 耐药性 毒力基因 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的耐药性及毒力特征的分子生物学研究 被引量:7
9
作者 师志云 马苗 +8 位作者 尹晓丽 王良方 侯晓慧 张玉英 李刚 王文 陶佳 李莎莎 贾伟 《中国感染与化疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期725-731,共7页
目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表... 目的了解宁夏医科大学总医院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子流行病学及毒力特征。方法收集2015年1月—2019年12月分离的CRKP 103株,采用改良碳青霉烯酶灭活试验(mCIM)联合EDTA改良碳青霉烯酶灭活试验(eCIM)检测产碳青霉烯酶表型,PCR分子生物学技术检测碳青霉烯酶等耐药基因以及荚膜血清型、毒力基因,多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)对碳青霉烯类耐药高毒力肺炎克雷伯菌(CR-hvKP)进行同源性分析。结果103株CRKP对临床常见抗菌药物表现为不同程度的耐药,mCIM联合eCIM试验结果显示94株CRKP产碳青霉烯酶,其中67.0%产金属酶,33.0%产丝氨酸碳青霉烯酶。耐药基因检出率依次为blaNDM 50.5%(52/103)、bla_(KPC)33.0%(34/103)、bla_(OXA-48)22.3%(23/103)、bla_(IMP)10.7%(11/103)。18种ST型中以ST11型35.3%(36/102)及ST76型22.5%(23/102)为主。CR-hvKP 10株,其中仅4株为荚膜血清K1型、10株均为菌毛黏附基因fim-H和铁载体相关基因ent-B携带者。10株CRhvKP菌株PFGE同源性分析显示以D族群居多,亲缘性接近;未发现同一病区同一时间段的暴发流行。结论该院CRKP菌株以产NDM-5型碳青霉烯酶为主,ST11型为优势流行株。已发现9.7%的CRKP为CR-hvKP菌株,应当引起临床和院感相关部门的重视,防止暴发流行。 展开更多
关键词 碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌 耐药机制 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳 毒力特征
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禽源多杀性巴氏杆菌多位点序列分型研究 被引量:7
10
作者 李伟杰 田野 +3 位作者 岂晓鑫 蒋颖 魏财文 蒋桃珍 《中国兽药杂志》 北大核心 2017年第2期1-6,共6页
为了解国内禽源多杀性巴氏杆菌流行情况,对分离自18省份的84株多杀性巴氏杆菌采用荚膜多重PCR分型和多位点序列分型对其血清型和基因型进行鉴定。结果表明:禽源多杀性巴氏杆菌主要以血清A型为主,占96.4%(81/84);多位点序列分型可将禽源... 为了解国内禽源多杀性巴氏杆菌流行情况,对分离自18省份的84株多杀性巴氏杆菌采用荚膜多重PCR分型和多位点序列分型对其血清型和基因型进行鉴定。结果表明:禽源多杀性巴氏杆菌主要以血清A型为主,占96.4%(81/84);多位点序列分型可将禽源多杀性巴氏杆菌分为5种ST型,其中ST129为主要流行型,占94.0%(79/84)。本研究为我国禽源多杀性巴氏杆菌的流行病学监测和基因多样性提供了数据支持。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 荚膜分型 多位点序列分型
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幽门螺杆菌克拉霉素异质性耐药及其特征分析 被引量:7
11
作者 孙路 何利华 +1 位作者 张艺瑶 张建中 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期391-395,共5页
