期刊文献+
共找到827篇文章
< 1 2 42 >
每页显示 20 50 100
冠心病血瘀证遗传相关的差异基因筛选及其功能路径分析 被引量:26
1
作者 袁肇凯 王丽萍 +7 位作者 黄献平 李杰 王萍 喻松仁 简维雄 孙贵香 刘群良 郑景辉 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第10期1313-1318,共6页
目的探讨冠心病(coronary heart disease,CHD)血瘀证遗传相关的差异基因功能及目标通路。方法以家系CHD血瘀证者(A组)及家系CHD非血瘀证者(B组)、家系非CHD血瘀证者(C组)、家系健康人(D组)、非家系CHD血瘀证者(E组)、非家系健康人(F组)... 目的探讨冠心病(coronary heart disease,CHD)血瘀证遗传相关的差异基因功能及目标通路。方法以家系CHD血瘀证者(A组)及家系CHD非血瘀证者(B组)、家系非CHD血瘀证者(C组)、家系健康人(D组)、非家系CHD血瘀证者(E组)、非家系健康人(F组)为研究对象,应用基因芯片技术比较A组与B、C、D、E组,以及D组与F组的差异基因表达谱;通过基因本体论(geneontology,GO)分析阐释差异基因的分子功能;通过BioCarta及KEGG网站寻找差异基因所在通路,应用超几何分布统计学方法分析筛选出有意义的目标通路,并用实时荧光定量RT-PCR对差异基因进行验证。结果 (1)通过对基因芯片数据的筛选(差异倍数≥3),发现家系CHD血瘀证差异基因表达主要涉及趋化因子、白介素细胞因子、补体系统、基质金属蛋白酶系、成纤维细胞生长因子、内皮细胞黏附因子等。(2)通过相关差异基因(P<0.05)GO分析,找到与CHD血瘀证相关的差异基因的分子功能。(3)经过BioCarta及KEGG通路分析,发现家系CHD血瘀证与遗传相关的差异基因中差异有统计学意义(P<0.05)的目标通路主要涉及到炎症、斑块形成、内皮损伤等方面。经实时荧光定量RT-PCR反应验证了基因芯片准确可靠。结论 CHD血瘀证遗传相关的差异基因与炎症、斑块形成及血管内皮损伤密切相关。 展开更多
关键词 冠心病 血瘀证 遗传 家系 差异基因
下载PDF
基于消癌解毒方中白花蛇舌草有效成分治疗肿瘤的靶点研究 被引量:22
2
作者 朱恒舟 桑天庆 +2 位作者 季漪 李文婷 吴勉华 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2020年第5期132-135,I0028,I0029,共6页
目的探讨消癌解毒方中有白花蛇舌草有效成分对于肝癌、结肠癌治疗关键靶点。方法利用GSE21510及GSE121248芯片数据分析肿瘤差异基因,同时利用网络药理学手段寻找到白花蛇舌草有效成分作用靶点。通过KEGG通路,GO基因富集分析寻找差异基... 目的探讨消癌解毒方中有白花蛇舌草有效成分对于肝癌、结肠癌治疗关键靶点。方法利用GSE21510及GSE121248芯片数据分析肿瘤差异基因,同时利用网络药理学手段寻找到白花蛇舌草有效成分作用靶点。通过KEGG通路,GO基因富集分析寻找差异基因靶点及通路。通过TCGA数据库分析差异表达基因分布及生存情况。结果(1)通过芯片分析共找到差异基因261个,同时发现白花蛇舌草有效成分槲皮素、熊果酸共同作用靶点31个;(2)通过富集分析发现通路为肿瘤蛋白p53(p53)信号通路;(3)生存分析发现核糖核苷酸还原酶调节亚基M2(RRM2)、肿瘤蛋白p53诱导蛋白3(TP53I3)在肿瘤中的差异表达会导致患者的预后不同;(4)消癌解毒方可能作用靶点为RRM2、TP53I3、p53。结论消癌解毒方中白花蛇舌草有效成分槲皮素,熊果酸可能通过p53信号通路,通过多靶点的方式作用于RRM2、TP53I3、p53,实现抑制癌细胞,延长患者生命周期的效果。 展开更多
关键词 消癌解毒方 差异基因 靶点 生物信息学
下载PDF
通过cDNARDA法分离和识别盐藻(Dunaliella salina)盐胁迫相关基因 被引量:10
3
作者 方孝东 黄薇 +2 位作者 林栖凤 李冠一 屈良鹄 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期67-72,共6页
