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山东省1例脊髓灰质炎疫苗高变异株病例的变异分析
被引量:
3
1
作者
林小娟
刘尧
+6 位作者
王素婷
张晓
宋立志
陶泽新
纪峰
熊萍
徐爱强
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期542-547,共6页
为了解山东省2011年分离的1株脊髓灰质炎(脊灰)疫苗高变异株的基因特征,并对该病例接触者标本进行病原学鉴定及分析。本研究对采集的2份病例及40份接触者粪便标本进行病毒分离,对脊灰病毒进行全基因组序列测定和分析,对非脊灰肠道病...
为了解山东省2011年分离的1株脊髓灰质炎(脊灰)疫苗高变异株的基因特征,并对该病例接触者标本进行病原学鉴定及分析。本研究对采集的2份病例及40份接触者粪便标本进行病毒分离,对脊灰病毒进行全基因组序列测定和分析,对非脊灰肠道病毒进行VP1区序列测定,并将分离率较高的柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)B1和CV-B3与国内外其他地区分离株进行VP1区同源性及系统进化树分析。其中病例标本中分离到1株脊灰病毒(P1/11186),1株CV-A4和1株CV-A8;接触者标本中分离到1株CV-A2、10株CV-B1、5株CV-B3和埃可病毒(Echovirus,E)3型、12型、14型各1株,提示当地可能存在肠道病毒流行,应加强监测。P1/11186为Ⅰ型脊灰疫苗病毒,在2A及3A区分别与Ⅱ型和Ⅲ型脊灰病毒发生重组,与相应的疫苗株相比全基因组共有25个核苷酸、9个氨基酸发生变异,其中VP1区8个核苷酸、5个氨基酸发生突变。CV-B1和CV-B3的同源性分析显示10株CVB1之间核苷酸同源性为97.0%~100%,氨基酸同源性为98.9%~100%;5株CV-B3之间核苷酸与氨基酸同源性分别为92.6%~100%与99.2%~100%。CV-B1与CV-B3VP1完整编码区进化树分析显示,山东分离株与国内其他省份分离株亲缘关系较近,位于同一基因簇,与世界其他地区分离株位于不同分支。
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关键词
脊髓灰质炎病毒
非脊灰肠道病毒
脊灰疫苗高变异株
重组病毒
原文传递
题名
山东省1例脊髓灰质炎疫苗高变异株病例的变异分析
被引量:
3
1
作者
林小娟
刘尧
王素婷
张晓
宋立志
陶泽新
纪峰
熊萍
徐爱强
机构
山东省疾病预防控制中心山东大学预防医学研究院山东省传染病预防控制重点实验室
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期542-547,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81302481)
国家"十二五"科技重大专项"病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究"课题(2013ZX10004-202)
文摘
为了解山东省2011年分离的1株脊髓灰质炎(脊灰)疫苗高变异株的基因特征,并对该病例接触者标本进行病原学鉴定及分析。本研究对采集的2份病例及40份接触者粪便标本进行病毒分离,对脊灰病毒进行全基因组序列测定和分析,对非脊灰肠道病毒进行VP1区序列测定,并将分离率较高的柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)B1和CV-B3与国内外其他地区分离株进行VP1区同源性及系统进化树分析。其中病例标本中分离到1株脊灰病毒(P1/11186),1株CV-A4和1株CV-A8;接触者标本中分离到1株CV-A2、10株CV-B1、5株CV-B3和埃可病毒(Echovirus,E)3型、12型、14型各1株,提示当地可能存在肠道病毒流行,应加强监测。P1/11186为Ⅰ型脊灰疫苗病毒,在2A及3A区分别与Ⅱ型和Ⅲ型脊灰病毒发生重组,与相应的疫苗株相比全基因组共有25个核苷酸、9个氨基酸发生变异,其中VP1区8个核苷酸、5个氨基酸发生突变。CV-B1和CV-B3的同源性分析显示10株CVB1之间核苷酸同源性为97.0%~100%,氨基酸同源性为98.9%~100%;5株CV-B3之间核苷酸与氨基酸同源性分别为92.6%~100%与99.2%~100%。CV-B1与CV-B3VP1完整编码区进化树分析显示,山东分离株与国内其他省份分离株亲缘关系较近,位于同一基因簇,与世界其他地区分离株位于不同分支。
关键词
脊髓灰质炎病毒
非脊灰肠道病毒
脊灰疫苗高变异株
重组病毒
Keywords
poliovirus
Non-polio
enterovirus
highly
variant
vaccine
-
related
poliovirus
Recombinant
virus
分类号
R373.2 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
山东省1例脊髓灰质炎疫苗高变异株病例的变异分析
林小娟
刘尧
王素婷
张晓
宋立志
陶泽新
纪峰
熊萍
徐爱强
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
3
原文传递
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
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