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脑梗死和脑出血患者外周血中循环microRNA表达谱差异的初步分析 被引量:21
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作者 李武英 金俊 +3 位作者 陈健 郭阳 汤郡 谭盛 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第11期1750-1753,共4页
目的:利用microRNA芯片研究急性脑梗死和脑出血患者循环血浆中是否存在相关的miRNAs及有表达差异的miRNAs。方法:分别收集急性脑梗死、脑出血患者和健康对照者全血各3例,运用Norgen血浆外泌体RNA提取试剂盒提取血浆总RNA并通过定量PCR... 目的:利用microRNA芯片研究急性脑梗死和脑出血患者循环血浆中是否存在相关的miRNAs及有表达差异的miRNAs。方法:分别收集急性脑梗死、脑出血患者和健康对照者全血各3例,运用Norgen血浆外泌体RNA提取试剂盒提取血浆总RNA并通过定量PCR进行质量和浓度检测。采用μParaflorTM microRNA芯片技术进行miRNAs表达谱研究。用相关软件和统计学方法进行数据分析。结果:在脑梗死和脑出血患者血浆中发现8个与脑卒中相关的miRNAs,且有显著差异性表达(P<0.05)。脑梗死和健康对照者、脑出血和健康对照者间分别有11、24个差异表达miRNAs,但两两比较上调或下调2倍以上的差异表达的miRNAs均无统计学意义(P>0.05)。结论:脑梗死和脑出血组间miRNA的表达差异可能与不同类型脑卒中的发生发展相关,可为进一步研究急性脑卒中发生的表观遗传学分子机制提供依据。 展开更多
关键词 脑梗死 脑出血 循环microrna microrna芯片
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microRNA在犬心房纤颤模型中的变化 被引量:16
2
作者 张莹 张勇 +6 位作者 蔡本志 冯铁明 李宝馨 乔国芬 王玲 吕延杰 杨宝峰 《哈尔滨医科大学学报》 CAS 北大核心 2007年第2期92-94,共3页
目的应用miRNA芯片技术研究小分子RNA(miRNA)对犬心房纤颤(AF)的调节作用,发现了AF的新机制,为新药研究提供了新的靶点。方法将杂种犬随机分为两组,假手术组(n=4);利用高频起搏器对右心耳进行刺激起搏诱发持续性AF组(n=5),取左心房组织... 目的应用miRNA芯片技术研究小分子RNA(miRNA)对犬心房纤颤(AF)的调节作用,发现了AF的新机制,为新药研究提供了新的靶点。方法将杂种犬随机分为两组,假手术组(n=4);利用高频起搏器对右心耳进行刺激起搏诱发持续性AF组(n=5),取左心房组织常规抽提总RNA,采用含有468种miRNA的芯片检测系统进行miRNA表达谱差异分析。结果和假手术组相比,AF模型组的miRNA表达谱中差异表达的miRNA共有10个,其中有4个miRNA上调,6个miRNA下调。结论miRNA参与了持续性AF的调节作用,提示miRNA是抗心律失常药物作用的新靶点。 展开更多
关键词 心房纤颤 microrna MIRNA芯片
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miR-193b对胃癌细胞浸润和转移的影响 被引量:13
3
作者 周海燕 王宽松 +1 位作者 胡忠良 文继舫 《中国普通外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期377-382,共6页
目的探讨miR-193b转染对胃癌细胞浸润、转移的影响及其作用机制。方法应用microRNA芯片检测TGF-β1处理胃癌细胞BGC823前后miRNA的差异表达谱;应用划痕实验,transwell迁移浸润及裸鼠成瘤等实验分别检测瞬时转染miR-193b抑制剂前后胃癌... 目的探讨miR-193b转染对胃癌细胞浸润、转移的影响及其作用机制。方法应用microRNA芯片检测TGF-β1处理胃癌细胞BGC823前后miRNA的差异表达谱;应用划痕实验,transwell迁移浸润及裸鼠成瘤等实验分别检测瞬时转染miR-193b抑制剂前后胃癌细胞株生物学行为的变化。结果 TGF-β1处理胃癌细胞BGC823前后miRNA的表达谱存在6个差异表达,包括3个(miR-27a,miR-29b-1和miR-194)表达上调,3个(miR-193b,miR-574-3p和miR-130b)表达下调。转染miR-193b抑制剂后,胃癌细胞株BGC823迁移、浸润和转移的能力明显增强。结论 TGF-β1可能通过下调miR-193b的表达负向调控胃癌细胞的迁移、浸润和转移。 展开更多
关键词 胃肿瘤/病理学 microrna芯片 miR-193b UPA 肿瘤转移 肿瘤浸润 迁移
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肺癌、癌旁组织及正常组织中微小RNA表达谱的检测 被引量:12
4
作者 李丽琴 许丽敏 +7 位作者 李静 沈琦斌 李鸿伟 平金良 马志红 钟婧 黄惠莲 戴利成 《中华实验外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期409-410,共2页
