期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到159篇文章
< 1 2 … 8 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
冬虫夏草及其相关类群的分子系统学分析 被引量：79
1
作者 魏鑫丽 印象初 +2 位作者 郭英兰 沈南英 魏江春 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期192-202,共11页
为了探明冬虫夏草及其相关类群的亲缘关系,以冬虫夏草、中国被毛孢及中华束丝孢(=冬虫夏草头孢=蝙蝠蛾多毛孢)共6株菌种作为内群和一株蛹草拟青霉作为外群进行了DNA随机多态型(RAPD)分析。此外,基于上述供试材料又在内群中增加了一株蝙... 为了探明冬虫夏草及其相关类群的亲缘关系,以冬虫夏草、中国被毛孢及中华束丝孢(=冬虫夏草头孢=蝙蝠蛾多毛孢)共6株菌种作为内群和一株蛹草拟青霉作为外群进行了DNA随机多态型(RAPD)分析。此外,基于上述供试材料又在内群中增加了一株蝙蝠蛾拟青霉,并对内群和外群样品的nrDNA间隔区(ITS)碱基序列进行了测定;对于测定的8条序列连同来自GenBank中的4条相关序列进行了分子系统学分析。结果表明:中华束丝孢和中国被毛孢均系冬虫夏草菌的无性型。按照国际植物命名法规,中国被毛孢应为冬虫夏草菌无性型的正确名称。而蝙蝠蛾拟青霉为不同于冬虫夏草菌的另一种真菌;该名称由于不合格发表而不被国际植物命名法规所承认。 展开更多
关键词 DNA随机扩增多态型 间隔区 中华束丝孢 中国被毛孢 无性型 蝙蝠蛾拟青霉
下载PDF
中国苋属nrDNA的ITS序列分析及其系统学意义 被引量：28
2
作者 宋葆华 陈之端 +1 位作者 汪小全 李法曾 《Acta Botanica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第11期1184-1189,共6页
运用PCR直接测序法 ,对苋属 (AmaranthusL .) 15个种及外类群鸡冠花 (CelosiacristataL .)nrDNA的ITS区(包括ITS_1,5 .8SrDNA和ITS_2 )进行序列测定。结果表明苋属植物的ITS序列总长度为 6 2 9～ 6 32bp ,长度变异仅发生在ITS_1区 (2 5 ... 运用PCR直接测序法 ,对苋属 (AmaranthusL .) 15个种及外类群鸡冠花 (CelosiacristataL .)nrDNA的ITS区(包括ITS_1,5 .8SrDNA和ITS_2 )进行序列测定。结果表明苋属植物的ITS序列总长度为 6 2 9～ 6 32bp ,长度变异仅发生在ITS_1区 (2 5 0～ 2 5 3bp)。采用PAUP软件进行系统发育分析表明 :分布于中国的苋属植物可分为 3组 ,即刺苋组 (sect.Spinosus) ,五蕊组 (sect.Amaranthus)和 2_3蕊组 (sect.Paucestamen) ;栽培种AmaranthuspaniculatusL .,A .cruentusL .,A .caudatusL .和A .hypochondriacusL .可作为A .hybridusL .的种下等级 ;新种A .taishanensisF .Z .Li和新分布种A .tenuifoliusWilld与 2_3蕊组 (传统 3被组 )关系密切。另外 ,研究结果分析表明 :雄蕊数目比花被片数目和胞果是否开裂等性状在苋属植物分类中更有意义。 展开更多
关键词 苋属 its区 分子系统发育 分类
下载PDF
核糖体DNA ITS区应用于虫草属无性型鉴定的初步研究 被引量：15
3
作者 凌建亚 彭俊峰 +1 位作者 张晗星 张长铠 《山东大学学报（理学版）》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期117-122,共6页
虫草无性型鉴定是困扰学术界的一个难题 .本文检索了互联网上报道的虫草及可能的无性型序列 ,应用相关软件构建进化树 ,研究了它们的同源性 .从总体上看 。
关键词 虫草 无性型 its区 同源性
下载PDF
