深圳急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒临床和流行病学特征分析 被引量：8

1

作者 祝亚楠 张海龙 +6 位作者 陈龙 姚相杰 杨洪 韩敏 关心 何雅青 胡贵方 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第3期400-405,共6页

目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3... 目的研究深圳地区急性肠胃炎住院患儿中人副肠孤病毒(HPeV)的临床和流行病学特征。方法收集2017年1月到2018年12月深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便标本(常规细菌鉴定为阴性)497份,实时荧光RT⁃PCR方法检测HPeV,通过巢式PCR扩增VP3/VP1连接区片段进行分型,同时对患儿的流行病学和临床资料进行统计分析。结果497例患儿中,HPeV的阳性率为8.2%;男性HPeV阳性率为7.6%,女性HPeV阳性率为9.4%(χ2=0.491,P=0.501);0~6月龄患儿HPeV阳性率最高,且92.7%的HPeV阳性患儿月龄<24个月;深圳夏季(7~9月)HPeV的阳性率最高。HPeV阳性患儿主要临床表现为中热(38.1~39℃),腹泻频率平均>6次/d,以黏液便为主,常伴有呕吐,呕吐频率平均每天5次,呕吐物以胃内容物为主。HPeV阳性患儿较阴性患儿在有无呕吐和呕吐物性状差异具有统计学意义。本研究中共检测到HPeV⁃1(HPeV⁃1A和HPeV⁃1B亚型)、3、4、5、6和14在内的6种基因型,其中HPeV⁃1B(56.1%)为优势流行株,其次是HPeV⁃1A(17.1%)、HPeV⁃3(7.3%)、HPeV⁃4(7.3%)、HPeV⁃5(4.9%)、HPeV⁃6(4.9%)和HPeV⁃14(2.4%)。系统进化分析结果显示,大部分深圳分离株与兰州和广州来源的参考株核苷酸序列一致性高。结论本研究首次在深圳地区5岁以下急性肠胃炎住院患儿粪便中检测到HPeV,且在2017年和2018年有稳定的感染率,检测到6种HPeV基因型别可能与急性肠胃炎相关,HPeV夏季检出率最高,好发于0~6个月患儿,可能是引起急性肠胃炎住院患儿呕吐胃内容物的病因。开展HPeV监测以更充分地掌握其在深圳地区的流行和临床特征,有助于进一步明确深圳地区住院患儿病毒性急性肠胃炎病原谱构成。 展开更多

关键词 人副肠孤病毒 急性肠胃炎 儿童 基因分型 系统进化分析

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人副肠孤病毒与儿童脓毒症和中枢神经系统感染的相关性 被引量：6

2

作者 罗雷 朱汝南 +6 位作者 赵林清 邓洁 王芳 孙宇 宋秦伟 丁雅馨 钱渊 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期444-448,共5页

目的 了解疑似中枢神经系统（CNS）感染患儿中人副肠孤病毒（HPeV）的感染状况及脓毒症感染的关系.方法 回顾性收集2012年因疑似CNS感染而在首都儿科研究所附属儿童医院住院患儿的脑脊液标本.采用针对HPeV基因组相对保守的5＇端非编码... 目的 了解疑似中枢神经系统（CNS）感染患儿中人副肠孤病毒（HPeV）的感染状况及脓毒症感染的关系.方法 回顾性收集2012年因疑似CNS感染而在首都儿科研究所附属儿童医院住院患儿的脑脊液标本.采用针对HPeV基因组相对保守的5＇端非编码区和变异显著的衣壳蛋白基因3和1交界区的通用引物和分型引物,分别对脑脊液标本核酸进行反转录巢式PCR （RT-nPCR）扩增.阳性标本的PCR产物直接进行核苷酸序列测定,与GenBank中的序列进行比对分析并建立系统进化树.对HPeV筛查阳性的脑脊液标本进行肠道病毒（EV）、EB病毒（EBV）和人巨细胞病毒（HCMV）的检测.同时收集HPeV筛查阳性患儿的其他类型标本（包括血清、鼻咽洗液、粪便标本等）进行上述检测.结果 577份脑脊液标本中检测到18份HPeV阳性标本,检出率为3.1％.阳性患儿中男12例,女6例,年龄范围为15 d～14岁,其中3个月以下患儿最多,占7例;其次是3个月～1岁年龄组5例;另有3例阳性患儿＞9岁.对分型成功的10份脑脊液标本中HPeV的序列分析显示7份为HPeV 3型,3份为HPeV 1型.18份HPeV筛查阳性的脑脊液标本中EV、EBV和HCMV检测均为阴性.脑脊液HPeV筛查阳性患儿的其他类型标本中,8份血清标本中检出2份阳性（均为HPeV3）,其中1份与脑脊液标本检出及分型结果一致,而另1份对应脑脊液标本筛查为阳性,但未分出型别;2份粪便标本中检出1份阳性（HPeV1）,但对应脑脊液标本未分出型别.HPeV阳性患儿临床诊断主要是脓毒症（7/18）和CNS感染（4/18）.其中6例（6/8） HPeV3阳性患儿诊断为脓毒症.HPeV3感染多集中于8月份,而HPeV1则集中于1月份.结论 HPeV与北京儿童脓毒症和CNS感染性疾病相关.1岁以下儿童为易感人群.HPeV3型为脑脊液中主要的检出型别. 展开更多

