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高等植物特有的LBD基因的分子生物学功能研究进展 被引量:10
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作者 卢寰 时振英 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期833-846,共14页
LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN(LBD)基因家族是在拟南芥中发现的高等植物所特有的一类基因,编码的蛋白中含有LATERAL ORGAN BOUNDARIES(LOB)结构域。LBD基因一般在侧生器官与茎尖分生组织的边界处、侧生器官的近轴面一侧的基部表达,... LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN(LBD)基因家族是在拟南芥中发现的高等植物所特有的一类基因,编码的蛋白中含有LATERAL ORGAN BOUNDARIES(LOB)结构域。LBD基因一般在侧生器官与茎尖分生组织的边界处、侧生器官的近轴面一侧的基部表达,并呈现出在多种组织内特异性表达的特征,暗示该类基因可能在植物的多种发育过程中发挥功能。LBD蛋白结构中除含有上述LOB结构域以外,尚未发现其它已知功能的结构域的存在。目前,已经在拟南芥中发现43个LBD基因,而在玉米和水稻中各有35和43个LBD基因。根据LBD蛋白结构中是否含有亮氨酸拉链类似基序,将LBD基因分为两类:第一类(class I)LBD蛋白结构域中包含完整亮氨酸拉链基序;第二类(class II)LBD蛋白结构域中不含亮氨酸拉链基序。本文就LBD基因的结构以及它们对高等植物生长发育的影响、LBD基因和植物激素的关系、LBD基因与miRNA的关系进行了系统的总结。 展开更多
关键词 LBD基因 lob结构域 高等植物 茎尖分生组织 表达模式 蛋白结构 植物激素 miRNA
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LBD基因家族研究进展 被引量:8
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作者 石玉 沈诗雅 +3 位作者 张倩茹 孙振美 邬荣领 郭允倩 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2019年第4期738-745,共8页
LBD(lateral organ boundaries domain)基因家族因包含保守的LOB(lateral organ boundaries)结构域区段而得名,是一类植物所特有的转录因子。近期研究表明,该家族基因最早起源于早期陆生藻类植物,在进化过程中产生分化,从而具有多种生... LBD(lateral organ boundaries domain)基因家族因包含保守的LOB(lateral organ boundaries)结构域区段而得名,是一类植物所特有的转录因子。近期研究表明,该家族基因最早起源于早期陆生藻类植物,在进化过程中产生分化,从而具有多种生物学功能。早期关于LBD基因家族的生物学功能验证多集中于植物的侧生器官,近年研究发现,该家族基因还与植物再生、次生生长、环境胁迫信号响应等植物细胞生长调节过程密切相关。随着研究的深入,一个依赖于LBD基因家族参与调控的分子代谢调控网络逐渐清晰。该文主要对LBD基因家族的结构、分类、进化、生物学功能及参与的分子代谢调控网络进行综述性介绍,并对近年来关于该基因家族的最新研究进展进行系统阐述,为深入理解LBD基因家族在植物生长和发育过程中的重要作用提供帮助。 展开更多
关键词 LBD基因家族 lob结构域 功能 网络
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LBD基因家族在高等植物中的研究进展 被引量:5
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作者 李爱宏 张亚芳 +2 位作者 戴正元 张洪熙 潘学彪 《分子植物育种》 CAS CSCD 2006年第3期301-308,共8页
