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中国境内不同地理型东方蜜蜂线粒体DNA tRNA^(leu)～COⅡ基因多态性研究 被引量：44
1
作者 姜玉锁 赵慧婷 +4 位作者 姜俊兵 曹果清 张桂贤 朱文进 郭传甲 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期1535-1542,共8页
【目的】从线粒体水平上探讨中国境内不同地理型东方蜜蜂的系统发育关系,为东方蜜蜂亚种分化的研究及我国境内东方蜜蜂资源的保护与合理开发利用提供基础资料。【方法】采用公开的E2、H2引物对11个不同地理型东方蜜蜂线粒体DNA tRNAleu... 【目的】从线粒体水平上探讨中国境内不同地理型东方蜜蜂的系统发育关系,为东方蜜蜂亚种分化的研究及我国境内东方蜜蜂资源的保护与合理开发利用提供基础资料。【方法】采用公开的E2、H2引物对11个不同地理型东方蜜蜂线粒体DNA tRNAleu～COⅡ基因进行了PCR扩增、测序,并利用相关软件和网站进行了序列比较分析。【结果】该序列长度为471bp;序列中共有9个位点发生变异;序列相似性均在99%以上;限制性酶切分析表明:云南保山东方蜜蜂缺少一个SwaⅠ酶切位点;部分编码蛋白序列比对表明,海南海口和吉林安图东方蜜蜂各有一个氨基酸发生变异。与GeneBank上公开登录的国内外有关东方蜜蜂相关序列的比较表明,单纯利用非编码区序列对比,不能把日本蜜蜂同中国大陆的东方蜜蜂区别开来;COⅡ基因部分序列对比显示,东方蜜蜂的线粒体类型包括:日本-韩国型、中国大陆型、中国台湾型、马来西亚沙巴州-印度黑色蜜蜂型、中国海南型、印度黄色蜜蜂型、泰国南部型和印度黑色蜜蜂型。【结论】中国境内不同地理型东方蜜蜂存在着较明显的遗传分化,其中海南东方蜜蜂由于长期的海岛隔离形成了一个独特的类群,支持了通过形态学认定的海南东方蜜蜂为东方蜜蜂的一个新亚种的观点。本研究部分测序结果已在美国国家生物信息中心(NCBI)网站GeneBank上登录,登录号为:DQ385854,DQ388602～DQ388609。 展开更多
关键词 东方蜜蜂 线粒体dna 非编码区 细胞色素氧化酶Ⅱ 序列分析
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用dHPLC技术检测线粒体DNA编码区单核苷酸多态性 被引量：8
2
作者 刘雅诚 郝金萍 +3 位作者 严江伟 唐晖 王静 任嘉诚 《中国法医学杂志》 CSCD 2006年第3期142-146,共5页
目的研究线粒体DNA(m tDNA)编码区单核苷酸多态性,建立检测m tDNA编码区单核苷酸多态性(SNP)的变性高效液相色谱(dHPLC)方法。方法设计针对线粒体DNA编码区nt10287-10679及nt8507-8805引物,应用dHPLC技术检测其序列多态性。结果100例中... 目的研究线粒体DNA(m tDNA)编码区单核苷酸多态性,建立检测m tDNA编码区单核苷酸多态性(SNP)的变性高效液相色谱(dHPLC)方法。方法设计针对线粒体DNA编码区nt10287-10679及nt8507-8805引物,应用dHPLC技术检测其序列多态性。结果100例中国汉族无关个体中,m tDNA nt10287-10679检出13个SNP位点,13种单倍型,基因多样性(H)为70.79%,偶合概率(P)为29.92%;m tDNA nt8507-8805检出10个SNP位点,12种单倍型,H为70.42%,P为30.28%;两段序列联合起来共检出23个SNP位点,23种单倍型,H为84.14%,P为16.70%。结论所建立的dHPLC方法可用于快速、准确地检测m tDNA编码区序列多态性;m tDNA编码区多态性位点作为m tDNA控制区多态性位点的补充,联合应用可以提高m tDNA的个体识别能力。 展开更多
关键词 法医物证学 线粒体dna编码区 单核苷酸多态性 变性高效液相色谱
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林麝肺成纤维细胞线粒体全基因组结构特征及遗传变异分析 被引量：1
3
