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河南省猪戊型肝炎病毒HN-JY40的全基因组序列测定及分析
被引量：
1
1
作者
张小霞
张亲
+2 位作者
梁振普
许锋
邵新峰
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期231-238,共8页
本文旨在测定猪戊型肝炎病毒HN-JY40株的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析。设计8对引物,利用RT-PCR、3′RACE和5′RACE技术得到了戊型肝炎病毒（Hepatitis E virus,HEV）河南分离株HNJY40的近似全基因组序列,命名为＂HN-...
本文旨在测定猪戊型肝炎病毒HN-JY40株的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析。设计8对引物,利用RT-PCR、3′RACE和5′RACE技术得到了戊型肝炎病毒（Hepatitis E virus,HEV）河南分离株HNJY40的近似全基因组序列,命名为＂HN-JY40＂;用Expasy、Megalign、Clustal X和MEGA 4等生物学软件进行序列分析、同源比对和进化树的构建。测序得到的HN-JY40序列去除polyA后全长7 223bp,5′UTR有9个碱基,3′UTR全长69bp。ORF1（5 124bp）编码1 707个氨基酸,ORF2（2 025bp）编码674个氨基酸,ORF3（345bp）编码114个氨基酸。全基因组相似性分析发现,HN-JY40为典型的基因4型病毒,且属于一个新亚型。猪HN-JY40ORF1的部分核苷酸（153~432bp）与人源HK104-2004同源性高达到96%,为揭示戊型肝炎的跨种传播提供了新的分子生物学依据。
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关键词
猪戊型肝炎病毒
hn
-
jy
40
RT-PCR
3′RACE
5′RACE
序列分析
同源性
原文传递
题名
河南省猪戊型肝炎病毒HN-JY40的全基因组序列测定及分析
被引量：
1
1
作者
张小霞
张亲
梁振普
许锋
邵新峰
机构
河南农业大学生命科学学院
出处
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第3期231-238,共8页
文摘
本文旨在测定猪戊型肝炎病毒HN-JY40株的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析。设计8对引物,利用RT-PCR、3′RACE和5′RACE技术得到了戊型肝炎病毒（Hepatitis E virus,HEV）河南分离株HNJY40的近似全基因组序列,命名为＂HN-JY40＂;用Expasy、Megalign、Clustal X和MEGA 4等生物学软件进行序列分析、同源比对和进化树的构建。测序得到的HN-JY40序列去除polyA后全长7 223bp,5′UTR有9个碱基,3′UTR全长69bp。ORF1（5 124bp）编码1 707个氨基酸,ORF2（2 025bp）编码674个氨基酸,ORF3（345bp）编码114个氨基酸。全基因组相似性分析发现,HN-JY40为典型的基因4型病毒,且属于一个新亚型。猪HN-JY40ORF1的部分核苷酸（153~432bp）与人源HK104-2004同源性高达到96%,为揭示戊型肝炎的跨种传播提供了新的分子生物学依据。
关键词
猪戊型肝炎病毒
hn
-
jy
40
RT-PCR
3′RACE
5′RACE
序列分析
同源性
Keywords
Swine hepatitis E virus
hn
-
jy
40
Reverse transcription-polymerase chain reaction
3′RACE
5′RACE
Sequence analysis
Homology
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
河南省猪戊型肝炎病毒HN-JY40的全基因组序列测定及分析
张小霞
张亲
梁振普
许锋
邵新峰
《病毒学报》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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参考文献
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