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水稻粳型亲籼系S-b座位基因型鉴定 被引量:7
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作者 丁效华 张泽民 +2 位作者 曾瑞珍 李文涛 张桂权 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期297-301,共5页
S b是控制水稻籼粳亚种间杂种不育性的基因座位之一。在该座位 ,台中 65的基因型为Sj/Sj,广陆矮 4号的基因型为Si/Si。以台中 65和广陆矮 4号为遗传测验种 ,分别与 4个粳型亲籼系配组 ,根据紧密连锁分子标记基因型在这些组合F2 群体中... S b是控制水稻籼粳亚种间杂种不育性的基因座位之一。在该座位 ,台中 65的基因型为Sj/Sj,广陆矮 4号的基因型为Si/Si。以台中 65和广陆矮 4号为遗传测验种 ,分别与 4个粳型亲籼系配组 ,根据紧密连锁分子标记基因型在这些组合F2 群体中的偏态分离程度 ,测定了这 4个粳型亲籼系在F1花粉不育性S b基因座位的基因型 ,结果表明 ,G2 416 3和G2 417 2 1在S b基因座位的基因型为Si/Si,而G2 60 5和G3 0 0 4 4的基因型为Sn/Sn。比较了不同粳型亲籼系S b基因座位等位基因遗传效应的大小 ,结果表明G2 416 3携带的Si基因与G2 417 2 1携带的Si基因之间 ,以及G2 60 5携带的Sn基因与G3 0 0 4 4携带的Sn基因之间没有显著差异 。 展开更多
关键词 水稻 粳型亲籼系 花粉不育性 复等位基因 微卫星标记
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水稻粳型亲籼系S-c座位基因型分析 被引量:4
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作者 丁效华 张泽民 +1 位作者 曾瑞珍 张桂权 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2007年第4期5-8,共4页
S-c是控制水稻籼粳亚种间杂种F1花粉不育性的基因座位之一。在该座位,台中65的基因型为Sj/Sj,广陆矮4号的基因型为Si/Si。以台中65和广陆矮4号为遗传测验种,分别与4个粳型亲籼系配组,根据部分F2群体中植株花粉育性表型及与S-c紧密连锁... S-c是控制水稻籼粳亚种间杂种F1花粉不育性的基因座位之一。在该座位,台中65的基因型为Sj/Sj,广陆矮4号的基因型为Si/Si。以台中65和广陆矮4号为遗传测验种,分别与4个粳型亲籼系配组,根据部分F2群体中植株花粉育性表型及与S-c紧密连锁分子标记基因型的偏态分离程度,测定了这4个粳型亲籼系在S-c座位的基因型,结果表明,G2416-3的基因型为Si-2/Si-2;G2605和G3004-4的基因型均为Si-1/Si-1;G2417-2-1的基因型为Sn/Sn。本文还对F1花粉不育性基因遗传分化的测定方法进行了讨论。 展开更多
关键词 水稻 粳型亲籼系 花粉不育性 复等位基因 微卫星标记
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Sanger Sequencing for Molecular Diagnosis of SARS-CoV-2 Omicron Subvariants and Its Challenges
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作者 Sin Hang Lee 《Journal of Biosciences and Medicines》 CAS 2022年第9期182-223,共42页
Large population passages of the SARS-CoV-2 in the past two and a half years have allowed the circulating virus to accumulate an increasing number of mutations in its genome. The most recently emerging Omicron subvari... Large population passages of the SARS-CoV-2 in the past two and a half years have allowed the circulating virus to accumulate an increasing number of mutations in its genome. The most recently emerging Omicron subvariants have the highest number of mutations in the Spike (S) protein gene and these mutations mainly occur in the receptor-binding domain (RBD) and the N-terminal domain (NTD) of the S gene. The European Centre for Disease Prevention and Control (eCDC) and the World Health Organization (WHO) recommend partial Sanger sequencing of the SARS-CoV-2 S gene RBD and NTD on the polymerase chain reaction (PCR)-positive samples in diagnostic laboratories as a practical means of determining the variants of concern to monitor possible increased transmissibility, increased virulence, or reduced effectiveness of vaccines against them. The author’s diagnostic laboratory has implemented the eCDC/WHO recommendation by sequencing a 398-base segment of the N gene for the definitive detection of SARS-CoV-2 in clinical samples, and sequencing a 445-base segment of the RBD and a 490 - 509-base segment of the NTD for variant determination. This paper presents 5 selective cases to illustrate the challenges of using Sanger sequencing to diagnose Omicron subvariants when the samples harbor a high level of co-existing minor subvariant sequences with multi-allelic single nucleotide polymorphisms (SNPs) or possible recombinant Omicron subvariants containing a BA.2 RBD and an atypical BA.1 NTD, which can only be detected by using specially designed PCR primers. In addition, Sanger sequencing may reveal unclassified subvariants, such as BA.4/BA.5 with L84I mutation in the S gene NTD. The current large-scale surveillance programs using next-generation sequencing (NGS) do not face similar problems because NGS focuses on deriving consensus sequence. 展开更多
关键词 eCDC WHO Sanger Sequencing Omicron Variant Minor Subvariants BA.4/BA.5 L84I BA.2 multi-allelic RECOMBINANT
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一个新的棉花腺体形成基因的遗传鉴定 被引量:10
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作者 张天真 张雪林 +2 位作者 金林 陈兆夏 郭旺珍 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期75-79,共5页
湘X9628陆地棉突变体具有植株有腺体、种子低棉酚的特性。种子棉仁中的棉酚含量为 0.0354%,低于国家标准。它的种子无腺体,当种子萌发后,长出的真叶有腺体,但比常规陆地棉品种 少。遗传分析表明,控制湘X9628植株... 湘X9628陆地棉突变体具有植株有腺体、种子低棉酚的特性。种子棉仁中的棉酚含量为 0.0354%,低于国家标准。它的种子无腺体,当种子萌发后,长出的真叶有腺体,但比常规陆地棉品种 少。遗传分析表明,控制湘X9628植株有腺体、种子低棉酚特性由二对重叠隐性基因所控制。等位性 测验表明,其中一对基因是gl2的等位基因,另一对是gl3的复等位基因,并且对gl3表现为隐性。因 此,这是一个新发现的棉花腺体形成基因。按照棉花基因命名的规则,我们建议把控制湘X9628植株 有腺体、种子低棉酚特性的基因定名为gl3n。 展开更多
关键词 陆地棉 腺体发生 遗传分析 复等位基因
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