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中国不同地区绞股蓝ITS序列分析
被引量：
20
1
作者
蒋玲艳
郭志刚
+1 位作者
王翀
赵桂仿
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期1123-1127,共5页
目的比较中国不同地区绞股蓝的nrDNAITS碱基序列的差异,以期分析绞股蓝的地理分布与ITS基因型的相关性,为我国不同地区绞股蓝的鉴别提供分子依据。方法PCR克隆测序,MegAlign(DNASTAR)软件对序列进行对位排列,PAUP4.0b10软件进行系统发...
目的比较中国不同地区绞股蓝的nrDNAITS碱基序列的差异,以期分析绞股蓝的地理分布与ITS基因型的相关性,为我国不同地区绞股蓝的鉴别提供分子依据。方法PCR克隆测序,MegAlign(DNASTAR)软件对序列进行对位排列,PAUP4.0b10软件进行系统发育分析,构建最大简约树。结果绞股蓝ITS区长度为658～659bp,变异位点为8.48%,信息位点为2.72%。不同地区的样品在碱基的量、信息位点的碱基位置和遗传距离等方面存在一些差异。系统发育分析表明ITS基因型与绞股蓝的地理分布具有一定的相关性,但也有部分不一致,可能主要是因为绞股蓝种内复杂的倍性。结论ITS序列可作为中国不同地区绞股蓝的一种良好的分子标记,而要确定不同地区的绞股蓝合理的亲缘关系还需要结合其他方面的证据。
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关键词
绞股蓝
its
克隆测序
分子鉴定
原文传递
rRNA基因ITS区序列分析在粘帚霉属生防菌株种级分类上的应用
被引量：
6
2
作者
马桂珍
张拥华
+1 位作者
李世东
谢丙炎
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期704-707,共4页
对分离自不同地域的粘帚霉属不同种类的生防菌株rRNA基因转录间区进行了克隆测序,用Clustal X软件进行自动排序,用Njplot程序构建系统进化树.供试26个粘帚霉菌株分在4个组,与传统形态分类结果一致,同一种类的不同来源的菌株差异不明显....
对分离自不同地域的粘帚霉属不同种类的生防菌株rRNA基因转录间区进行了克隆测序,用Clustal X软件进行自动排序,用Njplot程序构建系统进化树.供试26个粘帚霉菌株分在4个组,与传统形态分类结果一致,同一种类的不同来源的菌株差异不明显.研究表明,可以根据ITS区DNA序列差异对粘帚霉属进行种级分类,但不能用于区分种内不同地域的菌株之间的差别.
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关键词
粘帚霉
rRNA基因转录间区
克隆
序列
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职称材料
昆明野生鲍鱼菇的ITS分子鉴定
被引量：
5
3
作者
李翠新
张婉洁
+1 位作者
王兵
何德
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期1202-1206,共5页
鲍鱼菇口感特殊,味道鲜美,营养价值高,但产量稀少。传统的形态特征进行的分类鉴定常常带有一定的局限性和主观性,采集的野生鲍鱼菇的真实性需要进一步鉴定。文章采用一对通用引物ITS1和ITS4对野生鲍鱼菇子实体样本及其组织分离菌株的rDN...
鲍鱼菇口感特殊,味道鲜美,营养价值高,但产量稀少。传统的形态特征进行的分类鉴定常常带有一定的局限性和主观性,采集的野生鲍鱼菇的真实性需要进一步鉴定。文章采用一对通用引物ITS1和ITS4对野生鲍鱼菇子实体样本及其组织分离菌株的rDNA ITS片段进行PCR扩增,并克隆测序。通过GenBank数据库搜索和系统发育树构建来进行分子鉴定。结合形态特点的分析,结果显示采集的野生菇样本就是鲍鱼菇。ITS序列在鲍鱼菇不同菌株的鉴定上具有重要的价值。
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关键词
克隆测序
分离
its
序列
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职称材料
杂草稻nrDNA ITS序列的测序分析
4
作者
刘志文
王英
陈温福
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第11期87-90,共4页
杂草稻nrDNAITS序列的直接测序和克隆测序比较结果表明直接测序和克隆测序均能得到准确的杂草稻nrD-NAITS序列。尽管直接测序方便和经济,但它的峰图差,有叠峰出现。杂草稻的ITS序列在587-589bp之间,其中ITS1长度为193-194bp,ITS2的长度...