目的对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)克拉霉素异质性耐药进行检测,并分析异质性耐药的遗传进化特征。方法对中国某医院50个^(13)C尿素呼气试验阳性患者的胃窦黏液标本进行HP分离培养,每个样本挑取16个HP单克隆(分离培养平板中不... 目的对幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)克拉霉素异质性耐药进行检测,并分析异质性耐药的遗传进化特征。方法对中国某医院50个^(13)C尿素呼气试验阳性患者的胃窦黏液标本进行HP分离培养,每个样本挑取16个HP单克隆(分离培养平板中不满16个克隆者选取全部HP克隆),用Etest法测定各克隆的克拉霉素最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)。进一步在异质性克拉霉素耐药病例中选取6份样本(MIC值差异较大的样本)相关的81个幽门螺杆菌克隆,利用多位点序列(MLST)分析的方法进行初步进化分析。结果 44个分离培养阳性的样本中24个全敏感,9个全耐药,11个为异质性耐药;6个MIC值差异较大的样本,最大值与最小值差别在100~1 000倍间。每个样本的9~16个克隆可分为1~6个ST型,结合vacA基因差异,分为2~8个基因型。遗传进化树显示2个样本的敏感、耐药克隆分为两簇,余4个样本中ST型与耐药间无明显关联。结论 HP在中国感染存在明显的克拉霉素异质性耐药现象,传统药敏试验可能不足以充分反映克拉霉素异质性耐药的现象,可能会引起误判,应高度关注。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 异质性耐药 多位点序列分析
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重症监护病房耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌分子流行病学研究 被引量:7
12
作者 杨程茹 王英 +4 位作者 李莹 张吉生 曾令怡 胡可望 张晓丽 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期209-216,共8页
目的分析重症监护病房(ICU)临床来源耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子特征及流行情况,为感染控制及药物治疗提供实验室数据。方法收集2018年7月—2020年7月某院ICU分离的51株CRKP,采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度,多位点序列分... 目的分析重症监护病房(ICU)临床来源耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌(CRKP)的分子特征及流行情况,为感染控制及药物治疗提供实验室数据。方法收集2018年7月—2020年7月某院ICU分离的51株CRKP,采用微量肉汤稀释法测定最低抑菌浓度,多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳分析菌株同源性,检测菌株耐药和毒力基因,接合试验验证质粒的转移性。结果药敏试验显示,CRKP对头孢他啶/阿维巴坦全部敏感,对替加环素耐药率最低(3.9%),其次是阿米卡星(49.0%)、多粘菌素(64.7%),对亚胺培南(96.1%)、美罗培南(98.0%)、左氧氟沙星(98.0%)和头孢他啶(100.0%)均高度耐药。51株CRKP中,mCIM试验阳性菌株49株(96.1%),eCIM试验阳性菌株1株(2.0%)。碳青霉烯酶基因blaKPC-2阳性菌株占96.1%。所有分离株中,高黏液表型阳性4株(7.8%),毒力基因阳性情况分别为:uge 100.0%,mrkD 94.1%,kpn 94.1%,fim-H 72.5%,aero 2.0%,rmpA 2.0%。ST11 CRKP在ICU中占98.0%(50/51),ST1373占2.0%(1/50)。检出1株ST1373的高毒力肺炎克雷伯菌。携带blaKPC-2基因菌株的接合试验成功率为12.2%。结论ICU存在产KPC-2的ST11 CRKP单克隆传播,同时携带一定的毒力基因。携带blaKPC-2基因的质粒可通过接合水平传播。头孢他啶/阿维巴坦对CRKP有较高的敏感性,可供临床治疗选择使用。 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 分子流行病学 多位点序列分型 重症监护室 质粒接合
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北京市昌平区食源性单增李斯特菌特征分析 被引量:6
13
作者 牛桓彩 吴杨 +3 位作者 舒高林 刘毅 马文军 李东迅 《疾病监测》 CAS 2018年第6期463-468,共6页