关键词 中枢神经系统感染 脓毒症 儿童 人副肠孤病毒

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中枢神经系统感染和脓毒症患儿人副肠孤病毒和非脊髓灰质炎肠道病毒感染的特征 被引量：4

3

作者 吴迪 宋秦伟 +7 位作者 张又 钱渊 丁雅馨 赵林清 邓洁 王芳 孙宇 朱汝南 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 2016年第2期153-156,共4页

目的 通过检测患儿脑脊液和血清标本中的HPeV和NPEV,结合临床探讨其在儿童中的感染特征.方法 收集2014年1月至12月首都儿科研究所附属儿童医院来自600例16岁以下怀疑中枢神经系统感染或脓毒症患儿的脑脊液标本543份和血清标本173份,其中... 目的 通过检测患儿脑脊液和血清标本中的HPeV和NPEV,结合临床探讨其在儿童中的感染特征.方法 收集2014年1月至12月首都儿科研究所附属儿童医院来自600例16岁以下怀疑中枢神经系统感染或脓毒症患儿的脑脊液标本543份和血清标本173份,其中116例患儿同时收集到脑脊液和血清标本.通过实时荧光RT-PCR和巢式RT-PCR的方法对HPeV和NPEV进行筛查及分型.结果 在最终诊断为CNS感染的136例患儿中,HPeV阳性率为1.5％,NPEV阳性率为16.9％;诊断为脓毒症的51例患儿中,HPeV阳性率为5.9％,NPEV阳性率为3.9％;其他诊断的413例患儿中,HPeV阳性率为3.4％,NPEV阳性率为2.9％.HPeV感染患儿以0月～＜3月年龄组最多,而NPEV则以3岁～＜7岁组最多.NPEV感染的高峰为7月～9月,而HPeV感染的高峰为11月和12月.结论 HPeV感染患儿年龄低于NPEV感染患儿,HPeV和NPEV可在儿童中引起脓毒症或CNS感染等严重疾病. 展开更多

关键词 人副肠孤病毒 非脊髓灰质炎肠道病毒 中枢神经系统感染 脓毒症 儿童

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人双埃克病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量：3