目的 探讨肺癌、癌旁及正常组织中微小RNA(miRNAs,miR)表达谱差异及其与TNM病理分期的关系.方法 采用Agilent miRNA芯片检测9例非小细胞肺癌患者的同体癌、癌旁和正常组织的miRNA表达谱,比较不同TNM分期间的表达差异.结果 筛选出36个... 目的 探讨肺癌、癌旁及正常组织中微小RNA(miRNAs,miR)表达谱差异及其与TNM病理分期的关系.方法 采用Agilent miRNA芯片检测9例非小细胞肺癌患者的同体癌、癌旁和正常组织的miRNA表达谱,比较不同TNM分期间的表达差异.结果 筛选出36个在癌组织和癌旁组织之间差异表达的miRNAs和55个在癌组织和正常组织间差异表达的miRNAs;与早期患者比较,Ⅲa期的正常组织有hsa-miR-205、hsa-miR-34b等11个差异表达的miRNAs;而癌旁组织则从Ⅱa期开始就出现了9个差异表达的miRNAs;不同TNM分期的癌组织之间仅有hsv2-miR-H7-3p和hsa-miR-23a*表达差异有统计学意义(P<0.05).结论 随着肺癌病理分级的发展,癌旁组织甚至远端组织也会出现特定mircoRNA表达量的变化,该特定mircoRNA的表达可能提示肿瘤的浸润能力. 展开更多
关键词 肺癌 微小RNA芯片 TNM病理分期
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MicroRNA在六种不同器官肿瘤细胞系中的差异表达 被引量:9
5
作者 马卓娅 汤华 +3 位作者 李欣 刘民 吴海东 王晶 《中国肿瘤》 CAS 2007年第9期714-717,共4页
[目的]利用生物芯片技术分析microRNA(miRNA)在六种不同器官肿瘤细胞系中mi-croRNA(miRNA)的表达差异。[方法]将210个(206个miRNA,4个阳性对照)与已知人类和小鼠miRNA互补的序列作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片。提取肿瘤细胞(HeLa... [目的]利用生物芯片技术分析microRNA(miRNA)在六种不同器官肿瘤细胞系中mi-croRNA(miRNA)的表达差异。[方法]将210个(206个miRNA,4个阳性对照)与已知人类和小鼠miRNA互补的序列作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片。提取肿瘤细胞(HeLa、MCF-7、A549、HT-29、ES-2、K562)的miRNA,用荧光染料Cy3标记,并与制备好的芯片杂交。用Sca-nArrayTMExpress1.0扫描仪扫描荧光信号,采用ScanArray3.0和Cluster3.0软件分析处理扫描结果。并用Northernblot和RT-PCR方法对芯片检测结果进行验证。[结果]芯片检测到在六种不同器官肿瘤细胞系中,发现115种miRNA存在差异,91种miRNA没有明显差异。其中,miR-21在六种肿瘤细胞表达水平均较高,miR-125b表达水平均较低,let-7在六种细胞系中表达水平较低。miR-17-5p和miR-20a呈集簇表达,在卵巢肿瘤ES-2细胞系中的表达水平高于其它细胞,乳腺肿瘤细胞系MCF-7和宫颈癌细胞系HeLa的miRNA的表达谱聚为一类。[结论]应用生物芯片技术检测细胞中miRNA的表达差异谱是可行的,miRNA可能参与肿瘤的发生发展。 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 microrna 肿瘤 表达谱
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MicroRNA在6种肿瘤细胞中的表达差异 被引量:8
6
作者 马卓娅 汤华 +3 位作者 李欣 刘民 吴海东 王晶 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 2007年第3期254-258,共5页
目的:利用生物芯片技术分析6种不同器官肿瘤细胞中microRNA(miRNA)的表达差异。方法:将210个与已知人类和小鼠miRNA互补的序列(206个miRNA,4个阳性对照)作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片。提取肿瘤细胞HeLa(人宫颈癌上皮细胞)、MCF... 目的:利用生物芯片技术分析6种不同器官肿瘤细胞中microRNA(miRNA)的表达差异。方法:将210个与已知人类和小鼠miRNA互补的序列(206个miRNA,4个阳性对照)作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片。提取肿瘤细胞HeLa(人宫颈癌上皮细胞)、MCF-7(人乳腺癌细胞)、A549(人肺腺癌细胞)、HT-29(人结肠腺癌细胞)、ES-2(人卵巢透明细胞癌)、K562(人慢性髓细胞性白血病细胞)的miRNA,荧光染料Cy3标记,并与制备好的芯片杂交;用ScanArrayTM Express1.0扫描仪扫描荧光信号,采用ScanArray3.0和Cluster3.0软件分析处理扫描结果;Northern blotting和RT-PCR方法对芯片检测结果进行验证。结果:在6种不同器官肿瘤细胞中,检测到115种miRNA存在差异,91种miRNA没有明显差异;其中,miR-21在6种肿瘤细胞表达水平均较高,miR-125b表达水平均较低,let-7不同亚型在6种细胞系中表达水平较低;miR-17-5p和miR-20a呈集簇表达,在卵巢肿瘤ES-2细胞中的表达水平高于其他细胞,乳腺肿瘤细胞系MCF-7和宫颈癌细胞系HeLa的miRNA表达谱聚为一类。Northern blotting检测到miR-17-5p及其前体在K562细胞中均见表达,A549和ES-2细胞中只见较弱的前体表达,MCF-7、HeLa和HT-29中可见明显的前体和较弱的成熟miRNA的表达。RT-PCR检测到miR-17-5p前体在K562细胞中表达水平高于其他几种细胞,在ES-2细胞中的表达量低于K562细胞,同时高于另外4种细胞;miR-21在6种肿瘤细胞中表达水平均较高,在A549细胞中表达最高。结论:应用生物芯片技术检测肿瘤细胞中miRNA的表达差异为进一步探索miRNA与肿瘤间的关系奠定基础。 展开更多