目的了解北京市昌平区食源性单增李斯特菌(Lm)的毒力基因携带情况、抗生素敏感性及分子特征。方法对2010-2016年12类食品中分离的22株Lm进行血清型、毒力基因、抗生素敏感性、多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 22... 目的了解北京市昌平区食源性单增李斯特菌(Lm)的毒力基因携带情况、抗生素敏感性及分子特征。方法对2010-2016年12类食品中分离的22株Lm进行血清型、毒力基因、抗生素敏感性、多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 22株Lm分为5种血清型(以1/2c、3a血清型为主);19种毒力基因携带谱(T1~T19),毒力基因阳性数为6~12个;对氨苄西林、青霉素、美罗培南、复方新诺明、万古霉素和环丙沙星敏感,出现对四环素、红霉素耐药菌株;分为8个序列型(ST)(包括7个新型STA1~STA7),STA3为主要型别;分为17种PFGE带型,其相似系数为63.5%~100.0%,PTⅠ为主要PFGE带型。结论昌平区食源性Lm以1/2c、3a血清型为主,STA3为主要型别,PTⅠ为主要PFGE带型,其毒力基因的携带具有差异性,出现对四环素、红霉素耐药株,为食源性Lm的研究提供了参考。 展开更多
关键词 单增李斯特菌 血清型 毒力基因 耐药性 多位点序列分型 脉冲场凝胶电泳
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湖南省部分地区猪、鸡源粪肠球菌耐药性及多位点序列分型分析 被引量:6
14
作者 蒋逸凡 李岱霞 +1 位作者 鲍翔宇 黎满香 《中国动物传染病学报》 CAS 北大核心 2020年第6期102-107,共6页
为探究湖南省不同地区猪、鸡源粪肠球菌耐药特征,多重耐药株的流行性和多位点序列的分型,本研究采用微量肉汤稀释法对81株分离的粪肠球菌进行8种抗菌药物的耐药性检测,应用MLST方法对部分多重耐药菌株进行分型。结果显示,分离株对红霉... 为探究湖南省不同地区猪、鸡源粪肠球菌耐药特征,多重耐药株的流行性和多位点序列的分型,本研究采用微量肉汤稀释法对81株分离的粪肠球菌进行8种抗菌药物的耐药性检测,应用MLST方法对部分多重耐药菌株进行分型。结果显示,分离株对红霉素、四环素以及头孢西丁严重耐药,耐药率均在90%以上,对氧氟沙星和氟苯尼考的耐药相对严重,耐药率为60%~80%,仅有1株对万古霉素耐药;本次试验中有75株粪肠球菌对3种及3种以上药物耐药,多重耐药率达92.6%;35株多重耐药粪肠球菌共有21个MLST型,其中CC(Clonal complex)16、CC480、CC476、CC4为优势克隆群。CC16所覆盖的粪肠球菌数量最多,占比28.6%。比较4个优势CC群耐药性,所有菌株均对四环素、红霉素及头孢菌素耐药,2株ST16型菌株的多重耐药谱完全相同,2株ST480菌株的耐药谱仅存在1处差异。结果表明,不同地区猪、鸡源粪肠球菌分离株有着丰富的ST型,同一种ST型的菌株可能具有相同或相似的多重耐药谱。 展开更多
关键词 粪肠球菌 耐药性 多位点序列分型
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2016-2018年东莞地区耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌的耐药表型、耐药机制和分子流行病学分析 被引量:5
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作者 郭主声 吕飞 +7 位作者 谢树金 黄亚 林偲思 徐宝华 冯剑波 冯森 何芬 周谋清 《中国抗生素杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期798-805,共8页
目的通过研究东莞地区的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的耐药情况和基因分型,研究耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的亲缘性、耐药机制和bla_(KPC... 目的通过研究东莞地区的耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌(carbapenem-resistant Enterobacteriaceae,CRE)的耐药情况和基因分型,研究耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae,CRKP)的亲缘性、耐药机制和bla_(KPC-2)基因环境,为临床寻找控制和治疗该致病菌的更优方案提供参考。