4

作者 余莹 朱彩霞 +2 位作者 杨志彪 袁聪俐 华修国 《上海交通大学学报（农业科学版）》 2012年第1期1-7,共7页

为建立一种能快速、简便、灵敏地检测人双埃克病毒(Human Parechovirus,HPeV)SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR检测方法,根据GenBank发表的人双埃克病毒8个基因型的参考毒株全序列,针对5′端非编码区保守序列设计1对特异性引物,通过RT-PC... 为建立一种能快速、简便、灵敏地检测人双埃克病毒(Human Parechovirus,HPeV)SYBR Green I实时荧光定量RT-PCR检测方法,根据GenBank发表的人双埃克病毒8个基因型的参考毒株全序列,针对5′端非编码区保守序列设计1对特异性引物,通过RT-PCR扩增此靶序列,构建重组质粒作为标准阳性模板,经过优化反应条件,建立标准曲线和融解曲线,对其灵敏性、特异性和重复性进行评价;检测临床粪便样品共156份,并与常规套式RT-PCR检测结果进行比较。结果显示,建立的标准曲线Ct值与模板浓度呈现良好的线性关系(r2=0.999),融解曲线特异,检测灵敏度可达60拷贝/μL,比常规PCR检测方法高100倍,重复性变异系数小(<1%),能特异地检测HPeV。临床样本检测结果也表明该法(检出30份)灵敏度高于套式RT-PCR(检出21份)。实验结果证明建立的实时荧光定量RT-PCR检测方法具有良好的特异性、敏感性和重复性,有望成为HPeVs的分子诊断、流行病学调查等相关研究的工具。 展开更多

关键词 人双埃克病毒 SYBR Green Ⅰ 荧光定量RT-PCR

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EVaGreen实时荧光PCR法检测人类双埃可病毒 被引量：1

5

作者 曾华书 周海涛 +3 位作者 候红斌 陈润莉 张勇 赖植发 《中国卫生检验杂志》 北大核心 2013年第6期1462-1464,共3页

目的:构建实时荧光PCR法以测定人类双埃可病毒RNA。方法:通过相关资料自行设计合成人类双埃可病毒引物,将病毒RNA进行反转录之后,进行基于EVaGreen染料的实时荧光定量(Real-time)PCR扩增,通过高分辨率溶解曲线、核酸电泳及产物测序验证... 目的:构建实时荧光PCR法以测定人类双埃可病毒RNA。方法:通过相关资料自行设计合成人类双埃可病毒引物,将病毒RNA进行反转录之后,进行基于EVaGreen染料的实时荧光定量(Real-time)PCR扩增,通过高分辨率溶解曲线、核酸电泳及产物测序验证PCR结果。结果:对该病毒保守区约260BP片段扩增成功,测序证实为人双埃可病毒序列,建立了该病毒EVaGreen实时荧光PCR检测方法。结论:为人类双埃可病毒的检测提供了一种快速简便的方法。 展开更多

关键词 实时荧光聚合酶链反应 人双埃可病毒 高分辨率熔解曲线

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深圳市人副肠孤病毒感染的危险因素分析

6

作者 钟景成 叶郁辉 吴延杰 《实用临床医学（江西）》 CAS 2019年第10期100-102,共3页

目的探讨深圳市人副肠孤病毒(HpeV)感染的危险因素。方法回顾性调查分析2016年1月至2017年12月北京大学深圳医院收治的5岁以下腹泻儿童220例,根据HpeV感染情况分为2组:未感染组186例,感染组34例。收集2组患者一般临床资料及可能的危险因... 目的探讨深圳市人副肠孤病毒(HpeV)感染的危险因素。方法回顾性调查分析2016年1月至2017年12月北京大学深圳医院收治的5岁以下腹泻儿童220例,根据HpeV感染情况分为2组:未感染组186例,感染组34例。收集2组患者一般临床资料及可能的危险因素,通过单因素分析和多因素分析识别深圳市HpeV感染的危险因素。结果单因素分析提示2组患儿神经系统感染、脓毒症、肠炎、轮状病毒感染、呼吸道疾病比较差异有统计学意义(P<0.05);多因素Logistic回归分析提示,神经系统感染(95%CI-3.659 8~3.968 9,P<0.001)、脓毒症(95%CI-2.567 1~2.876 2,P<0.001)、肠炎(95%CI-2.981 2~3.290 3,P<0.001)、轮状病毒感染(95%CI-2.918 2~3.227 3,P<0.001)、呼吸道疾病(95%CI-2.735 6~3.044 7,P<0.001)为HpeV感染发生的独立危险因素。结论深圳地区引起HpeV感染的危险因素包括神经系统感染、脓毒症、肠炎、轮状病毒感染、呼吸道疾病等,因此,患儿一旦发生腹泻应立即送院诊治,以降低不良事件发生率。 展开更多

