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高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其分子流行病学分析 被引量：387
1
作者 童光志 周艳君 +4 位作者 郝晓芳 田志军 仇华吉 彭金美 安同庆 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期323-327,共5页
为了弄清2006年在我国南方一些猪场暴发的一种以高热、高发病率和高死亡率为特征的传染病的病因,我们从12个省市48个发病猪场采集临床样品进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的... 为了弄清2006年在我国南方一些猪场暴发的一种以高热、高发病率和高死亡率为特征的传染病的病因,我们从12个省市48个发病猪场采集临床样品进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的分离鉴定和分子流行病学分析。结果显示从48个猪场样品中均检测出了PRRSV,通过完整的ORF5和部分Nsp2基因序列比较分析发现来自12个省市不同猪场的PRRSV高度同源,而且在Nsp2基因上都有两个相同位点的缺失;从分离的15株PRRSV中选择湖南分离株HuN4人工感染5头60日龄的健康猪,结果5头猪分别在7 d～21 d内全部死亡,感染猪的临床症状和现地所见十分相似。本次试验结果表明新出现的以Nsp2基因部分缺失为特征的PRRSV对猪是高致病性的,可能是2006年大部分猪场暴发"高热综合症"的主要病因。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 高热综合症 分子流行病学
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耐甲氧西林金黄色葡萄球菌分子流行病学研究 被引量：163
2
作者 李春辉 吴安华 +4 位作者 黄昕 李洁 李宪 黄勋 文细毛 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期1032-1035,共4页
目的研究湖南省4所综合医院分离耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）分子流行病学特点，为临床预防、监测MRSA的流行，并制定合理的防治方案提供确实可靠的依据。方法采用质粒图谱分析4所医院MRSA是否存在质粒流行，并分析其型别；采用RAP... 目的研究湖南省4所综合医院分离耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）分子流行病学特点，为临床预防、监测MRSA的流行，并制定合理的防治方案提供确实可靠的依据。方法采用质粒图谱分析4所医院MRSA是否存在质粒流行，并分析其型别；采用RAPD分析对住院患者、环境、医务人员分离的MRSA进行同源性分析。结果对89株MRSA进行质粒图谱分析，有7株未检测到质粒，82株携带有质粒，可分为17型，4所医院MRSA均存在1～2种主要质粒的流行；经RAPD分型89株MRSA可分为A、B、C、D、E5型，其中A型85株占所有菌株的95．50％，B型1株、C型1株、D型1株、E型1株。结论质粒图谱分析及RAPD分型方法可很好用于MRSA分子流行病学分析，医院MRSA临床株与环境株及湖南省4所综合医院之间MRSA菌株具有同源性，呈暴发流行。 展开更多
关键词 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 分子流行病学 质粒图谱 RAPD分型
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呼吸机相关肺炎内源性感染途径的分子流行病学研究 被引量：153
3
作者 李华茵 何礼贤 +3 位作者 胡必杰 王葆青 陈雪华 马伟 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 2004年第2期121-125,共5页