中国不同地区杜仲rDNA的ITS序列分析 被引量：17
4
作者 马玉花 杨吉安 +1 位作者 贾万忠 冶贵生 《西北林学院学报》 CSCD 北大核心 2004年第4期16-19,共4页
运用克隆测序法,对分布于中国不同地区的杜仲(Eucommia ulmoides)的核糖体DNA的ITS区(包括ITS-1,5.8S和ITS-2)进行测定.结果表明,杜仲植物的ITS区序列总长度为587-589 bp,长度变异仅为2 bp,其中ITS-1区为218～219 bp,在ITS-2区为205～20... 运用克隆测序法,对分布于中国不同地区的杜仲(Eucommia ulmoides)的核糖体DNA的ITS区(包括ITS-1,5.8S和ITS-2)进行测定.结果表明,杜仲植物的ITS区序列总长度为587-589 bp,长度变异仅为2 bp,其中ITS-1区为218～219 bp,在ITS-2区为205～206 bp,5.8SrDNA均为164bp,且高度保守,无变异位点.采用DNASTAR软件进行系统发育分析表明,来自不同地区的杜仲样品同源性均在96.9%以上.根据ITS序列特征构建的系统树,来自同一地区的样品并不一定处于同一分组,而来自不同地区的样品也可能属于同一分组;另外它们的聚类结果与其根据叶型分类的情况也不一致.因而认为只有把杜仲的遗传变异与其它方面的证据和特征相结合,进行深入的研究,才能最终确定它们的合理的系统发育关系. 展开更多
关键词 杜仲 its区 序列分析 地区 核糖体DNA 系统发育
下载PDF
应用ITS区序列对秋海棠属无翅组分类学问题的探讨 被引量：14
5
作者 向建英 管开云 杨俊波 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2002年第4期455-462,共8页
以侧膜组 (Sect .Coeloecentrum)的Begoniacirrosa和单裂组 (Sect.Reichenheimia)的B henryi为外类群 ,对秋海棠属 (BegoniaL .)无翅组 (Sect.Sphenanthera) 9种 2变种及秋海棠组 (Sect.Begonia) 4种进行了ITS区 (包括 5 8SrDNA)序列... 以侧膜组 (Sect .Coeloecentrum)的Begoniacirrosa和单裂组 (Sect.Reichenheimia)的B henryi为外类群 ,对秋海棠属 (BegoniaL .)无翅组 (Sect.Sphenanthera) 9种 2变种及秋海棠组 (Sect.Begonia) 4种进行了ITS区 (包括 5 8SrDNA)序列的测定。发现该属的ITS序列较一般类群要长一些 ,所测的序列长度变化范围为 6 48～ 74 3bp。这些序列经ClustalX软件排序后序列总长为 75 6个位点 ,gap做缺失处理时 ,变异位点和信息位点分别占 2 6 4 1%和10 11%。运用PAUP4 0b8软件分析 ,获得 6棵最大简约树 ,步长为 2 86 ,一致性指数 (CI)和维持性指数 (RI)分别为 0 82 87和 0 784 1,利用 6棵最简约树获取严格一致树 ,并作Bootstrap检测。结果表明 :1.支持将原无翅组内子房 3室的种类移入秋海棠组 ,而将子房 4室的种保留 ,成立四室组 (Sect.Sphenanthera) ;2 .将B tetragona作为B acetosella的异名处理得到一定的支持 ;3.B crassirostris的系统位置有待进一步的研究。 展开更多
关键词 its区序列 秋海棠属 无翅组 分类学问题
下载PDF
中国柽柳属和水柏枝属的分子系统学研究 被引量：13
6
作者 华丽 张道远 潘伯荣 《云南植物研究》 CSCD 北大核心 2004年第3期283-289,共7页