关键词 microrna 肿瘤细胞 寡核苷酸芯片 表达差异
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MicroRNA 145 may play an important role in uveal melanoma cell growth by potentially targeting insulin receptor substrate-1 被引量:9
7
作者 Li Yang Huang Qiming +4 位作者 Shi Xuehui Jin Xiang Shen Li Xu Xiaolin Wei Wenbin 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2014年第8期1410-1416,共7页
Background MicroRNAs (miRNAs) contribute to tumorigenesis by acting as either oncogenes or tumor suppressor genes. In this study, we investigated the role of miR-145 in the pathogenesis of uveal melanoma. Methods Ex... Background MicroRNAs (miRNAs) contribute to tumorigenesis by acting as either oncogenes or tumor suppressor genes. In this study, we investigated the role of miR-145 in the pathogenesis of uveal melanoma. Methods Expression profiles of miRNAs in uveal melanoma were performed using Agilent miRNA array. Quantitative real-time polymerase chain reaction was used to screen the expression levels of miR-145 in normal uveal tissue, uveal melanoma tissue, and uveal melanoma cell lines. Lenti-virus expression system was used to construct MUM-2B and OCM-1 cell lines with stable overexpression of miR-145. Cell proliferation, cell cycle, and cell apoptosis of these miR-145 overexpression cell lines were examined by MTT assay and flow cytometry respectively. The target genes of miR-145 were predicted by bioinformatics and confirmed using a luciferase reporter assay. The expression of insulin-like growth factor-1 receptor (IGF-1R), insulin receptor substrate-1 (IRS-1) proteins was determined by Western blotting analysis. IRS- 1 was knocked down in OCM-1 cells. TUNEL, BrdU, and flow cytometry assay were performed in IRS-1 knocked down OCM-1 cell lines to analyze its function. Results Forty-seven miRNAs were up regulated in uveal melanoma and 61 were down regulated, miR-145 expression was significantly lower in uveal melanoma sample and the cell lines were compared with normal uveal sample. Overexpression of miR-145 suppressed cell proliferation by blocking the G1 phase entering S phase in uveal melanoma cells, and promoted uveal melanoma cell apoptosis. IRS-1 was identified as a potential target of miR-145 by dual luciferase reporter assay. Knocking down of IRS-1 had similar effect as overexpression of miR-145. Conclusion miR-145 might act as a tumor suppressor in uveal melanoma, and downregulation of the target IRS-1 might be a potential mechanism. 展开更多
