目的:利用网络药理学方法及分子对接技术探析脉管复康片治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platfo...目的:利用网络药理学方法及分子对接技术探析脉管复康片治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选脉管复康片(丹参、鸡血藤、没药、乳香、郁金)活性成分和靶基因。使用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、遗传药理学与药物基因组学数据库(pharmacogenetics and pharmacogenomics knowledge base,PharmGKB)、DrugBank疾病数据库获得AS相关基因。使用Cytoscape 3.8.2构建“成分-靶点”网络。使用STRING数据库下载蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)数据,导入Cytoscape,使用CytoNCA插件获取核心靶基因。使用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。对活性成分及核心基因做分子对接。结果:从脉管复康片中共筛选出157个活性成分,对应AS靶基因238个,PPI核心靶基因共20个。GO功能富集显示生物学功能主要涉及脂多糖反应、细菌来源分子反应、金属离子反应、氧化应激反应等;KEGG通路富集显示主要涉及流体剪切应力和AS、AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路等;分子对接结果提示槲皮素、木犀草素、柚皮素、丹参酮ⅡA、刺芒柄花素、甘草查尔酮A与4个核心蛋白JUN、MAPK1、TP53、STAT3结合稳定。结论:脉管复康片可通过槲皮素、木犀草素等活性成分作用于多种信号通路及多个基因靶点治疗AS。展开更多
文摘目的:利用网络药理学方法及分子对接技术探析脉管复康片治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选脉管复康片(丹参、鸡血藤、没药、乳香、郁金)活性成分和靶基因。使用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物靶标数据库(therapeutic target database,TTD)、遗传药理学与药物基因组学数据库(pharmacogenetics and pharmacogenomics knowledge base,PharmGKB)、DrugBank疾病数据库获得AS相关基因。使用Cytoscape 3.8.2构建“成分-靶点”网络。使用STRING数据库下载蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)数据,导入Cytoscape,使用CytoNCA插件获取核心靶基因。使用R软件进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。对活性成分及核心基因做分子对接。结果:从脉管复康片中共筛选出157个活性成分,对应AS靶基因238个,PPI核心靶基因共20个。GO功能富集显示生物学功能主要涉及脂多糖反应、细菌来源分子反应、金属离子反应、氧化应激反应等;KEGG通路富集显示主要涉及流体剪切应力和AS、AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路等;分子对接结果提示槲皮素、木犀草素、柚皮素、丹参酮ⅡA、刺芒柄花素、甘草查尔酮A与4个核心蛋白JUN、MAPK1、TP53、STAT3结合稳定。结论:脉管复康片可通过槲皮素、木犀草素等活性成分作用于多种信号通路及多个基因靶点治疗AS。