目的　用分子流行病学方法研究呼吸机相关肺炎 (VAP)内源性感染途径在VAP发病机制中的作用 ,为探索和发展全新的VAP预防措施提供理论依据。方法　通过前瞻性队列研究 ,动态采集重症监护病房 (ICU)人工气道 (artificialairway ,AA)包括... 目的　用分子流行病学方法研究呼吸机相关肺炎 (VAP)内源性感染途径在VAP发病机制中的作用 ,为探索和发展全新的VAP预防措施提供理论依据。方法　通过前瞻性队列研究 ,动态采集重症监护病房 (ICU)人工气道 (artificialairway ,AA)包括气管插管或气管切开患者胃腔、口咽部、下呼吸道标本行病原菌培养和药敏试验 ;筛选VAP患者中下呼吸道、胃液和 (或 )咽拭子标本中所分病原菌生化反应结果相同并有先后定植次序者 ;通过PFGE方法分析这些病原菌是否具有同源性。结果　 98例人工气道机械通气患者中 5 2例发生VAP ;表型分析 5 2例VAP患者有 13例下呼吸道病原菌呈现胃腔→口咽部→下呼吸道的逆向定植次序 ;3例出现胃腔→下呼吸道的定植次序 ;病原菌的PFGE同源性分析表明ICU中 5 2例VAP患者有 15例 (其中 14例为晚发性VAP)存在胃腔→下呼吸道逆向内源性感染途径 ,占VAP发病总数的 2 8 8% ;PFGE技术方法为分析病原菌同源性的有效方法。结论　病原菌的PFGE同源性分析表明ICU中VAP患者存在胃腔→下呼吸道逆向内源性感染途径。 展开更多
关键词 呼吸机 肺炎 分子流行病学 脉冲场凝胶电泳
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乙型肝炎病毒基因型和血清亚型在我国部分地区的分布及其特点 被引量：131
4
作者 夏国良 Omana V Nainan +6 位作者 贾志远 刘洪斌 罗述斌 李荣成 曹慧霖 刘崇柏 HaroldS Margolis 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期348-351,共4页
目的　研究乙型肝炎病毒 (hepatitisBvirus ,HBV)基因型和血清亚型的分布特点及其基因的相关性。方法　湖南、广西、河南和河北 4省 (区 ) 2 5个县 (市 ) 2 80例慢性HBV携带者 ,应用聚合酶链反应 (PCR)扩增和脱氧核糖核酸 (DNA)序列分... 目的　研究乙型肝炎病毒 (hepatitisBvirus ,HBV)基因型和血清亚型的分布特点及其基因的相关性。方法　湖南、广西、河南和河北 4省 (区 ) 2 5个县 (市 ) 2 80例慢性HBV携带者 ,应用聚合酶链反应 (PCR)扩增和脱氧核糖核酸 (DNA)序列分析 ,确定HBV基因型和血清亚型。结果　HBV基因型B、C和D均有分布 ,分别占 2 9.3%、6 7.9%和 2 .9% ,其中B和C为优势基因型。adr、adw2、ayr、ayw1、ayw2和ayw3等 6种血清亚型均有分布 ,其中adr和adw2为优势血清亚型 ,分别占6 4.3%和 31.4%。基因型B与adw2血清亚型 ,基因型C与adr血清亚型有非常密切的基因相关性。 2 80例HBV携带者表面抗原基因序列每 10 0个核苷酸的平均置换频数为 2 .94。基因型B(adw2血清亚型 )毒株核苷酸置换频数为 5 .6 3(5 .48) ,而基因型C(adr血清亚型 )仅为 1.6 (1.5 1)。结论　HBV基因型和血清亚型的分布均有明显的地区性 ;基因型B及相对应的adw2血清亚型毒株的基因可变性明显高于基因型C及相应的adr血清亚型。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 流行病学 分子 基因型 血清亚型
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肠道病毒71型的RT-PCR诊断及基因特征 被引量：133
5
作者 崔爱利 许文波 +7 位作者 李秀珠 胡家瑜 凌华 唐伟 杨智宏 张燕 陈立 Hiroyuki Shimizu 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期160-165,共6页
2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,... 2002～2003年从上海市和重庆市手足口病患儿的疱液标本中分离到10株病毒,其中上海9株,重庆1株。利用两对分别针对EV71和Cox.A16病毒VP1区的特异性引物,用RT PCR方法对病毒进行初步鉴别。根据PCR所用引物及PCR扩增出的产物片段大小不同,可初步判定出EV71和Cox.A16病毒的血清型别。RT PCR结果提示,上海分离到的9株病毒中,有2株为EV71,其余7株病毒为Cox.A16;重庆分离到的1株病毒为EV71。10株病毒的RT PCR产物经序列测定和分析证实,PCR定型结果正确,说明PCR法具有很高的特异性,可作为EV71初步鉴定的首选方法。对所分离的3株EV71病毒进行VP1区编码基因全序列的测定和遗传学分析,通过同源性比较和构建系统发生树发现,此3株EV71病毒和中国大陆已发表的7株EV71病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26和CHN 87)全部属于C基因型,与该型代表株比较,同源性为89 3%～94 6%;与A、B基因型代表株比较,同源性为81 3%～84 0%,差异较大。在C基因型中,此3株EV71病毒和中国大陆先前分离的6株病毒(SHZH03、SHZH98、SH F1、SH F2、SH H25、SH H26)的同源性较高,在94 5%～100%范围内。在系统发生树上,这9株病毒形成一个较独立的分支。与CHN 87株的同源性在92 1%～93 6%之间。与已知的C1、C2、C3亚型代表株比较,同源? 展开更多