作者 唐可欣 伍茜 +9 位作者 付文龙 程建国 吴杰 周磊 王翔 赵位 任梓薇 李依濛 刘洁 罗燕 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期534-541,共8页
林麝(Moschus berezovskii)是一种具有较高经济价值和药用价值的保护野生动物。为深入研究林麝线粒体基因组的结构特征及遗传变异,基于IlluminaNovaSeq平台对林麝肺成纤维细胞FMD-C1线粒体进行全基因组测序,并进行特征注释、结构预测、... 林麝(Moschus berezovskii)是一种具有较高经济价值和药用价值的保护野生动物。为深入研究林麝线粒体基因组的结构特征及遗传变异,基于IlluminaNovaSeq平台对林麝肺成纤维细胞FMD-C1线粒体进行全基因组测序,并进行特征注释、结构预测、序列分析和系统发育重建。结果显示,FMD-C1线粒体基因组序列全长为16351bp,共有13个蛋白编码基因(protein coding gene,PCG),22个tRNA,2个rRNA和两段非编码区,具有明显的AT偏好性。将序列上传至GenBank,登录号为MW879208。与NCBI上林麝的其余序列比对,FMD-C1的4个PCGs中检测出5个单氨基酸突变和3个插入氨基酸;D-loop区检测出19个差异碱基和2个碱基缺失。系统进化分析发现与林麝亲缘关系最近的是安徽麝。研究结果可为林麝的选育和遗传多样性保护提供参考依据,也为进一步探讨林麝肺部疾病线粒体水平的致病机制奠定基础。 展开更多
关键词 林麝 线粒体基因组 蛋白编码基因 非编码区 系统进化
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延边地区汉族群体线粒体DNA编码区五个部分序列多态性 被引量：1
4
作者 张永吉 徐京男 李哲 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期696-700,共5页
目的了解中国汉族群体线粒体DNA（mitochondrialDNA，mtDNA）5个编码区3954～4506nt、5218~5974nt、7942~871Int、10296410653nt及14496~14867nt的序列多态性。方法采用PCR产物直接测序方法，对200名吉林省延边地区汉族无关个体进行序... 目的了解中国汉族群体线粒体DNA（mitochondrialDNA，mtDNA）5个编码区3954～4506nt、5218~5974nt、7942~871Int、10296410653nt及14496~14867nt的序列多态性。方法采用PCR产物直接测序方法，对200名吉林省延边地区汉族无关个体进行序列多态性变化和单倍型分布调查。结果在200名无关个体中，共分出110种单体型。遗传变异度为0．9879，偶合概率为0．0171。测序结果与Anderson标准序列比较，共检测出81个变异位点，其中66个与MITOMAP收录的基因突变相同，15个未见收录。结论mtDNA编码区多态性位点作为mtDNA控制区多态性位点的补充，联合应用可以提高mtDNA的个体识别能力。而且可为中国汉族群体的法医学个人识别、亲权鉴定及民族遗传学研究提供宝贵的基础数据资料。 展开更多
关键词 线粒体dna 编码区 单核苷酸多态性
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肺癌患者外周血白细胞线粒体DNA突变研究 被引量：1
5
作者 胡义德 贾立明 +4 位作者 刘丽红 孙玉兰 孙恒文 钱桂生 房殿春 《重庆医学》 CAS CSCD 2004年第11期1712-1714,共3页
目的　分析mtDNAtRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在肺癌患者及健康成人外周血中的突变情况并探讨其意义。方法　一步法制备外周血白细胞mtDNA ,结合PCR产物直接测序 ,对比分析mtDNAtRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在... 目的　分析mtDNAtRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在肺癌患者及健康成人外周血中的突变情况并探讨其意义。