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旧城改造的社会性思考 被引量：43
1
作者 张伊娜 王桂新 《城市问题》 CSSCI 北大核心 2007年第7期97-101,共5页
改革开放以来,土地的有偿使用、房地产业的兴起和市场经济机制的运作,使停滞不前的城市旧区改造获得前所未有的机遇,旧城区改建步伐大大加快。然而不少实践表明,改建的目标多从经济角度出发,忽略了从和谐的、长远发展的社会性角度去制... 改革开放以来,土地的有偿使用、房地产业的兴起和市场经济机制的运作,使停滞不前的城市旧区改造获得前所未有的机遇,旧城区改建步伐大大加快。然而不少实践表明,改建的目标多从经济角度出发,忽略了从和谐的、长远发展的社会性角度去制定相应策略,以致出现众多问题。从旧城改造的社会性角度出发,分析了目前改造面临的种种问题,以期决策和实践者加以注意,避免留下改造后的社会久远隐患。 展开更多
关键词 旧城改造 社会性 交往网络
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基于整合药理学平台的桂枝-白芍药对抗脓毒症的分子机制研究 被引量：16
2
作者 杨清鑫 吕红君 +2 位作者 王小博 姜蕾 曾南 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第13期2691-2700,共10页
桂枝汤属于解表剂,为中医经典复方,临床上治疗脓毒症的疗效确切。但由于经方的复杂性,其抗脓毒症的机制难以明确,'桂枝-白芍'药对为调和营卫经典配伍,是桂枝汤的核心,该研究以桂枝-白芍为研究对象,借助整合药理学平台(TCMIP,htt... 桂枝汤属于解表剂,为中医经典复方,临床上治疗脓毒症的疗效确切。但由于经方的复杂性,其抗脓毒症的机制难以明确,'桂枝-白芍'药对为调和营卫经典配伍,是桂枝汤的核心,该研究以桂枝-白芍为研究对象,借助整合药理学平台(TCMIP,http://www.tcmip.cn/),进行桂枝-白芍化学成分分析、疾病靶标预测、基因功能和通路富集分析,并建立'中药-化学成分-核心靶标-关键通路'的多维网络关系,对桂枝-白芍治疗脓毒症的作用机制进行探讨。'桂枝-白芍'药对预测结果表明桂枝-白芍药对抗脓毒症主要与45个化学成分相关,其活性成分可针对多个靶点、多条通路发挥抗脓毒症的作用,其作用涉及PF4,MyD88,TLR4,BDKRB2,CD14,NOS3等炎症靶标,主要通过Toll样受体信号通路、叉头转录因子Fox O信号通路、趋化因子信号通路等炎症通路、甲状腺素、胰岛素信号通路等代谢通路、催产素信号通路、雌激素信号通路等与内分泌系统相关通路来调节脓毒症。该研究为进一步开发桂枝-白芍药对及桂枝汤抗脓毒症的作用机制提供了科学依据。 展开更多
关键词 桂枝-白芍 药对 整合药理学 脓毒症 作用机制 靶点 通路分析 相互作用网络
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基于项目的协作学习互动网络分析 被引量：11
3
作者 林雪芬 《远程教育杂志》 CSSCI 2015年第1期80-86,共7页
互动分析是探究协作学习规律和把握协作学习过程变化的核心。通过七周的实验和运用SNA软件、Ucinet及SPSS进行数据处理与研究发现,整个社会网络的连接数、密度、互惠性、平均度、聚类系数等都有不同程度的提高;小组内高度互动,小组间互... 互动分析是探究协作学习规律和把握协作学习过程变化的核心。通过七周的实验和运用SNA软件、Ucinet及SPSS进行数据处理与研究发现,整个社会网络的连接数、密度、互惠性、平均度、聚类系数等都有不同程度的提高;小组内高度互动,小组间互动较少;小组密度与小组绩效的相关性极为显著,凝聚子群密度在一定程度上可考察团体的互动情况,辅助判定协作学习是否有效发生;中心度能反映成员及小组的活跃程度,但和学习绩效没有直接关系。 展开更多
关键词 CPBL 协作学习 社会网络分析 互动网络 互动分析
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基于网络药理学探讨归肾丸治疗卵巢早衰的作用机制 被引量：11
4