对中国柽柳科 3属 2 1种植物的核糖体DNA中的内转录间隔区 (ITS)序列及 5 8SrRNA基因的 3′端序列进行测定。结果表明 ,ITS - 1片段的长度范围在 2 5 4bp～ 2 6 9bp之间 ,ITS - 2片段的长度范围在 2 2 5bp～ 2 5 3bp之间。以Reaumurias... 对中国柽柳科 3属 2 1种植物的核糖体DNA中的内转录间隔区 (ITS)序列及 5 8SrRNA基因的 3′端序列进行测定。结果表明 ,ITS - 1片段的长度范围在 2 5 4bp～ 2 6 9bp之间 ,ITS - 2片段的长度范围在 2 2 5bp～ 2 5 3bp之间。以Reaumuriasongarica作为功能性外类群 ,运用PAUP软件分析仅得到一个最简约树。简约树步长为 4 6 6步 ,一致性指数CI =0 85 84 ,保持性指数RI=0 86 2 2。系统发育分析表明 :秀丽水柏枝不应从水柏枝属中分出。另外 ,研究分析为目前分类上存有争议的白花柽柳。 展开更多
关键词 中国 柽柳属 水柏枝属 系统发育 分子生物学 核糖体DNA
下载PDF
黑胫病感染对烟草茎秆及根际土壤真菌群落结构的影响 被引量：15
7
作者 向立刚 汪汉成 +3 位作者 郭珍妮 谢红炼 蔡刘体 余知和 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期2099-2111,共13页
烟草黑胫病是由寄生疫霉烟草变种引起的一种对烟草生产造成巨大经济损失的土传病害。本文以健康烟株与感染黑胫病烟株茎秆和根际土壤为研究对象,通过PCR技术扩增样本中真菌转录间隔区的ITS1区域,采用Illumina Miseq高通量测序技术对扩... 烟草黑胫病是由寄生疫霉烟草变种引起的一种对烟草生产造成巨大经济损失的土传病害。本文以健康烟株与感染黑胫病烟株茎秆和根际土壤为研究对象,通过PCR技术扩增样本中真菌转录间隔区的ITS1区域,采用Illumina Miseq高通量测序技术对扩增片段进行测序,旨在了解黑胫病感染对于烟草茎秆和根际土壤真菌群落结构与多样性的影响。本研究20个测序样品,共获得755599条高质量序列片段,最短序列为200bp,最长序列为356bp,平均序列长度248bp。结果表明,健康烟株和发病烟株根际土壤的优势真菌为子囊菌门Ascomycota、接合菌门Zygomycota和担子菌门Basidiomycota,所有茎秆样品的优势真菌为子囊菌门、担子菌门。健康烟株与感染黑胫病烟株根际土壤样品相对丰度大于1%的属有镰刀菌属Fusarium、被孢霉属Mortierella、隐球菌属Cryptococcus、链格孢属Alternaria和赤霉菌属Gibberella等,其中,健康烟株根际土壤优势属为镰刀菌属(39.35%)和被孢霉属(14.19%),发病烟株根际土壤镰刀菌属和被孢霉属相对丰度分别为40.26%和20.77%;健康茎秆样品优势属为隐球菌属(31.12%)、链格孢属(18.28%)、镰刀菌属(15.67%)和红酵母属Rhodotorula(13.34%);病健交界茎秆样品优势属为镰刀菌属(41.36%)、隐球菌属(28.15%)和链格孢属(22.32%);发病茎秆优势属为隐球菌属(62.14%)和链格孢属(27.75%)。烟株感染黑胫病后,其根际土壤与茎秆样品真菌优势属种类与健康烟株无明显变化,但属水平的相对丰度变化显著。发病烟株茎秆与根际土壤样品真菌群落Sobs、Chao1、Shannon指数较健康烟株降低,Simpson指数上升,表明烟株发病后根际土壤真菌与茎秆内生真菌群落丰富度与多样性降低。该结果对于研究烟草黑胫病发生的微生态机制及其生物防治具有一定的理论指导意义。 展开更多
关键词 寄生疫霉烟草变种 Illumina高通量测序 真菌多样性 转录间隔区
原文传递
基于核糖体DNA ITS区和COX1基因鉴别华支睾吸虫囊蚴 被引量：14
8
作者 杨庆利 申继清 +4 位作者 蒋智华 杨益超 李红梅 陈颖丹 周晓农 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期217-220,共4页
