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ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶家族系统进化与功能分化
被引量：
8
1
作者
官玲亮
侯凯
+2 位作者
陈郡雯
徐应文
吴卫
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期643-654,共12页
文章利用生物信息学方法对ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶基因家族的氨基酸序列特征、系统进化及功能分化进行分析。结果表明,ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸序列均含有3个保守的组氨酸基序(Hisbox)。质体类ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸N-端序...
文章利用生物信息学方法对ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶基因家族的氨基酸序列特征、系统进化及功能分化进行分析。结果表明,ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸序列均含有3个保守的组氨酸基序(Hisbox)。质体类ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸N-端序列均有数目不等的信号肽区域,并且在信号肽区中部发现1个由10个氨基酸残基组成的相对保守的疏水区,推测为该类酶信号肽的功能区域。多数植物微体ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸C-端均有KKXX-like motif内质网滞留信号,而红花CtFAD2-3、CtFAD2-4、CtFAD2-5、CtFAD2-6和CtFAD2-7中没有检测到该滞留信号,但C-端序列富含芳香族氨基酸,同样具有内质网滞留信号的作用。系统进化分析可将所有序列分为4大类,结果显示ω-3脂肪酸脱氢酶在原核生物中由ω-6脂肪酸脱氢酶基因进化而来;并且植物质体和微体类ω-3脂肪酸脱氢酶均可再划分为单子叶和双子叶植物2个亚类,表明植物质体和微体类ω-3脂肪酸脱氢酶功能的分化早在单子叶和双子叶植物分化之前就已经形成;而植物微体类ω-6脂肪酸脱氢酶可细分为种子特异表达型和组成性表达型两类,是在双子叶植物形成之后才开始分化的。各亚群间的功能分化位点分析表明,除植物FAD3/植物FAD2外,在所有存在功能分化的亚群间,均存在后验概率值超过0.80的氨基酸位点,而这些位点主要分布在Hisbox I的前后两端以及Hisbox II的前端,表明这些位点变化对蛋白质功能域的大小或构象有着重要影响,对于亚群间功能分化起着非常重要的作用。
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关键词
系统进化
组氨酸保守区
信号肽
内质网滞留信号
功能分化
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职称材料
用农杆菌真空渗透法在烟草中瞬时表达人酸性成纤维细胞生长因子
被引量：
2
2
作者
李玉玺
刘晶莹
+4 位作者
伏秀清
杨涛
肖乃仲
朱筱娟
王兴智
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期430-434,共5页
利用农杆菌真空渗透法在烟草中瞬时表达了人酸性成纤维细胞生长因子（haFGF）基因,并对影响表达量的几个因素进行了研究。结果表明,在真空渗透后4天,外源基因获得最高水平的表达,烟草Nicotiana benthamiana（N.b）的表达量明显低于烟草...
利用农杆菌真空渗透法在烟草中瞬时表达了人酸性成纤维细胞生长因子（haFGF）基因,并对影响表达量的几个因素进行了研究。结果表明,在真空渗透后4天,外源基因获得最高水平的表达,烟草Nicotiana benthamiana（N.b）的表达量明显低于烟草N.H（转基因沉默抑制子Hc-pro的N.b植株）。pM390-haFGF、pM390-haFGF/KDEL、pM390-SP/haFGF/KDEL三种表达框架被用来表达人酸性成纤维细胞生长因子,结果表明框架pM390-haFGF/KDEL的表达效果最好,受伤叶片和Valentine的培养方法要比完整叶片和Kapila的培养方法的表达量高。
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关键词
人酸性成纤维细胞生长因子(haFGF)
内质网滞留信号(KDEL)
信号肽
真空渗透
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职称材料
一个新的C-末端内质网定位信号RFSK
3
作者
梁琳
刘永波
+1 位作者
彭炬
卢光琇
《激光生物学报》
CAS
CSCD
2010年第1期18-24,共7页
蛋白质的亚细胞定位与其生物学功能有密切的关系。以一个新的小鼠N5-谷氨酰胺甲基转移酶基因mHemk的两个转录剪接本mHemkl和mHemk2(GenBank编号分别为AY456393和AY583759)为材料,进一步分析了该蛋白的亚细胞定位。根据生物信息学预测,...
