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海水鱼类寄生本尼登虫的ITS1序列 被引量：6
1
作者 丁雪娟 李安兴 +1 位作者 张剑英 廖翔华 《华南师范大学学报（自然科学版）》 CAS 2003年第2期85-90,共6页
从不同的海水鱼上采获一批本尼登虫 (单殖纲、分室科、本尼登亚科 ) ,其中部分标本经形态学研究后仍不能定种 .本文采用PCR扩增及DNA序列测定的分子生物学方法 ,对棘鳞鱼畏本尼登虫、玫氏新本尼登虫、新本尼登虫未定种 1和新本尼登虫未... 从不同的海水鱼上采获一批本尼登虫 (单殖纲、分室科、本尼登亚科 ) ,其中部分标本经形态学研究后仍不能定种 .本文采用PCR扩增及DNA序列测定的分子生物学方法 ,对棘鳞鱼畏本尼登虫、玫氏新本尼登虫、新本尼登虫未定种 1和新本尼登虫未定种 2的rDNA基因的ITS1序列进行了研究 .结果表明 :新本尼登虫未定种 1和新本尼登虫未定种 2与玫氏新本尼登虫的ITS1序列非常相似 ,差异率为 0 7%(小于 1%) ,应为同一个种 .而本尼登虫与新本尼登虫间的差异在 33%以上 .本研究弥补了本尼登类单殖吸虫形态分类的某些不足 . 展开更多
关键词 本尼登虫 单殖纲 海水鱼类 寄生虫 itsl序列 内转录间隔区1 PCR扩增 DNA序列测定 分子生物学
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广东湛江湾可培养丝状真菌分布状况的初步调查 被引量：6
2
作者 刘月廉 张瑜斌 +1 位作者 胡汉桥 王季槐 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期633-642,共10页
通过一次航行对广东湛江湾19个站位的表层和底层海水进行采样。经过对样品的分离纯化,共获得253株丝状真菌菌株。通过测序获得了121个rDNA-ITS序列,并已提交给GenBank。经统计分析发现,湛江湾表层和底层海水真菌数量总体上表现为由湾内... 通过一次航行对广东湛江湾19个站位的表层和底层海水进行采样。经过对样品的分离纯化,共获得253株丝状真菌菌株。通过测序获得了121个rDNA-ITS序列,并已提交给GenBank。经统计分析发现,湛江湾表层和底层海水真菌数量总体上表现为由湾内向湾口逐渐减少的水平分布格局;湛江湾表层丝状真菌的数量略多于底层,在海水表层和底层中真菌种类和数量的分布规律相似。根据形态特征及rDNA-ITS的Blast同源性分析,这些菌株分属于18个属和32个分类单元,其中包括7个海洋真菌新记录属。结果表明,湛江湾丝状真菌多样性Shannon指数达2.75,物种优势度变化范围为30.90%–0.02%。枝孢属Cladosporium的优势度最高,为湛江湾优势种群,其次是青霉属Penicillium、侧齿霉属Engyodontium、曲霉属Aspergillus、枝顶孢属Acremonium等。湛江湾表层和底层海水真菌群落的Jaccard相似系数为0.42。 展开更多
关键词 丝状真菌 海洋真菌多样性 its序列
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蜡梅科(Calycanthaceae)若干植物nrDNA ITS序列PCR反应条件分析 被引量：3
3
作者 赵凯歌 陈龙清 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第S2期29-31,28,共4页
该文旨在探讨适合于扩增蜡梅科植物ITS序列的PCR反应条件。试验中设计了2个新引物来扩增整个核糖体RNA基因(nrDNA)的ITS序列,进行了4种引物组合、2种扩增程序、7种Mg^(2+)浓度、4种dNTP浓度和3种二甲基亚砜浓度的比较。结果表明:当反应... 该文旨在探讨适合于扩增蜡梅科植物ITS序列的PCR反应条件。试验中设计了2个新引物来扩增整个核糖体RNA基因(nrDNA)的ITS序列,进行了4种引物组合、2种扩增程序、7种Mg^(2+)浓度、4种dNTP浓度和3种二甲基亚砜浓度的比较。结果表明:当反应体系中Mg^(2+)浓度为1.8 mmol/L,dNTP为2 mmol/L,含5%二甲基亚砜,扩增时先进行两步预扩增,反应效果最好。文中还对引物的设计进行了探讨,认为当所选用的植物可能有寄生真菌时,最好不用与真菌同源的引物。最后提出了几点引物设计的注意事项。 展开更多
关键词 CALYCANTHACEAE NRDNA its (internal transcribed spacer) region PCR reaction condition
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木糖净化液中微生物的菌种鉴定及抑制生长方法研究
4
作者 罗希韬 崔静 +2 位作者 田强 王冉 王运刚 《中国食品添加剂》 CAS 北大核心 2015年第12期107-112,共6页
玉米芯水解制木糖的生产过程中,经过离子交换之后的木糖净化液易滋生微生物。本研究通过ITS序列鉴定方法确定了该菌株所在种属为Lachancea fermentati,系酵母科真菌;研究了温度、p H对木糖净化液中单糖稳定性的影响,结果表明：副反应会... 玉米芯水解制木糖的生产过程中,经过离子交换之后的木糖净化液易滋生微生物。本研究通过ITS序列鉴定方法确定了该菌株所在种属为Lachancea fermentati,系酵母科真菌;研究了温度、p H对木糖净化液中单糖稳定性的影响,结果表明：副反应会随着温度和p H升高而加剧。保证低温和弱酸性环境,有利于保持单糖的稳定性和木糖净化液的品质;对比分析了不同温度和氧气条件该酵母增殖的影响规律,结果表明：升温至50℃以上可以抑制该酵母菌生长;隔绝空气条件下,该酵母菌仍能增殖,但增殖速度低。抑制该酵母菌的最佳工艺方案：将木糖净化液温度由常温升至50-60℃,同时通过调节上游生产指标,控制木糖净化液p H在4-5,同时采取措施隔绝空气与物料的接触。 展开更多
关键词 木糖 its序列鉴定 酵母科 温度 阴离子交换
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奶山羊弓形虫ITS1和529bp基因序列分析
5
作者 阚松鹤 刘侠 +3 位作者 李日飞 朱振邦 梁雪伟 林青 《畜牧兽医杂志》 2015年第1期9-12,共4页
采集关中某羊场奶山羊的血液样品,以提取的血液基因组DNA为模板对弓形虫ITS1及529bp基因进行PCR扩增、测序,并对测序结果进行比对,基于529bp重复序列构建系统进化树。序列分析结果表明,待测样品与GenBank中弓形虫RH虫株的ITS1序列(AY259... 采集关中某羊场奶山羊的血液样品,以提取的血液基因组DNA为模板对弓形虫ITS1及529bp基因进行PCR扩增、测序,并对测序结果进行比对,基于529bp重复序列构建系统进化树。序列分析结果表明,待测样品与GenBank中弓形虫RH虫株的ITS1序列(AY259044)完全一致,与529bp重复序列(FJ656209.1)存在差异;基于529bp重复序列构建的系统进化树分析结果显示,待测样品弓形虫与RH虫株遗传距离最近。该结果为奶山羊弓形虫病的分子流行病学、诊断方法的建立等方面的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 第一内转录间隔区 529 bp重复序列 奶山羊 弓形虫 序列分析
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