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杨树MIR169基因家族分子进化分析
被引量：
6
1
作者
刘志祥
曾超珍
谭晓风
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期1307-1316,共10页
MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员,是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR...
MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员,是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR169基因家族的分子系统发育、基因倍增模式、表达分化和靶基因进行了分析。结果表明,染色体大片段重复和串联重复在毛果杨MIR169基因家族扩张中均具有重要作用;MIR169基因家族在表达方式上已经出现了较大的分化;MIR169基因家族可能在杨树中已经形成了复杂的调控网络,对杨树的生长发育和适应性等具有重要的调控作用。文章为杨树及杨柳科相关植物中miRNA基因家族的分子进化研究提供了参考。
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关键词
毛果杨
mir
169
基因家族
分子进化
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职称材料
油菜miR169基因家族的生物信息学分析及靶基因预测
被引量：
5
2
作者
阮先乐
王俊生
+2 位作者
刘红占
陈良兵
赵锦慧
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2018年第8期1273-1280,共8页
为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析。结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成...
为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析。结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成2个组;其前体序列在形成成熟miRNA的位置高度保守;油菜miR169基因家族上游启动子主要元件有13个,数量最多的是胚乳表达元件、厌氧胁迫元件、热响应元件和MBS;油菜miR169基因家族的靶基因一共有16个,大部分属于NF-YA基因家族。该结果为进一步研究油菜miR169基因家族的功能奠定了基础。
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关键词
油菜
mir
169
基因家族
靶基因
生物信息学
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职称材料
题名
杨树MIR169基因家族分子进化分析
被引量：
6
1
作者
刘志祥
曾超珍
谭晓风
机构
中南林业科技大学生命科学与技术学院
中南林业科技大学林学院
经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第11期1307-1316,共10页
基金
湖南省自然科学基金项目(编号:13JJ3095)
中南林业科技大学青年基金项目(编号:QJ2011042B)资助
文摘
MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员,是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR169基因家族的分子系统发育、基因倍增模式、表达分化和靶基因进行了分析。结果表明,染色体大片段重复和串联重复在毛果杨MIR169基因家族扩张中均具有重要作用;MIR169基因家族在表达方式上已经出现了较大的分化;MIR169基因家族可能在杨树中已经形成了复杂的调控网络,对杨树的生长发育和适应性等具有重要的调控作用。文章为杨树及杨柳科相关植物中miRNA基因家族的分子进化研究提供了参考。
关键词
毛果杨
mir
169
基因家族
分子进化
Keywords
Populus
trichocarpa
mir
169
gene
family
molecular
evolution
分类号
S792.11 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
油菜miR169基因家族的生物信息学分析及靶基因预测
被引量：
5
2
作者
阮先乐
王俊生
刘红占
陈良兵
赵锦慧
机构
周口师范学院生命科学与农学学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2018年第8期1273-1280,共8页
基金
河南省科技攻关项目(152102110106
172102110165)
高等学校重点科研计划(16A210043)
文摘
为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析。结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成2个组;其前体序列在形成成熟miRNA的位置高度保守;油菜miR169基因家族上游启动子主要元件有13个,数量最多的是胚乳表达元件、厌氧胁迫元件、热响应元件和MBS;油菜miR169基因家族的靶基因一共有16个,大部分属于NF-YA基因家族。该结果为进一步研究油菜miR169基因家族的功能奠定了基础。
关键词
油菜
mir
169
基因家族
靶基因
生物信息学
Keywords
Brassica
napus
L.
mir
169
gene
family
target
gene
bioinformatics
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杨树MIR169基因家族分子进化分析
刘志祥
曾超珍
谭晓风
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013
6
下载PDF
职称材料
2
油菜miR169基因家族的生物信息学分析及靶基因预测
阮先乐
王俊生
刘红占
陈良兵
赵锦慧
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2018
5
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职称材料
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