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京海黄鸡LYZ基因SNPs检测及其与生长、产蛋性能的联系 被引量：4
1
作者 侯启瑞 王金玉 +2 位作者 王慧华 李源 施会强 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期524-530,共7页
旨在探讨溶菌酶(lysozyme,LYZ)基因与生长和产蛋性能的关系。本研究以京海黄鸡育种场培育的慢速J+和常速J-两个品系F2代育种群为试验材料,对鸡LYZ基因外显子进行了SNP检测,分析了LYZ基因与生长和产蛋性能的关系。结果,在京海黄鸡LYZ基... 旨在探讨溶菌酶(lysozyme,LYZ)基因与生长和产蛋性能的关系。本研究以京海黄鸡育种场培育的慢速J+和常速J-两个品系F2代育种群为试验材料,对鸡LYZ基因外显子进行了SNP检测,分析了LYZ基因与生长和产蛋性能的关系。结果,在京海黄鸡LYZ基因外显子1和2上发现了3个突变位点(G111A、T1426C、C1492T);统计分析表明,AA基因型个体12、16周龄体质量显著高于GG和GA基因型个体,开产日龄小于GG和GA基因型个体(P<0.05);TT基因型个体4、8周龄体质量和开产体质量显著低于其他基因型个体,而TN基因型个体4、8周龄体质量和开产体质量显著高于其他基因型个体(P<0.05);不同单倍型在4～16周龄体质量和开产体质量差异显著(P<0.05);群体遗传学分析表明,3个突变位点的基因型在两品系间差异显著(P≤0.05)。初步推断鸡LYZ基因可能是控制京海黄鸡生长发育的主基因或与主基因紧密连锁。 展开更多
关键词 鸡 lyz基因 SNP 生长 产蛋性能 主基因
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牛亚科6个群体LYZ基因序列分析及系统进化研究 被引量：5
2
作者 陈仁金 杨章平 +5 位作者 毛永江 冀德君 常洪 陈莹 施雪奎 吴海涛 《扬州大学学报（农业与生命科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期30-33,共4页
对牛亚科6个群体溶菌酶(LYZ)基因的编码区核苷酸序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank上海福特牛该基因编码区核苷酸序列进行比对分析,并采用邻接法构建分子系统进化树。结果表明:在检测的样本中(水牛除外),有5个核苷酸多态位点,定义了9... 对牛亚科6个群体溶菌酶(LYZ)基因的编码区核苷酸序列进行PCR扩增和测序,结合GenBank上海福特牛该基因编码区核苷酸序列进行比对分析,并采用邻接法构建分子系统进化树。结果表明:在检测的样本中(水牛除外),有5个核苷酸多态位点,定义了9种单倍型;群内核苷酸多样性(Pi)在0.000 00~0.001 96之间,说明群体内遗传多样性程度较低。构建的分子系统发育树表明,瘤牛、蒙古牛、鲁西黄牛间关系密切,瘤牛和普通牛与牦牛关系相对较近,而与大额牛关系相对较远。 展开更多
关键词 牛亚科 lyz基因 序列分析 系统进化
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中国荷斯坦牛LYZ基因多态性及其与乳房炎的关联分析 被引量：3
3
作者 陈仁金 杨章平 +6 位作者 毛永江 陈莹 常玲玲 吴海涛 冀德君 李云龙 张亚琴 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第23期4936-4941,共6页
【目的】通过研究中国荷斯坦牛溶菌酶基因(lysozyme,LYZ)编码区多态性与乳房炎的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛LYZ基因进行多态性检... 【目的】通过研究中国荷斯坦牛溶菌酶基因(lysozyme,LYZ)编码区多态性与乳房炎的关联性,寻找与乳房炎相关的分子标记,加快中国荷斯坦牛的抗病育种进程。