方法回顾性收集2016年1月—2018年12月东莞市人民医院、东莞东华医院、康华医院、东莞市中医院和东莞市妇幼保健院等十三所医院的住院患者的CRE菌株进行常规微生物培养、鉴定和药敏试验。以美罗培南或亚胺培南纸片法(K-B法)或最小抑菌浓度(MIC)测定法对肠杆菌目细菌进行初筛;采用改良Hodge试验、亚胺培南-EDTA双纸片协同试验和CIM试验检测CRE产酶情况;聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测并鉴定CRE的碳青霉烯类耐药基因(bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(IMP)、bla_(DHA)、bla_(CTX-M)和bla_(CMY)),以及CRKP的多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)和孔蛋白(OmpK35、OmpK36和OmpK37);通过Junction PCR、Mapping PCR和Crossing PCR检测bla_(KPC-2)基因环境;使用WHONET 5.6软件统计分析CRE临床分离株在标本和科室中的分布与耐药情况,以及碳青霉烯酶基因在科室中的分布情况。结果从37217株肠杆菌目细菌中共检出131株CRE(占0.35%),其中肺炎克雷伯菌79株(占60.31%)、大肠埃希菌21株(占16.03%)和阴沟肠杆菌12株(占9.16%);检出CRE的临床科室主要为ICU(66株,占50.38%);在检出CRE的标本中,位于前3位分别是痰液标本(56株,占42.75%)、尿液标本(21株,占16.03%)、伤口分泌物标本(12株,占9.16%);CRE对目前临床中常使用的抗菌药物表现出高耐药性,仅对阿米卡星耐药率较低,为21.38%。检测104株CRE(包括肺炎克雷伯菌、大肠埃希菌和阴沟肠杆菌)发现的碳青霉烯酶有KPC-2型(57,54.81%)、NDM-1型(7株,6.73%)和NDM-5型(2株,1.92%);其中,CRKP主要为ST11型(49株,占62.03%),其 展开更多
关键词 耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌 耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌 多位点序列分型 孔蛋白 bla_(KPC-2) 基因环境
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山东省禽源产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌的分子流行病学分析 被引量:1
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作者 宋祥彬 赵晓雨 +8 位作者 李传溥 门晓冬 梁萌 魏秀丽 李有志 杨志昆 张德琛 郭玉秋 汤文利 《中国畜牧兽医》 CSCD 北大核心 2024年第1期407-416,共10页
【目的】分析山东省禽源产超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases, ESBLs)大肠杆菌的耐药情况、耐药机制、毒力基因、多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)、亲缘性和Inc型质粒,为禽临床合理使用抗菌药物防... 【目的】分析山东省禽源产超广谱β-内酰胺酶(extended-spectrum β-lactamases, ESBLs)大肠杆菌的耐药情况、耐药机制、毒力基因、多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)、亲缘性和Inc型质粒,为禽临床合理使用抗菌药物防治此类细菌病提供参考。【方法】复苏2021年4月-2021年7月分离自山东省禽泄殖腔拭子样本中的38株产ESBLs大肠杆菌,采用微量肉汤稀释法测定其对16种抗菌药物的敏感性,通过全基因组测序检测其携带的耐药基因、毒力基因、MLST、Inc型质粒,使用Parsnp构建菌株系统发育树。【结果】药敏试验结果显示,所有菌株对氨苄西林、头孢噻呋和头孢他啶耐药,对磺胺异噁唑(97.4%)、甲氧苄啶/磺胺甲噁唑(94.7%)、四环素(89.5%)、氟苯尼考(86.8%)、大观霉素(84.2%)耐药严重。