作者 邵芷若 关永格 《中药新药与临床药理》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1332-1342,共11页
目的通过网络药理学的方法探讨归肾丸治疗卵巢早衰的信号通路,并预测其可能的作用机制。方法通过计算系统生物学实验室(TCMSP)检索归肾丸中熟地黄、菟丝子、山药、枸杞、山茱萸、杜仲、当归、茯苓等8味中药组成的化合物,设置口服生物利... 目的通过网络药理学的方法探讨归肾丸治疗卵巢早衰的信号通路,并预测其可能的作用机制。方法通过计算系统生物学实验室(TCMSP)检索归肾丸中熟地黄、菟丝子、山药、枸杞、山茱萸、杜仲、当归、茯苓等8味中药组成的化合物,设置口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18筛选药物的有效活性成分及对应靶点;利用Genecards数据库、OMIM数据库获取卵巢早衰的疾病靶点基因;通过venny R软件获取药物-疾病的179个交集作用靶点,并输入String数据库及Cytoscape 3.7.2软件构建"药物-成分-靶点-疾病"的可视化网络;通过Enrichr数据库、David 6.8数据库进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果归肾丸中药物组成的活性成分有121个,卵巢早衰的疾病靶点有4131个;通过Venny软件得到179个交集靶点,归肾丸治疗卵巢早衰的映射率为4.3%;将179个交集靶点导入String数据库得到由164个节点(node)、673条边(edge)构成的平均节点度为7.52、平均局部聚类系数为0.476的"药物-疾病"蛋白互作网络图;GO富集分析通过Enrichr数据库共得到146条富集结果(P<0.01),并选取靠前排名20位的富集结果绘图;通过David 6.8数据库进行GO功能注释分析,设置P<0.01,结果显示涉及70个生物过程(BP)、15个细胞组分(CC)、21个分子功能(MF);KEGG信号通路富集分析利用David数据库筛选相关信号通路富集结果,共获得144条信号通路(P<0.01),绘制排名靠前20位的信号通路气泡图。结论归肾丸可能通过多成分、多靶点、多通路实现改善卵巢早衰的作用,为进一步的实验研究及临床运用提供了思路和理论依据。 展开更多
关键词 归肾丸 卵巢早衰 网络药理学 作用机制 互作网络
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基于谱毒关系和肝毒网络整合模式的柴胡水煎液肝毒物质基础研究 被引量：10
5
作者 侯磊 王亮 +1 位作者 刘闰平 孙蓉 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期2798-2806,共9页
目的研究柴胡水煎液HPLC指纹图谱及体外肝毒性的谱毒关系,构建柴胡水煎液致肝毒性的作用网络,整合谱毒关系和网络毒理学预测柴胡水煎液致肝毒性的物质基础。方法采用HPLC法建立10批次柴胡水煎液的指纹图谱;测定柴胡水煎液对正常人肝细胞... 目的研究柴胡水煎液HPLC指纹图谱及体外肝毒性的谱毒关系,构建柴胡水煎液致肝毒性的作用网络,整合谱毒关系和网络毒理学预测柴胡水煎液致肝毒性的物质基础。方法采用HPLC法建立10批次柴胡水煎液的指纹图谱;测定柴胡水煎液对正常人肝细胞L02中丙氨酸转氨酶(ALT)、天冬氨酸转氨酶(AST)的含量;采用灰色关联分析法进行谱毒关联分析,初步确定肝毒性成分。结合网络毒理学,预测肝毒性候选成分。整合分析探究柴胡水煎液致肝毒性的成分。结果建立了柴胡水煎液指纹图谱,共标定29个共有峰;根据灰色关联度大小排序,13、12、8、26、10、14、27、11号共有峰与L02细胞ALT含量有较高关联度;12、13、26、8、10、14、27、11号共有峰与L02细胞AST含量有较高关联度。网络毒理学推测柴胡致肝毒性的成分为豆甾醇、黄芩苷等17个;整合分析确定柴胡致肝毒性的成分为共有峰13、12、8、26、10、14、27、11代表的成分及豆甾醇、黄芩苷、柴胡皂苷D等。结论柴胡水煎液致肝毒性是多种成分共同作用的结果,本研究可对下一步柴胡水煎液致肝毒性的物质基础研究提供数据支持。 展开更多
关键词 柴胡 肝毒性 谱毒关系 作用网络 网络毒理学 物质基础 HPLC 指纹图谱 L02细胞 丙氨酸转氨酶 天冬氨酸转氨酶 灰色关联分析法 整合分析 豆甾醇 黄芩苷 柴胡皂苷D
