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马尾松EST-SSR PCR体系的优化
被引量：
11
1
作者
邵俊培
李志辉
+3 位作者
杨模华
黄丽群
洪永辉
黄以法
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期159-163,共5页
用单因素法研究马尾松EST-SSR PCR体系中各成分及退火温度对扩增结果的影响。结果显示优化后的反应体系为:2μL 10×Buffer(Mg2+Free),30 ng模板DNA,0.187 5 mmol/L-1 dNTPs,3.75 mmol·L-1 Mg2+,8 pmol引物,1.0 U Taq DNA聚合...
用单因素法研究马尾松EST-SSR PCR体系中各成分及退火温度对扩增结果的影响。结果显示优化后的反应体系为:2μL 10×Buffer(Mg2+Free),30 ng模板DNA,0.187 5 mmol/L-1 dNTPs,3.75 mmol·L-1 Mg2+,8 pmol引物,1.0 U Taq DNA聚合酶,加水至20μL。退火温度为56℃。并用21个马尾松DNA检验这一优化体系。检测试验表明,优化后的EST-SSR PCR反应体系稳定、可靠、可重复性强。
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关键词
马尾松
est
-
ssr
分子标记
单因素法
PCR体系
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职称材料
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
被引量：
6
2
作者
徐鹏
蔡继鸿
+4 位作者
杨阳
郭琪
张香桂
徐珍珍
沈新莲
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期65-74,共10页
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁...
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。
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关键词
陆地棉
耐盐
转录组
est
-
ssr
标记
est
-InDel标记
差异表达基因
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职称材料
蒺藜苜蓿种子产量相关性状的遗传分析
被引量：
5
3
作者
雷艳芳
魏臻武
+2 位作者
杨占花
盖钧镒
王仪明
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期337-342,共6页
通过对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula Gaertn.)种子产量相关性状的田间调查,解析影响蒺藜苜蓿种子产量的主要构成因素。结果表明:搜集的38份蒺藜苜蓿种质资源在种子产量方面存在显著差异(P<0.05),选系J1.12单株平均种子产量明显高于...
通过对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula Gaertn.)种子产量相关性状的田间调查,解析影响蒺藜苜蓿种子产量的主要构成因素。结果表明:搜集的38份蒺藜苜蓿种质资源在种子产量方面存在显著差异(P<0.05),选系J1.12单株平均种子产量明显高于其他材料;不同种质在分枝数、伸展长度、小花数、结荚数和百荚重等构成因素上存在显著差异(P<0.05);对蒺藜苜蓿种质种子产量与其构成因素间的相关性进行分析发现,伸展长度与种子产量相关性最大,相关系数为0.719,每荚种子数与种子产量相关性最小。通过系统聚类,参试蒺藜苜蓿种质可分为3个类群,并从中筛选6份种子产量特性差异大的蒺藜苜蓿种质作为杂交亲本,利用SSR、EST-SSR和SRAP引物检测亲本的多态性,发现6份亲本多态性差异明显;通过应用主基因+多基因遗传模型发现蒺藜苜蓿A17×A20组合的RILs群体种子产量性状的最佳遗传模型是2对加性-上位性主基因模型,该组合群体种子产量遗传以主基因为主,多基因遗传率较低,第二对主基因的加性效应值高于第一对主基因的加性效应值。
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关键词
蒺藜苜蓿
种子产量
主基因+多基因遗传分析
est
—
ssr
标记
SRAP标记
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职称材料
题名
马尾松EST-SSR PCR体系的优化
被引量：
11
1
作者
邵俊培
李志辉
杨模华
黄丽群
洪永辉
黄以法
机构
中南林业科技大学林学院
中南林业科技大学环境艺术设计学院
福建省漳平五一国有林场
出处
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第4期159-163,共5页
基金
国家"十一五"科技支撑项目(2006BAD24B0301-5)
文摘