关键词 深圳市 人副肠孤病毒 危险因素 单因素分析 LOGISTIC回归分析

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新生儿人双埃柯病毒的检测及遗传特性分析

7

作者 李红 唐炜 吕进泉 《江苏大学学报（医学版）》 CAS 2021年第5期401-405,411,共6页

目的:了解人双埃柯病毒(human parechovirus,HPeV)在新生儿中的流行情况。方法:采集新生儿血液、粪便及鼻咽分泌物样本各95份,共计285份样本。将其中45份新生儿粪便样本分为5组,利用病毒宏基因组学方法进行文库构建,再经高通量测序检测H... 目的:了解人双埃柯病毒(human parechovirus,HPeV)在新生儿中的流行情况。方法:采集新生儿血液、粪便及鼻咽分泌物样本各95份,共计285份样本。将其中45份新生儿粪便样本分为5组,利用病毒宏基因组学方法进行文库构建,再经高通量测序检测HPeV。通过Geneious软件拼接获取HPeV全基因组,并对该毒株进行遗传特性解析。依据HPeV衣壳蛋白序列设计巢氏PCR引物,利用巢氏PCR对285份样本进行流行病学调查。结果:5个文库分别检测出248534、277432、398756、475408、130634条病毒序列,将原始数据上传至NCBI序列读长档案(sequence read archive,SRA)数据库;在文库newbornfeces41获得一株HPeV全基因组,经鉴定属于HPeV-1,重组分析显示该毒株由HPeV-1和HPeV-5重组产生,命名为newborn_zjlh;HPeV流行病学调查显示6份粪便样本阳性,血液及鼻咽分泌物样本检测均为阴性。结论:本研究显示HPeV可在新生儿中流行,主要是肠道感染。 展开更多

关键词 新生儿 人双埃柯病毒 病毒宏基因组学 系统发育分析 重组分析 Illumina Hiseq测序

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2株人副肠孤病毒1型山东地方株的全基因组序列分析

8

作者 王倩 刘尧 +1 位作者 林小娟 陶泽新 《中国病毒病杂志》 CAS 2024年第3期282-288,共7页

目的了解人副肠孤病毒1型(human parechovirus 1,HPeV1)山东地方株的遗传背景和进化特征,为国内HPeV的流行病学调查及预防提供科学依据。方法山东省疾病预防控制中心脊髓灰质炎实验室对来自2019年和2021年山东省急性弛缓性麻痹监测系统... 目的了解人副肠孤病毒1型(human parechovirus 1,HPeV1)山东地方株的遗传背景和进化特征,为国内HPeV的流行病学调查及预防提供科学依据。方法山东省疾病预防控制中心脊髓灰质炎实验室对来自2019年和2021年山东省急性弛缓性麻痹监测系统报告病例的1319份粪便标本按照监测方案要求进行病毒分离,病毒分离物应用下一代测序技术测定其全基因组序列。使用BioEdit 7.0.9.0软件进行同源性分析,使用MEGA 11.0软件构建系统发生树,使用SimPlot 3.5.1软件进行重组分析。结果成功分离到2株HPeV1(19225和21031),其基因组全长分别为7324 nt和7328 nt(未包括多聚腺苷酸尾),编码区长6540 nt,可编码一个含2179个氨基酸的多聚蛋白,衣壳蛋白VP1羧基端含有精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸基序。2株山东分离株间的核苷酸同源性为91.4%,与国内外其他地区HPeV1分离株的核苷酸同源性为77.3%~95.4%。VP1区系统发生分析结果显示,山东分离株位于HPeV1B基因簇内,与其他地区HPeV1分离株的平均遗传距离为0.153。重组分析结果显示,21031株在3C和3D区与HPeV5毒株CH-ZXY1存在重组信号,19225株不存在基因重组现象。结论山东地方株与国内外其他HPeV1分离株存在不同程度的序列变异,研究结果为HPeV的基因组流行病学研究和诊断试剂研发提供了科学依据。 展开更多

关键词 人副肠孤病毒1型 下一代测序 全基因组 系统发生学分析 重组分析

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人副肠孤病毒的研究进展 被引量：3

9

作者 罗雷 朱汝南 《中国病毒病杂志》 CAS 2013年第4期310-316,共7页

人副肠孤病毒（human parechovirus,HPeV）是一种单股正链、无包膜的RNA病毒,属于小RNA病毒科（Picornaviridae）副肠孤病毒属（Parechovirus）。同属于副肠孤病毒属的还有永贝里病毒（Ljungan virus）。