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绵、山羊毛囊发育与毛发弯曲机制研究进展 被引量：10
6
作者 肖平 仲涛 +3 位作者 刘占发 浦亚斌 马月辉 赵倩君 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期1567-1576,共10页
毛囊作为唯一的一个终生呈周期性生长的微器官,其生长、代谢都处于一个相对活跃的状态。毛发是由毛囊生长发育后的终末分化细胞构成,是一个持续不断生长的结构。毛发的生长依赖于毛囊结构干细胞特性的分裂、增殖、分化,因此毛发生长的... 毛囊作为唯一的一个终生呈周期性生长的微器官,其生长、代谢都处于一个相对活跃的状态。毛发是由毛囊生长发育后的终末分化细胞构成,是一个持续不断生长的结构。毛发的生长依赖于毛囊结构干细胞特性的分裂、增殖、分化,因此毛发生长的形态变化取决于毛囊结构生长发育的情况。随着研究方法的不断进步与更新,近年来针对毛发弯曲性状分子遗传学层面的研究进展较迅速,一些影响毛囊形态发育和毛发弯曲过程的基因和调控通路相继被发现和鉴定。本文旨在先通过对毛囊结构及其形态发生特点的剖析,进一步对近年来毛囊各细胞层在毛发弯曲产生的影响和特异性调控基因的相关研究进行归纳,绘制出与毛囊发育相关的经典通路和相关调控基因的互作网络,为今后对羊毛弯曲动态现象的分子机理研究提供参考。 展开更多
关键词 毛囊发育 毛发 弯曲 互作网络
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基于中药整合药理学平台分析黄连汤治疗胃炎的作用机制 被引量：10
7
作者 吴智春 于华芸 +3 位作者 张成博 马婷 宗鑫 季旭明 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期57-62,共6页
目的:探讨黄连汤治疗胃炎的功效物质基础和可能的作用机制,为该复方的后续应用与研发提供参考。方法:利用中药整合药理学平台预测黄连汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,构建黄连汤成分靶标-疾病靶标网络,筛选关键节点进行通路富集分... 目的:探讨黄连汤治疗胃炎的功效物质基础和可能的作用机制,为该复方的后续应用与研发提供参考。方法:利用中药整合药理学平台预测黄连汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,构建黄连汤成分靶标-疾病靶标网络,筛选关键节点进行通路富集分析,探索黄连汤多成分-多靶点-多通路治疗胃炎的可能作用机制。结果:黄连汤预测的175个活性成分与胃炎相关的538个关键靶标相互作用,通过趋化因子、雌激素和T细胞受体等信号通路参与幽门螺旋杆菌感染侵润、胃黏膜损伤、胃黏膜萎缩等胃炎发生与发展过程中病理环节的调控。结论:该研究初步揭示了黄连汤治疗胃炎的潜在活性成分及其可能的作用机制,为该方进一步的药效物质基础和作用机制实验研究提供了理论依据。 展开更多
关键词 黄连汤 整合药理学 胃炎 作用机制 靶点 通路分析 相互作用网络
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北京东灵山土壤动物-植物互作关系对海拔格局的响应 被引量：8
8
作者 丁彰琦 徐国瑞 +2 位作者 张霜 张育新 马克明 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第7期2741-2750,共10页
土壤动物可能会与植物形成复杂的互作网络,有关其对海拔梯度做出响应的研究还相对较少,了解不同生境下的生态网络为理解和预测系统的稳定性及其动态变化机制提供了新途径。于北京东灵山地区调查了沿海拔梯度凋落物层与土壤层中的土壤动... 土壤动物可能会与植物形成复杂的互作网络,有关其对海拔梯度做出响应的研究还相对较少,了解不同生境下的生态网络为理解和预测系统的稳定性及其动态变化机制提供了新途径。于北京东灵山地区调查了沿海拔梯度凋落物层与土壤层中的土壤动物以及木本和草本植物的多样性,并通过零模型的方法对比了土壤动物-植物互作网络特征参数的标准化效应值在高-中-低三个海拔段的差异。结果显示:土壤动物的稀有类群在中海拔段多样性较高,木本植物多样性随海拔降低,而草本植物多样性则随海拔升高。各生物类群组成都随海拔距离而增加,存在明显的聚集性分布格局。植物与土壤动物之间的互作网络特征参数不仅随海拔改变,且在凋落物与土壤层之间、木本与草本植物之间存在差异。总体而言,土壤动物与木本植物互作网络的海拔变化主要与土壤动物多样性有关,而与草本的互作网络则与草本植物多样性有关。沿海拔梯度,存在土壤动物-木本植物向土壤动物-草本植物网络的适应性转变。本研究在同一海拔梯度上探讨了不同层土壤动物与植物的互作关系,对深入理解山地生态系统中各生物类群的共存机制具有重要意义。 展开更多