关键词 uveal melanoma microrna array MIR-145 insulin receptor substrate-1
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胃癌组织microRNA表达谱检测及生物信息学分析 被引量:7
8
作者 黄幼生 解娜 +2 位作者 张艺馨 罗志飞 薛逢贵 《临床与实验病理学杂志》 CSCD 北大核心 2017年第6期591-595,共5页
目的探讨微小RNA(microRNA,miRNA)在胃癌组织中的表达特征。方法采用Exiqon miRNA芯片检测3对胃癌组织及其配对正常胃黏膜组织中miRNA差异表达情况,随机选取10个上调或下调差异表达的miRNA应用qPCR技术验证;应用生物信息学分析差异表达... 目的探讨微小RNA(microRNA,miRNA)在胃癌组织中的表达特征。方法采用Exiqon miRNA芯片检测3对胃癌组织及其配对正常胃黏膜组织中miRNA差异表达情况,随机选取10个上调或下调差异表达的miRNA应用qPCR技术验证;应用生物信息学分析差异表达的miRNA及其靶向基因在胃癌发生、发展中的作用。结果芯片结果显示,在3对胃癌组织中有111个miRNA出现差异表达(差异倍数>2,P<0.05),其中上调表达95个,下调表达16个。进一步行qPCR验证的10个miRNA的表达情况与miRNA芯片结果一致(P=0.040)。聚类分析显示胃癌组织与癌旁组织存在明显的差异表达,基因本体(gene ontology,GO)及pathway分析显示差异表达的miRNA涉及胃癌的凋亡、周期转换、分化、侵袭、转移及各种肿瘤通路的激活等。结论胃癌组织中miRNA存在异常表达,可能涉及胃癌的发生、发展。 展开更多
关键词 胃肿瘤 MIRNA 差异表达 生物信息学 MIRNA芯片
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MicroRNA与肺部疾病 被引量:4
9
作者 王晓曈 谢婷 +2 位作者 李翼飞 屈会化 王庆国 《国际病理科学与临床杂志》 CAS 2011年第5期457-460,共4页
MicroRNA(miRNA)在生物的发育、疾病的发生和发展过程中扮演着重要角色,以其在生命活动中起到的调控作用而备受关注。大量研究证实miRNA与包括肺的生长发育、肺内炎性反应、肺癌、肺纤维化等在内的肺部疾病的发生和发展及转归有着密切... MicroRNA(miRNA)在生物的发育、疾病的发生和发展过程中扮演着重要角色,以其在生命活动中起到的调控作用而备受关注。大量研究证实miRNA与包括肺的生长发育、肺内炎性反应、肺癌、肺纤维化等在内的肺部疾病的发生和发展及转归有着密切的关联。MiRNA芯片技术是一种有效地、高通量地获取miRNA表达的手段,已经成功地运用于肺癌、肺动脉高压症和H1N1流感的研究中。了解miRNA的作用机制有利于完善我们对miRNAs在呼吸系统及全身各个系统的生理调节、疾病发生和发展中作用的理解,为临床诊断及治疗提供新的依据和方向。 展开更多
关键词 microrna 肺部疾病 microrna芯片技术
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Mir-106b对阿尔茨海默病昼夜节律调控的初步研究 被引量:4
10
作者 王海林 刘嘉琳 +2 位作者 宗园媛 张连峰 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 2010年第4期19-23,87,共6页
目的探讨mir-106b在阿尔茨海默病发病中的作用。方法取6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织,进行microRNA芯片的检测;利用real-time PCR对芯片检测结果进行验证;构建mir-106b表达载体,将其转染至SH-SY5Y细胞中构建mir-106b稳定转染的稳转细胞... 目的探讨mir-106b在阿尔茨海默病发病中的作用。方法取6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织,进行microRNA芯片的检测;利用real-time PCR对芯片检测结果进行验证;构建mir-106b表达载体,将其转染至SH-SY5Y细胞中构建mir-106b稳定转染的稳转细胞系。用Targetsan、Pictar、miRanda等靶基因预测软件,对mir-106b的靶基因进行预测,根据靶基因的功能选择可能与AD发病相关的靶基因,并用Western blot对所选择的靶基因在稳转细胞中的表达进行验证。用双荧光素酶报告检测系统检测mir-106b与其靶基因的结合位点。