目的基于核糖体DNA ITS区和COX1基因,PCR鉴别鱼体内华支睾吸虫囊蚴。方法于2013年5月底采集广西横县某水库的麦穗鱼,用消化法从鱼肉组织中分离单个华支睾吸虫囊蚴及其他吸虫囊蚴;PCR检测华支睾吸虫核糖体DNA ITS区和COX1基因,并分析检... 目的基于核糖体DNA ITS区和COX1基因,PCR鉴别鱼体内华支睾吸虫囊蚴。方法于2013年5月底采集广西横县某水库的麦穗鱼,用消化法从鱼肉组织中分离单个华支睾吸虫囊蚴及其他吸虫囊蚴;PCR检测华支睾吸虫核糖体DNA ITS区和COX1基因,并分析检测的灵敏性和特异性。结果分离到不同发育阶段的华支睾吸虫囊蚴并经PCR检测证实。用针对核糖体DNA ITS区和COX1基因的PCR均能检测到单个华支睾吸虫囊蚴DNA,其特异性扩增条带大小分别为437/549、156/249和195/166 bp。用核糖体DNA ITS1和ITS2区的通用引物和特异性引物扩增华支睾吸虫囊蚴DNA的阳性数之比分别为0.905和0.952。针对COX1基因的特异性扩增均检测到目标DNA,并且扩增条带较亮。用该方法对其他吸虫囊蚴检测的对比试验显示特异性引物均未出现任何非特异性扩增反应;用ITS区通用引物检测其他吸虫囊蚴则显示出严重的非特异性扩增反应。结论通过形态观察结合PCR法识别出了不同发育阶段的华支睾吸虫囊蚴。用华支睾吸虫核糖体DNA ITS区的特异性引物进行PCR检测的灵敏性和特异性均优于相应通用引物。针对COX1基因的特异性PCR检测的灵敏性和特异性与核糖体DNA ITS区的检测结果相当。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 囊蚴 its区 COX1基因 PCR
下载PDF
烧酒曲中扣囊复膜酵母的分离及鉴定 被引量：14
9
作者 应玲云 伍时华 +4 位作者 赵东玲 何启刚 刘光鹏 黄翠姬 易弋 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期146-150,共5页
为了筛选1株可用于纯菌种酿造糯米酒的酵母菌,将烧酒曲稀释涂布在淀粉培养基(YPS)平板上培养,得到1株产淀粉酶酵母菌(YW12)。通过形态学、生理生化特征和18S rDNA、ITS区序列分析鉴定,YW12为扣囊复膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)... 为了筛选1株可用于纯菌种酿造糯米酒的酵母菌,将烧酒曲稀释涂布在淀粉培养基(YPS)平板上培养,得到1株产淀粉酶酵母菌(YW12)。通过形态学、生理生化特征和18S rDNA、ITS区序列分析鉴定,YW12为扣囊复膜酵母(Saccharomycopsis fibuligera)。YW12在YPS液体培养基中28℃培养4 d,用Yoo改良法测其粗酶液的淀粉酶活力为49.8 U/mL。YW12在糯米糖化液(含175 g/L葡萄糖)中28℃发酵3 d的酒精度为5.63%(v/v)。YW12既能同化淀粉又能发酵产生酒精,具有用于纯菌种酿造糯米酒的潜力。 展开更多
关键词 扣囊复膜酵母 淀粉酶 18S RDNA its区
下载PDF
序列图像的自适应背景提取及车型分类 被引量：8
10
作者 胡炜炜 李树广 吴舟舟 《计算机工程与应用》 CSCD 北大核心 2007年第12期239-242,共4页
提出了一种基于计算机图像视觉模式识别理论针对车型识别的自适应背景提取得的新方法。基于彩色图像的特征,利用三通道的差分图象获得对象掩模。并根据两种不同的情况分别采用了不同的背景更新方法;最后利用软传感器来触发车型提取工作... 提出了一种基于计算机图像视觉模式识别理论针对车型识别的自适应背景提取得的新方法。基于彩色图像的特征,利用三通道的差分图象获得对象掩模。并根据两种不同的情况分别采用了不同的背景更新方法;最后利用软传感器来触发车型提取工作。与同类方法相比,该方法速度快,准确率高,能很好地满足实时性的要求。 展开更多
关键词 智能交通系统 自适应背景更新 车型识别 区域填充 实时性
下载PDF
天津地区保护地蔬菜根结线虫种类的分子鉴定 被引量：12
11
作者 霍建飞 任文来 +5 位作者 刘春艳 王勇 田涛 郝永娟 王万立 万久兴 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2012年第5期179-183,共5页