全基因组分析结果显示,38株产ESBLs大肠杆菌的blaCTX-M型中blaCTX-M-55基因携带率为34.2%,blaNDM型中blaNDM-5和blaNDM-4基因携带率分别为21.1%和10.5%,其携带大量介导临床中常用抗菌药物的耐药基因和黏附类、侵袭类、血清抗性、铁转运类毒力基因。MLST结果显示,ST10(13.2%)为产ESBLs大肠杆菌最流行的ST型,其次是ST616(10.5%)和ST746(10.5%)。系统发育树分析表明,ST10、ST616和ST746分别属于同一起源。Inc型质粒结果显示,IncFIB(AP001918)携带率最高(68.4%),其次为IncHI2(42.1%)。【结论】山东省禽源产ESBLs大肠杆菌耐药状况严峻,blaCTX-M基因是导致大肠杆菌对超广谱β-内酰胺类抗菌药物耐药的主要原因,且该类菌株携带大量毒力基因,亟需对其加强监测。 展开更多
关键词 超广谱β-内酰胺酶 碳青霉烯 禽源大肠杆菌 全基因组测序 多位点序列分型
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进口蜂蜜中幼虫芽孢杆菌分子分型方法的比较研究
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作者 俞佳 高有领 +6 位作者 王建峰 赵秀玲 李如松 王春 杨伯龙 于纪棉 江玲丽 《动物医学进展》 北大核心 2024年第8期78-82,共5页
为研究来自不同地域幼虫芽孢杆菌的进化关系,建立其分子分型方法,对来自11个国家和地区的50株幼虫芽孢杆菌分离株进行MLST分型分析,并与ERIC分型比较。结果显示,ERIC法将50株分离株分为ERICⅠ、ERICⅡ与ERICⅣ型,但不能区分不同区域菌株... 为研究来自不同地域幼虫芽孢杆菌的进化关系,建立其分子分型方法,对来自11个国家和地区的50株幼虫芽孢杆菌分离株进行MLST分型分析,并与ERIC分型比较。结果显示,ERIC法将50株分离株分为ERICⅠ、ERICⅡ与ERICⅣ型,但不能区分不同区域菌株;MLST法将菌株分为ST1至ST8共8种序列型,其中ST1为优势型,占比高且分布广泛;其次为ST5(主要为加拿大分离株),ST3(澳大利亚分离株),ST4(法国与匈牙利分离株),ST6(新西兰分离株),ST2(西班牙分离株),ST7(匈牙利分离株)和ST8(澳大利亚分离株)。与ERIC相比,MLST可以对不同地域的幼虫芽孢杆菌进行有效分型,具有更高的分辨率,可作为后续进口蜂蜜中幼虫芽孢杆菌流行病学调查的工具。 展开更多
关键词 幼虫芽孢杆菌 多位点序列分型 管家基因 肠杆菌基因间重复共有序列分型
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杭州地区产KPC酶大肠埃希菌耐药性及流行性分析 被引量:4
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作者 王育瑛 齐艳 +4 位作者 杨雪静 王燕飞 蒋琰 楼正青 俞云松 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第5期359-363,共5页
目的了解产肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)大肠埃希菌的流行情况,加强医院感染控制及防止多重耐药菌大范围播散。方法收集2012年7月至2014年1月杭州市中医院、浙江大学医学院附属第一医院、浙江省中医院和浙江省人民医院共25株碳青霉... 目的了解产肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶(KPC)大肠埃希菌的流行情况,加强医院感染控制及防止多重耐药菌大范围播散。方法收集2012年7月至2014年1月杭州市中医院、浙江大学医学院附属第一医院、浙江省中医院和浙江省人民医院共25株碳青霉烯类抗生素耐药大肠埃希菌。利用K-B纸片法测试所有菌株对22种常用抗菌药物的敏感性;PCR扩增确认blaKPC基因,改良Hodge试验确认菌株是否产碳青霉烯酶;脉冲场凝胶电泳(PFGE)及多位点序列分型(MLST)技术进行菌株同源性分析。结果25株大肠埃希菌均产KPC酶,编码blaKPC-2基因。这些产KPC酶菌株对抗菌药物的耐药率较高,尤其对几乎所有β-内酰胺类药物耐药。PFGE分型将25株菌株分为3个主要同源克隆群,克隆群A(4株)、克隆群B(5株)和克隆群C(2株),其余14株为散发克隆。MLST分型则分为8个ST型,其中以ST131型为主,共有14株(占56%),另外还包括ST167型3株,ST2003型3株,其余ST型各有1株,这些ST型之间同源性相距较远。PFGE分型和MLST分型结果基本一致。结论目前我国杭州地区产KPC酶大肠埃希菌以ST131型为主,呈多重耐药性,并且在多家医院检出。耐药菌株的流行具有一定的病区集中性,如重症监护室、急诊科,其余多为散发菌株。 展开更多