结果芯片结果显示,与野生型小鼠相比,6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织中mir-106b的表达下降,经real-time PCR验证,mir-106b的表达在APPswe/PSΔE9小鼠脑组织中的表达较野生型小鼠升高,差别具有统计学意义(P=0.03)。mir-106b稳转细胞系较对照mir-106b的表达升高2~5倍。神经PAS结构域蛋白2(neuronal PAS domain protein2,NPAS2)在mir-106b稳转细胞中的表达明显下降。双荧光素酶报告实验证实:与对照相比,带有NPAS2的3'UTR的荧光素酶报告载体与mir-106b表达载体共转染,海肾荧光素酶/萤火虫荧光素酶的相对活性降低;荧光素酶报告载体的NPAS2-3'UTR突变后与mir-106b表达载体共转染,海肾荧光素酶/萤火虫荧光素酶的相对活性升高。结论mir-106b可能通过调节机体生物钟基因NPAS2的表达,影响阿尔茨海默病人的生活节律,参与阿尔茨海默病的发生。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 microrna 转基因小鼠 microrna芯片 神经PAS结构域蛋白2
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微小RNA-181a-5p、320a及其靶基因TGF-β1在食管鳞癌中的表达 被引量:6
11
作者 李彦桦 李雨珊 +2 位作者 张仁静 周雪梅 何欣蓉 《肿瘤预防与治疗》 2019年第5期395-401,共7页
目的:检测人食管鳞癌组织中miR-181a-5p、miR-320a及TGF-β1的表达情况,研究其在食管鳞癌发生中的作用。方法:收集食管鳞癌及癌旁正常组织各3例,抽取总RNA,利用miRNA芯片技术检测miRNA的表达;采用qRT-PCR方法验证miRNA芯片结果的可靠性... 目的:检测人食管鳞癌组织中miR-181a-5p、miR-320a及TGF-β1的表达情况,研究其在食管鳞癌发生中的作用。方法:收集食管鳞癌及癌旁正常组织各3例,抽取总RNA,利用miRNA芯片技术检测miRNA的表达;采用qRT-PCR方法验证miRNA芯片结果的可靠性。采用软件和数据库对差异表达miRNA调控的靶基因进行初步分析。收集食管鳞癌及对照正常组织各22例,采用qRT-PCR方法检测miR-181a-5p、miR-320a和TGF-β1mRNA。结果:miRNA芯片结果显示,共有22种miRNA在食管鳞癌和正常组织中的表达差异有统计学意义(P<0.05),其中6种显著上调,16种显著下调;qRT-PCR证实miR-320a表达下降,miR-181a-5p表达上升,差异均有统计学意义(P<0.05),与芯片结果一致;TGF-β1mRNA在食管鳞癌中表达较对照正常组织稍升高,但差异无统计学意义。结论:miR-181a-5p和miR-320a可能参与食管鳞癌的发生发展过程。 展开更多
关键词 miR-181a-5p miR-320a 食管鳞癌 MIRNA芯片 QRT-PCR TGF-Β1
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阿尔茨海默病中mir-222作用机制的初步研究 被引量:3
12
作者 王晓映 宗园媛 +1 位作者 张连峰 秦川 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第9期13-15,I0003,共4页
目的探讨mir-222在阿尔茨海默病发病机制中的作用。方法取6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织,进行microRNA芯片的检测;利用real-time PCR对芯片检测结果进行验证;构建mir-222表达载体,将其转染至SH-SY5Y细胞中,转染后48小时提取蛋白检测p27k... 目的探讨mir-222在阿尔茨海默病发病机制中的作用。方法取6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织,进行microRNA芯片的检测;利用real-time PCR对芯片检测结果进行验证;构建mir-222表达载体,将其转染至SH-SY5Y细胞中,转染后48小时提取蛋白检测p27kip1的表达情况。结果芯片结果显示,与野生型C57BL/6J小鼠相比,6月龄APPswe/PSΔE9小鼠脑组织中mir-222表达明显下降,经real-time PCR验证,差别具有统计学意义(P=0.012);将mir-222表达载体转染至SH-SY5Y细胞后,p27kip1表达减少。结论mir-222可能通过调节细胞周期抑制因子p27kip1的表达参与阿尔茨海默病的发生。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 microrna 转基因小鼠 microrna芯片
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结肠癌microRNA表达谱检测及生物信息学分析 被引量:4
13
作者 黄幼生 翁阳 +3 位作者 解娜 张艺馨 罗志飞 薛逢贵 《海南医学》 CAS 2017年第18期2928-2931,共4页