关键词 人副肠孤病毒 病毒学 临床表现 诊断

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广州和厦门鼠类携带3种致腹泻病毒检测分析 被引量：3

10

作者 邱旻 郑雪燕 +7 位作者 柯雪梅 周军华 蒋丽娜 钟雪珊 陈少威 熊益权 马淑娟 陈清 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2018年第3期438-441,共4页

目的了解鼠类携带致腹泻病毒情况,充实感染性腹泻病原体动物宿主的流行病学背景资料。方法2012—2014年采用笼捕法捕捉鼠类,收集来自广东省广州市和福建省厦门市的鼠类粪便样品,提取病毒RNA,RT-PCR检测样品中的A组轮状病毒(RVA)、GI、GI... 目的了解鼠类携带致腹泻病毒情况,充实感染性腹泻病原体动物宿主的流行病学背景资料。方法2012—2014年采用笼捕法捕捉鼠类,收集来自广东省广州市和福建省厦门市的鼠类粪便样品,提取病毒RNA,RT-PCR检测样品中的A组轮状病毒(RVA)、GI、GII型诺如病毒(No V)和人双埃可病毒(HPeV)的核酸序列,并对实验获得序列进行测序和系统进化树分析。结果共收集样品224份,分别来自188只褐家鼠、27只黄毛鼠、9只黄胸鼠。在褐家鼠粪便中检出1份HPeV核酸阳性,阳性率为0.53%(1/188),但病毒分型实验未成功。在所有标本中未发现RVA或GI、GII型NoV核酸阳性。结论首次发现在褐家鼠有携带HPeV的可能,但仍有待进一步研究证实。 展开更多

关键词 鼠 腹泻病毒 人双埃可病毒(HPeV) 轮状病毒(RVA) 诺如病毒(NoV)

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北京脓毒症患儿血清中发现的3型人副肠孤病毒的全基因组序列分析 被引量：2

11

作者 朱汝南 罗雷 +6 位作者 钱渊 赵林清 邓洁 王芳 孙宇 宋秦伟 丁雅馨 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期541-548,共8页

3型人副肠孤病毒(Human parechovirus 3,HPeV3)是2004年发现的与儿童脓毒症密切相关的一种病原体。HPeV基因组是不分节段的单股正链线性RNA。测定其全基因组序列有助于了解北京儿科患者中流行的HPeV3的遗传背景和进化地位。方法采用将... 3型人副肠孤病毒(Human parechovirus 3,HPeV3)是2004年发现的与儿童脓毒症密切相关的一种病原体。HPeV基因组是不分节段的单股正链线性RNA。测定其全基因组序列有助于了解北京儿科患者中流行的HPeV3的遗传背景和进化地位。方法采用将一名脑脊液和血清中HPeV3核酸检测均为阳性的脓毒症患儿(编号:BJC3174)的血清标本接种到细胞后从培养上清中检测到HPeV3核酸,随后分段扩增HPeV3BJ-C3174株的全基因组序列,并进行序列测定、拼接及分析。结果表明BJ-C3174株基因组全长(未包括3′末端的PolyA尾)7 329个核苷酸(nt),其中5′和3′编码区(UTR)分别长707nt和91nt,编码区长6 531nt,可编码一个长为2 177个氨基酸的多聚蛋白。BJ-C3174病毒株与已发表的HPeV3型病毒株位于同一进化分枝,而与HPeV8、HPeV6和HPeV1等型别进化距离较远。BJ-C3174株与德国HPeV3BONN-2株亲缘关系最为密切,两者核苷酸相似性达到99.3%,氨基酸相似性达到99.8%,均高于其与HPeV3原型株A308/99的相似性(89.6%和98.6%)。各基因片段中,BJC3174株均与BONN-2株相似性最高,核苷酸和氨基酸相似性分别达到98.3%和99.3%以上。未发现BJ-C3174株存在基因重组现象。 展开更多

关键词 3型人副肠孤病毒 全基因组 系统进化树及同源性分析

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