杂草稻nrDNAITS序列的直接测序和克隆测序比较结果表明直接测序和克隆测序均能得到准确的杂草稻nrD-NAITS序列。尽管直接测序方便和经济,但它的峰图差,有叠峰出现。杂草稻的ITS序列在587-589bp之间,其中ITS1长度为193-194bp,ITS2的长度为230-232bp,而5.8S均为164bp。与已公布的部分稻属的ITS进行多重比较,该序列蕴含了大量的系统学信息,可在分子水平为杂草稻的发生机理提供证据。
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关键词
杂草稻
its
序列
直接测序
克隆测序
系统学
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职称材料
题名
中国不同地区绞股蓝ITS序列分析
被引量：
20
1
作者
蒋玲艳
郭志刚
王翀
赵桂仿
机构
西部资源生物与现代生物技术教育部重点实验室西北大学生命科学学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第7期1123-1127,共5页
基金
教育部"长江学者和创新团队发展计划"资助项目
文摘
目的比较中国不同地区绞股蓝的nrDNAITS碱基序列的差异,以期分析绞股蓝的地理分布与ITS基因型的相关性,为我国不同地区绞股蓝的鉴别提供分子依据。方法PCR克隆测序,MegAlign(DNASTAR)软件对序列进行对位排列,PAUP4.0b10软件进行系统发育分析,构建最大简约树。结果绞股蓝ITS区长度为658～659bp,变异位点为8.48%,信息位点为2.72%。不同地区的样品在碱基的量、信息位点的碱基位置和遗传距离等方面存在一些差异。系统发育分析表明ITS基因型与绞股蓝的地理分布具有一定的相关性,但也有部分不一致,可能主要是因为绞股蓝种内复杂的倍性。结论ITS序列可作为中国不同地区绞股蓝的一种良好的分子标记,而要确定不同地区的绞股蓝合理的亲缘关系还需要结合其他方面的证据。
关键词
绞股蓝
its
克隆测序
分子鉴定
Keywords
Gynostemma
pentaphyllum
（Thunb.）
Makino
its
clone
sequencing
molecular
identification
分类号
R282.7 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
rRNA基因ITS区序列分析在粘帚霉属生防菌株种级分类上的应用
被引量：
6
2
作者
马桂珍
张拥华
李世东
谢丙炎
机构
淮海工学院海洋学院
中国农科院植物保护研究所
中国农科院蔬菜花卉研究所
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第5期704-707,共4页
基金
国家"863"计划资助项目(No.2006AA10A211)~~
文摘
对分离自不同地域的粘帚霉属不同种类的生防菌株rRNA基因转录间区进行了克隆测序,用Clustal X软件进行自动排序,用Njplot程序构建系统进化树.供试26个粘帚霉菌株分在4个组,与传统形态分类结果一致,同一种类的不同来源的菌株差异不明显.研究表明,可以根据ITS区DNA序列差异对粘帚霉属进行种级分类,但不能用于区分种内不同地域的菌株之间的差别.
关键词
粘帚霉
rRNA基因转录间区
克隆
序列
Keywords
Gliocladium
its
clone
sequencing
分类号
S476.1 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
昆明野生鲍鱼菇的ITS分子鉴定
被引量：
5
3
作者
李翠新
张婉洁
王兵
何德
机构
西南林业大学生命科学学院
出处
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014年第5期1202-1206,共5页
基金
西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室开放基金项目(KL200707)
西南林业大学大学生科技创新基金(1141)
云南省优势特色重点学科生物学建设项目(50097505)
文摘
鲍鱼菇口感特殊,味道鲜美,营养价值高,但产量稀少。传统的形态特征进行的分类鉴定常常带有一定的局限性和主观性,采集的野生鲍鱼菇的真实性需要进一步鉴定。文章采用一对通用引物ITS1和ITS4对野生鲍鱼菇子实体样本及其组织分离菌株的rDNA ITS片段进行PCR扩增,并克隆测序。通过GenBank数据库搜索和系统发育树构建来进行分子鉴定。结合形态特点的分析,结果显示采集的野生菇样本就是鲍鱼菇。ITS序列在鲍鱼菇不同菌株的鉴定上具有重要的价值。
关键词
克隆测序
分离
its
序列
Keywords
clone
sequencing
isolate
its
sequence
分类号
S567.3 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
杂草稻nrDNA ITS序列的测序分析
4
作者
刘志文
王英
陈温福
机构
大连工业大学生物工程学院
沈阳农业大学水稻研究所
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第11期87-90,共4页
基金
第43批中国博士后科学基金项目(20080431156)
辽宁省教育厅项目(2009S011)
文摘
杂草稻nrDNAITS序列的直接测序和克隆测序比较结果表明直接测序和克隆测序均能得到准确的杂草稻nrD-NAITS序列。尽管直接测序方便和经济,但它的峰图差,有叠峰出现。杂草稻的ITS序列在587-589bp之间,其中ITS1长度为193-194bp,ITS2的长度为230-232bp,而5.8S均为164bp。与已公布的部分稻属的ITS进行多重比较,该序列蕴含了大量的系统学信息,可在分子水平为杂草稻的发生机理提供证据。
关键词
杂草稻
its
序列
直接测序
克隆测序
系统学
Keywords
Weedy
rice
its
Direct
sequencing
clone
sequencing
Phylogenetics
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国不同地区绞股蓝ITS序列分析
蒋玲艳
郭志刚
王翀
赵桂仿
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2009
20
原文传递
2
rRNA基因ITS区序列分析在粘帚霉属生防菌株种级分类上的应用
马桂珍
张拥华
李世东
谢丙炎
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2007
6
下载PDF
职称材料
3
昆明野生鲍鱼菇的ITS分子鉴定
李翠新
张婉洁
王兵
何德
《浙江农业学报》
CSCD
北大核心
2014
5
下载PDF
职称材料
4
杂草稻nrDNA ITS序列的测序分析
刘志文
王英
陈温福
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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