关键词 土壤动物-植物 多样性 互作网络 海拔梯度 嵌套性
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学术社交网络中iSchool成员机构的学科交互关系研究 被引量：6
9
作者 严炜炜 刘倩 曹灿瑜 《情报理论与实践》 CSSCI 北大核心 2020年第3期59-64,共6页
[目的/意义]学术社交网络吸引了众多科研人员参与并使用,对学术社交网络中的学科交互研究有利于促进科研人员利用学术社交网络开展非正式交流及跨学科合作。[方法/过程]文章以ResearchGate(RG)为例,将iSchool成员机构作为研究对象,获取6... [目的/意义]学术社交网络吸引了众多科研人员参与并使用,对学术社交网络中的学科交互研究有利于促进科研人员利用学术社交网络开展非正式交流及跨学科合作。[方法/过程]文章以ResearchGate(RG)为例,将iSchool成员机构作为研究对象,获取61所iSchool机构成员用户的交互关系数据,并对其中的2798所机构及其间所形成的30393条交互关系数据进行社会网络分析。[结果/结论]从交互数量来看,iSchool成员机构在学术社交网络中的学科交互范围较广,但跨学科影响力有限,其跨学科交互情况反映了目前图情学科领域的跨学科研究趋势和研究热点;从交互关系网络来看,iSchool成员机构整体学科交互关系网络结构较为松散,网络还呈现出iSchool成员机构分别主要与人文与社会科学类和工程与技术科学类的机构产生交互关系的两种趋势。此外,对学术社交网络中交互关系的拓展和学术影响力的提高有利于科研合作的开展和学术声望的提升。 展开更多
关键词 学术社交网络 学科交互 关系网络 ISCHOOL
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基于注意力融合网络的方面级多模态情感分类
10
作者 冼广铭 招志锋 阳先平 《计算机系统应用》 2024年第2期94-104,共11页
方面级多模态情感分类任务的一个关键是从文本和视觉两种不同模态中准确地提取和融合互补信息,以检测文本中提及的方面词的情感倾向.现有的方法大多数只利用单一的上下文信息结合图片信息来分析,存在对方面和上下文信息、视觉信息的相... 方面级多模态情感分类任务的一个关键是从文本和视觉两种不同模态中准确地提取和融合互补信息,以检测文本中提及的方面词的情感倾向.现有的方法大多数只利用单一的上下文信息结合图片信息来分析,存在对方面和上下文信息、视觉信息的相关性的识别不敏感,对视觉中的方面相关信息的局部提取不够精准等问题,此外,在进行特征融合时,部分模态信息不全会导致融合效果一般.针对上述问题,本文提出一种注意力融合网络AF-Net模型去进行方面级多模态情感分类,利用空间变换网络STN学习图像中目标的位置信息来帮助提取重要的局部特征;利用基于Transformer的交互网络对方面和文本以及图像之间的关系进行建模,实现多模态交互;同时补充了不同模态特征间的相似信息以及使用多头注意力机制融合多特征信息,表征出多模态信息,最后通过Softmax层取得情感分类的结果.在两个基准数据集上进行实验和对比,结果表明AF-Net能获得较好的性能,提升方面级多模态情感分类的效果. 展开更多
关键词 多模态 情感分类 空间变换网络 交互网络 相似信息 注意力融合网络
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社会组织参与全球治理研究述评 被引量：7
11
作者 闫海潮 杨丽 《社会科学》 CSSCI 北大核心 2017年第6期38-46,共9页
