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胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
彭瑾瑜
朱勋
+6 位作者
唐蔚青
王抒
黎健
王仁
郭芳
刘俊文
杨向东
《中国动脉硬化杂志》
CAS
CSCD
2005年第3期259-262,共4页
目的利用差异表达基因克隆方法(抑制消减杂交)获得大量的动脉粥样硬化相关候选基因和表达序列标签后,探讨如何进行后续基因表达及功能的研究。方法利用Internet网络上的数据库及生物学分析软件对胆固醇损伤内皮细胞后获得的差异表达基...
目的利用差异表达基因克隆方法(抑制消减杂交)获得大量的动脉粥样硬化相关候选基因和表达序列标签后,探讨如何进行后续基因表达及功能的研究。方法利用Internet网络上的数据库及生物学分析软件对胆固醇损伤内皮细胞后获得的差异表达基因进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索差异表达基因克隆后的研究方法和思路。结果通过电子延伸得到一个684bp的全长cDNA序列;通过核酸序列分析,该序列定位在线粒体基因组的7587位~8270位,含有一个完整的开放阅读框,编码与氧化磷酸化相关的9个亚基。对其中一个亚基细胞色素氧化酶Ⅱ(COX2)分析得知,细胞色素氧化酶Ⅱ基因编码一段25.6kDa的弱酸性的信号锚蛋白,细胞色素氧化酶Ⅱ蛋白的三维结构是一个典型的椅式结构,它含有一段疏水区域,一个跨膜结构域和一个胞质结构域。运用蛋白的进化分析,得知细胞色素氧化酶Ⅱ蛋白胞质结构域的氨基酸序列在进化过程中高度保守。结论生物信息学技术是一种高效的获取疾病相关基因信息的方法,利用生物信息学方法对细胞色素氧化酶Ⅱ基因进行分析,获得了基因及其编码蛋白的相关信息,该蛋白参与电子传递,可能与细胞的氧化应激有关。
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关键词
病理学与病理生理学
胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的分析
生物信息学分析
动脉粥样硬化
内皮细胞
胆固醇
细胞色素氧化酶亚基Ⅱ
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职称材料
条纹斑竹鲨鱼肝再生差异表达新基因NT7.1的原核表达及产物活性分析
2
作者
刘丽加
赵艳景
+4 位作者
袁瑞英
王颖
边杉
吴梧桐
叶波平
《中国海洋药物》
CAS
CSCD
2009年第1期1-6,共6页
目的NT7.1是一种鲨鱼肝脏再生过程中表达下调的功能基因片断,编码一个由134个氨基酸残基组成的假设蛋白。本研究的目的在于获得其重组蛋白,并检测该重组蛋白对肿瘤细胞增殖的作用。方法利用T4DNA连接酶将该编码序列连接到pET-28a载体中...
目的NT7.1是一种鲨鱼肝脏再生过程中表达下调的功能基因片断,编码一个由134个氨基酸残基组成的假设蛋白。本研究的目的在于获得其重组蛋白,并检测该重组蛋白对肿瘤细胞增殖的作用。方法利用T4DNA连接酶将该编码序列连接到pET-28a载体中,通过CaCl2法转化到E.coli BL21中获得表达该基因的工程菌;工程菌经IPTG诱导表达,获得的包涵体蛋白经金属螯合亲和层析方法纯化和复性;进一步通过MTT法检测纯化后的重组蛋白对人胃腺癌细胞株BGC-823、急性粒细胞白血病细胞株HL-60、人肺腺癌细胞株A549和肝癌细胞株SMMC-7721生长的影响。结果构建的基因工程菌株经1mmol·L-1的IPTG诱导6h后,可表达一大小约为18kDa的蛋白,表达量约占菌体总可溶性蛋白的40%。纯化后的重组NT7.1体外对4种肿瘤细胞的增殖均具有明显的抑制作用,其对BGC-823、HL-60、A549和SMMC-7721的IC50分别为2.66、0.44、2.96和4.99 nmol·L-1。结论NT7.1的原核重组表达产物对肿瘤细胞的增殖具有明显的抑制作用。
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关键词
条纹斑竹鲨鱼
差异表达序列
重组表达
抗肿瘤活性
原文传递
差别表达基因片段的克隆策略
被引量:
1
3
作者
晏猛
《河南职业技术师范学院学报》
2004年第4期50-52,共3页
克隆差异表达的基因可为分化细胞与祖细胞、激活细胞与静止细胞、突变细胞(如肿瘤细胞)与正常细胞提供某些有意义的信息,本文综述了差异表达基因克隆的一些策略。
关键词
克隆
差别表达基因
祖细胞
差异表达基因
正常细胞
突变细胞
肿瘤细胞
分化细胞
活细胞
片段
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职称材料
题名
胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的生物信息学分析
被引量:
3
1
作者
彭瑾瑜
朱勋
唐蔚青
王抒
黎健
王仁
郭芳
刘俊文
杨向东
机构
南华大学心血管病研究所
北京医院卫生部老年医学研究所
出处
《中国动脉硬化杂志》
CAS
CSCD
2005年第3期259-262,共4页
基金
国家自然科学基金(3002103)
湖南省自然科学基金(02JJY4011)
湖南省教育厅青年基金(02B039)
文摘