采用cDNA代表性差异分析 (RDA)技术 ,对盐藻在盐胁迫时差异表达的基因进行了分离鉴定 .在分离到的 10个基因中 ,有 5个与已知基因同源 (包括叶绿素a b结合蛋白基因、蛋白磷酸酶I催化亚基基因和 3个核糖体蛋白基因 ) ,还有 5个未知功能... 采用cDNA代表性差异分析 (RDA)技术 ,对盐藻在盐胁迫时差异表达的基因进行了分离鉴定 .在分离到的 10个基因中 ,有 5个与已知基因同源 (包括叶绿素a b结合蛋白基因、蛋白磷酸酶I催化亚基基因和 3个核糖体蛋白基因 ) ,还有 5个未知功能基因则是首次在盐藻中被分离 .值得注意的是 ,所有这 5个已知基因的功能都与细胞分裂或盐胁迫有关 .结果表明 :取样时盐藻细胞仍处于恢复阶段 ,所分离到的基因对于盐藻耐盐可能具有重要意义 ;蛋白磷酸酶I的下调表达可能是盐藻调节离子平衡的一个重要过程和细胞分裂受阻的原因所在 ;盐藻减缓细胞分裂速度可能是为了减少能量消耗 ,以留出足够的能量来应对盐胁迫 ;其它 5个未知基因可能也与盐藻适应盐胁迫机制有关 . 展开更多
关键词 盐藻 盐胁迫 差异表达 基因分离鉴定 代表性差异分析
下载PDF
用荧光差异显示法分离新的肝细胞癌相关基因 被引量:17
4
作者 刘军建 张杰 +3 位作者 张宁 芮静安 金城 周柔丽 《北京医科大学学报》 CSCD 2000年第5期411-414,共4页
目的 :寻找新的肝细胞癌 (hepatocellularcarcinoma ,HCC)相关基因。方法 :应用荧光 差异显示 (fluorescentdifferentialdisplay)技术分析人HCC、配对非癌肝、胎肝、正常肝等组织之间的基因差异表达 ,差异表达cDNA片段 ,经测序后 ,再用... 目的 :寻找新的肝细胞癌 (hepatocellularcarcinoma ,HCC)相关基因。方法 :应用荧光 差异显示 (fluorescentdifferentialdisplay)技术分析人HCC、配对非癌肝、胎肝、正常肝等组织之间的基因差异表达 ,差异表达cDNA片段 ,经测序后 ,再用RNA狭缝杂交对部分差异片段在上述 4种组织中的表达进行验证。结果 :共得到差异表达cDNA片段 110条。经狭缝杂交筛选 ,获得了 4条阳性片段 ,未知cDNA片段L2和与人醛缩酶B 99.5 %同源的cDNA片段L7在部分HCC中特异性低表达 ,未知cDNA片段LC2 7和与人Nip3基因 99.4%同源的cDNA片段LC2 0在部分HCC中特异性高表达。结论 :确认了 4条HCC相关基因。其中L2和人醛缩酶B基因可能为阻抑HCC发生、发展的基因 ,而人Nip3基因和LC2 7可能为促进HCC发生、发展的基因。L2和LC2 7为目前未知的新基因。 展开更多
关键词 肝细胞癌 遗传学 癌基因 荧光差异显示法
下载PDF
小麦条锈菌鉴别寄主Lee中抗性基因Yr7的微卫星标记 被引量:9
5
作者 姚占军 蔺瑞明 +3 位作者 徐世昌 李在峰 万安民 马峙英 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1146-1152,共7页
目的对近等基因系Taichung296/Lee对条锈菌(PST)菌系CYR27的抗性谱进行遗传分析,并运用微卫星技术对近等基因系Taichung296/Lee中的抗条锈性基因进行标记。方法将Taichung296/Lee与Taichung29杂交、自交和测交并对双亲及其杂交后代进行... 目的对近等基因系Taichung296/Lee对条锈菌(PST)菌系CYR27的抗性谱进行遗传分析,并运用微卫星技术对近等基因系Taichung296/Lee中的抗条锈性基因进行标记。方法将Taichung296/Lee与Taichung29杂交、自交和测交并对双亲及其杂交后代进行苗期抗性鉴定。采用SSR技术,利用抗性供体Lee中含有目的基因Yr7的小麦抗条锈病近等基因系Taichung296/Lee,选用Yr7所在的2B染色体上88对和Yr22、Yr23所在4D、6D染色体上22对SSR引物,对供试的Taichung296/Lee、Taichung29和Lee基因组DNA进行PCR扩增和电泳分析。