基于社会组织和全球治理视角研究社会组织参与全球治理是当前两种主要的研究路径。前者主要涉及社会组织参与全球治理的合法性、参与方式以及在全球治理中的作用、地位等;后者主要集中于当前全球治理体系不利于社会组织参与的理念与机制... 基于社会组织和全球治理视角研究社会组织参与全球治理是当前两种主要的研究路径。前者主要涉及社会组织参与全球治理的合法性、参与方式以及在全球治理中的作用、地位等;后者主要集中于当前全球治理体系不利于社会组织参与的理念与机制,社会组织与政府间国际组织、其它社会组织等如何共建关系网络参与全球治理等问题。社会组织参与全球治理未来可重点拓展以下三条研究线索:第一,更加注重从互动网络角度研究社会组织参与全球治理的网络;第二,基于中国国家战略和社会组织现状拓宽研究思路、视角与方法;第三,更加注重社会组织参与全球治理的战略与机制等微观问题研究。 展开更多
关键词 全球治理 社会组织 非政府组织 互动网络
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基于网络药理学的二甲双胍/多奈哌齐治疗糖尿病脑病的机制
12
作者 赵丽 李福智 +5 位作者 甄露露 王宏烨 于简瑞 钟家旺 郭笑川 侯阳 《锦州医科大学学报》 CAS 2024年第2期40-44,50,共6页
目的应用网络药理学的研究方法预测二甲双胍/多奈哌齐治疗糖尿病脑病的作用机制并初步进行动物实验。方法Drugbank和DisGeNET数据库检索二甲双胍/多奈哌齐和糖尿病脑病靶点,得到交集靶点。使用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作... 目的应用网络药理学的研究方法预测二甲双胍/多奈哌齐治疗糖尿病脑病的作用机制并初步进行动物实验。方法Drugbank和DisGeNET数据库检索二甲双胍/多奈哌齐和糖尿病脑病靶点,得到交集靶点。使用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络(PPI),DAVID数据库对交集靶点进行功能(gene ontology,GO)和通路(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,筛选出关键基因,动物实验进行初步验证。结果药物和疾病共同靶点15个、10个hub基因;GO功能注释结果显示:交集靶点主要富集于离子型谷氨酸受体信号通路、化学突触传递等。KEGG通路富集分析表明交集靶点的KEGG信号通路主要为Cocaine addiction、Nicotine addiction等。动物实验结果显示,二甲双胍/多奈哌齐能改善糖尿病学习认知能力,改善脑组织IL1B和ACHE的改变。结论可通过调节GRIN2B、GRIN2A、GRIN1、GRIN2C、GRIN2D、GRIN3A、NOS1、GRIN3B、IL1B、ACHE等靶点基因,调控Cocaine addiction,Nicotine addiction,Amphetamine addiction,cAMP signaling pathway等信号通路来实现抗糖尿病脑病作用,并初步验证。 展开更多
关键词 网络药理学 糖尿病脑病 二甲双胍/多奈哌齐 交互网络 hub基因
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智能物质的创制与应用
13
作者 蒋冯逸 邵宇 张文彬 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第26期3914-3924,共11页
人工智能的崛起正深刻地影响着我们的社会,也催生出智能物质这一新兴的交叉研究领域.智能物质是由分子组装而成的复杂物质体系,包含传感、存储和驱动基元及其之间的相互作用网络.复杂相互作用导致“涌现”现象的产生,使智能物质能够胜... 人工智能的崛起正深刻地影响着我们的社会,也催生出智能物质这一新兴的交叉研究领域.智能物质是由分子组装而成的复杂物质体系,包含传感、存储和驱动基元及其之间的相互作用网络.复杂相互作用导致“涌现”现象的产生,使智能物质能够胜任特定的功能,并可实现自主的学习、适应和进化.目前,智能物质的创制主要有“自下而上”和“自上而下”两种策略,前者通过设计分子基元及其相互作用,构造全新的智能体系;后者通过改造生命体等已有体系,赋予全新的功能角色.智能物质具有独特的应用场景,本文以柔性器件与软体机器人、生物医学应用为例,阐述了智能物质的优势和广阔前景.智能物质的研究是物质科学的机遇与挑战,也是人工智能领域的新方向. 展开更多
