越来越多的证据表明,长非编码RNA在肿瘤发生发展中起着关键作用。FEZ家族锌指1反义RNA 1(FEZF1-AS1)是一种与肿瘤密切相关的长非编码RNA,对多种类型的恶性肿瘤产生致病作用,并与肿瘤患者的预后不良及化疗耐药性有关。因此,FEZF1-AS1有...越来越多的证据表明,长非编码RNA在肿瘤发生发展中起着关键作用。FEZ家族锌指1反义RNA 1(FEZF1-AS1)是一种与肿瘤密切相关的长非编码RNA,对多种类型的恶性肿瘤产生致病作用,并与肿瘤患者的预后不良及化疗耐药性有关。因此,FEZF1-AS1有可能成为一种新型的癌症临床诊断和预后生物标志物,为肿瘤治疗提供新的分子靶点。本研究利用中国知网和PubMed数据库,在中国知网中以“FEZF1-AS1”“癌症或肿瘤”为关键词,在PubMed中以“FEZF1-AS1”“cancer or tumor”为关键词,分别检索2012-01-01-2023-12-01相关文献。纳入标准:(1)FEZF1-AS1与癌症诊断与治疗;(2)FEZF1-AS1与癌症的发生发展;(3)FEZF1-AS1与癌症的耐药性。剔除标准:重复,及其发表时间较早的综述文章。最终纳入分析文献65篇。研究发现,FEZF1-AS1不仅可以通过海绵化miRNA、引发染色质表观遗传、与蛋白质相互作用、调节信号通路、与mRNA形成双链等5种机制,在胰腺癌、结直肠癌、肝癌、非小细胞肺癌、胃癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、卵巢癌、口腔鳞状细胞癌、喉鳞状细胞癌、视网膜母细胞瘤、骨髓瘤、骨肉瘤、乳腺癌、鼻咽癌、前列腺癌和膀胱癌等17种肿瘤的发生发展中起致病作用,而且与癌症的化疗耐药密切相关。提示FEZF1-AS1具有极好的潜力,有可能成为癌症早期诊断、治疗和改善人类癌症整体预后的重要分子标志物。展开更多
目的基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)构建结肠腺癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)临床预测模型与验证。方法从TCGA下载结肠腺癌转录组和临床数据,从基因集富集分析(gene set enrichm...目的基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)构建结肠腺癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)临床预测模型与验证。方法从TCGA下载结肠腺癌转录组和临床数据,从基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库及检索文献得到坏死性凋亡相关基因。运用R软件通过共表达筛选出差异坏死性凋亡相关LncRNA,采用单因素分析筛选出预后相关坏死性凋亡LncRNA,运用Lasso回归分析和多因素分析构建预后风险模型。通过差异分析、Kaplan-Meier生存分析、风险分析、受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)、临床分组模型验证以评价该模型的可行性和准确性。采用多因素进行模型的独立预后分析,同时绘制Nomogram图预测患者1年、3年和5年的生存率,凭借校准曲线评价其准确性和预测能力。结果坏死性凋亡LncRNA共1039个,预后相关的坏死性凋亡LncRNA共46个。Lasso回归分析以AP005264.1、ALMS1-IT1、AL354993.2、LINC00513、AC145423.2、AC008764.8构建预后风险模型,模型评价显示可区分高低风险组的患者,高风险的患者较低风险预后较差(P<0.05);AUC显示模型具有较高的准确性;多因素分析显示风险评分可作为结肠腺癌的独立预后因子;临床分组的模型验证显示模型同时适用于不同年龄、性别、Stage、N、T等临床症状;Nomgarm分析内部验证中显示校准曲线显示具有良好的拟合度,提示该列线图预测模型具有良好预测能力。GSEA富集分析结果显示在高风险组中活跃的功能或通路有缺口信号通路、磷脂酰肌醇信号系统、癌症的途径、JAKSTAT信号通路等,在低风险组中活跃的功能或通路有阿尔茨海默病、柠檬酸循环、亨廷顿病、氧化磷酸化等。结论本研究建立了6个坏死性凋亡展开更多
