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红火蚁实时荧光分子检测方法 被引量：18
1
作者 陈岩 陈乃中 +1 位作者 朱水芳 陈洪俊 《植物检疫》 2005年第4期204-206,共3页
根据GenBank上发表的火蚁属(Solenopsis)COI基因序列,手工设计了检测红火蚁(Solenopsisinvicta)的引物与探针。实时荧光PCR结果表明红火蚁样品可被成功地检测到,而近似种热带火蚁没有被检测到,同种不同虫态的个体得到一致结果。
关键词 红火蚁 COI基因 分子检测 实时荧光PCR GENBANK 基因序列 手工设计 近似种 虫态
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小麦纹枯病菌的分子检测 被引量：15
2
作者 陈怀谷 方正 +2 位作者 陈厚德 林玲 王裕中 《植物保护学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期261-265,共5页
小麦茎基部可寄居多种真菌,并可导致发褐、坏死等症状,与小麦纹枯病相混淆。为准确诊断小麦纹枯病,根据江苏省小麦茎基部常见寄居菌禾谷丝核菌 Rhizoctonia cerealis、立枯丝核菌 Rhi-zoctonia solani、长蠕孢菌 Helminthosporium spp.... 小麦茎基部可寄居多种真菌,并可导致发褐、坏死等症状,与小麦纹枯病相混淆。为准确诊断小麦纹枯病,根据江苏省小麦茎基部常见寄居菌禾谷丝核菌 Rhizoctonia cerealis、立枯丝核菌 Rhi-zoctonia solani、长蠕孢菌 Helminthosporium spp.、交链孢菌 Alternaria spp.、小麦全蚀病菌 Gaeumanno-myces graminis var.tritici 和禾谷镰刀菌 Fsarium graminearum rDNA 的 ITS 区段序列差别,设计合成了2对特异性扩增引物(DNF77+DNR554,DNF81+DNR564)用于小麦纹枯病菌检测。2对引物均能从小麦纹枯病菌株扩增到特异性的分子片段,说明设计的特异性引物可以用来检测小麦纹枯病菌。采集田间具有小麦纹枯病症状、茎基部变褐及健康麦苗,进行病原菌分离,同时提取这些麦苗茎基部 DNA,利用上述2对引物进行扩增。结果表明,仅从能分离到禾谷丝核菌的麦组织中扩增到约480bp 的特异性条带。说明设计的特异性引物可以对田间小麦纹枯病进行早期、快速分子诊断。 展开更多
关键词 小麦纹枯病菌 分子检测 RHIZOCTONIA 特异性引物 特异性扩增 禾谷丝核菌 病原菌分离 小麦全蚀病菌 设计合成 rDNA
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荧光实时定量PCR法检测流感病毒核酸的质控结果分析 被引量：6
3
作者 龙春平 孔令军 吴周建 《中国卫生检验杂志》 CAS 2008年第6期1107-1108,共2页
目的:通过参加湖南省2007年疾控机构分子生物学能力考核、实验室间比对试验结果,及时发现问题,启动分子生物学实验室并提高检测技术能力。方法:荧光实时定量PCR法2007年湖南省分子生物学能力考核表中的考核操作规程及7300型实时荧光定量... 目的:通过参加湖南省2007年疾控机构分子生物学能力考核、实验室间比对试验结果,及时发现问题,启动分子生物学实验室并提高检测技术能力。方法:荧光实时定量PCR法2007年湖南省分子生物学能力考核表中的考核操作规程及7300型实时荧光定量PCR的SDS软件操作。结果:根据湖南省CDC反馈结果,本中心的考核成绩为合格。结论:建立分子生物学实验室,同时要保证实验室结果的准确性,是我们分子生物学能力考核的主要任务。 展开更多
关键词 质量控制 分子生物学检验 比对试验
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橡胶树褐根病菌的分子检测 被引量：4
4
作者 梁艳琼 吴伟怀 +5 位作者 李锐 郑肖兰 郑金龙 习金根 贺春萍 易克贤 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期576-581,共6页
利用褐根病菌的一对特异性引物G1F/G1R,对不同来源橡胶树褐根病菌菌株的r DNA-ITS区进行PCR扩增,对发病组织进行分子检测,并构建橡胶树褐根病菌系统发育树。结果表明:10株不同来源橡胶树褐根病菌菌株DNA均能扩增出一条653 bp的特异性片... 利用褐根病菌的一对特异性引物G1F/G1R,对不同来源橡胶树褐根病菌菌株的r DNA-ITS区进行PCR扩增,对发病组织进行分子检测,并构建橡胶树褐根病菌系统发育树。结果表明:10株不同来源橡胶树褐根病菌菌株DNA均能扩增出一条653 bp的特异性片段,而橡胶树红根病菌、紫根病菌、臭根病菌、白根病菌和清水对照均无扩增条带。发病组织检测结果表明,该引物能特异性检测到橡胶树褐根病菌的存在。引物对基因组DNA检测灵敏度为100 ag/μL。基于r DNA-ITS系统发育分析结果表明,供试菌株与Gen Bank中的菌株KF233592、KM079591聚在同一分支上,其亲缘关系最近,均属于Phellinus noxius。 展开更多
关键词 橡胶树 褐根病菌 特异性引物 分子检测
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玉米纹枯病菌的分子检测 被引量：1
5
作者 刘震 傅俊范 +2 位作者 桑立君 陈良宇 李德全 《玉米科学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期181-185,共5页