关键词 肠道病毒71型 RT-PCR 诊断 基因 分子流行病学
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产ESBL肺炎克雷伯菌医院感染分子流行病学研究 被引量：133
6
作者 周清德 缪竞智 张秀珍 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 2000年第1期10-12,共3页
目的　明确产 ESBL 肺炎克雷伯菌医院感染发生率及其流行病学特征。方法　收集、鉴定分离菌株 ,进行药敏实验和 ESBL 检测 ;PCR扩增 bla TEM和 bla SHV基因 ;等电聚焦测定 β-内酰胺酶的等电点 ( p I)、染色体 DNA的PFGE分型以及进行病... 目的　明确产 ESBL 肺炎克雷伯菌医院感染发生率及其流行病学特征。方法　收集、鉴定分离菌株 ,进行药敏实验和 ESBL 检测 ;PCR扩增 bla TEM和 bla SHV基因 ;等电聚焦测定 β-内酰胺酶的等电点 ( p I)、染色体 DNA的PFGE分型以及进行病例资料分析。结果　共分离到 10 4株非重复肺炎克雷伯菌 ,产 ESBL 株占 13 .5 %。医院感染株 ESBL 阳性率 ( 2 8.3 % )明显高于院外感染株 ( 3 .6% ) ;ESBL 阳性菌对 CPD、CTX、CAZ、CTR、ATM、FOX、CIP和 GEN的中敏或耐药率分别为 92 .9%、92 .9%、3 5 .7%、92 .8%、78.6%、7.1%、2 8.6%和 4 2 .9% ,但对IMP10 0 %敏感 ;β-内酰胺酶等电聚焦分析及 bla TEM和 bla SHV基因检测结果 ,提示该院流行的 ESBL 主要为 SHV类 ;PFGE分析证实在干部 1病区、SICU和 RICU存在产 ESBL 菌株流行。结论　该医院存在产 ESBL 肺炎克雷伯菌医院感染流行 ;合理使用抗生素 ,加强消毒隔离措施 ,严格遵守无菌操作规程和屏障护理 ,是控制医院感染流行的重要措施。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 医院内感染 分子流行病学 肺炎
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我国部分地区NDV的分子流行病学研究 被引量：101
7
作者 曹殿军 郭鑫 +4 位作者 梁荣 闫丽辉 刘培欣 闵平 陈杰 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期29-32,共4页
本研究根据新城疫病毒 (NDV)F基因编码区 1_374位核苷酸序列计算其遗传距离并绘制了NDV的系统发育进化树 ,将 6 8株NDV分为 9个基因型 (30株为国内分离株 ) ,其中Ⅰ～Ⅵ是早已存在的老基因型 ,Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ为新发现的基因型 ,特别是Ⅸ为... 本研究根据新城疫病毒 (NDV)F基因编码区 1_374位核苷酸序列计算其遗传距离并绘制了NDV的系统发育进化树 ,将 6 8株NDV分为 9个基因型 (30株为国内分离株 ) ,其中Ⅰ～Ⅵ是早已存在的老基因型 ,Ⅶ、Ⅷ、Ⅸ为新发现的基因型 ,特别是Ⅸ为我国特有的基因型 (F48E9、M3、HLJ_3、HeB_1P和NM_5 )。 1997～ 1999年在我国云南、广西、甘肃、陕西、新疆等地分离的YN_1P、GX_3、H1、H2、P1、GX_1、GX_2、GS_2、GS_3、SHX_2、SHX_3、SHX_6、SHX_7、XJ_2和 1991年分离的HuB_1均属于Ⅶ基因型 ,该基因型的病毒是 90年代以来引起新城疫发生的主要病原。根据遗传距离和分离年代可将此基因型进一步划分为 5个基因亚型 ,分别是Ⅶa、Ⅶb、Ⅶc、Ⅶd和Ⅶe。此外HuN_1/ 98、HLJ_4/ 95和HeH_1P属一个老的基因Ⅵ ,1979～ 1985年分离自青海的QH_1、QH_2、QH_4属于一个新的基因型—Ⅷ型。可见在我国新城疫的流行是极其复杂的 ,既有老基因型的危险 (Ⅰ～Ⅵ ) ,又有新基因型 (Ⅶ )的流行 ,更有我国独特Ⅷ和Ⅸ基因型潜伏。 展开更多
关键词 新城疫病毒 F基因 系统发育进化树 分子流行病学 中国