【方法】利用PCR-SSCP技术对30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛LYZ基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对LYZ基因的多态位点与SCS和305d产奶量进行相关分析【结果】LYZ基因的外显子1上存在115(T>G)突变位点,突变使精氨酸变为亮氨酸;突变位点经PCR-SSCP法检测发现了3种基因型TT、TG和GG,频率分别为0.270、0.508和0.222,χ2检验表明中国荷斯坦牛在该位点偏离Hardy-Weinberg平衡;GG基因型个体的SCS最小二乘均值极显著低于TT基因型个体(P<0.01),显著低于TG基因型个体(P<0.05);GG基因型个体的305d产奶量最小二乘均值极显著高于TT基因个体(P<0.01),显著高于TG基因型个体(P<0.05)。【结论】115(T>G)位点GG基因型,对中国荷斯坦牛的SCS和305d产奶量有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性的筛选。 展开更多
关键词 中国荷斯坦牛 lyz基因 PCR-SSCP 多态性 体细胞评分 305D产奶量 乳房炎抗性
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骨髓特异性高表达neuritin转基因小鼠的构建
4
作者 刘远志 周吉银 +2 位作者 张祚 李和教 黄毅岚 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2018年第10期1624-1627,1632,共5页
目的构建骨髓特异性高表达neuritin转基因小鼠并进行繁殖、基因型鉴定,为进一步研究neuritin蛋白治疗外周神经病变奠定基础。方法将2对转基因小鼠loxp-stop-loxp-neuritin与转基因小鼠lyz-Cre/+进行饲养和繁殖,对其子鼠提取尾组织DNA,采... 目的构建骨髓特异性高表达neuritin转基因小鼠并进行繁殖、基因型鉴定,为进一步研究neuritin蛋白治疗外周神经病变奠定基础。方法将2对转基因小鼠loxp-stop-loxp-neuritin与转基因小鼠lyz-Cre/+进行饲养和繁殖,对其子鼠提取尾组织DNA,采用PCR方法鉴定小鼠基因型,获取基因型neuritinloxp/+_lyz-Cre/+即为骨髓特异性高表达neuritin小鼠。选择C57BL/6j野生型小鼠作为对照,并通过组织免疫荧光检测小鼠骨髓neuritin的表达量,进一步验证neuritin loxp/+_lyz-Cre/+小鼠的准确性。结果 2种转基因纯合子小鼠均有繁殖能力,相互杂交其子鼠基因型为neuritin loxp/+_lyz-Cre/+、neuritin loxp/-_lyz-Cre/+、neuritin loxp/+_lyz-Cre/-、neuritin loxp/-_lyz-Cre/-,其繁殖结果基本符合孟德尔遗传定律。免疫荧光结果显示:neuritin loxp/+_lyz-Cre/+小鼠骨髓neuritin表达量显著高于野生型小鼠(P<0.05)。结论 PCR是小鼠基因型鉴定的可靠方法。雄性lyz-Cre/+小鼠与雌性neuritin loxp/+小鼠交配是获得neuritin loxp/+_lyz-Cre/+小鼠的有效途径。 展开更多
关键词 Neuritin基因 转基因小鼠 lyz-Cre Cre-Loxp系统 基因型鉴定
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农杆菌介导的Lyz-GFP基因对匍匐翦股颖Penn A-1转化和表达的研究 被引量：7
5
作者 安惠惠 马晖玲 +2 位作者 李坚 白生军 马祥 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第2期141-148,共8页
以匍匐翦股颖Penn A-1成熟胚为供试材料,建立了其植株高效再生体系。利用农杆菌介导法将溶菌酶与绿色荧光蛋白Lyz-GFP双元基因转入匍匐翦股颖Penn A-1胚性愈伤组织中,经培养获得抗病转基因植株。并对Lyz-GFP双元基因转化Penn A-1的适宜... 以匍匐翦股颖Penn A-1成熟胚为供试材料,建立了其植株高效再生体系。利用农杆菌介导法将溶菌酶与绿色荧光蛋白Lyz-GFP双元基因转入匍匐翦股颖Penn A-1胚性愈伤组织中,经培养获得抗病转基因植株。并对Lyz-GFP双元基因转化Penn A-1的适宜条件进行了研究。