关键词 智能物质 分子组装 相互作用网络 涌现 合成生物学 软体机器人
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抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点相关神经细胞类型及相互作用网络分析
14
作者 赵弘毅 丁伟健 +3 位作者 冯飞翔 宋文正 刘书齐 高蕾 《生物信息学》 2024年第2期124-133,共10页
基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102个易感基因.。使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270个校正之后显著的基因,两者合... 基于抑郁症的全基因组关联分析研究(GWAS),对于获得的单核苷酸多态性位点(SNP)使用Haploreg软件进行基因注释,得到SNP注释的102个易感基因.。使用MAGMA软件对GWAS的汇总统计数据做基因水平的分析,获得了270个校正之后显著的基因,两者合并共得到320个抑郁症易感基因。通过药物数据库Drugbank获取133个抗抑郁药物靶点基因。使用EWCE包对抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点在三套脑组织单细胞测序数据中,分别进行神经细胞类型富集分析。结果发现大脑皮质的GABA神经元(抑制性神经元)和谷氨酸能神经元(兴奋性神经元)是抑郁症易感基因和抗抑郁药物靶点共同的神经元。这两种类型的神经细胞可能是抗抑郁药物与抑郁症易感基因相互作用的神经细胞,另外少突胶质前体细胞可能是抑郁症特有的易感神经细胞。使用Network Calculator软件构建网络并进行进行网络拓扑学参数分析。结果表明抑郁症易感基因与抗抑郁药物靶点组成了一个具有显著的相互连接的网络。本研究从单细胞层面揭示抑郁症的遗传机制,在网络层面为寻找新的抗抑郁药物靶点提供了一定的启示。 展开更多
关键词 单细胞测序 抑郁症易感基因 抗抑郁药物靶点 神经细胞 相互作用网络
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森林破碎化对鼠类—种子互作网络的影响 被引量：6
15
作者 赵清建 顾海峰 +2 位作者 严川 曹科 张知彬 《兽类学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期15-23,共9页
森林碎片化严重威胁生态系统的健康,导致物种多样性、生态系统稳定性的降低。鼠类和森林种子是一类重要的互作网络,在生物多样性维持和生态系统服务功能上发挥着重要作用,有关森林斑块大小及演替阶段对鼠类—种子互作网络的影响的报道... 森林碎片化严重威胁生态系统的健康,导致物种多样性、生态系统稳定性的降低。鼠类和森林种子是一类重要的互作网络,在生物多样性维持和生态系统服务功能上发挥着重要作用,有关森林斑块大小及演替阶段对鼠类—种子互作网络的影响的报道较少。本研究以都江堰地区亚热带森林鼠类—种子互作系统为例,选取15个不同大小和演替阶段的森林斑块,结合红外相机监测和种子标记,通过监测鼠类与种子的互作过程,分析了斑块大小和演替阶段对鼠类—种子互作关系的影响,并绘制了各斑块鼠类—种子互作网络图谱,发现:中斑块(2-4 hm^2)森林中鼠类的物种数最多,大斑块(9-30 hm^2)最少;演替后期(20-40 yrs)次生林的加权嵌套度(Weighted-Interaction Nestedness Estimator,WINE)显著地高于演替早期(10-20 yrs)次生林;原始林网络内相关植物的植株总数和胸径(DBH)总和都要显著大于次生林。我们的结果说明森林破碎化对鼠类—种子互作网络的加权嵌套度有一定影响,对其他网络参数影响不大,可能与其种间关系泛化度较大有关。该结果对进一步研究种间互作关系及生态网络结构与功能具有一定的参考意义。 展开更多
关键词 森林破碎化 斑块大小 演替 鼠类 种子 互作网络