LBD基因是最近在高等植物中发现的为植物所特有的一类新的基因,含有保守的LOB(lateralor-ganboundaries)结构域。研究发现拟南芥和水稻中的LBD基因均为一大的基因家族,LBD基因参与了侧生器官原基的启动、侧生器官的形态建成以及侧生器... LBD基因是最近在高等植物中发现的为植物所特有的一类新的基因,含有保守的LOB(lateralor-ganboundaries)结构域。研究发现拟南芥和水稻中的LBD基因均为一大的基因家族,LBD基因参与了侧生器官原基的启动、侧生器官的形态建成以及侧生器官与茎尖分生组织(SAM,shootapicalmeristem)之间边界的建立,并与茎尖分生组织中特异表达的部分基因或基因家族间存在相互作用的关系,对高等植物地上部、地下部的特定器官的形成与发育具有重要影响。本文对LBD基因的结构域特征、在单/双子叶模式植物中的分类、表达特点、已克隆LBD基因的功能及与其它基因或基因家族间的相互作用关系进行了综述,并对LBD基因在高等植物中的功能冗余特性、LOB结构域可能所具有的基本功能和LBD基因与其它基因相互作用的分子机制进行了探讨。 展开更多
关键词 lob结构域 LBD基因家族 表达模式 功能 高等植物
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圆锥小麦ramosa2的克隆及其重组蛋白的DNA结合特性分析 被引量:2
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作者 唐如春 杨宇衡 +1 位作者 范三红 郭蔼光 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期439-446,共8页
【目的】从四倍体圆锥小麦中克隆ramosa2(TtRa2),分析其序列特征、组织表达特异性和体外活性,为阐明ramosa2与麦类作物穗形态建成关系奠定基础。【方法】利用半定量RT-PCR分析ramosa2在不同组织中的表达水平,将其重组到pET-21a-MBP载体... 【目的】从四倍体圆锥小麦中克隆ramosa2(TtRa2),分析其序列特征、组织表达特异性和体外活性,为阐明ramosa2与麦类作物穗形态建成关系奠定基础。【方法】利用半定量RT-PCR分析ramosa2在不同组织中的表达水平,将其重组到pET-21a-MBP载体并在T7 Express菌株中诱导表达。利用Amylose亲和层析柱纯化重组蛋白,通过凝胶阻滞试验对其DNA特异结合能力进行鉴定。【结果】TtRA2含有LOB和RA2结构域,属于Ⅰ类LBD蛋白家族成员。TtRa2在幼穗中高丰度表达,而在根、茎、叶、种子中未检测到表达。融合的TtRA2主要以可溶性形式存在,其表达量占总蛋白的68.6%。重组TtRA2可与包含核心序列"GCGGCG"的DNA探针特异性结合,两者形成的复合体的解离常数约为10 nmol.L-1。【结论】TtRa2参与圆锥小麦穗形态建成,其编码产物具备RA2-like转录因子的典型特征,具有类似拟南芥LOB的DNA结合特性。 展开更多
关键词 圆锥小麦 ramosa2 原核表达 lob结构域 凝胶迁移阻滞分析
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柱型苹果MdCoLBD1/2基因生物信息学及SNP分析 被引量:1
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作者 姜仁珍 刘政礼 +4 位作者 周亚平 侯鸿敏 祝军 戴洪义 张玉刚 《青岛农业大学学报(自然科学版)》 2017年第2期100-106,共7页
柱型苹果(Columnar apple)是苹果株型育种的珍贵资源。利用同源基因克隆方法,以柱型苹果‘威塞克旭’一年生枝上休眠期芽cDNA为模板,克隆得到了LOB DOMAIN家族(LBD)的2个同源基因,命名为MdCoLBD1/2,分别编码195和240个氨基酸。该基因有... 柱型苹果(Columnar apple)是苹果株型育种的珍贵资源。利用同源基因克隆方法,以柱型苹果‘威塞克旭’一年生枝上休眠期芽cDNA为模板,克隆得到了LOB DOMAIN家族(LBD)的2个同源基因,命名为MdCoLBD1/2,分别编码195和240个氨基酸。该基因有LBD家族的典型结构域,如C盒、GAS盒、亮氨酸拉链(Leu zipper)结构以及LOB Domain区域等。MdCoLBD1/2分别定位于第10条染色体Chr10:18985568..19005801和MdCoLBD2Chr10:18985594..19005850区间。MdCoLBD1/2与白梨、葡萄、草莓、椰子、梅、核桃的氨基酸的相似性均在60%以上。聚类分析表明MdCoLBD1和白梨、梅、草莓亲缘关系较近,MdCoLBD2与葡萄、核桃亲缘关系较近,MdCoLBD1/2与亚洲棉、陆地棉的聚类关系均较远。通过测序分析了MdCoLBD1/2基因在30个不同类型材料中的碱基序列差异,得到MdCoLBD1有8个碱基差异位点,MdCoLBD2有5个碱基差异位点。 展开更多
关键词 柱型苹果 lob结构域 MD CoLBD1/2基因 单核苷酸多态性
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