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启动子区域甲基化对肺腺癌GPC_5表达的调控作用及意义
被引量：
2
1
作者
李燕
苗立云
+2 位作者
肖永龙
蔡后荣
张德平
《临床肺科杂志》
2012年第5期873-876,共4页
目的研究启动子区域CpG岛的甲基化对肺腺癌细胞GPC5表达的调节作用。方法在线预测GPC5启动子区域CpG岛的分布,合成甲基化特异性聚合酶链反应(Methylation specific polymerase chain reaction,MSP)引物,甲基化酶特异性抑制剂5-氮杂-2’...
目的研究启动子区域CpG岛的甲基化对肺腺癌细胞GPC5表达的调节作用。方法在线预测GPC5启动子区域CpG岛的分布,合成甲基化特异性聚合酶链反应(Methylation specific polymerase chain reaction,MSP)引物,甲基化酶特异性抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞嘧啶核苷(5-AZA)处理肺腺癌细胞系A549、SPC-A1及永生化支气管上皮细胞HBE,检测处理前后GPC5表达的变化。同时用MSP方法检测肺腺癌组织标本中GPC5基因启动子区域CpG岛甲基化情况,以探讨其可能的临床意义。结果 GPC5在正常的支气管上皮中不表达,而在肺腺癌细胞系中均有明显表达。5-AZA处理后,GPC5在A549及SPC-A1中的表达均上调,提示启动子区域CpG岛的甲基化参与了GPC5基因表达的调节。但肺腺癌组织标本中GPC5基因启动子区域CpG岛呈现低甲基化状态,提示这种低甲基化状态参与了肺腺癌细胞中GPC5表达的上调。结论 GPC5基因启动子区域的甲基化参与了其表达的调控,可能是导致肺腺癌中GPC5上调的一个重要因素。
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关键词
肺腺癌
gpc
5
基因
甲基化
聚合酶链反应
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职称材料
GPC5基因在肺腺癌组织中差异表达和突变分析
被引量：
1
2
作者
饶文
余祖滨
+5 位作者
向颖
吴龙
邬娜
吴亚楠
白莉
李亚斐
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1153-1157,共5页
目的探讨GPC5基因在肺腺癌组织和正常肺组织中差异表达和突变情况。方法通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的两个数据集分析肿瘤组织和相匹配正常组织GPC5表达量,对GPC5基因表达差异进行分析。运用肿瘤基因组图谱(the ca...
目的探讨GPC5基因在肺腺癌组织和正常肺组织中差异表达和突变情况。方法通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的两个数据集分析肿瘤组织和相匹配正常组织GPC5表达量,对GPC5基因表达差异进行分析。运用肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公共数据库初步分析GPC5突变和拷贝数变异情况。运用实时定量PCR检测39例肺癌患者肿瘤组织和正常组织样本中GPC5基因的表达,对结果进一步验证。结果我们对GEO数据库中的两个数据集进行分析发现肺腺癌肿瘤组织中GPC5表达量明显低于配对的正常组织(P<0.05);实时定量PCR检测结果证实了GPC5基因在肿瘤组织中的相对表达量均显著低于相匹配的正常组织(P<0.01),而且与Ⅰ期肿瘤组织相比,Ⅱ期+Ⅲa期的肿瘤组织中GPC5表达水平明显较低(P<0.05)。结论 GPC5基因的拷贝数变异广泛存在,杂合子缺失可能是导致GPC5表达水平降低的原因。
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关键词
肺腺癌
gpc
5
突变
分析
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职称材料
高通量转录组测序技术研究过表达GPC5对A549细胞基因表达影响
被引量：
1
3
作者
张海天
王国祥
+2 位作者
杨欣
邱满堂
许林
《中国肺癌杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期545-549,共5页
背景与目的磷脂酰肌醇蛋白聚糖-5(glypican-5,GPC5)是一个重要的抑癌基因,然而GPC5对肺腺癌细胞增殖能力和基因表达的影响目前研究甚少。本研究拟在肺腺癌A549细胞中过表达GPC5以研究细胞增殖能力和基因表达变化情况。方法通过慢病毒载...
