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类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析
1
作者
李程鹏
孙一丁
+5 位作者
刘辉
曾千春
王炎炎
马继琼
杨奕
许明辉
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第9期2009-2015,共7页
OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsHMA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码...
OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsHMA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息。OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471bp的编码序列内发现了6个变异位点;Tajima'sD检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变异,而第457位的变异使得5个供试材料(1个O.nivara,4个ARO品种和1个粳稻品种)由于提前形成终止子在C末端少3个氨基酸,ARO类品种在此位点上与TRJ、IND、TEJ存在显著差异,这暗示ARO类品种可能由O.nivara演化而来。
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关键词
亚洲栽培稻
野生稻
oshma
2
-
like
基因
进化
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职称材料
题名
类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析
1
作者
李程鹏
孙一丁
刘辉
曾千春
王炎炎
马继琼
杨奕
许明辉
机构
云南农业大学农学与生物技术学院
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
中国科学院昆明动物研究所
出处
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2016年第9期2009-2015,共7页
基金
国家自然科学基金"抗稻瘟病基因Pid2进化与专化抗性分子机制研究"(31360331)
科技部基础性工作专项"贵州农业生物资源调查"(2012FY110200)
云南省自然科学基金"云南地方稻种Pi-d2同源基因序列及专化抗性分子机制研究"(2013FZ146)
文摘
OsHMA2是水稻根和地上部一个主要的Zn和Cd的转运蛋白,在水稻基因组OsHMA2位点存在OsHMA2类似基因OsHMA2-like,编码蛋白包含水稻P1B型ATP酶重金属转运蛋白的功能域。对来自世界不同稻区的27份亚洲栽培稻和8份野生稻基因OsHMA2-like编码区序列进行了测序分析,以了解水稻OsHMA2-like序列的多样性,为发掘基因资源提供信息。OsHMA2-like核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,在471bp的编码序列内发现了6个变异位点;Tajima'sD检验表明均不显著,说明这些位点属中性进化状态;6个变异位点中,第15、78、132、214、417位点碱基不引起氨基酸的变异,而第457位的变异使得5个供试材料(1个O.nivara,4个ARO品种和1个粳稻品种)由于提前形成终止子在C末端少3个氨基酸,ARO类品种在此位点上与TRJ、IND、TEJ存在显著差异,这暗示ARO类品种可能由O.nivara演化而来。
关键词
亚洲栽培稻
野生稻
oshma
2
-
like
基因
进化
Keywords
Oryza
sativa
Wild
rice
gene
oshma
2
-
like
Evolution
分类号
S511 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
类重金属ATP酶基因序列遗传变异分析
李程鹏
孙一丁
刘辉
曾千春
王炎炎
马继琼
杨奕
许明辉
《西南农业学报》
CSCD
北大核心
2016
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