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毛重楼叶绿体基因组序列特征及其系统发育分析 被引量:16
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作者 江媛 杨青淑 +4 位作者 王婧 杨成金 黄林芳 杨燕 段宝忠 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2021年第13期4014-4022,共9页
目的获取毛重楼Paris mairei叶绿体基因组信息特征并对其系统位置进行研究。方法采用Illumination测序技术对毛重楼叶绿体基因组进行测序,对其进行组装、注释和特征分析,并构建最大似然(maximum likelihood,ML)系统发育树。结果毛重楼... 目的获取毛重楼Paris mairei叶绿体基因组信息特征并对其系统位置进行研究。方法采用Illumination测序技术对毛重楼叶绿体基因组进行测序,对其进行组装、注释和特征分析,并构建最大似然(maximum likelihood,ML)系统发育树。结果毛重楼叶绿体基因组大小为163918 bp,总GC含量为37.05%,大单拷贝区(large single-copy,LSC)、小单拷贝区(small single-copy region,SSC)分别为84173、13054 bp,反向互补重复区(inverted repeats,IR)大小为33296 bp,共编码113个基因,包括79个蛋白质编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因。在系统进化树中,重楼属Paris L.与藜芦科(Melanthiaceae Batsch ex Borkh.)关系较近,与百合科(Liliaceae Juss.)关系较远。结论LSC区和SSC区序列变异高于IR区;相较于重楼属,毛重楼与蚤休组的亲缘关系最近,应将毛重楼归属为蚤休组;相较于百合科,毛重楼与藜芦科藜芦属亲缘关系更近,应将蚤休组从百合科中独立,归属为藜芦科。 展开更多
关键词 毛重楼 叶绿体基因组 重楼属 系统发育 藜芦科
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药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究(英文) 被引量:9
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作者 李晓娟 杨振艳 +1 位作者 黄玉玲 纪运恒 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期601-613,共13页
为探究华重楼(Paris polyphylla var.chinensis)的叶绿体基因组特征,利用叶绿体系统发育基因组学方法,对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明,华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp,由4个区组成,包括2个反向重复... 为探究华重楼(Paris polyphylla var.chinensis)的叶绿体基因组特征,利用叶绿体系统发育基因组学方法,对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明,华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp,由4个区组成,包括2个反向重复区(IRA和IRB,27473 bp)、1个小单拷贝区(SSC,18175 bp)和1个大单拷贝区(LSC,85187 bp)。其叶绿体基因组有115个基因,包括81个编码蛋白质基因、30个转运RNA基因和4个核糖体RNA基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cem A基因是假基因,其起始密码子后有多聚核苷酸poly(A)及CA双核苷酸重复序列,编码序列中出现多个终止密码子,且与北重楼(Paris verticillata)的cemA编码序列中的终止密码子位置不同。因此,华重楼叶绿体基因组比较保守;cemA结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息,其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。 展开更多
关键词 叶绿体全基因组 华重楼 黑药花科 百合目 cemA假基因化
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腾冲重楼根茎的化学成分及抗菌活性研究
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作者 杨莹莉 白雪 +3 位作者 杨珺 罗吉凤 段晓燕 王跃虎 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1466-1476,共11页
目的研究藜芦科植物腾冲重楼Paris tengchongensis根茎的化学成分及抗菌活性。方法采用HPD100大孔吸附树脂、正相硅胶、RPC_(18)硅胶和Sephadex LH-20凝胶色谱,以及半制备高效液相色谱等方法进行分离和纯化,利用NMR和MS等波谱数据对化... 目的研究藜芦科植物腾冲重楼Paris tengchongensis根茎的化学成分及抗菌活性。方法采用HPD100大孔吸附树脂、正相硅胶、RPC_(18)硅胶和Sephadex LH-20凝胶色谱,以及半制备高效液相色谱等方法进行分离和纯化,利用NMR和MS等波谱数据对化合物的化学结构进行鉴定。对分离到的化合物用微量稀释法进行抗细菌和真菌活性评价。结果从腾冲重楼根茎70%乙醇提取物中分离并鉴定了16个化合物,分别为parisvanioside A(1)、kingianoside K(2)、7-氧薯蓣皂苷(3)、pariposide A(4)、parisvanioside B(5)、parisrugoside H(6)、(25R)-17α-羟基螺甾-5-烯-3β-基O-β-D-吡喃葡萄糖基-(1→4)-O-[α-L-吡喃鼠李糖基-(1→2)]-β-D-吡喃葡萄糖苷(7)、麦冬皂苷Cʹ(8)、纤细薯蓣皂苷(9)、重楼皂苷Ⅰ(10)、重楼皂苷Ⅱ(11)、重楼皂苷Ⅵ(12)、pennogenin 3-O-β-chacotrioside(13)、重楼皂苷H(14)、重楼皂苷Ⅶ(15)和β-蜕皮激素(16)。化合物3、5~15对絮状表皮癣菌有较强抑制作用,50%最低抑菌浓度(50%minimun inhibitory concentration,MIC50)为0.07~93.60μmol/L;化合物5~15对红色毛癣菌有较强抑制作用,MIC50为0.06~73.08μmol/L;化合物3、5~8、10~15对石膏样小孢子菌有很强的抑制作用,MIC50为0.04~69.92μmol/L。结论化合物1~7为首次从腾冲重楼中分离得到;化合物7、12~15对白色念珠菌氟康唑耐药株抑制率可达100%。化合物11对絮状表皮癣菌抑菌效果最好,MIC50为(0.07±0.004)μmol/L;化合物11对红色毛癣菌抑菌效果最好,MIC50为(0.06±0.003)μmol/L;化合物11对石膏样小孢子菌抑菌效果最好,MIC50为(0.04±0.001)μmol/L。腾冲重楼中含有的甾体皂苷有治疗皮肤及深部真菌感染的潜力。 展开更多