近年来随着气候的变化和玉米种植密度的加大,玉米纹枯病发生日益严重,该病株残体残留在田土表面土层较浅的区域进行越冬。为准确诊断玉米纹枯病,根据玉米主要病害玉米大斑病、玉米弯孢菌叶斑病、玉米灰斑病rDNA的ITS区间序列差别,设计合... 近年来随着气候的变化和玉米种植密度的加大,玉米纹枯病发生日益严重,该病株残体残留在田土表面土层较浅的区域进行越冬。为准确诊断玉米纹枯病,根据玉米主要病害玉米大斑病、玉米弯孢菌叶斑病、玉米灰斑病rDNA的ITS区间序列差别,设计合成1对特异性扩增引物(LZ-F+LZ-R)用于玉米纹枯病检测。该引物能从玉米纹枯病菌扩增到特异性的分子片段,说明设计的特异性引物可以用来检测玉米纹枯病菌。采集田间玉米纹枯病、玉米大斑病、玉米弯孢菌叶斑病、玉米灰斑病病株样本进行病原菌分离,同时提取其病原菌和土壤总DNA,利用上述引物进行扩增。结果表明,只有以R.solani基因组DNA为模板通过反应体系在PCR仪中进行扩增最终能扩增出1条460 bp左右清晰的特异性条带,其他菌株均无特异性条带。利用该特异性引物只能从受到该病害侵染的发病组织DNA中扩增出特异性条带,对照及健康玉米植株均无扩增条带。接种该病原菌的土壤DNA也扩增出相应的特异性条带,表明特异性引物LZ-F/LZ-R可用于玉米纹枯病菌的分子检测和早期诊断。 展开更多
关键词 玉米 玉米纹枯病菌 分子检测 引物设计
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基因突变和单核苷酸多态性分析技术新进展 被引量：3
6
作者 廖晓兰 朱水芳 罗宽 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期447-451,共5页
基因突变和单核苷酸多态性分析是确定生物性状与某种遗传变异的关系、探讨生物物种内基因的差异、了解生物种间亲缘和进化的关键技术 ,对生物群体遗传学、生物分类学研究都有着重要的理论意义和实用价值 .对近2 0年来基因突变和单核苷... 基因突变和单核苷酸多态性分析是确定生物性状与某种遗传变异的关系、探讨生物物种内基因的差异、了解生物种间亲缘和进化的关键技术 ,对生物群体遗传学、生物分类学研究都有着重要的理论意义和实用价值 .对近2 0年来基因突变和单核苷酸多态性检测技术及应用的研究进展进行了全面概述 ,特别对 2 0世纪 90年代发展起来的几种最新技术进行了详细介绍 ,并展望了这些技术在农业上的应用前景 . 展开更多
关键词 基因突变 单核苷酸多态性 分子检测技术
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葡萄白粉病菌潜伏侵染量Real-time PCR检测方法建立
7
作者 王雯雯 张强强 +3 位作者 李玲 金婧 王若彤 顾沛雯 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期1368-1376,共9页
根据葡萄EF1-α基因序列设计引物F-g-6/R-g-6,根据葡萄白粉菌细胞色素P450基因序列设计特异性引物F-P450-Un/R-Un,分别建立葡萄叶片和葡萄白粉菌的real-time PCR检测方法,用于计算分子病情指数。结果表明:使用real-time PCR方法对酿酒... 根据葡萄EF1-α基因序列设计引物F-g-6/R-g-6,根据葡萄白粉菌细胞色素P450基因序列设计特异性引物F-P450-Un/R-Un,分别建立葡萄叶片和葡萄白粉菌的real-time PCR检测方法,用于计算分子病情指数。结果表明:使用real-time PCR方法对酿酒葡萄‘赤霞珠’叶片DNA和葡萄白粉菌DNA测定的灵敏度分别为10^(-2)和10^(-5) ng·μL^(-1),分别是常规PCR的100倍和1 000倍。同时建立葡萄叶片DNA和白粉菌DNA各自的标准曲线,标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,相关系数分别为0.99637和0.99564。利用建立的real-time PCR检测方法对葡萄尚未发病的30个田间样品进行检测,共检测到22个样品中含有葡萄白粉菌,其分子病情指数与18d后的田间病情指数极显著相关(相关系数为0.916)。建立的葡萄白粉菌潜伏侵染量real-timePCR分子检测体系,能够为葡萄白粉病的早期诊断和监测预警提供理论支持。 展开更多
关键词 葡萄 葡萄白粉菌 早期诊断 real-time PCR 分子病情指数 田间病情指数
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应用real-time PCR定量检测果园葡萄霜霉病菌潜伏侵染 被引量：2
8
作者 杜娟 李金 +3 位作者 张涛 张游 姚珮 顾沛雯 《江苏农业学报》 CSCD 北大核心 2021年第4期861-866,共6页
为明确葡萄霜霉病菌潜伏侵染阶段的菌量与病害发生的关系,本研究对贺兰山东麓宁夏立兰酒庄酿酒葡萄园3个试验样地进行采样调查,分析3个样地检测的分子病情指数(MDI)与果园田间调查的病情指数(DI)的相关性。结果表明,宁夏立兰酒庄酿酒葡... 为明确葡萄霜霉病菌潜伏侵染阶段的菌量与病害发生的关系,本研究对贺兰山东麓宁夏立兰酒庄酿酒葡萄园3个试验样地进行采样调查,分析3个样地检测的分子病情指数(MDI)与果园田间调查的病情指数(DI)的相关性。结果表明,宁夏立兰酒庄酿酒葡萄园3个样地的MDI和DI呈极显著相关,3个样地的MDI均与采样后15 d的DI拟合性最高;当MDI值为0.0035~0.1841时,采样后12 d葡萄霜霉病在果园零星发生。MDI大于0.0035时,可作为当地酿酒葡萄霜霉病防治预警指标。 展开更多
关键词 葡萄霜霉菌 real-time PCR 分子病情指数 田间病情指数
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