旨为明确天津地区蔬菜根结线虫的主要种类,为该区域线虫病害的防治提供理论依据。从天津市7个区、县温室中采集蔬菜根结线虫样本14份,应用线粒体DNA-限制性片段长度多态性(mtDNA-RFLP)技术,结合核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS区)的序... 旨为明确天津地区蔬菜根结线虫的主要种类,为该区域线虫病害的防治提供理论依据。从天津市7个区、县温室中采集蔬菜根结线虫样本14份,应用线粒体DNA-限制性片段长度多态性(mtDNA-RFLP)技术,结合核糖体DNA内转录间隔区(rDNA-ITS区)的序列分析对其进行种类鉴定。结果表明,在天津地区采集的蔬菜根结线虫均为南方根结线虫。 展开更多
关键词 蔬菜 根结线虫 线粒体DNA 限制性片段长度多态性 内转录间隔区
下载PDF
长根菇菌丝培养、鉴定及氨基酸成分分析 被引量：11
12
作者 邹立扣 潘欣 +5 位作者 岳爱玲 罗燕 李蓓 张悦 姚琼 吴琦 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第3期144-147,共4页
采用组织分离法,选择不同培养条件(温度、pH值),获得长根菇的纯培养物。扫描电镜观测其菌丝体特征,结合ITS区序列鉴定菌丝体,用全自动氨基酸分析仪分别测定长根菇子实体、菌丝体氨基酸组成。结果表明:长根菇菌丝最佳生长温度为26℃,最... 采用组织分离法,选择不同培养条件(温度、pH值),获得长根菇的纯培养物。扫描电镜观测其菌丝体特征,结合ITS区序列鉴定菌丝体,用全自动氨基酸分析仪分别测定长根菇子实体、菌丝体氨基酸组成。结果表明:长根菇菌丝最佳生长温度为26℃,最佳生长pH值为5.0;菌丝体ITS区序列与子实体完全一致(850bp),ITS区基因片段的分子鉴定简便、准确,可以作为长根菇菌丝体鉴定的有效手段。长根菇菌丝体、子实体总氨基酸含量分别为18.25%、13.98%,必需氨基酸含量分别为6.97%、5.28%,非必需氨基酸含量分别为11.28%、8.70%,可见长根菇氨基酸种类丰富,营养价值高,长根菇菌丝体可开发成为功能性运动食品。 展开更多
关键词 长根菇 培养 菌丝 鉴定 its区 氨基酸
下载PDF
不同来源白首乌rDNA ITS序列分析 被引量：10
13
作者 张宁 闫滨 +1 位作者 徐星航 徐凌川 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第12期1537-1540,共4页
目的:研究白首乌不同种的ITS序列遗传差异性,分析序列差异性在白首乌品种鉴定及种质资源研究中的意义。方法:从不同来源的白首乌中提取总DNA,以核基因组ITS通用引物进行扩增,扩增产物经克隆后,进行测序。结果:获得4个不同来源样品的ITS... 目的:研究白首乌不同种的ITS序列遗传差异性,分析序列差异性在白首乌品种鉴定及种质资源研究中的意义。方法:从不同来源的白首乌中提取总DNA,以核基因组ITS通用引物进行扩增,扩增产物经克隆后,进行测序。结果:获得4个不同来源样品的ITS全序列及5.8 S全序列以及两端的18 S,26 S的部分序列,其中戟叶牛皮消CynanchumbungeiITS序列为国际首次获得,登录号分别分别为GU198970(野生种),GU479037(栽培种)。各样品间ITS序列存在不同,4个样品序列间共存在10个变异位点。结论:ITS序列对白首乌种质资源鉴定具有较好的分辨性,为鉴别不同来源的白首乌提供了依据。 展开更多
关键词 白首乌 克隆 its序列 序列分析
原文传递
一株能产类胡萝卜素的粘性红酵母的分离与鉴定 被引量：10
14
作者 王蓉 伍时华 +3 位作者 赵东玲 黄翠姬 易弋 庞春秋 《中国调味品》 CAS 北大核心 2015年第4期16-20,共5页
通过YPD液体培养基富集培养和稀释涂YPD琼脂平板从苹果皮上分离一株产类胡萝卜素的酵母WP3。基于形态学,生理生化和18SrDNA,ITS区和26SrDNA D1/D2区序列分析确定这株酵母为粘性红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)。
关键词 粘性红酵母 类胡萝卜素 18S RDNA its区 26S RDNA D1/D2区
下载PDF
基于ITS序列分析对秦岭冷水沟羊肚菌的鉴定 被引量：9
15
作者 戴璐 李峻志 +2 位作者 李安利 祁鹏 丁仕刚 《中国食用菌》 北大核心 2010年第6期45-46,共2页