蛋白质的亚细胞定位与其生物学功能有密切的关系。以一个新的小鼠N5-谷氨酰胺甲基转移酶基因mHemk的两个转录剪接本mHemkl和mHemk2(GenBank编号分别为AY456393和AY583759)为材料,进一步分析了该蛋白的亚细胞定位。根据生物信息学预测,在这两个蛋白质C-末端可能分别存在内质网(ER)定位信号RFSK和KSLK,且这两个蛋白质都可能主要定位于细胞质。分别构建了这两个蛋白质以及相应的删除了C-末端RFSK和KSLK的缺失突变体与加强型绿色荧光蛋白的融合蛋白的表达质粒,并转染到MCF-7细胞中。结果证明mHemkl蛋白中的RFSK基序是一个新的内质网定位信号,但没有足够的证据支持KSLK基序是mHemk2蛋白的内质网定位信号。这两个转录剪接本蛋白不同的亚细胞定位是否表明它们在不同的亚细胞器内有不同的功能仍值得深入研究。
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关键词
mHemk基因
亚细胞定位
内质网定位信号
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职称材料
题名
ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶家族系统进化与功能分化
被引量：
8
1
作者
官玲亮
侯凯
陈郡雯
徐应文
吴卫
机构
四川农业大学农学院
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所
出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第5期643-654,共12页
基金
国家自然科学基金项目(编号:181274020)资助
文摘
文章利用生物信息学方法对ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶基因家族的氨基酸序列特征、系统进化及功能分化进行分析。结果表明,ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸序列均含有3个保守的组氨酸基序(Hisbox)。质体类ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸N-端序列均有数目不等的信号肽区域,并且在信号肽区中部发现1个由10个氨基酸残基组成的相对保守的疏水区,推测为该类酶信号肽的功能区域。多数植物微体ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶氨基酸C-端均有KKXX-like motif内质网滞留信号,而红花CtFAD2-3、CtFAD2-4、CtFAD2-5、CtFAD2-6和CtFAD2-7中没有检测到该滞留信号,但C-端序列富含芳香族氨基酸,同样具有内质网滞留信号的作用。系统进化分析可将所有序列分为4大类,结果显示ω-3脂肪酸脱氢酶在原核生物中由ω-6脂肪酸脱氢酶基因进化而来;并且植物质体和微体类ω-3脂肪酸脱氢酶均可再划分为单子叶和双子叶植物2个亚类,表明植物质体和微体类ω-3脂肪酸脱氢酶功能的分化早在单子叶和双子叶植物分化之前就已经形成;而植物微体类ω-6脂肪酸脱氢酶可细分为种子特异表达型和组成性表达型两类,是在双子叶植物形成之后才开始分化的。各亚群间的功能分化位点分析表明,除植物FAD3/植物FAD2外,在所有存在功能分化的亚群间,均存在后验概率值超过0.80的氨基酸位点,而这些位点主要分布在Hisbox I的前后两端以及Hisbox II的前端,表明这些位点变化对蛋白质功能域的大小或构象有着重要影响,对于亚群间功能分化起着非常重要的作用。
关键词
系统进化
组氨酸保守区
信号肽
内质网滞留信号
功能分化
Keywords
phylogenetic
analysis
cons
er
ved
histidine
rich
motifs
signal
peptide
er
-
retention
signal
functional
div
er
gence
分类号
Q55 [生物学—生物化学]
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职称材料
题名
用农杆菌真空渗透法在烟草中瞬时表达人酸性成纤维细胞生长因子
被引量：
2
2
作者
李玉玺
刘晶莹
伏秀清
杨涛
肖乃仲
朱筱娟
王兴智
机构
东北师范大学遗传与细胞研究所
滨州学院生命科学系
出处
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007年第4期430-434,共5页
基金
国家植物转基因专项（JY03-B-17-01）资助项目.
文摘
利用农杆菌真空渗透法在烟草中瞬时表达了人酸性成纤维细胞生长因子（haFGF）基因,并对影响表达量的几个因素进行了研究。结果表明,在真空渗透后4天,外源基因获得最高水平的表达,烟草Nicotiana benthamiana（N.b）的表达量明显低于烟草N.H（转基因沉默抑制子Hc-pro的N.b植株）。pM390-haFGF、pM390-haFGF/KDEL、pM390-SP/haFGF/KDEL三种表达框架被用来表达人酸性成纤维细胞生长因子,结果表明框架pM390-haFGF/KDEL的表达效果最好,受伤叶片和Valentine的培养方法要比完整叶片和Kapila的培养方法的表达量高。
关键词
人酸性成纤维细胞生长因子(haFGF)
内质网滞留信号(KDEL)
信号肽
真空渗透
Keywords
human
acid
fibroblast
growth
factor
（haFGF）,
er
retention
signal
,
signal
peptide,
vacuum
infiltration
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
一个新的C-末端内质网定位信号RFSK
3
作者
梁琳
刘永波
彭炬
卢光琇
机构
中南大学生殖与干细胞工程研究所人类干细胞国家工程与研究中心
出处
《激光生物学报》
CAS
CSCD
2010年第1期18-24,共7页
基金
国家"863计划"(2006AA02A102)
国家"973计划"(2007CB947900)
国家自然科学基金(00CB51010)
文摘
蛋白质的亚细胞定位与其生物学功能有密切的关系。以一个新的小鼠N5-谷氨酰胺甲基转移酶基因mHemk的两个转录剪接本mHemkl和mHemk2(GenBank编号分别为AY456393和AY583759)为材料,进一步分析了该蛋白的亚细胞定位。根据生物信息学预测,在这两个蛋白质C-末端可能分别存在内质网(ER)定位信号RFSK和KSLK,且这两个蛋白质都可能主要定位于细胞质。分别构建了这两个蛋白质以及相应的删除了C-末端RFSK和KSLK的缺失突变体与加强型绿色荧光蛋白的融合蛋白的表达质粒,并转染到MCF-7细胞中。结果证明mHemkl蛋白中的RFSK基序是一个新的内质网定位信号,但没有足够的证据支持KSLK基序是mHemk2蛋白的内质网定位信号。这两个转录剪接本蛋白不同的亚细胞定位是否表明它们在不同的亚细胞器内有不同的功能仍值得深入研究。
关键词
mHemk基因
亚细胞定位
内质网定位信号
Keywords
mHemk
gene
subcellular
localization
endoplasmic
reticulum
（
er
）
-
retention
signal
分类号
Q631 [生物学—生物物理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
ω-6和ω-3脂肪酸脱氢酶家族系统进化与功能分化
官玲亮
侯凯
陈郡雯
徐应文
吴卫
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2013
8
下载PDF
职称材料
2
用农杆菌真空渗透法在烟草中瞬时表达人酸性成纤维细胞生长因子
李玉玺
刘晶莹
伏秀清
杨涛
肖乃仲
朱筱娟
王兴智
《高技术通讯》
CAS
CSCD
北大核心
2007
2
下载PDF
职称材料
3
一个新的C-末端内质网定位信号RFSK
梁琳
刘永波
彭炬
卢光琇
《激光生物学报》
CAS
CSCD
2010
0
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职称材料
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