方法　一步法制备外周血白细胞mtDNA ,结合PCR产物直接测序 ,对比分析mtDNAtRNAThr、tRNAPRO基因及非编码HVRⅠ区序列在 17例肺癌患者和 14例健康成人外周血白细胞中的突变情况。结果　肺癌组和健康成人组中 ,仅 1例健康成人mtDNA编码区tRNAThr基因中出现了 1个碱基变异 ,碱基平均变异率为 0 .0 2 37% ,而非编码HVRⅠ区共发现 136个变异 ,碱基平均变异率为 1.2 82 8%。肺癌组和健康成人组碱基平均变异率分别为 1.2 384 %和 1.336 7%。肺癌组中腺癌、鳞癌、小细胞癌的碱基平均变异率分别为 0 .994 2 %、1.2 0 2 1%和 1.75 4 4 %。结论　肺癌患者外周血白细胞mtDNA编码区序列趋于高度保守 ,主要碱基变异发生在非编码HVRⅠ区 ,与健康成人相应区域变异率总体上趋于一致 ,但肺癌组人均碱基变异随年龄增长有增高趋势 ,且小细胞肺癌外周血白细胞mtDNA非编码HVRⅠ区碱基平均变异率有增高趋势。 展开更多
关键词 肺肿瘤 线粒体dna 非编码区 高变Ⅰ区 突变
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中国朝鲜族群体mtDNA编码区3954—4506nt序列多态性
6
作者 张永吉 徐京男 +1 位作者 张美花 韩松瑛 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期106-108,共3页
目的了解中国朝鲜族群体线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）编码区39544506nt的序列多态性。方法采用PCR产物直接测序方法对198名吉林省延边朝鲜族自治州朝鲜族无关个体进行单倍型分布调查。结果在198名无关个体中，共分出21种单倍... 目的了解中国朝鲜族群体线粒体DNA（mitochondrial DNA，mtDNA）编码区39544506nt的序列多态性。方法采用PCR产物直接测序方法对198名吉林省延边朝鲜族自治州朝鲜族无关个体进行单倍型分布调查。结果在198名无关个体中，共分出21种单倍型。遗传变异度为0．5906，偶合概率为0．4124。测序结果与Anderson序列比较，共检测出19个变异位点，14个与MITOMAP收录的基因突变相同，5个未见收录。结论mtDNA编码区多态性位点作为mtDNA控制区多态性位点的补充，联合应用可以提高mtDNA的个体识别能力，为mtDNA在中国朝鲜族法医学鉴定提供了基础数据。 展开更多
关键词 线粒体dna 编码区 单核苷酸多态性 中周朝鲜族人群
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贵州四个民族人群线粒体DNA编码区的多态性 被引量：3
7
作者 李彬彬 钟复光 +4 位作者 易红生 王先然 李良芳 王丽兰 吴立甫 《中国比较医学杂志》 CAS 2010年第3期8-11,34,共5页
目的研究贵州土家族、侗族、仡佬族和彝族人群线粒体DNA(mtDNA)编码区的核苷酸多态性。方法采用PCR-RFLP技术和DNA测序法对贵州4个群体145例样本mtDNA编码区的8个SNP基因座及COⅡ/tRNAlys基因间9 bp缺失进行多态性分析。结果贵州4个民... 目的研究贵州土家族、侗族、仡佬族和彝族人群线粒体DNA(mtDNA)编码区的核苷酸多态性。方法采用PCR-RFLP技术和DNA测序法对贵州4个群体145例样本mtDNA编码区的8个SNP基因座及COⅡ/tRNAlys基因间9 bp缺失进行多态性分析。结果贵州4个民族群体的9 bp缺失频率依次为土家族18.4%,侗族29.7%,仡佬族25%,彝族16.7%,平均缺失频率为22.8%;在8个SNP基因座中,A10398G、C10400T突变在4个群体中较普遍;A663G、C5178A和G12406A突变在部分民族群体中也有较高的频率;共检测出14种单倍型,其中仡佬族11种,土家族10种,侗族8种,彝族6种。结论贵州4个民族群体mtDNA编码区可能存在不同的突变热点,在等位基因和单倍型分布频率上存在一定差异。 展开更多
关键词 贵州民族人群 线粒体dna 编码区 多态性