目的探讨miRNA(micro RNA,微小RNA)在结肠癌组织中的表达特征及生物学功能。方法选取临床特征相似的3对结肠癌组织及其配对正常黏膜组织,应用Exiqon miRNA芯片检测miRNA在结肠癌及其配对组织中差异表达情况;3个差异表达的miRNA被选取进... 目的探讨miRNA(micro RNA,微小RNA)在结肠癌组织中的表达特征及生物学功能。方法选取临床特征相似的3对结肠癌组织及其配对正常黏膜组织,应用Exiqon miRNA芯片检测miRNA在结肠癌及其配对组织中差异表达情况;3个差异表达的miRNA被选取进行q PCR验证;生物信息学分析差异表达的miRNA及其靶向基因在结肠癌进展中的作用机制。结果芯片结果显示,在3对结肠癌组织中有201个miRNA出现上调表达,94个下调表达(差异倍数>2),差异有统计学意义(P<0.05)。qPCR结果显示,与对照组织比较,选取的3个miRNA中hsa-miR-18b-3p、hsa-miR-31-5p在结肠癌组织中表达上调,hsa-miR-142-3p表达下调,与芯片结果一致,差异有统计学意义(P<0.05)。GO及pathway分析显示差异表达的miRNA涉及结肠癌细胞的分化、迁移、定位、增生及RNA、蛋白合成等功能调控,与细胞粘附、结肠癌发生发展等信号途径的激活相关。结论结肠癌组织中miRNA存在异常表达,可能涉及结肠癌的发生、发展。 展开更多
关键词 MIRNA 结肠癌 差异表达 生物信息学 MIRNA芯片
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中重度哮喘和轻度哮喘差异表达microRNA及生物信息学分析
14
作者 罗雅妮 熊轶 《解剖学研究》 CAS 2023年第2期143-148,152,共7页
目的 探讨中重度哮喘生物标志物和致病机制,为更有效的中重度哮喘治疗和控制提供线索。方法 采用microRNA芯片检测中重度哮喘患者与轻度哮喘患者血清中的差异表达microRNA。通过miRanda,TargetScan,RNAhybrid和miRTarbase数据库对micro... 目的 探讨中重度哮喘生物标志物和致病机制,为更有效的中重度哮喘治疗和控制提供线索。方法 采用microRNA芯片检测中重度哮喘患者与轻度哮喘患者血清中的差异表达microRNA。通过miRanda,TargetScan,RNAhybrid和miRTarbase数据库对microRNA的靶基因进行预测,并使用GO功能聚类分析和KEGG信号通路富集分析对microRNA的靶基因进行功能解析。使用qRT-PCR检验慢性哮喘小鼠肺组织中microRNA的含量。结果 与轻度哮喘患者相比,miR-4746-3p、miR-6798-5p和miR-762等在中重度哮喘患者血清中上调,而miR-26a-5p、miR-377-3p和miR-410-3p等下调。与轻度哮喘相比,慢性炎症调控、脂质吸收、储存、分解代谢功能及PI3K-Akt信号通路、Wnt信号通路、TOR复合体等细胞增殖相关通路在中重度哮喘中显著富集。此外,慢性哮喘模型鼠呈现出与重度哮喘患者类似的病理表型如炎性细胞浸润与气道重塑,且miR-377-3p和miR-410-3p在慢性哮喘小鼠肺组织中也显著下调。结论 我们的研究提供了中重度哮喘可能的非侵入性风险生物标志物。为中重度哮喘患者的炎症及气道细胞成分如平滑肌细胞,黏液腺细胞,血管内皮细胞增生肥大引起的气道重塑提供了可能的分子机制和信号通路,这些发现可为更有效的重度哮喘治疗和控制提供理论基础。 展开更多
关键词 哮喘 microrna芯片 气道重塑 气道炎症
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转化生长因子β1对宫颈癌Siha细胞microRNA表达谱的影响 被引量:4
15
作者 甘露 刘晓英 +1 位作者 王雯智 魏荣 《山西医科大学学报》 CAS 2019年第9期1224-1227,共4页
目的 探讨转化生长因子β1(transforming growth factor β1,TGF-β1)对宫颈癌Siha细胞microRNA(miRNA)表达谱的影响及其意义。方法 应用miRNA芯片检测TGF-β1处理宫颈癌Siha细胞前后的miRNA表达谱;实时荧光定量RT-PCR验证差异表达的miR... 目的 探讨转化生长因子β1(transforming growth factor β1,TGF-β1)对宫颈癌Siha细胞microRNA(miRNA)表达谱的影响及其意义。方法 应用miRNA芯片检测TGF-β1处理宫颈癌Siha细胞前后的miRNA表达谱;实时荧光定量RT-PCR验证差异表达的miRNA;生物信息学技术用于分析由差异表达的miRNA调节的可能靶基因。结果 TGF-β1处理宫颈癌Siha细胞48 h,miRNA的表达谱存在39个差异表达的miRNA,其中27个表达上调,12个表达下调。选择其中差异倍数大的2个miRNA(hsa-miR-494-3p,hsa-miR-378a-5p)进行实时荧光定量RT-PCR验证,结果与芯片结果一致。结论 TGF-β1影响宫颈癌Siha细胞miRNAs的表达,这些差异表达的miRNAs可能参与了宫颈癌的浸润转移。 展开更多
关键词 microrna芯片 转化生长因子Β1 宫颈癌 SIHA细胞
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miR-21在脑出血患者外周血中表达特点的研究 被引量:4
16
作者 王加璐 胡畔 +3 位作者 何振巍 张小倩 李瞿 何志义 《解剖科学进展》 2018年第4期339-343,共5页