关键词 碳青霉烯酶 大肠埃希菌 脉冲场凝胶电泳 多位点序列分型
原文传递
宁波副溶血性弧菌临床株毒力基因与多位点序列分型研究 被引量:4
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作者 高红 宋启发 +2 位作者 徐景野 郑剑 沈玄艺 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期240-243,共4页
目的了解宁波地区副溶血性弧菌临床分离株毒力基因分布以及分子分型特征。方法收集来源于食物中毒和散发腹泻患者副溶血弧菌菌株,利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测耐热直接溶血素基因(tdh)和耐热直接溶血素相关... 目的了解宁波地区副溶血性弧菌临床分离株毒力基因分布以及分子分型特征。方法收集来源于食物中毒和散发腹泻患者副溶血弧菌菌株,利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测耐热直接溶血素基因(tdh)和耐热直接溶血素相关溶血素基因(trh),利用多位点序列分型(multi-locus sequence typing,MLST)进行分子分型。结果2006—2012年共分离临床株248株,选择48株进行毒力基因和MLST分型研究。42株tdh+,为93.75%;11株trh+,为22.92%。48株菌株可分为9个ST型和一个未分型,ST3有32株,占66.67%;ST265有5株,占10.42%;ST120有3株,占6.25%。ST3克隆群中tdh+/trh-菌株有25株,占78.16%。与全国其他地区比较,在宁波临床株中发现ST262。结论 tdh+型是宁波地区副溶血性弧菌优势菌株。有9种ST型,以ST3克隆为主,其次为ST265和ST120。ST3克隆中以tdh+/trh-型为主。另发现1个独特的ST262菌株。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 耐热直接溶血素基因 耐热直接溶血素相关溶血素基因 多位点序列分型
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广州腹泻与健康非腹泻人群产气荚膜梭菌检出率及MLST分型
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作者 姚淑雯 邹洁 +3 位作者 钟华敏 杨敏 龙燕 梁秉绍 《检验医学与临床》 2024年第3期289-293,共5页
目的比较广州地区腹泻和健康非腹泻人群粪便中产气荚膜梭菌的检出率和序列分型的差异。方法此项前瞻性研究共收集了广州医科大学附属妇女儿童医疗中心2021年10—12月诊断为腹泻和健康非腹泻人群的粪便标本和腹泻患者大便肛管保存液标本... 目的比较广州地区腹泻和健康非腹泻人群粪便中产气荚膜梭菌的检出率和序列分型的差异。方法此项前瞻性研究共收集了广州医科大学附属妇女儿童医疗中心2021年10—12月诊断为腹泻和健康非腹泻人群的粪便标本和腹泻患者大便肛管保存液标本296例,按照标本类型与人群的不同,分为腹泻儿童粪便组(104例)、腹泻儿童肛管组(68例)、非腹泻儿童粪便组(30例)和非腹泻成人粪便组(94例)。采用疱肉培养基增菌并转血平板厌氧培养,分离并鉴定产气荚膜梭菌。从各组中随机选取部分产气荚膜梭菌进行多位点序列分型(MLST)。结果腹泻儿童粪便组产气荚膜梭菌检出率为36.5%(38/104);腹泻儿童肛管组产气荚膜梭菌检出率为16.2%(11/68);非腹泻儿童粪便组产气荚膜梭菌检出率为46.7%(14/30);非腹泻成人粪便组产气荚膜梭菌检出率为53.2%(50/94)。非腹泻人群(包括成人和儿童)产气荚膜梭菌检出率[51.6%(64/124)]比腹泻人群高[23.8%(41/172)],差异有统计学意义(P=0.02)。34株产气荚膜梭菌共分为31种序列(ST)型,以ST210最多,占8.82%,共发现18种新ST型,占52.92%。结论广州地区产气荚膜梭菌在腹泻和非腹泻人群粪便的检出率较高,且检测出不溶血型菌株。MLST分型为产气荚膜梭菌病原学溯源提供可靠依据。 展开更多
关键词 产气荚膜梭菌 腹泻 食物中毒 检出率 多位点序列分型 全基因组测序
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