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癌细胞线粒体DNA CoⅡ及ATPase6基因结构探讨 被引量：2
8
作者 胡义德 钱桂生 曹世龙 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 1999年第1期37-39,共3页
目的探讨癌细胞ｍｔＤＮＡ基因编码区的结构特征。方法采用ＰＣＲ和ＰＣＲ产物ＨａｅⅢ限制性片段长度多态性分析方法，分析了６株人癌细胞系、８例癌患者及８例正常人白细胞线粒体ＣｏⅡ和ＡＴＰａｓｅ６基因的缺失和限制酶谱变化。结... 目的探讨癌细胞ｍｔＤＮＡ基因编码区的结构特征。方法采用ＰＣＲ和ＰＣＲ产物ＨａｅⅢ限制性片段长度多态性分析方法，分析了６株人癌细胞系、８例癌患者及８例正常人白细胞线粒体ＣｏⅡ和ＡＴＰａｓｅ６基因的缺失和限制酶谱变化。结果在６个癌细胞系、８例癌患者和８例健康成人白细胞ｍｔＤＮＡ中，两个基因片段均未出现缺失现象；６个癌细胞系及８例癌患者白细胞ｍｔＤＮＡＣｏⅡ和ＡＴＰａｓｅ６基因ＰＣＲ扩增片段ＨａｅⅢ的酶切位点一致，且与人ｍｔＤＮＡ剑桥序列相应区段ＨａｅⅢ酶切位点完全同源，与８例健康成人白细胞ｍｔＤＮＡ相应基因片段ＨａｅⅢ酶切位点比较，也具有非常高的同源性。结论癌细胞ｍｔＤＮＡ基因编码区结构非常稳定。 展开更多
关键词 癌 细胞系 白细胞 线粒体dna 基因编码区 结构
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法医线粒体DNA检测的系统效能及应用价值
9
作者 王旭东 徐跃 《吉林公安高等专科学校学报》 2009年第3期67-69,共3页
线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)遗传标记的检测在法医学实践中有着重要的价值。线粒体DNA异质性的出现,对检测体系的系统效能存在着影响,主要表现在对所检测样本的单倍型的认同及个体识别概率的计算上。通过建立mtDNA数据库,找出... 线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)遗传标记的检测在法医学实践中有着重要的价值。线粒体DNA异质性的出现,对检测体系的系统效能存在着影响,主要表现在对所检测样本的单倍型的认同及个体识别概率的计算上。通过建立mtDNA数据库,找出异质性在人群中的发生频率,并使检测异质性的方法标准化,对线粒体DNA的更有效检测具有重要意义;线粒体DNA编码区多态性位点在提高线粒体DNA系统效能中具有独到之处。因此,更进一步地进行mtDNA编码区多态性的探索,将进一步提高线粒体DNA检测的系统效能。 展开更多
关键词 线粒体dna(mtdna) 非编码区(控制区) 编码区 系统效能 异质性
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肺鳞癌患者线粒体DNA编码区序列突变研究 被引量：1
10
作者 刘丽红 胡义德 《中国肺癌杂志》 CAS 2007年第6期500-503,共4页
背景与目的吸烟是肺癌发病的重要因素,但吸烟在肺癌发生发展中的机制目前尚不清楚。本研究旨在分析肺鳞癌患者外周血白细胞、癌旁组织及癌组织线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)编码区序列的突变情况,并探讨其临床意义。方法应用改良... 背景与目的吸烟是肺癌发病的重要因素,但吸烟在肺癌发生发展中的机制目前尚不清楚。本研究旨在分析肺鳞癌患者外周血白细胞、癌旁组织及癌组织线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)编码区序列的突变情况,并探讨其临床意义。方法应用改良一步法制备15例肺鳞癌患者外周血白细胞、癌旁组织及癌组织mtDNA,PCR产物直接测序,对比分析编码区序列突变情况。结果15例肺鳞癌患者癌组织mtDNA编码区中,有11例(73.33%)发生突变,共发现18个突变,其中10例患者有长期吸烟病史。结论肺鳞癌患者mtDNA编码区突变可能与吸烟密切相关。 展开更多
关键词 肺鳞癌 线粒体dna 编码区 吸烟 突变
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