关键词 藜芦科 腾冲重楼 甾体皂苷 抗菌活性 7-氧薯蓣皂苷 重楼皂苷Ⅱ
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Comparative chloroplast genome analysis of medicinally important Veratrum(Melanthiaceae)in China:Insights into genomic characterization and phylogenetic relationships 被引量:2
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作者 Ying-Min Zhang Li-Jun Han +4 位作者 Cong-Wei Yang Zi-Li Yin Xing Tian Zi-Gang Qan Guo-Dong Li 《Plant Diversity》 SCIE CAS CSCD 2022年第1期70-82,共13页
Members of Veratrum are perennial herbs widely used in traditional Chinese medicine to induce vomiting,resolve blood stasis and relieve pain.However,the intrageneric classification and phylogenetic relationships withi... Members of Veratrum are perennial herbs widely used in traditional Chinese medicine to induce vomiting,resolve blood stasis and relieve pain.However,the intrageneric classification and phylogenetic relationships within Veratrum have long been controversial due to the complexity of morphological variations and lack of high-resolution molecular markers.In this study,we reevaluated the infrageneric relationships with the genus Veratrum using complete chloroplast genome sequence data.Herein,the complete cp genomes of ten species of Veratrum were newly sequenced and characterized.The complete cp genomes of ten species of Veratrum had the typical quadripartite structure,ranging from 151,597 bp to 153,711 bp in size and comprising a total of 135 genes.The structure of Veratrum cp genomes(i.e.,gene order,content,and genome components)was highly similar across species.The number of simple sequence repeats(SSRs)ranged from 63 to 7&and of long repeats ranged from 31 to 35.Eight highly divergent regions(ndhF,psbC-psbZ,psbK-psbl,rpoB-tmCjGCA,tmK_UUU-tmQ_UUG,tmS_GCU-tmG_UCC,tmT_UGU-tmL_UAA and ycfl)were identified and are potentially useful for the DNA barcoding of Veratrum.Phylogenetic analysis among 29 taxa based on cp genomes,total genes,protein-coding genes and intergenic regions strongly supported the monophyly of Veratrum.The circumscription and relationships of the infrageneric taxa of Veratrum were well-presented with great resolution.These results will facilitate the identification,taxonomy,and utilization of Veratrum plants as well as the evolutionary studies of Melanthiaceae. 展开更多
关键词 Veratrum melanthiaceae Chloroplast genome Comparative analysis PHYLOGENY
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皱叶重楼根茎的化学成分及抗菌活性研究 被引量:1
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作者 段晓燕 岳美岑 +4 位作者 杨珺 白雪 罗吉凤 李恒 王跃虎 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2981-2988,共8页
藜芦科植物皱叶重楼目前仅分布于我国云南省,其化学成分尚未被系统地研究。该研究通过多种柱色谱方法及半制备高效液相等分离手段,从皱叶重楼根茎的乙醇提取物中分离鉴定了9个化合物,分别为pariposide G(1)、cerin(2)、豆甾-4-烯-3-酮(3... 藜芦科植物皱叶重楼目前仅分布于我国云南省,其化学成分尚未被系统地研究。该研究通过多种柱色谱方法及半制备高效液相等分离手段,从皱叶重楼根茎的乙醇提取物中分离鉴定了9个化合物,分别为pariposide G(1)、cerin(2)、豆甾-4-烯-3-酮(3)、β-蜕皮激素(4)、麦冬皂苷C′(5)、甲基原纤细薯蓣皂苷(6)、纤细薯蓣皂苷(7)、重楼皂苷H(8)、parisyunnanoside G(9)。其中化合物1为新化合物,化合物1~9均为首次从该植物中分离得到。对所有化合物的抗细菌和真菌活性进行了评价,实验结果表明麦冬皂苷C′对白色念珠菌[MIC90=(4.68±0.01)μmol·L^(-1)]和白色念珠菌氟康唑耐药株[MIC90=(4.66±0.02)μmol·L^(-1)]有较强的抑制作用。 展开更多
关键词 藜芦科 皱叶重楼 甾体皂苷 抗菌活性 白色念珠菌氟康唑耐药株