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山西陈醋酿造微生物群落结构及其互作网络分析 被引量：5
16
作者 寇蓉 董弘毅 +2 位作者 何永吉 邢俊德 范晓军 《中国酿造》 CAS 北大核心 2022年第4期59-64,共6页
为揭示山西陈醋酿造过程微生物群落的演替规律和相互作用,采用高通量测序技术对6个不同发酵阶段醋醅样品的微生物群落组成结构和多样性进行分析,通过斯皮尔曼相关系数(SCC)计算得到物种相关系数矩阵后,并利用互作网络数据可视化的软件Cy... 为揭示山西陈醋酿造过程微生物群落的演替规律和相互作用,采用高通量测序技术对6个不同发酵阶段醋醅样品的微生物群落组成结构和多样性进行分析,通过斯皮尔曼相关系数(SCC)计算得到物种相关系数矩阵后,并利用互作网络数据可视化的软件Cytoscape 3.7.2研究发酵菌群的共存关系网络。结果表明,醋醅中细菌群落多样性远高于真菌群落。醋醅中优势细菌属为乳酸杆菌属(Lactobacillus)和醋酸杆菌属(Acetobacter),优势真菌属为复膜孢酵母属(Saccharomycopsis)。细菌互作网络分析表明,醋酸杆菌属(Acetobacter)与乳酸杆菌属(Lactobacillus)、魏斯氏菌属(Weissella)具有显著的拮抗性;乳酸杆菌属(Lactobacillus)和魏斯氏菌属(Weissella)存在协同作用。真菌互作网络分析表明,复膜孢酵母属(Saccharomycopsis)与链格孢属(Alternaria)存在显著负相关关系。 展开更多
关键词 山西陈醋 高通量测序 微生物群落 互作网络
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农户互动网络特征、功能及培育建议 被引量：6
17
作者 罗庆 李小建 《经济地理》 CSSCI 北大核心 2010年第5期808-813,共6页
农户互动网络正成为农区发展研究的重要内容。农户互动网络具有嵌入性、多功能性、动态性和传承性等一般特征。根据网络结构特征,可划分为共和型互动网络、轮轴型互动网络和核心—边缘型互动网络。从功能角度看,具有资源配置、分工协作... 农户互动网络正成为农区发展研究的重要内容。农户互动网络具有嵌入性、多功能性、动态性和传承性等一般特征。根据网络结构特征,可划分为共和型互动网络、轮轴型互动网络和核心—边缘型互动网络。从功能角度看,具有资源配置、分工协作、技术扩散和技术创新等功能。在不同的发展阶段,以某一种经济功能为主。在此基础上,提出农户互动网络的培育应从重视培育农户创业精神、加强软硬件环境建设、适度加大网络的异质性和多样性、支持引导农户合作组织的建立、加大对孤立农户扶持力度和充分发挥各种类型行动者的作用等方面入手。 展开更多
关键词 农户 互动网络 特征 功能
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褪黑素联合纳洛酮对肝内胆汁淤积的作用及机制研究 被引量：2
18
作者 毕华 郑晓明 +2 位作者 马鑫 王永欣 崔晓燕 《中国医药科学》 2023年第13期30-34,共5页
目的应用生物信息学研究方法探讨纳洛酮联合褪黑素治疗胆汁淤积的作用及机制,并采用动物实验进行初步验证。方法通过Drugbank、DisGeNET、String、DAVID网络资源和Cytoscape软件,获得褪黑素、纳洛酮及胆汁淤积疾病相关基因,获得药物与... 目的应用生物信息学研究方法探讨纳洛酮联合褪黑素治疗胆汁淤积的作用及机制,并采用动物实验进行初步验证。方法通过Drugbank、DisGeNET、String、DAVID网络资源和Cytoscape软件,获得褪黑素、纳洛酮及胆汁淤积疾病相关基因,获得药物与疾病靶基因交集,利用DAVID对交集靶点基因进行功能富集分析。动物实验采用α-萘异硫氰酸酯(ANIT)诱导胆汁淤积大鼠模型。进行肝脏功能相关的血清生化指标检测及病理学研究。结果获得药物和疾病交集靶点22个。主要富集于磷脂酰肌醇3-激酶信号、信号转导等通路。动物实验结果显示,纳洛酮联合褪黑素可明显改善模型组大鼠生化指标、肝脏病理变化,提高肝脏EGFR蛋白表达水平。结论纳洛酮联合褪黑素可通过调节EGFR、ERBB2等靶点,调控分子功能和疾病相关通路,实现改善胆汁淤积的作用。 展开更多
关键词 生物信息学 相互作用网络 关键基因 胆汁淤积 纳洛酮 褪黑素
