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陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
被引量：
6
1
作者
徐鹏
蔡继鸿
+4 位作者
杨阳
郭琪
张香桂
徐珍珍
沈新莲
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期65-74,共10页
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁...
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。
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关键词
陆地棉
耐盐
转录组
est
-SSR标记
est
-
indel
标记
差异表达基因
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职称材料
题名
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
被引量：
6
1
作者
徐鹏
蔡继鸿
杨阳
郭琪
张香桂
徐珍珍
沈新莲
机构
江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花油菜重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016年第1期65-74,共10页
基金
国家科技重大专项"转基因生物新品种培育"(2014ZX08005-004-002)
棉花生物学国家重点实验室开放课题(CB2015A12)
江苏省自主创新基金(CX(14)2065)
文摘
随着棉花基因组学、转录组学等重要学科的快速发展,针对候选基因进行序列多样性分析,开发基于候选基因的分子标记,将能够极大推进棉花分子育种研究。本研究利用高通量的测序技术对耐盐陆地棉品种Miscott 7913-83和盐敏感品种苏棉12盐胁迫前后根、叶总RNA的混样进行了转录组测序,对不同盐处理时期Miscott 7913-83和苏12根和叶分别进行表达谱分析。获得3232条盐胁迫下差异表达基因;基于差异表达基因利用生物信息学手段大规模开发了SSR以及In Del等分子标记;随机选择了部分SSR及In Del引物进行验证,进一步证实了分子标记的准确性。本研究为快速开发陆地棉品种间多态性分子标记提供了高效可行的分析方法,通过开发陆地棉耐盐相关功能标记,以期用于分子标记辅助育种改良陆地棉耐盐性。
关键词
陆地棉
耐盐
转录组
est
-SSR标记
est
-
indel
标记
差异表达基因
Keywords
Gossypiumhirsutum
salt
tolerance
transcriptome
est
-SSR
makers
est
-
indel
markers
differentially
expressed
gene
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
陆地棉耐盐相关EST-SSR以及EST-InDel分子标记的开发
徐鹏
蔡继鸿
杨阳
郭琪
张香桂
徐珍珍
沈新莲
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2016
6
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