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2011～2013年福建省手足口病相关病原柯萨奇病毒A组6型的分子流行病学研究 被引量：90
8
作者 陈炜 翁育伟 +7 位作者 何文祥 张拥军 杨秀惠 黄萌 谢剑锋 王金章 郑奎城 严延生 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期624-629,共6页
为揭示2011~2013年福建省手足口病相关病原其它肠道病毒中优势血清型柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的分子流行病学特征,我们收集2011~2013年福建省确诊为其它肠道病毒个人的1340例手足口病的病例标本,进行病毒培养和鉴定... 为揭示2011~2013年福建省手足口病相关病原其它肠道病毒中优势血清型柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）的分子流行病学特征,我们收集2011~2013年福建省确诊为其它肠道病毒个人的1340例手足口病的病例标本,进行病毒培养和鉴定分型,对其中优势血清型CVA6进行完整VP1区基因片段的扩增测序和分析。共分型鉴定出其它肠道病毒病例375例,其中CVA6病例182例（占48.5%）。CVA6病例在2011~2013年福建省手足口病病原谱的年度构成比分别为7.9%、16.2%和39.6%。与手足口病总体疫情相比,CVA6病例在地区、性别、年龄组分布没有特异性,致重症率较低。VP1区基因序列分析显示,CVA6福建分离株与原型株的核苷酸序列差异较大（16.2%~18.6%）,氨基酸序列差异为4.3%~6.2%。进化分析显示,CVA6福建分离株与原型株及国外地区分离株的亲缘关系远,与国内地区分离株的亲缘关系近。CVA6福建分离株在进化树的分布呈多个分支。结果表明,2011~2013年福建省手足口病病原谱发生较大变化,CVA6成为手足口病主要的病原之一。CVA6福建分离株与国内地区相应分离株共进化共循环,在福建至各个地区呈多条亲缘关系接近传播链同时流行。 展开更多
关键词 手足口病 柯萨奇病毒A6 分子流行病学
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铜绿假单胞菌耐药基因的分子流行病学研究 被引量：75
9
作者 金辉 糜祖煌 +2 位作者 钱小毛 李智山 黄支密 《中华医院感染学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期134-136,共3页
目的了解不同地区临床分离铜绿假单胞菌耐药基因的流行现状。方法对临床分离的104株铜绿假单胞菌采用ATB细菌鉴定仪鉴定菌种和K—B法测定抗菌药物的敏感性，利用聚合酶链反应（PCR）检测耐药基因（16种）和多分子标志法聚类分析菌株的... 目的了解不同地区临床分离铜绿假单胞菌耐药基因的流行现状。方法对临床分离的104株铜绿假单胞菌采用ATB细菌鉴定仪鉴定菌种和K—B法测定抗菌药物的敏感性，利用聚合酶链反应（PCR）检测耐药基因（16种）和多分子标志法聚类分析菌株的亲缘性。结果3个地区铜绿假单胞菌对亚胺培南的耐药率依次为51．3％、80．0％和100．0％，对第三代头孢菌素的耐药率为48．2％～100．0％，耐药基因oprD2缺失率为90％～100％；多重耐药基因标志的菌株显示存在克隆传播现象，但绍兴地区流行耐药株以oprD2的缺失为主，湖州地区则以TEM、oprD2缺失、aac（3）-Ⅱ、ant（3”）-Ⅰ、qacEΔ1为主。结论3个地区临床分离的铜绿假单胞菌呈多重耐药，并由克隆传播导致医院感染，但耐药的机制并不相同。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 多重耐药基因 分子流行病学
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2012―2013年猪繁殖与呼吸综合征病毒河南流行株的分离鉴定及分子流行病学调查 被引量：78
10
作者 周峰 常洪涛 +6 位作者 赵军 陈陆 王新卫 刘红英 姚慧霞 王川庆 杨霞 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1398-1404,1410,共8页
