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利用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物克隆芒果LAX基因家族片段 被引量:10
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作者 李运合 孙光明 《热带作物学报》 CSCD 2011年第12期2278-2282,共5页
详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法,并利用这2个程序设计了8对简并引物,从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段,测序结果表明,这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在NCBI上进行blastx分析,这些序列与其它植物的LAX基... 详细介绍采用CODEHOP和iCODEHOP设计简并引物的方法,并利用这2个程序设计了8对简并引物,从芒果子叶中扩增到8条不同长度的cDNA片段,测序结果表明,这些片段包含4类不同的DNA序列。经过在NCBI上进行blastx分析,这些序列与其它植物的LAX基因具有高度同源性,因此推测,芒果中的LAX基因家族其至少包括4条同源基因。研究结果表明CODEHOP和iCODEHOP设计的简并引物可信性强并具有高效性。 展开更多
关键词 芒果 lax基因 简并引物 iCODEHOP 克隆
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一个控制水稻侧生小穗形成基因的遗传定位分析 被引量:1
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作者 冯志赟 符德保 +3 位作者 张亚芳 马玉银 李玲梅 吴昌银 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期483-490,共8页
水稻的穗是一个典型的圆锥花序,其发育形态直接影响水稻产量。本研究利用本课题组创建的水稻"中花11号"T-DNA插入突变体库,通过表型筛选鉴定了一个稀穗突变体。该突变体在营养生长阶段表现为分蘖数减少,生殖生长阶段稻穗一次... 水稻的穗是一个典型的圆锥花序,其发育形态直接影响水稻产量。本研究利用本课题组创建的水稻"中花11号"T-DNA插入突变体库,通过表型筛选鉴定了一个稀穗突变体。该突变体在营养生长阶段表现为分蘖数减少,生殖生长阶段稻穗一次枝梗发育正常、但二次枝梗数和侧生小穗数目显著减少,表现为明显的稀穗表型。分子检测结果表明该突变体不是由T-DNA插入导致的。通过与籼稻品种"珍汕97"构建F2遗传定位群体遗传分析表明:该突变性状受一个隐性基因所控制。采用图位克隆的方法将目标基因定位于4号染色体上的SSR标记RM16880和RM1205之间约120 kb范围内。基因组序列分析表明:该突变体是由于LAX2基因序列缺失60 bp所导致。该突变体是LAX2的一个新的等位突变体,命名为lax2-4。lax2-4为研究LAX2控制水稻穗形态建成的分子机制积累了遗传材料。 展开更多
关键词 水稻 侧生小穗 基因定位 lax2
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Genetic analysis and fine mapping of a lax mutant in rice 被引量:1
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作者 WANGYun XIAOHan +3 位作者 QIANQian LiHongchang LIShigui ZHULihuang 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第19期2072-2076,共5页
We have analyzed a lax mutant that exhibits altered panicle architecture in rice. The primary and secondary rachis-branches are normally initiated and each branch ends in a terminal spikelet, but all the lateral spike... We have analyzed a lax mutant that exhibits altered panicle architecture in rice. The primary and secondary rachis-branches are normally initiated and each branch ends in a terminal spikelet, but all the lateral spikelets are absent and the terminal spikelet displays variegated structures in the mutant. An F2 population from the cross between the lax mutant and a japonica variety, W11, was constructed and analyzed. Using microsatellite and CAPS markers, the lax locus was mapped on the long arm of chromosome 1, co-segregated with a CAPS marker, LZ1, within an interval of 0.28 cM between a CAPS marker, HB2, and a microsatellite marker, MRG4389. RT-PCR analysis revealed that the expressions of the rice B-function MADS-box genes OsMADS2, OsMADS4, OsMADS16 and OsMADS3 were significantly reduced, whereas the expression of the rice A-function gene RAP1A was not altered. 展开更多
关键词 基因分析 水稻 突变异种 微量标记 CAPS 基因定位
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毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 杨乐 张康 李龙 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期89-95,共7页
AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析。结果表明,PheAUX1/LAX候选基因分为Clas... AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用。利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析。结果表明,PheAUX1/LAX候选基因分为ClassⅠ和ClassⅡ2个亚组,其中classⅠ的候选基因包含6~7个外显子,而ClassⅡ的候选基因包含8~10个外显子。不同组织器官转录组数据分析表明多数ClassⅠ候选成员在毛竹冬笋中高丰度表达,而ClassⅡ中的PH02Gene38722.t在跳鞭中高丰度表达。通过qRT-PCR对AUX1/LAX候选基因在不同生长发育时期笋中的表达量分析表明,有6个候选基因与对照相比呈现出不同程度的上调表达,表明PheAUX1/LAX候选基因广泛参与毛竹笋的生长发育。本研究将为进一步研究毛竹AUX1/LAX基因的功能和调控机制奠定理论基础。 展开更多
关键词 AUX1/lax 毛竹 基因表达 生物信息学
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水稻稀穗突变体的遗传分析及其基因的初步定位 被引量:1
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作者 马洪丽 温婵 +1 位作者 吕巧香 张书标 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期2106-2112,共7页
水稻的穗形与其产量关系密切,也是研究的一大热点。利用60Co-γ射线辐射诱变水稻68902B,筛选到一个水稻稀穗突变体,暂命名为Oslp(Oryza sativa lax panicle)。研究了该突变体的主要农艺性状与稀穗的遗传方式,并对稀穗突变基因Oslp进行... 水稻的穗形与其产量关系密切,也是研究的一大热点。利用60Co-γ射线辐射诱变水稻68902B,筛选到一个水稻稀穗突变体,暂命名为Oslp(Oryza sativa lax panicle)。研究了该突变体的主要农艺性状与稀穗的遗传方式,并对稀穗突变基因Oslp进行了分子定位。结果显示稀穗突变体Oslp的每穗粒数为104粒、二次枝梗数目为7个,它们都显著地少于原品种68902B每穗粒数的124粒和二次枝梗数目的 20个。遗传分析揭示突变体Oslp的稀穗性状受一对隐性核基因控制。将(籼稻品种261S×稀穗突变体Oslp)F2代中的稀穗个体作为定位群体,结合BSA和SSR分子标记技术,将基因Oslp定位在第7号染色体短臂的2个分子标记FR-3和FR-4之间,基因Oslp与FR-3和FR-4的遗传距离分别为0.6 c M和0.8 c M。 展开更多
关键词 水稻 稀穗突变体Oslp 遗传分析 基因定位
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