研究结果表明,在2.0mg/L 2,4-D+0.1mg/L 6-BA的MS培养基上Penn A-1愈伤组织诱导率最高,可达36%,且质量最好。愈伤组织在MSO+0.5mg/L NAA上分化率最高,达42.5%;浓度为300mg/L的头孢霉素(Cef)可抑制农杆菌LBA4404的生长;Penn A-1胚性愈伤组织经携有pBI121-Lyz-GFP的农杆菌LBA4404(OD600值0.3～0.5)侵染10～15min,共培养3d后,转化愈伤组织生长状况良好,转化率达12.5%,且在后期的生长和转化苗的再生中有良好的表现,转化苗再生率为27.5%;转化植株有较强的荧光表达量,并经PCR检测,获得的2株匍匐翦股颖Penn A-1转化植株中均扩增出750bp的目标基因片断。 展开更多
关键词 匍匐翦股颖 基因转化 溶菌酶lyz基因 绿色荧光蛋白GFP基因
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京海黄鸡LYZ基因外显子的遗传多态性及其与体重的关联分析 被引量：6
6
作者 侯启瑞 王金玉 +2 位作者 王慧华 李源 施会强 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第7期124-128,共5页
试验旨在研究鸡溶菌酶基因(LYZ)对鸡体重的影响。以200只京海黄鸡为研究群体,采用PCR-SSCP和DNA测序的方法检测LYZ基因单核苷酸多态性,并将所发现的SNPs与体重进行关联分析。结果发现,共3个突变位点,且均为沉默突变,未引起氨基酸序列的... 试验旨在研究鸡溶菌酶基因(LYZ)对鸡体重的影响。以200只京海黄鸡为研究群体,采用PCR-SSCP和DNA测序的方法检测LYZ基因单核苷酸多态性,并将所发现的SNPs与体重进行关联分析。结果发现,共3个突变位点,且均为沉默突变,未引起氨基酸序列的改变;经χ2适合性检验,除1411位点外,其他2个突变位点均显著偏离Hardy-Weinberg平衡;111位点AA基因型个体12和16周龄体重显著高于GG基因型个体(P<0.05),1411位点AA和GA基因型个体各周龄体重均高于GG基因型个体,且4周龄体重差异达到了显著水平(P<0.05),1426位点各基因型对体重没有显著影响(P>0.05)。单倍型分析结果显示,除4周龄外,ANC个体各周龄体重均较大,GAC个体4周龄体重较大,这与上述各位点基因型对体重影响的分析结果相一致,暗示在选种、育种过程中,可将鸡LYZ基因作为京海黄鸡体重候选基因应用于遗传标记辅助选择。 展开更多
关键词 鸡 溶菌酶基因lyz 体重 SNP PCR-SSCP
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Lyz-GFP双元基因在苜蓿愈伤组织中的转化 被引量：2
7
作者 韩斌 马晖玲 李云霞 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期352-357,共6页
利用农杆菌介导法将溶菌酶（Lyz）与绿色荧光蛋白（GFP）基因转入＂甘农1号＂杂花苜蓿（Medicago sativaMartyn）和＂甘农3号＂紫花苜蓿（Medicago sativaL.）品种中,获得含有该双元基因的苜蓿转基因愈伤组织;采用荧光检测和PCR扩增技术... 利用农杆菌介导法将溶菌酶（Lyz）与绿色荧光蛋白（GFP）基因转入＂甘农1号＂杂花苜蓿（Medicago sativaMartyn）和＂甘农3号＂紫花苜蓿（Medicago sativaL.）品种中,获得含有该双元基因的苜蓿转基因愈伤组织;采用荧光检测和PCR扩增技术,检测到溶菌酶Lyz和绿色荧光蛋白GFP基因在苜蓿愈伤细胞中的表达;研究该双元基因在苜蓿品种＂甘农1号＂和＂甘农3号＂中转化的若干影响因素,确定适宜的转化条件以期提高基因转化效率。结果表明：75 mg.L-1的卡那霉素对苜蓿愈伤组织的生长具有显著抑制效应;300 mg.L-1头孢霉素能够有效地抑制农杆菌LBA4404的生长;OD600值为0.4~0.5的农杆菌适宜的侵染时间是10 min;经预培养3~4 d的材料侵染后再共培养3 d之后,在愈伤组织诱导培养基MS＋2,4-D 2.0 mg.L-1＋KT 0.5 mg.L-1＋0.6%琼脂＋2.5%蔗糖的培养基上诱导出抗性愈伤组织;＂甘农1号＂和＂甘农3号＂的抗性愈伤组织诱导率分别为35%和32%。 展开更多
关键词 苜蓿 溶菌酶lyz基因 绿色荧光蛋白GFP基因 愈伤组织 农杆菌介导