在秦岭中段宁陕县冷水沟采集10株野生羊肚菌,获得菌丝体,扩增其rDNA的ITS区,并进行分析比对,构建分子系统树,鉴定这10株羊肚菌都为粗腿羊肚菌(Morchella crassipes)。
关键词 秦岭 its区 羊肚菌
下载PDF
粗柄鸡枞菌总DNA提取及ITS区克隆测序研究 被引量：9
16
作者 邹立扣 潘欣 《北方园艺》 CAS 北大核心 2009年第6期217-219,共3页
利用2种DNA提取方法获得了粗柄鸡枞菌总DNA,并比较了2种方法之间的提取效果,利用分子生物学方法扩增并克隆出粗柄鸡枞菌长632 bp的ITS区序列,为以后的鸡枞菌培养及鉴定奠定了一定的基础。
关键词 粗柄鸡枞菌 总DNA 克隆测序
下载PDF
三株赤潮硅藻5.8S rDNA及转录间隔区(ITS)的克隆及序列分析 被引量：6
17
作者 张宝玉 王广策 +3 位作者 吕颂辉 齐雨藻 邹景忠 曾呈奎 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期111-117,共7页
对引发赤潮的3株硅藻———1株尖刺拟菱形藻(Pseudo-nitzshia pungens)和2株中肋骨条藻(Skeletonema costatum)的5.8S rDNA和ITS(internal transcribed spacers)序列进行了PCR扩增、克隆和序列测定,并分析了硅藻门10株赤潮藻(7株从GenB... 对引发赤潮的3株硅藻———1株尖刺拟菱形藻(Pseudo-nitzshia pungens)和2株中肋骨条藻(Skeletonema costatum)的5.8S rDNA和ITS(internal transcribed spacers)序列进行了PCR扩增、克隆和序列测定,并分析了硅藻门10株赤潮藻(7株从GenBank获得)的系统进化关系.研究结果表明,尖刺拟菱形藻的ITS和5.8S rDNA的长度为693bp,SK-1(分离自东海赤潮暴发区)测序得到715bp,除ITS和5.8SrDNA外,还包含部分18S rDNA和28S rDNA;SK-2(分离自青岛养殖场)的ITS和5.8S rDNA的长度为331bp,尖刺拟菱形藻与从GenBank中获得的2株尖刺拟菱形藻相似程度最高,为100%,与该属的多列拟菱形藻相似程度稍低,为82.9%.SK-2的ITS序列与SK-1的相似程度很低,只有51%,但与拟中肋骨条藻的ITS序列相似程度高,为95.5%.SK-1的ITS序列与拟中肋骨条藻的相似程度也低,为56.7%.系统进化树反映的结果与相似性反映的结果一致.研究的该株尖刺拟菱形藻从根据ITS序列研究的结果与形态鉴定的结果看是一致的;SK-2可能属于拟中肋骨条藻;SK-1比较特殊,有待于用其他的方法进一步研究确定其分类地位. 展开更多
关键词 硅藻 尖刺拟菱形藻 its 序列分析 系统进化
下载PDF
水稻籼粳亚种间rDNA的ITS(internal transcribed spacer,ITS)序列分析 被引量：5
18
作者 高健 梁满中 陈良碧 《生物技术》 CAS CSCD 2004年第2期1-3,共3页
为探讨水稻亚种间的遗传背景及亲缘关系 ,运用PCR技术扩增并测序了水稻籼亚种的南京 11号、9311、广陆矮 4号三个品种和粳亚种的秋光、日本晴、爪哇稻三个品种的完整ITS区 (包括 5 .8S区 )。供试材料的 5 .8SrDNA的长度和G C含量完全一... 为探讨水稻亚种间的遗传背景及亲缘关系 ,运用PCR技术扩增并测序了水稻籼亚种的南京 11号、9311、广陆矮 4号三个品种和粳亚种的秋光、日本晴、爪哇稻三个品种的完整ITS区 (包括 5 .8S区 )。供试材料的 5 .8SrDNA的长度和G C含量完全一致。ITS1的长度为 193- 195bp ,G C含量为 72 .31% - 74 .38;ITS2的长度为 2 2 4 - 2 32bp ,G C含量为 74 .4 6 % - 76 .86 %。序列的相似性为 94 .4 % - 99.3%。CLUSTAL .W软件排序及分析表明 :1)存在 4个信息位点把 6个品种分为籼粳两大类群 ;2 )籼稻之间的ITS序列的同源性小于粳稻之间的同源性。由此可见 ,水稻核糖体DNA的ITS序列的变化规律与其传统的分类具有高度的一致性。 展开更多