背景与目的磷脂酰肌醇蛋白聚糖-5(glypican-5,GPC5)是一个重要的抑癌基因,然而GPC5对肺腺癌细胞增殖能力和基因表达的影响目前研究甚少。本研究拟在肺腺癌A549细胞中过表达GPC5以研究细胞增殖能力和基因表达变化情况。方法通过慢病毒载体构建稳定过表达GPC5的A549细胞株,通过Cell Counter Kit 8(CCK8)、平板克隆和Ed U实验检测细胞增殖能力;通过高通量转录组测序研究基因表达变化。结果相对于空白载体组,CCK8实验发现过表达GPC5可以明显抑制A549细胞的增殖速率;平板克隆实验结果显示,过表达GPC5之后A549细胞克隆形成能力下降(181±17 vs 278±23);Ed U染色结果显示过表达GPC5后阳性染色细胞比例下降。转录组测序结果提示过表达GPC5之后,2,108个基因表达发生明显变化,其中具有正性调节细胞增殖作用的基因明显下调。结论过表达GPC5可以明显抑制肺腺癌细A549的增殖能力,而且过表达GPC5后具有正性调节细胞增殖作用的基因表达下调。
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关键词
磷脂酰肌醇蛋白聚糖-
5
A
5
49
增殖
基因表达
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职称材料
题名
启动子区域甲基化对肺腺癌GPC_5表达的调控作用及意义
被引量：
2
1
作者
李燕
苗立云
肖永龙
蔡后荣
张德平
机构
南京大学医学院附属鼓楼医院呼吸科
出处
《临床肺科杂志》
2012年第5期873-876,共4页
基金
中央高校基本科研业务费苗圃项目(编号:1117021411)
文摘
目的研究启动子区域CpG岛的甲基化对肺腺癌细胞GPC5表达的调节作用。方法在线预测GPC5启动子区域CpG岛的分布,合成甲基化特异性聚合酶链反应(Methylation specific polymerase chain reaction,MSP)引物,甲基化酶特异性抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞嘧啶核苷(5-AZA)处理肺腺癌细胞系A549、SPC-A1及永生化支气管上皮细胞HBE,检测处理前后GPC5表达的变化。同时用MSP方法检测肺腺癌组织标本中GPC5基因启动子区域CpG岛甲基化情况,以探讨其可能的临床意义。结果 GPC5在正常的支气管上皮中不表达,而在肺腺癌细胞系中均有明显表达。5-AZA处理后,GPC5在A549及SPC-A1中的表达均上调,提示启动子区域CpG岛的甲基化参与了GPC5基因表达的调节。但肺腺癌组织标本中GPC5基因启动子区域CpG岛呈现低甲基化状态,提示这种低甲基化状态参与了肺腺癌细胞中GPC5表达的上调。结论 GPC5基因启动子区域的甲基化参与了其表达的调控,可能是导致肺腺癌中GPC5上调的一个重要因素。
关键词
肺腺癌
gpc
5
基因
甲基化
聚合酶链反应
Keywords
Lung
adenocarcinoma
gpc
5
gene
Methylation
Polymerase
chain
reactions
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
GPC5基因在肺腺癌组织中差异表达和突变分析
被引量：
1
2
作者
饶文
余祖滨
向颖
吴龙
邬娜
吴亚楠
白莉
李亚斐
机构
第三军医大学军事预防医学院军队流行病学教研室
第三军医大学新桥医院胸外科
第三军医大学新桥医院全军呼吸内科研究所
出处
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第11期1153-1157,共5页
基金
国家自然科学基金面上项目(81171903)
重庆市自然科学基金(CSTC2011BB5024)~~
文摘
目的探讨GPC5基因在肺腺癌组织和正常肺组织中差异表达和突变情况。方法通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的两个数据集分析肿瘤组织和相匹配正常组织GPC5表达量,对GPC5基因表达差异进行分析。运用肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公共数据库初步分析GPC5突变和拷贝数变异情况。运用实时定量PCR检测39例肺癌患者肿瘤组织和正常组织样本中GPC5基因的表达,对结果进一步验证。结果我们对GEO数据库中的两个数据集进行分析发现肺腺癌肿瘤组织中GPC5表达量明显低于配对的正常组织(P<0.05);实时定量PCR检测结果证实了GPC5基因在肿瘤组织中的相对表达量均显著低于相匹配的正常组织(P<0.01),而且与Ⅰ期肿瘤组织相比,Ⅱ期+Ⅲa期的肿瘤组织中GPC5表达水平明显较低(P<0.05)。结论 GPC5基因的拷贝数变异广泛存在,杂合子缺失可能是导致GPC5表达水平降低的原因。
关键词
肺腺癌
gpc
5
突变
分析
Keywords
lung
adenocarcinoma
gpc
5
gene
expression
分类号
R181.23 [医药卫生—流行病学]
R394.3 [医药卫生—公共卫生与预防医学]
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职称材料
题名
高通量转录组测序技术研究过表达GPC5对A549细胞基因表达影响
被引量：
1
3
作者
张海天
王国祥
杨欣
邱满堂
许林
机构
徐州医科大学临床医学系
徐州医科大学附属医院心胸外科
常州市第一人民医院肿瘤内科
南京医科大学附属江苏省肿瘤医院胸外科/江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室
出处
《中国肺癌杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第8期545-549,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.81372321和No.81572261)
江苏省重大疾病生物资源样本库项目(No.BM2015004)资助~~
文摘
背景与目的磷脂酰肌醇蛋白聚糖-5(glypican-5,GPC5)是一个重要的抑癌基因,然而GPC5对肺腺癌细胞增殖能力和基因表达的影响目前研究甚少。本研究拟在肺腺癌A549细胞中过表达GPC5以研究细胞增殖能力和基因表达变化情况。方法通过慢病毒载体构建稳定过表达GPC5的A549细胞株,通过Cell Counter Kit 8(CCK8)、平板克隆和Ed U实验检测细胞增殖能力;通过高通量转录组测序研究基因表达变化。结果相对于空白载体组,CCK8实验发现过表达GPC5可以明显抑制A549细胞的增殖速率;平板克隆实验结果显示,过表达GPC5之后A549细胞克隆形成能力下降(181±17 vs 278±23);Ed U染色结果显示过表达GPC5后阳性染色细胞比例下降。转录组测序结果提示过表达GPC5之后,2,108个基因表达发生明显变化,其中具有正性调节细胞增殖作用的基因明显下调。结论过表达GPC5可以明显抑制肺腺癌细A549的增殖能力,而且过表达GPC5后具有正性调节细胞增殖作用的基因表达下调。
关键词
磷脂酰肌醇蛋白聚糖-
5
A
5
49
增殖
基因表达
Keywords
gpc
5
A
5
49
Proliferation
gene
expression
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
启动子区域甲基化对肺腺癌GPC_5表达的调控作用及意义
李燕
苗立云
肖永龙
蔡后荣
张德平
《临床肺科杂志》
2012
2
下载PDF
职称材料
2
GPC5基因在肺腺癌组织中差异表达和突变分析
饶文
余祖滨
向颖
吴龙
邬娜
吴亚楠
白莉
李亚斐
《第三军医大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
1
下载PDF
职称材料
3
高通量转录组测序技术研究过表达GPC5对A549细胞基因表达影响
张海天
王国祥
杨欣
邱满堂
许林
《中国肺癌杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2016
1
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职称材料
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