为了解河南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和发展趋势。通过RT-PCR方法,对2012―2013年采自河南省各地疑似病料进行PRRSV检测,并对阳性病料进行病毒分... 为了解河南地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)流行毒株的遗传变异情况和发展趋势。通过RT-PCR方法,对2012―2013年采自河南省各地疑似病料进行PRRSV检测,并对阳性病料进行病毒分离鉴定及分子流行病学分析。结果显示:54份疑似病料中17份检测为阳性,阳性率为31.5%,并分离出3株PRRSV;通过完整的ORF5基因和部分NSP2基因序列遗传进化分析表明,河南地区流行毒株主要为美洲型PRRSV,且17份阳性样品中10份与高致病性猪繁殖与呼吸综合征病毒(HP-PRRSV)高度同源、2份与经典PRRSV高度同源、另外5份与美洲流行毒株NADC30高度同源,该类毒株的NSP2基因在不同部位存在393个核苷酸缺失,国内尚未见相关报道。结果表明,2012―2013年河南地区PRRSV主要流行毒株为HP-PRRSV,同时出现了新的变异毒株,使河南地区乃至我国PRRSV变异种类更加多样化,提示加强PRRSV流行及变异的监测十分必要。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 分离 分子流行病学 系统进化分析
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与氨基糖甙类抗生素耳毒性相关的线粒体12S rRNA突变的流行病学特征 被引量：72
11
作者 管敏鑫 赵立东 《中华耳科学杂志》 CSCD 2006年第2期98-105,共8页
线粒体DNA(mtDNA)12SrRNA是氨基糖甙类抗生素导致的非综合征型听力损失的一个突变热点区域。在这些突变位点中,位于12SrRNA高度保守的解码区的同质性的A1555G和C1494T突变与耳聋相关,这两个突变导致很多患者的氨基糖甙类抗生素中毒性耳... 线粒体DNA(mtDNA)12SrRNA是氨基糖甙类抗生素导致的非综合征型听力损失的一个突变热点区域。在这些突变位点中,位于12SrRNA高度保守的解码区的同质性的A1555G和C1494T突变与耳聋相关,这两个突变导致很多患者的氨基糖甙类抗生素中毒性耳聋。A1555G突变和C1494T突变会在12SrRNA的高度保守的A位形成新的1494C-G1555或1494U-A1555碱基对。这些改变使得12SrRNA在二级结构上与细菌的16SrRNA的相应区域的二级结构更加相似,因此,由于C1494T和A1555G突变在12SrRNA形成U-A和G-C配对使得氨基糖甙类抗生素的结合更加容易,这就是为何携带这些突变的人在接触了氨基糖甙类抗生素时会出现或加重耳聋的原因。携带C1494T和A1555G突变的细胞的生化特征是线粒体蛋白质合成的异常并随之引起细胞的呼吸功能异常。而且,当用含高浓度的巴龙霉素或新霉素的DMEM培养基来培养携带这两个突变的细胞系时,可以观察到这些细胞与对照细胞系相比会出现生长缺陷和线粒体内蛋白的翻译异常。这些观察为以下结论提供了直接的遗传和生化方面的证据,即A1555G和C1494T突变是导致氨基糖甙类抗生素诱导的非综合征型耳聋的致病性的mtDNA突变。而且,这些研究数据还为我们进行以下预测提供了有价值的信息和方法:(1)哪些患者有耳毒性风险;(2)提高使用氨基糖甙类抗生素治疗时的安全性;(3)逐渐减少耳聋的发生率。 展开更多
关键词 氨基糖甙类抗生素 非综合征性聋 线粒体DNA 分子流行病学
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中国艾滋病流行新变化及新特征 被引量：74
12
作者 何纳 《上海预防医学》 CAS 2019年第12期963-967,共5页
该文对我国过去10年来艾滋病流行出现的新变化新特点进行简要概述。当前我国艾滋病流行形势总体平稳,但地区差异显著。男男同性性行为者、老年男性人群中HIV感染风险较高,HIV基因亚型更加复杂,CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC的流行率不... 该文对我国过去10年来艾滋病流行出现的新变化新特点进行简要概述。当前我国艾滋病流行形势总体平稳,但地区差异显著。男男同性性行为者、老年男性人群中HIV感染风险较高,HIV基因亚型更加复杂,CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC的流行率不断上升,抗逆转录病毒治疗覆盖率显著提高,治疗效果显著,但未接受过抗病毒治疗的HIV感染者中原发性耐药率也显著增加。为应对我国艾滋病流行呈现出的新特点,需要适时调整艾滋病防控策略。 展开更多
关键词 艾滋病 高危人群 监测 分子流行病学 抗病毒治疗
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2009年我国部分地区禽白血病分子流行病学调查 被引量：70
13