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水牛胃型LYZ c基因多态性及功能生物信息学分析
8
作者 范新阳 张永云 +4 位作者 邱立华 陈涛 周芳廷 哈福 苗永旺 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期113-120,共8页
胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合... 胃型LYZ c的主要功能是裂解反刍动物胃中的微生物,释放营养物质,为机体提供养分。为了揭示水牛胃型LYZ c基因的遗传特征,采用PCR产物直接测序技术,对66头河流型和158头沼泽型水牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了比较基因组学和生物信息学分析。在水牛群体内共发现9个SNP位点,分别为c.87G>T、c.196G>A、c.228G>A、c.336G>C、c.351T>C、c.396C>T、c.423C>T、c.424G>A和c.438C>G,其中SNP87、SNP196、SNP336和SNP351仅存在于河流型水牛中,其他5个SNP为河流型和沼泽型水牛共享;SNP196和SNP424为异义替换,引起p.G66S和p.V142I氨基酸替换,但它们对水牛LYZ c的功能没有影响。在水牛胃型LYZ c基因中,共定义7种单倍型,确定了3种LYZ c变异体,其中变异体Buffalo1、Buffalo 2为两类水牛共享,Buffalo 3为河流型水牛独有。水牛这3种变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致。水牛与普通牛胃型LYZ c蛋白的上述特征也极相似,但水牛胃型LYZ c的等电点比普通牛更低。结果揭示水牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。 展开更多
关键词 水牛 胃型lyz C基因 前肠发酵 序列分析 生物信息学分析
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大额牛和牦牛胃型LYZ c基因多态性及其对消化功能的适应性分析
9
作者 范新阳 张自芳 +4 位作者 邱立华 钱林东 刘丽仙 张永云 苗永旺 《云南农业大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2018年第5期858-866,共9页
【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化... 【目的】为了阐明大额牛和牦牛胃型LYZ c基因的多态性及其对消化功能的适应。【方法】采用PCR产物直接测序技术,对35头大额牛和33头牦牛样品胃型LYZ c基因完整编码区序列进行了变异检测,并结合已发表的牛科物种同源序列进行了其对消化功能的适应性分析。【结果】在大额牛群体内共发现6个SNP位点,分别为c.196G>A、c.267T>C、c.270C>T、c.396C>T、c.423C>T和c.438C>G。在牦牛群体内共发现10个SNP位点,其中6个与大额牛共享,非共享的SNP位点分别为c.336G>C、c.348T>G、c.351T>C和c.375A>C。SNP196和SNP348为异义替换,引起p.G66S和p.H116Q氨基酸替换,但它们对大额牛和牦牛LYZ c的功能没有影响。在大额牛LYZ c基因中,共定义6种单倍型,确定了2种LYZ c蛋白变异体(Gayal 1和Gayal 2);而在牦牛LYZ c基因中,共定义12种单倍型,确定了3种LYZ c变异体(Yak 1～Yak 3);变异体Gayal 1与Yak 3、Gayal 2与Yak 1相同,而变异体Yak 2为牦牛独有。大额牛、牦牛和普通牛胃型LYZ c变异体之间在氨基酸组成、理化特性与结构上基本一致,但大额牛和牦牛变异体LYZ c等电点比普通牛S3型LYZ c更低。【结论】大额牛和牦牛胃型LYZ c蛋白可能更适合胃中的酸性环境,具有分解胃中微生物的功能。 展开更多
关键词 大额牛和牦牛 胃型lyz C基因 消化酶 序列分析 适应性分析
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