目的研究脑出血患者外周血中microRNA的表达特点,探讨miR-21在脑出血患者外周血中的表达与脑出血后时间相关性。方法采用病例对照研究方法,病例组选择基底节区脑出血患者作为研究对象,正常对照组来自健康志愿者,并要求年龄和性别等因素... 目的研究脑出血患者外周血中microRNA的表达特点,探讨miR-21在脑出血患者外周血中的表达与脑出血后时间相关性。方法采用病例对照研究方法,病例组选择基底节区脑出血患者作为研究对象,正常对照组来自健康志愿者,并要求年龄和性别等因素与病例组匹配。采集4例病例组患者和与之相匹配的4例对照组患者外周静脉血,提取血清,抽提RNA,采用microRNA芯片技术分析microRNA在各组间的表达情况,运用统计学方法分析病例组与对照组临床资料的差异性及microRNA表达的差异性。运用靶基因预测软件及文献复习,挑选出可能与ICH相关的microRNA(miR-21)及其靶基因,采集31例病例组患者在脑出血后6h、24h、72h及7d的外周血,采集11例对照组患者外周血,提取血清,抽提RNA,采用real-time PCR方法扩大样本量进一步研究miR-21在脑出血患者外周血中的表达与出血时间的相关性,探讨其可能的分子作用机制。结果microRNA芯片结果显示,脑出血患者外周血中,共有101种microRNA表达下调(fold change>1.5),53种microRNA有统计学差异;表达上调的microRNA共有10种,其中2种呈差异性表达;通过靶基因预测软件及文献复习,分析miR-21可能与脑出血的多个病理机制相关;real-time PCR验证实验结果与芯片结果一致,miR-21在脑出血患者外周血中表达下调;且miR-21在发病6h、24h、72h及7d各个时间点表达随时间呈曲线变化趋势。结论脑出血患者血清中存在着特异性的mico RNA表达谱;miR-21在脑出血患者外周血中随时间变化表达下调,且其变化趋势与脑出血后水肿程度相一致。 展开更多
关键词 脑出血 外周血 microrna芯片 REAL-TIME PCR MIR-21 出血时间
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生物芯片检测细胞中microRNA的表达 被引量:1
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作者 马卓娅 李欣 +1 位作者 汤华 刘民 《生物技术通讯》 CAS 2007年第6期955-957,共3页
目的:制备microRNA(miRNA)检测芯片,检测细胞中miRNA的表达。方法:将210个(206个miRNA,4个阳性对照)与已知人类和小鼠miRNA互补的序列作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片;提取肿瘤细胞(HeLa,MCF-7,A549,HT-29,ES-2,K562)的miRNA,用荧... 目的:制备microRNA(miRNA)检测芯片,检测细胞中miRNA的表达。方法:将210个(206个miRNA,4个阳性对照)与已知人类和小鼠miRNA互补的序列作为探针,点于玻片上制备寡核苷酸芯片;提取肿瘤细胞(HeLa,MCF-7,A549,HT-29,ES-2,K562)的miRNA,用荧光染料Cy3标记,并与制备好的芯片杂交;用ScanArrayTM Express1.0扫描仪扫描荧光信号,采用ScanArray3.0和Cluster3.0软件分析处理扫描结果,并用RT-PCR方法对芯片检测结果进行验证。结果:建立了利用生物芯片检测miRNA表达的方法;发现不同细胞miRNA表达谱各异。结论:应用生物芯片技术检测细胞中miRNA的表达是可行的,可为研究miRNA的生理功能和作用机制奠定基础。 展开更多
关键词 寡核苷酸芯片 microrna(miRNA) 表达谱
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微小RNA的差异表达与胚胎质量的相关性 被引量:3
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作者 倪梦霞 薛永峰 +6 位作者 丁洁 杨慎敏 郑爱燕 蒲艳 王玮 李红 偶健 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2020年第9期938-941,共4页
目的探讨微小RNA(micro RNA,miRNA)差异表达与胚胎质量的相关性,为胚胎的植入前选择提供新的依据。方法用TaqMan微小RNA阵列(MicroRNA Array)对8个囊胚样本进行miRNA表达谱检测,筛选稳定高表达且有价值的miRNA。扩大样本量后选择囊胚,... 目的探讨微小RNA(micro RNA,miRNA)差异表达与胚胎质量的相关性,为胚胎的植入前选择提供新的依据。方法用TaqMan微小RNA阵列(MicroRNA Array)对8个囊胚样本进行miRNA表达谱检测,筛选稳定高表达且有价值的miRNA。扩大样本量后选择囊胚,针对筛选的miRNA进行逆转录PCR检测,同时采用二代测序平台检测胚胎的染色体异常,对结果进行分析比较。结果MicroRNA Array检测发现mir-720、mir-372、mir-886-3p和mir-512-3p表达量较高,而mir-145表达量较低,推测与早期胚胎发育相关。选择56个废弃囊胚,对上述5种miRNA进行检测,结果显示mir-145和mir-886-3p在染色体正常组中显著低表达。mir-145以相对表达量9作为阈值,mir-886-3p以相对表达量3作为阈值,其以上均未见胚胎染色体检测为正常者。结论特定的miRNA表达差异与胚胎染色体异常存在相关性,有可能作为一种新的胚胎选择的生物标记。 展开更多