目的利用差异表达基因克隆方法(抑制消减杂交)获得大量的动脉粥样硬化相关候选基因和表达序列标签后,探讨如何进行后续基因表达及功能的研究。方法利用Internet网络上的数据库及生物学分析软件对胆固醇损伤内皮细胞后获得的差异表达基因进行核酸序列和蛋白质序列分析,探索差异表达基因克隆后的研究方法和思路。结果通过电子延伸得到一个684bp的全长cDNA序列;通过核酸序列分析,该序列定位在线粒体基因组的7587位~8270位,含有一个完整的开放阅读框,编码与氧化磷酸化相关的9个亚基。对其中一个亚基细胞色素氧化酶Ⅱ(COX2)分析得知,细胞色素氧化酶Ⅱ基因编码一段25.6kDa的弱酸性的信号锚蛋白,细胞色素氧化酶Ⅱ蛋白的三维结构是一个典型的椅式结构,它含有一段疏水区域,一个跨膜结构域和一个胞质结构域。运用蛋白的进化分析,得知细胞色素氧化酶Ⅱ蛋白胞质结构域的氨基酸序列在进化过程中高度保守。结论生物信息学技术是一种高效的获取疾病相关基因信息的方法,利用生物信息学方法对细胞色素氧化酶Ⅱ基因进行分析,获得了基因及其编码蛋白的相关信息,该蛋白参与电子传递,可能与细胞的氧化应激有关。
关键词
病理学与病理生理学
胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的分析
生物信息学分析
动脉粥样硬化
内皮细胞
胆固醇
细胞色素氧化酶亚基Ⅱ
Keywords
Bioinformatics
Analysis
Atherosclerosis
Endothehum
Cell
Cholesterol
Cytochrome
C
Oxidase
Subunit
Ⅱ
gene
differentially
displayed
gene
分类号
R363 [医药卫生—病理学]
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职称材料
题名
条纹斑竹鲨鱼肝再生差异表达新基因NT7.1的原核表达及产物活性分析
2
作者
刘丽加
赵艳景
袁瑞英
王颖
边杉
吴梧桐
叶波平
机构
中国药科大学生命科学与技术学院
淮海工学院海洋学院
出处
《中国海洋药物》
CAS
CSCD
2009年第1期1-6,共6页
基金
国家863计划项目(No.2007AA091402)
国家自然科学基金项目(30572280)
文摘
目的NT7.1是一种鲨鱼肝脏再生过程中表达下调的功能基因片断,编码一个由134个氨基酸残基组成的假设蛋白。本研究的目的在于获得其重组蛋白,并检测该重组蛋白对肿瘤细胞增殖的作用。方法利用T4DNA连接酶将该编码序列连接到pET-28a载体中,通过CaCl2法转化到E.coli BL21中获得表达该基因的工程菌;工程菌经IPTG诱导表达,获得的包涵体蛋白经金属螯合亲和层析方法纯化和复性;进一步通过MTT法检测纯化后的重组蛋白对人胃腺癌细胞株BGC-823、急性粒细胞白血病细胞株HL-60、人肺腺癌细胞株A549和肝癌细胞株SMMC-7721生长的影响。结果构建的基因工程菌株经1mmol·L-1的IPTG诱导6h后,可表达一大小约为18kDa的蛋白,表达量约占菌体总可溶性蛋白的40%。纯化后的重组NT7.1体外对4种肿瘤细胞的增殖均具有明显的抑制作用,其对BGC-823、HL-60、A549和SMMC-7721的IC50分别为2.66、0.44、2.96和4.99 nmol·L-1。结论NT7.1的原核重组表达产物对肿瘤细胞的增殖具有明显的抑制作用。
关键词
条纹斑竹鲨鱼
差异表达序列
重组表达
抗肿瘤活性
Keywords
Chiloscyllium
plagiosus
differentially
displayed
gene
recombinant
expression
antitumor
activity
分类号
Q959.4 [生物学—动物学]
R915.2 [医药卫生—微生物与生化药学]
原文传递
题名
差别表达基因片段的克隆策略
被引量:
1
3
作者
晏猛
机构
河南省体育运动学校
出处
《河南职业技术师范学院学报》
2004年第4期50-52,共3页
文摘
克隆差异表达的基因可为分化细胞与祖细胞、激活细胞与静止细胞、突变细胞(如肿瘤细胞)与正常细胞提供某些有意义的信息,本文综述了差异表达基因克隆的一些策略。
关键词
克隆
差别表达基因
祖细胞
差异表达基因
正常细胞
突变细胞
肿瘤细胞
分化细胞
活细胞
片段
Keywords
mRNA
differentially
expressed
display
,reprensentative
difference
analysis,suppression
subtractive
hybridization,serial
analysis
of
gene
expression
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
R737.33 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
胆固醇损伤内皮细胞差异表达基因的生物信息学分析
彭瑾瑜
朱勋
唐蔚青
王抒
黎健
王仁
郭芳
刘俊文
杨向东
《中国动脉硬化杂志》
CAS
CSCD
2005
3
下载PDF
职称材料
2
条纹斑竹鲨鱼肝再生差异表达新基因NT7.1的原核表达及产物活性分析
刘丽加
赵艳景
袁瑞英
王颖
边杉
吴梧桐
叶波平
《中国海洋药物》
CAS
CSCD
2009
0
原文传递
3
差别表达基因片段的克隆策略
晏猛
《河南职业技术师范学院学报》
2004
1
下载PDF
职称材料
已选择
0
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参考文献
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