文摘越来越多的证据表明,长非编码RNA在肿瘤发生发展中起着关键作用。FEZ家族锌指1反义RNA 1(FEZF1-AS1)是一种与肿瘤密切相关的长非编码RNA,对多种类型的恶性肿瘤产生致病作用,并与肿瘤患者的预后不良及化疗耐药性有关。因此,FEZF1-AS1有可能成为一种新型的癌症临床诊断和预后生物标志物,为肿瘤治疗提供新的分子靶点。本研究利用中国知网和PubMed数据库,在中国知网中以“FEZF1-AS1”“癌症或肿瘤”为关键词,在PubMed中以“FEZF1-AS1”“cancer or tumor”为关键词,分别检索2012-01-01-2023-12-01相关文献。纳入标准:(1)FEZF1-AS1与癌症诊断与治疗;(2)FEZF1-AS1与癌症的发生发展;(3)FEZF1-AS1与癌症的耐药性。剔除标准:重复,及其发表时间较早的综述文章。最终纳入分析文献65篇。研究发现,FEZF1-AS1不仅可以通过海绵化miRNA、引发染色质表观遗传、与蛋白质相互作用、调节信号通路、与mRNA形成双链等5种机制,在胰腺癌、结直肠癌、肝癌、非小细胞肺癌、胃癌、胶质母细胞瘤、宫颈癌、卵巢癌、口腔鳞状细胞癌、喉鳞状细胞癌、视网膜母细胞瘤、骨髓瘤、骨肉瘤、乳腺癌、鼻咽癌、前列腺癌和膀胱癌等17种肿瘤的发生发展中起致病作用,而且与癌症的化疗耐药密切相关。提示FEZF1-AS1具有极好的潜力,有可能成为癌症早期诊断、治疗和改善人类癌症整体预后的重要分子标志物。
文摘目的基于癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)构建结肠腺癌坏死性凋亡相关长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)临床预测模型与验证。方法从TCGA下载结肠腺癌转录组和临床数据,从基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)数据库及检索文献得到坏死性凋亡相关基因。运用R软件通过共表达筛选出差异坏死性凋亡相关LncRNA,采用单因素分析筛选出预后相关坏死性凋亡LncRNA,运用Lasso回归分析和多因素分析构建预后风险模型。通过差异分析、Kaplan-Meier生存分析、风险分析、受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)曲线下面积(area under curve,AUC)、临床分组模型验证以评价该模型的可行性和准确性。采用多因素进行模型的独立预后分析,同时绘制Nomogram图预测患者1年、3年和5年的生存率,凭借校准曲线评价其准确性和预测能力。结果坏死性凋亡LncRNA共1039个,预后相关的坏死性凋亡LncRNA共46个。Lasso回归分析以AP005264.1、ALMS1-IT1、AL354993.2、LINC00513、AC145423.2、AC008764.8构建预后风险模型,模型评价显示可区分高低风险组的患者,高风险的患者较低风险预后较差(P<0.05);AUC显示模型具有较高的准确性;多因素分析显示风险评分可作为结肠腺癌的独立预后因子;临床分组的模型验证显示模型同时适用于不同年龄、性别、Stage、N、T等临床症状;Nomgarm分析内部验证中显示校准曲线显示具有良好的拟合度,提示该列线图预测模型具有良好预测能力。GSEA富集分析结果显示在高风险组中活跃的功能或通路有缺口信号通路、磷脂酰肌醇信号系统、癌症的途径、JAKSTAT信号通路等,在低风险组中活跃的功能或通路有阿尔茨海默病、柠檬酸循环、亨廷顿病、氧化磷酸化等。结论本研究建立了6个坏死性凋亡