关键词 微小RNA 二代测序 微小RNA阵列 胚胎
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遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs的筛选 被引量:3
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作者 田晰晰 珠珠 +5 位作者 黄鉴 任俊宇 王跃 张楠 陈明清 董坚 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2013年第11期1040-1045,共6页
目的:应用microRNA(miRNA)芯片筛选及qRT-PCR技术检测可作为遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs.方法:选取4个遗传性非息肉性大肠癌患者及3个无家族史正常人的血清miRNAs进行miRNA芯片检测,再用q-PCR方法对于芯片结果进行验证... 目的:应用microRNA(miRNA)芯片筛选及qRT-PCR技术检测可作为遗传性非息肉性大肠癌生物标志物的血清miRNAs.方法:选取4个遗传性非息肉性大肠癌患者及3个无家族史正常人的血清miRNAs进行miRNA芯片检测,再用q-PCR方法对于芯片结果进行验证.结果:miRNA芯片筛查出57个上调及30个下调miRNAs,在这些差异性表达的miRNAs中选出8个较为理想的miRNAs作进一步研究,运用3个靶基因预测软件预测靶基因后取交集,得到294个靶基因,均是属于mir-20a-5p,mir-548b-5p和mir-548as-3p的靶基因.用qPCR的方法在标本中进行验证发现mir-548as-3p的表达情况符合芯片结果-在遗传性非息肉性大肠癌患者血清中表达上调.结论:血清miRNAs在遗传性非息肉性大肠癌患者中的差异性表达,mir-548as-3p可能为遗传性非息肉性大肠癌非侵入性的生物标志物. 展开更多
关键词 血清micrornas micrornas芯片 遗传性非息肉性大肠癌 生物标志物
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舌鳞癌化疗耐药相关线粒体微小RNA的筛选和鉴定 被引量:3
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作者 林欣祤 陈伟雄 +3 位作者 雷新元 欧展鹏 范松 李劲松 《口腔疾病防治》 2019年第7期417-422,共6页
目的探讨舌鳞癌细胞线粒体微小RNA(mitochondrial microRNAs,mitomiRs)的表达,筛选出与化疗耐药相关的mitomiRs。方法提取舌鳞癌细胞系CAL-27及其顺铂耐药细胞株CAL-27-re的线粒体、细胞质、总细胞RNA,采用高通量miRNA芯片筛选出耐药和... 目的探讨舌鳞癌细胞线粒体微小RNA(mitochondrial microRNAs,mitomiRs)的表达,筛选出与化疗耐药相关的mitomiRs。方法提取舌鳞癌细胞系CAL-27及其顺铂耐药细胞株CAL-27-re的线粒体、细胞质、总细胞RNA,采用高通量miRNA芯片筛选出耐药和亲本细胞中差异表达的mitomiRs,应用qRT-PCR验证在CAL-27和CAL-27-re中表达上调的mitomiRs,并在化疗耐药及敏感的舌鳞癌患者样本中验证表达上调的mitomiRs。结果芯片结果显示,在CAL-27和CAL-27-re的线粒体、细胞质和总细胞RNA共6个组分中共检测到263个miRNA,其中共有57个mitomiRs和134个细胞质微小RNA(cytoplasmic microRNAs,cytomiRs);与总miRNA相比,CAL-27-re细胞中有35个mitomiRs表达上调,CAL-27细胞中有31个mitomiRs表达上调(≥1.5倍)。进一步比较分析亲本和耐药细胞中差异表达的mitomiRs,在CAL-27-re细胞中有miR-2392、miR-4462、miR-1290、miR-4449、miR-1268a、miR-1246、miR-371a-5p、miR-3934-5p、miR-4271、miR-513p、miR-664b-3p共11个mitomiRs表达上调;而5个表达下调的mitomiRs则分别是miR-188-5p、miR-1973、miR-3653、miR-4499、miR-5787;其他41个mitomiRs在两种细胞株中的表达水平几乎相同。qRT-PCR与miRNAs芯片结果相符合,并且在CAL-27和CAL-27-re中得到验证的11个表达上调的mitomiRs中,有miR-1268a、miR-2392、miR-4462、miR-1290、miR-4449共5个mitomiRs在化疗耐药舌鳞癌临床样本中也同样表达上调。结论顺铂化疗耐药和敏感的舌鳞癌细胞中存在差异表达的mitomiRs,特异高表达的mitomiRs:miR-1268a、miR-2392、miR-4462、miR-1290、miR-4449可能在舌鳞癌化疗耐药中具有重要作用. 展开更多
关键词 线粒体miRNAs 化疗耐药 线粒体转录 舌鳞癌 高通量 MIRNA芯片 miRNA表达谱
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