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兴义矮脚鸡肠道微生物与其体质量的关联性
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作者 龙小霞 杨永鲜 +6 位作者 吕玉新 吴古荣 张欢 杨金春 汪潘 杨胜宏 王忠 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期311-322,共12页
【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(... 【目的】探究不同体质量分组兴义矮脚鸡肠道菌群及其网络结构特征,鉴定出与鸡体质量相关的潜在生物标志物,为养鸡业促生长益生菌的发掘提供理论依据。【方法】从同批次的110羽兴义矮脚母鸡群体(16周龄)中选取体质量最高的20羽组成HWC组(1.12±0.05 kg),体质量最低的20羽组成LWC组(0.74±0.05 kg),采集肛门粪便样品检测16SrRNA序列V3~V4可变区,利用Mothur进行肠道菌群Alpha多样性,采用基于未加权UniFrac距离的主坐标分析(PCoA)评估肠道菌群Beta多样性,通过SparCC算法构建肠道菌群互作网络,并应用LEfSe分析鉴定与兴义矮脚鸡体质量相关的肠道微生物。【结果】从40份兴义矮脚鸡粪便样品中共获得3145511条Clean reads,经DADA2聚类分析得到22297个扩增子序列变异体(ASVs)。在门分类水平上,兴义矮脚鸡肠道菌群中相对丰度排名前5的菌门包括厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、放线菌门和热脱硫杆菌门,对应的相对丰度分别为67.54%、12.24%、11.28%、2.39%和1.26%;在属分类水平上,相对丰度排名前5的菌属分别为乳酸杆菌属、罗斯氏菌属、利吉拉杆菌属、拟杆菌属和志贺杆菌属,对应的相对丰度分别为23.35%、14.86%、5.44%、4.63%和2.77%。LWC组兴义矮脚鸡肠道菌群稳定性指数为3.95%,HWC组的为12.22%,且LWC组的网络复杂性(5.57%)也低于HWC组(7.70%),推测低体质量兴义矮脚鸡肠道菌群复杂性和稳定性的下降与其体质量较低有关。兴义矮脚鸡肠道菌群互作网络中重要性评分排名前5的枢纽菌群分别是植物乳杆菌、乳球菌、瘤胃球菌属扭链群、粪杆菌属和理研菌科_RC9_菌群。LEfSe分析发现,有18个ASVs的相对丰度在HWC组和LWC组间呈显著差异(LDA>2,P<0.05),其中,12个ASVs表现为在LWC组的相对丰度高于HWC组,6个ASVs表现为在HWC组的相对丰度高于LWC组。【结论】肠杆菌科、支原体属等有害菌相对丰度的上升会降低鸡肠道� 展开更多
关键词 兴义矮脚鸡 肠道菌群 体质量 互作网络 16S rRNA
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基于交互网测量的武器装备体系鲁棒性分析 被引量：6
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作者 司光亚 王飞 +1 位作者 李聪 张昱 《系统工程与电子技术》 EI CSCD 北大核心 2017年第7期1506-1512,共7页
鲁棒性分析是体系能力分析的一项重要的内容,与装备体系规划中的多种分析方法如组合分析和贡献度分析有着近似的逻辑结构和相同方法论。体系能力的鲁棒性分析的本质上是效能分析问题,对此本文通过体系的交互流构建了体系的交互网络,提... 鲁棒性分析是体系能力分析的一项重要的内容,与装备体系规划中的多种分析方法如组合分析和贡献度分析有着近似的逻辑结构和相同方法论。体系能力的鲁棒性分析的本质上是效能分析问题,对此本文通过体系的交互流构建了体系的交互网络,提出了交战环和交战结构等概念;进一步将交互网简化为交战结构的集合,提出了交互网的测量方法:流的测量和结构效能测量,将其作为鲁棒性分析的指标;最后使用"仿真试验床"完成了一个简单的案例分析,验证了方法的有效性。 展开更多
关键词 武器装备体系 鲁棒性 交互网 结构效能
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