关键词 水稻 籼 粳 亚种 RDNA its 序列分析 亲缘关系
下载PDF
比较不同DNA条形码对中国海岸带耐盐植物的识别率 被引量：7
19
作者 魏亚男 王晓梅 +2 位作者 姚鹏程 陈小勇 李宏庆 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2017年第10期1095-1104,共10页
海岸带耐盐植物是一个生态和经济价值独特的庞杂类群,人们对其DNA条形码特性的了解甚少。本文对我国从辽宁到海南10个沿海省(市)大陆及岛屿海岸带耐盐植物广泛采样,从采集获得的样品中筛选出53科97属116个物种共562个样品进行DNA条形码... 海岸带耐盐植物是一个生态和经济价值独特的庞杂类群,人们对其DNA条形码特性的了解甚少。本文对我国从辽宁到海南10个沿海省(市)大陆及岛屿海岸带耐盐植物广泛采样,从采集获得的样品中筛选出53科97属116个物种共562个样品进行DNA条形码研究。对3个叶绿体片段(mat K、rbc L、trn H-psb A)和1个核基因片段(ITS)进行了扩增和测序,统计各个片段的引物通用性和序列获得率,并检验了物种识别率。从序列获得率来看,mat K和trn H-psb A片段表现最好,ITS较差,ITS和mat K的引物通用性比其他2个片段差。序列相似性分析表明,单个片段ITS物种识别率最高(73.36%),其次为mat K(64.03%)和trn H-psb A(61.21%),rbc L的物种识别率最低,仅为46.41%。系统发育树分析显示mat K的物种识别率最高(82.3%),依据trn H-psb A片段难以获得可靠的系统发育树。多维度非度量分析(non-metric multidimensional scaling,NMDS)表明在进行海岸带区域性植物的DNA条形码研究时,叶绿体片段和核基因片段均应该考虑。综合上述研究结果,推荐联合片段ITS+mat K作为中国海岸带耐盐植物DNA条形码。本文为海岸带耐盐植物研究提供了总计1,939条DNA条形码基础数据,为构建耐盐植物DNA条形码数据库奠定了基础。 展开更多
关键词 DNA条形码 海岸带 耐盐植物 物种识别率 its MATK
原文传递
2009年和2010年黄海绿潮浒苔的ITS序列分析 被引量：6
20
作者 罗民波 刘峰 《海洋环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期653-656,共4页
2009年和2010年黄海绿潮爆发时,采集了江苏和山东5个站位的13份漂浮浒苔样品,利用PCR扩增和测序获得了浒苔样品转录间隔区ITS序列(包括5.8S rDNA),依据ITS序列基于邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统进化树。形态特征比较表明2009年出... 2009年和2010年黄海绿潮爆发时,采集了江苏和山东5个站位的13份漂浮浒苔样品,利用PCR扩增和测序获得了浒苔样品转录间隔区ITS序列(包括5.8S rDNA),依据ITS序列基于邻接法(NJ)和最大简约法(MP)构建系统进化树。形态特征比较表明2009年出现在青岛和乳山的浒苔与2010年出现在青岛、响水和如东的浒苔,形态特征相似。主要特征包括主枝明显,充满气体,分枝较多,藻体细胞纵向排列,形状为四边形或多边形,大小为(13～21)μm×(15～28)μm,一般具有一个蛋白核。比较分析2009年与2010年浒苔的ITS序列全长,发现ITS序列相似性为100%,与GenBank中黄海绿潮浒苔的ITS序列信息完全一致。分子系统学和形态学的结果一致表明2009年和2010年黄海爆发绿潮的浒苔为同一种;结合之前的研究结果,表明2007～2010年连续4 a黄海绿潮的形成种均为浒苔(Ulva prolifera)。 展开更多
关键词 浒苔 绿潮 its序列 系统分析
原文传递
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 2 … 8 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部