作者 高玉龙 邵华斌 +7 位作者 罗青平 潘伟 秦立廷 孙芬芬 刘超男 高宏雷 祁小乐 王笑梅 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期32-35,43,共5页
为了解自2009年年初以来国内一些地区禽白血病流行情况及流行毒株的分子特征,我们从湖北、黑龙江、山东、辽宁、吉林、广东、宁夏、安徽8个省区39个鸡场采集疑似禽白血病病料样品178份,用ALV-A、ALV-B和ALV-J特异性引物,通过PCR方法进... 为了解自2009年年初以来国内一些地区禽白血病流行情况及流行毒株的分子特征,我们从湖北、黑龙江、山东、辽宁、吉林、广东、宁夏、安徽8个省区39个鸡场采集疑似禽白血病病料样品178份,用ALV-A、ALV-B和ALV-J特异性引物,通过PCR方法进行检测。结果表明,8个省的35个鸡场的124份病料中检出了ALV-J(69.7%);25份病料中检出了ALV-A(13.9%);7份病料中检出了ALV-B(3.9%)。14个分离毒株env基因氨基酸同源性为84.3%～99%;与J亚群原型毒株HPRS-103的氨基酸序列同源性为87.3%～98.2%;与其它J亚群env基因氨基酸序列同源性为83%～97.4%。遗传进化分析表明,14个ALV-J分离株分别分属于不同的分支。其中,LJL09DH02分离株与其它分离株及参考毒株的的亲缘关系最远,与HPRS-103的氨基酸同源性仅为87.3%。另外4个分离株的env基因与HPRS-103的氨基酸同源性低于93%,其余9株与HPRS-103的同源性较高(96.6%以上)。该调查结果表明,我国目前ALV的感染主要以J亚群为主,ALV-A和B同时存在。 展开更多
关键词 禽白血病 J亚群白血病 血管瘤 ENV基因 分子流行病学
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中国HIV分子流行病学30年 被引量：64
14
作者 汪宁 钟平 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期541-546,共6页
1981年6月5日，美国疾病预防控制中心《发病率与病死率周报》（MMWR）发表了Gottlied报告洛杉矶5名年轻男同性恋者感染罕见的卡氏肺囊虫肺炎，尽管该报告当时并未引起关注，但该日被定为艾滋病发现日。1982年9月，美国疾病预防控制中心... 1981年6月5日，美国疾病预防控制中心《发病率与病死率周报》（MMWR）发表了Gottlied报告洛杉矶5名年轻男同性恋者感染罕见的卡氏肺囊虫肺炎，尽管该报告当时并未引起关注，但该日被定为艾滋病发现日。1982年9月，美国疾病预防控制中心首次正式在MMWR将此病症命名为AIDS。1983年法国病毒学家Barre-Sinoussi等从1例AIDS患者淋巴结中分离出一种新的人类反转录病毒（LAV）。 展开更多
关键词 艾滋病病毒 分子流行病学 中国
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肠道病毒71型的分子流行病学现况 被引量：57
15
作者 檀晓娟 许文波 《中国疫苗和免疫》 CAS 2008年第4期361-367,共7页
目的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)是导致婴幼儿感染的重要病原之一,可引起多种疾病,具有较广的疾病谱。EV71可引起大规模的手足口病(Hand,Foot,and Mouth Disease,HFMD)爆发,也可引起脑干脑炎等神经系统感染,导致死亡。现对EV71... 目的肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV71)是导致婴幼儿感染的重要病原之一,可引起多种疾病,具有较广的疾病谱。EV71可引起大规模的手足口病(Hand,Foot,and Mouth Disease,HFMD)爆发,也可引起脑干脑炎等神经系统感染,导致死亡。现对EV71分子流行病学研究方法和研究进展进行综述,总结和分析了EV71各种基因型/亚型毒株的进化史及进化地位,对国际上EV71各种基因型/亚型的流行现况进行了概括总结。 展开更多
关键词 肠道病毒71型 分子流行病学
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中国人DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态及其与食管癌风险的关系 被引量：41
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作者 宋春英 谭文 林东昕 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第1期28-31,共4页