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白花重楼叶绿体基因组特征及系统发育分析 被引量:1
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作者 张书东 凌立贞 +1 位作者 谢丹丹 刘祯珍 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2023年第8期1551-1560,共10页
白花重楼(Paris polyphylla var. alba)为藜芦科(Melanthiaceae)重楼属药用植物,为国家二级重点保护植物。随着重楼原料药需求量逐渐上涨,白花重楼野生资源遭到严重破坏。为保护白花重楼遗传资源和探讨该物种的系统位置,本研究对白花重... 白花重楼(Paris polyphylla var. alba)为藜芦科(Melanthiaceae)重楼属药用植物,为国家二级重点保护植物。随着重楼原料药需求量逐渐上涨,白花重楼野生资源遭到严重破坏。为保护白花重楼遗传资源和探讨该物种的系统位置,本研究对白花重楼的全基因组进行高通量测序,通过组装和注释获得其完整的叶绿体基因组序列。对其基因组结构特性和系统发育关系分析结果表明,白花重楼叶绿体基因组全长163 944 bp,大单拷贝区(large single-copy, LSC)、小单拷贝区(small single-copy region, SSC)和反向互补重复区(inverted repeats, IR)长度分别为84 179、12 967、33 399 bp,为典型的四分体结构。白花重楼叶绿体基因组共编码134个基因,包括88个蛋白质编码基因,38个tRNA基因和8个rRNA基因。白花重楼叶绿体基因组共检测到645个长重复序列和97个SSR(simple sequence repeat)位点,长重复序列以正向重复和回文重复为主,SSR以单碱基重复A/T类型为主。基于重楼属34种(含种下单位)叶绿体全基因组构建的系统进化树显示,重楼属为单系类群,可划分为5个大的分支,七叶一枝花各变种虽然均位于蚤休组,但并不构成单系,白花重楼与毛重楼亲缘关系最近。本研究通过二代测序数据组装获得了完整的白花重楼叶绿体基因组序列,明确了白花重楼在重楼属中的系统位置,为研究重楼属植物的系统进化、物种鉴定和资源保护提供科学依据。 展开更多
关键词 白花重楼 重楼属 藜芦科 系统发育 叶绿体基因组
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云龙重楼,重楼属(黑药花科)植物一新种 被引量:2
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作者 李恒 雷立公 杨宇明 《西部林业科学》 CAS 2017年第1期1-5,共5页
对黑药花科重楼属的新种云龙重楼进行描述和绘图。该种发现于云南省云龙县关坪乡的云南松+旱冬瓜混交林中,属于侧膜亚属蚤休组。与同组的毛重楼近似,但花瓣常缺如或少于萼片,药隔凸出部分长1~1.5cm。与同组的长药隔重楼的区别在于花瓣... 对黑药花科重楼属的新种云龙重楼进行描述和绘图。该种发现于云南省云龙县关坪乡的云南松+旱冬瓜混交林中,属于侧膜亚属蚤休组。与同组的毛重楼近似,但花瓣常缺如或少于萼片,药隔凸出部分长1~1.5cm。与同组的长药隔重楼的区别在于花瓣缺如或少于萼片,花瓣和雄蕊为淡紫色或紫色,叶脉仅2~3对,弧曲,远离。与同亚属黑籽组的同样有长药隔凸出的黑籽重楼的区别在于:种子红色且无假种皮。 展开更多
关键词 云龙重楼 新种 黑药花科 云龙县 云南
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贵州一新记录属--白丝草属 被引量:1
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作者 王波 王泽欢 +1 位作者 陈春伶 孙庆文 《中国野生植物资源》 CSCD 2021年第8期68-69,共2页
报道并描述了贵州省独山县药用植物野外调查过程中发现的贵州新记录属——白丝草属Chamaelirium Willd(.中国白丝草Chamaelirium chinense(K.Krause)N.Tanaka),并编制了中国5种白丝草属植物分种检索表。
关键词 贵州 新记录 中国白丝草 黑药花科
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Ypsilandrosides U-Y,five new steroidal saponins from Ypsilandra thibetica
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作者 Wen-Tao Gao Ling-Ling Yu +5 位作者 Jing Xie Long-Gao Xiao Shi-Juan Zhang Wen-Yi Ma Huan Yan Hai-Yang Liu 《Natural Products and Bioprospecting》 2022年第1期211-219,共9页
Phytochemical reinvestigation on the whole plants of Ypsilandra thibetica obtained four new spirostanol glycosides,named ypsilandrosides U-X(1-4),and one new cholestanol glycoside,named ypsilandroside Y(5).Their struc... Phytochemical reinvestigation on the whole plants of Ypsilandra thibetica obtained four new spirostanol glycosides,named ypsilandrosides U-X(1-4),and one new cholestanol glycoside,named ypsilandroside Y(5).Their structures have been established by extensive spectroscopic data and chemical methods.Among them,compound 4 is a rare spirostanol glycoside which possesses a novel 5(6→7)abeo-steroidal aglycone,while compound 1 is a first spiro-stanol bisdesmoside attached to C-3 and C-12,respectively,isolated from the genus Ypsilandra.The induced platelet aggregation activity of the isolates was tested. 展开更多
关键词 Ypsilandra thibetica melanthiaceae Ypsilandrosides U-Y Spirostanol saponins Cholestanol saponins
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