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基于基因组序列特征的甲型H1N1流感病毒来源分析 被引量：2
1
作者 张钫 郭骁才 +2 位作者 程薇波 王晔 张舒 《生物医学工程学杂志》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第4期868-874,共7页
2009年4月以来,甲型H1N1流感席卷全球,给人类造成极大灾难。流感病毒基因组包含8个节段,节段间的重配导致其极强的变异能力。分析各节段来源对于新型流感的预防和治疗至关重要。基于基因组序列的统计特征,在VC++编程环境下设计程序,用... 2009年4月以来,甲型H1N1流感席卷全球,给人类造成极大灾难。流感病毒基因组包含8个节段,节段间的重配导致其极强的变异能力。分析各节段来源对于新型流感的预防和治疗至关重要。基于基因组序列的统计特征,在VC++编程环境下设计程序,用邻近核苷酸单词频率(NWF)作为序列特征,对2009年的流感病毒基因组各节段起源进行分析。结果证实该法具有良好的性能;并分析得出2009年暴发的甲型H1N1流感病毒PB2和PA来源于北美禽流感,PB1来源于人的季节性流感病毒H3N2,HA、NP、NS来源于古典北美系猪流感病毒,而NA和M则与欧洲系的猪流感病毒相似。 展开更多
关键词 甲型H1N1流感病毒 序列特征分析 邻近核苷酸单词频率
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