目的：研究碱基切除修复基因ＸＲＣＣ１单核苷酸多态与食管癌易感性的关系。方法：以ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法分析了食管癌病例（ ｎ＝２２２）和按性别、年龄频数配对的正常对照者（ ｎ＝４３３） ＸＲＣＣ１基因 Ｃ２６３０４Ｔ和 Ｇ２... 目的：研究碱基切除修复基因ＸＲＣＣ１单核苷酸多态与食管癌易感性的关系。方法：以ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法分析了食管癌病例（ ｎ＝２２２）和按性别、年龄频数配对的正常对照者（ ｎ＝４３３） ＸＲＣＣ１基因 Ｃ２６３０４Ｔ和 Ｇ２８１５２Ａ多态，并比较不同基因型与食管癌风险的关系以及基因多态与吸烟之间的交互作用对食管癌风险的影响。结果：在食管癌病人中ＸＲＣＣ１　２６３０４ＴＴ变异基因型频率为１２．６％，高于对照组的６．７％（Ｐ＜０．０５）；携带此种基因型个体发生食管癌的风险比携带其他基因型者高１． ８倍（校正的ＯＲ＝１．８３， ９５％ ＣＩ　１．０３～３．２４）。Ｇ２８１５２Ａ基因型频率在对照组和病例组中的分布无显著性差异（Ｐ＞０．０５），因而与食管癌风险无关。ＸＲＣＣ１基因这两个位点多态之间没有联合作用，但２６３０４ＴＴ基因型与吸烟之间有一定的协同作用，在吸烟与否和吸烟量两个层次，２６３０４ＴＴ基因型均与之有联合作用而增高食管癌风险。结论：ＤＮＡ碱基切除修复基因ＸＲＣＣ１多态可能在食管癌的发生过程中起一定作用。 展开更多
关键词 XRC1基因 DNA修复 食管肿瘤 基因多态性 分子流行病学
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中国猪流行性腹泻病毒分子流行病学研究进展 被引量：60
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作者 施标 董世娟 +2 位作者 朱于敏 于瑞嵩 李震 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第20期4362-4369,共8页
2010—2011年中国境内的猪流行性腹泻(PED)大流行给养猪业造成重大经济损失。因疫苗免疫无法控制疫病流行,因此学者普遍认为猪流行性腹泻病毒(PEDV)出现了新的变种。论文综合分析了这个时期国内学者PEDV分子流行病学的研究结果,又对国... 2010—2011年中国境内的猪流行性腹泻(PED)大流行给养猪业造成重大经济损失。因疫苗免疫无法控制疫病流行,因此学者普遍认为猪流行性腹泻病毒(PEDV)出现了新的变种。论文综合分析了这个时期国内学者PEDV分子流行病学的研究结果,又对国内新近分离的PEDV的11个毒株的全基因序列进行遗传进化分析,进一步确定了国内暴发流行的PEDV毒株已远离中国86年分离的毒株和欧洲毒株CV777,成为了一个新的基因型。毒株基因变异应该是造成免疫失败和仔猪死亡率高的主要原因。进一步分析发现分离毒株的全长基因序列和棘突蛋白(S)基因序列长度有差异,其他基因长度保守性强。S基因的变异率高于其他基因,特别是短期内基因突变主要发生于S基因。综合分析认为国内变异毒株虽与韩国毒株遗传关系较近,但从境内毒株衍生和进化而来的可能性更大。因2006年已经观察到PEDV的免疫失效和PED流行,2010—2011年PED集中暴发可能是病原长期突变和适应性积累的结果,提示今后应充分发挥全国动物疫病预警网络的作用,加强毒株进化检测和疫病预警,优化疫病的防控手段,降低疫病发生频次和规模,减小疫病发生损失。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻 病毒 分子流行病学
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多重耐药肺炎克雷伯菌分子流行病学及β内酰胺酶基因型研究 被引量：54
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作者 魏泽庆 陈亚岗 +2 位作者 俞云松 陈云波 马亦林 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期329-332,共4页