用单因素法研究马尾松EST-SSR PCR体系中各成分及退火温度对扩增结果的影响。结果显示优化后的反应体系为:2μL 10×Buffer(Mg2+Free),30 ng模板DNA,0.187 5 mmol/L-1 dNTPs,3.75 mmol·L-1 Mg2+,8 pmol引物,1.0 U Taq DNA聚合酶,加水至20μL。退火温度为56℃。并用21个马尾松DNA检验这一优化体系。检测试验表明,优化后的EST-SSR PCR反应体系稳定、可靠、可重复性强。
关键词
马尾松
est
-
ssr
分子标记
单因素法
PCR体系
Keywords
Pinus
massoniana
1anb
est
-
ssr
makers
single
factor
analysis
method
PCR
system
分类号
S791.249 [农业科学—林木遗传育种]
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职称材料
题名
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
被引量：
6
2
作者
徐鹏
蔡继鸿
杨阳
郭琪
张香桂
徐珍珍
沈新莲
机构
江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花油菜重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期65-74,共10页
基金
国家科技重大专项"转基因生物新品种培育"(2014ZX08005-004-002)
棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2015A12)
江苏省自主创新基金(CX(14)2065)
文摘
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。
关键词
陆地棉
耐盐
转录组
est
-
ssr
标记
est
-InDel标记
差异表达基因
Keywords
Gossypiumhirsutum
salt
tolerance
transcriptome
est
-
ssr
makers
est
-InDel
markers
differentially
expressed
gene
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
蒺藜苜蓿种子产量相关性状的遗传分析
被引量：
5
3
作者
雷艳芳
魏臻武
杨占花
盖钧镒
王仪明
机构
甘肃农业大学草业学院
扬州大学动物科学与技术学院
南京农业大学国家大豆改良中心
出处
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第3期337-342,共6页
基金
国家自然科学基金(30671486)
国家863计划项目(2008AA10Z149)
+1 种基金
甘肃省教育厅科学技术研究项目
江苏省博士后基金
文摘
通过对蒺藜苜蓿(Medicago truncatula Gaertn.)种子产量相关性状的田间调查,解析影响蒺藜苜蓿种子产量的主要构成因素。结果表明:搜集的38份蒺藜苜蓿种质资源在种子产量方面存在显著差异(P<0.05),选系J1.12单株平均种子产量明显高于其他材料;不同种质在分枝数、伸展长度、小花数、结荚数和百荚重等构成因素上存在显著差异(P<0.05);对蒺藜苜蓿种质种子产量与其构成因素间的相关性进行分析发现,伸展长度与种子产量相关性最大,相关系数为0.719,每荚种子数与种子产量相关性最小。通过系统聚类,参试蒺藜苜蓿种质可分为3个类群,并从中筛选6份种子产量特性差异大的蒺藜苜蓿种质作为杂交亲本,利用SSR、EST-SSR和SRAP引物检测亲本的多态性,发现6份亲本多态性差异明显;通过应用主基因+多基因遗传模型发现蒺藜苜蓿A17×A20组合的RILs群体种子产量性状的最佳遗传模型是2对加性-上位性主基因模型,该组合群体种子产量遗传以主基因为主,多基因遗传率较低,第二对主基因的加性效应值高于第一对主基因的加性效应值。
关键词
蒺藜苜蓿
种子产量
主基因+多基因遗传分析
est
—
ssr
标记
SRAP标记
Keywords
Medicago
truncatula
Gaertn.
Seed
yield
Major
gene
plus
poly
gene
inheritance
analysis
est
-
ssr
maker
SRAP
maker
分类号
S336 [农业科学—作物遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马尾松EST-SSR PCR体系的优化
邵俊培
李志辉
杨模华
黄丽群
洪永辉
黄以法
《中南林业科技大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
11
下载PDF
职称材料
2
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
徐鹏
蔡继鸿
杨阳
郭琪
张香桂
徐珍珍
沈新莲
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016
6
下载PDF
职称材料
3
蒺藜苜蓿种子产量相关性状的遗传分析
雷艳芳
魏臻武
杨占花
盖钧镒
王仪明
《草地学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
5
下载PDF
职称材料
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