目的　了解重症监护病房 (ICU)分离的多重耐药肺炎克雷伯菌的同源性及其质粒介导的 β内酰胺酶基因型。 方法　对 6株临床分离的肺炎克雷伯菌进行浓度梯度法药敏试验、接合试验、β内酰胺酶等电聚焦电泳 (IEF)、脉冲场凝胶电泳 (PFGE)... 目的　了解重症监护病房 (ICU)分离的多重耐药肺炎克雷伯菌的同源性及其质粒介导的 β内酰胺酶基因型。 方法　对 6株临床分离的肺炎克雷伯菌进行浓度梯度法药敏试验、接合试验、β内酰胺酶等电聚焦电泳 (IEF)、脉冲场凝胶电泳 (PFGE)及聚合酶链反应 (PCR)产物克隆测序。 结果　 6株临床分离的肺炎克雷伯菌对多种抗菌药物耐药 ,其耐药表型、PFGE的条带及位置一致。 6株细菌的接合子均有等电点 (pIs) 5 .4 ,7.7,8.0 ,8.2和 8.4的条带 ,pI7.7的条带能被氯唑西林抑制 ,其他条带则能被克拉维酸抑制。PCR扩增接合子TEM、SHV和CTX M 1基因呈阳性反应 ,克隆测序分别为TEM 1、SHV 1 2和一新型 β内酰胺酶CTX M 2 2。 结论　 6株多重耐药肺炎克雷伯菌的质粒携带多个耐药基因并在ICU中引起一次小的医院感染流行。 展开更多
关键词 分子流行病学 克雷伯氏菌 肺炎 Β内酰胺酶 基因 质粒 耐药性
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HIV分子流行病学研究和实践进展 被引量：56
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作者 钟平 《新发传染病电子杂志》 2019年第3期137-144,共8页
本文系统地综述了近年来国内外艾滋病分子流行病学研究和实践方面的进展,主要从三个方面阐述了全球和中国HIV-1基因亚型和新型重组型病毒演变的现状、特点和趋势,以及正在发展的可助力于精准干预艾滋病流行的分子传播网络的最新研究进展... 本文系统地综述了近年来国内外艾滋病分子流行病学研究和实践方面的进展,主要从三个方面阐述了全球和中国HIV-1基因亚型和新型重组型病毒演变的现状、特点和趋势,以及正在发展的可助力于精准干预艾滋病流行的分子传播网络的最新研究进展,包括全球HIV-1亚型多样性和分布地域性、我国HIV-1亚型此消彼长、新型重组病毒频繁发生和HIV分子传播网络研究进入实践阶段。本文明确指出了HIV-1亚型和重组病毒多样性是阻碍遏制HIV流行的关键因素,并强调了基于分子簇的精准干预在助力控制艾滋病流行中的重要意义。本文将为从事艾滋病防治事业的公共卫生专业人员、医生以及实验室工作人员提供较新的信息,供读者进一步学习和参考。 展开更多
关键词 HIV/AIDS 分子流行病学 基因亚型 重组病毒 分子传播网络
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中国流行的麻疹病毒基因型和亚型趋势分析 被引量：54
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作者 张燕 姬奕昕 +5 位作者 朱贞 许松涛 蒋小泓 毛乃颖 崔爱利 许文波 《中国疫苗和免疫》 CAS 2009年第2期97-103,共7页
目的分析中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)1993～2006年本土麻疹病毒基因型和基因亚型的流行趋势。方法依据全国麻疹实验室网络监测数据库、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家麻疹实验室病毒学监测数据库,分析中国... 目的分析中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)1993～2006年本土麻疹病毒基因型和基因亚型的流行趋势。方法依据全国麻疹实验室网络监测数据库、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家麻疹实验室病毒学监测数据库,分析中国麻疹病毒分子流行病学资料。结果1993～2006年,从29个省(自治区、直辖市,下同)分离到748株麻疹病毒,其中743株为H1基因型,1株为H2基因型,1株为A基因型,3株为疫苗相关A基因型。在H1基因型中,684株为H1a基因亚型,50株为H1b基因亚型,9株为H1c基因亚型。从29个省分离到H1a基因亚型(西藏、湖北省未开展),H1b基因亚型只从10个省分离到,H1c基因亚型在1993～1994年从4个省分离到。自2000年以来,H1a基因亚型逐年成为优势流行亚型,并呈上升趋势;H1b基因亚型逐年转为弱势,其传播于2006年被阻断;而H1c基因亚型的流行自1995年已经消失。结论通过对1993～2006年中国29个省流行的麻疹病毒分子流行病学的系统研究,阐明了在麻疹控制和加速控制阶段中国流行的麻疹野病毒的基因变异规律,以及病毒基因型别在地域和年代上的分布,证实H1基因型是中国近14年麻疹病毒流行的绝对优势本土基因型,其中H1a逐渐成为中国近几年流行的绝对优势基因亚型。 展开更多
关键词 麻疹病毒 分子流行病学研究 H1基因型 基因亚型
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