结果根据F2分离群体的抗感单株分离比例,确定Taichung296/Lee对CYR27菌系的抗性为1个显性基因,2B染色体上的Xgwms526引物扩增出多态性谱带为Xgwms526/212bp和Xgwms526/216bp,并证明其DNA片段位点与抗条锈基因Yr7存在遗传连锁关系;用标记Xgwms526扩增F2作图群体的单株DNA,在75株抗病单株中,有22株扩增出A型带(Xgwm526-212bp),51株扩增出H型带(Xgwm526-212bp和Xgwm526-216),2株扩增出B型带(Xgwm526-216);在31株感病株中,有4株扩增出H型带,27株扩增出B型带。结论通过MapManagerQTX17b软件计算,确定Xgwm526标记位点与Yr7基因位点的遗传距离为5.3cM,标准差为2.3,LOD值为18.4。该标记Xgwm526可作为Yr7基因的SSR标记利用。 展开更多
关键词 小麦 条锈菌 鉴别寄主 LEE 抗病基因 微卫星标记
下载PDF
黄淮地区大豆种质资源对疫霉根腐病的抗病性评价 被引量:14
6
作者 唐庆华 崔林开 +6 位作者 李德龙 戴婷婷 阴伟晓 董莎萌 邢邯 郑小波 王源超 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期2246-2252,共7页
【目的】建立一套大豆抗疫霉菌根腐病基因鉴别菌系,并用于分析大豆品种(系)是否含有抗病基因Rps1a、Rps1c和Rps1k。【方法】采用下胚轴接种法测定了125个大豆疫霉菌分离物的毒性组成,筛选了不同毒力公式的6个大豆疫霉菌并建立了该菌系,... 【目的】建立一套大豆抗疫霉菌根腐病基因鉴别菌系,并用于分析大豆品种(系)是否含有抗病基因Rps1a、Rps1c和Rps1k。【方法】采用下胚轴接种法测定了125个大豆疫霉菌分离物的毒性组成,筛选了不同毒力公式的6个大豆疫霉菌并建立了该菌系,测定了黄淮地区55个主栽大豆品种(系)对该菌系的抗性并通过基因推导方法进行抗病基因分析。【结果】55个大豆品种(系)共产生18种反应型。抗病基因的推导结果表明,有2个品种可能含有Rps1c,没有鉴定到可能携带有Rps1a或Rps1k的大豆品种(系)。【结论】黄淮地区携带抗病基因Rps1a、Rps1c和Rps1k的大豆品种(系)并不多,且易感疫霉菌,因此需要及时进行抗性育种并积极推广。 展开更多
关键词 大豆疫霉菌 鉴别菌系 大豆 疫霉根腐病 抗病基因
下载PDF
家庭养育环境与儿童发展:差别易感性假说 被引量:14
7
作者 马园园 周荃 邢淑芬 《心理科学进展》 CSSCI CSCD 北大核心 2015年第11期1931-1941,共11页
差别易感性假说认为儿童对养育环境的影响的敏感性不同,一些儿童比其他儿童更易受消极养育环境的不利影响,同时也更易受积极的、支持性养育环境的有利影响。首先本文阐述了差别易感性理论的基本观点和建立差别易感性的统计标准;其次,重... 差别易感性假说认为儿童对养育环境的影响的敏感性不同,一些儿童比其他儿童更易受消极养育环境的不利影响,同时也更易受积极的、支持性养育环境的有利影响。首先本文阐述了差别易感性理论的基本观点和建立差别易感性的统计标准;其次,重点梳理了近年来差别易感性模型的行为、生理和基因方面的实证研究证据,即它们作为调节因素是如何调节养育环境对个体发展的影响;最后,对该领域研究的局限性和未来研究的方向进行了小结。 展开更多
关键词 差别易感性 养育 气质 生理 基因
下载PDF
植物差异表达基因克隆技术及研究进展 被引量:5
8
作者 谢伟伟 王凭青 +2 位作者 杨青川 刘博 李志中 《重庆大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第12期96-100,共5页
随着分子生物学技术的深入发展,植物基因组研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究,目前分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点.近些年来,国内外学者发展了多种分析差异表... 随着分子生物学技术的深入发展,植物基因组研究已经由以全基因组测序为目标的结构基因组学转向以基因功能鉴定为目标的功能基因组学研究,目前分离并克隆差异表达基因已成为生命科学研究的热点.近些年来,国内外学者发展了多种分析差异表达基因的技术来研究植物在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,掌握了生命活动过程中的重要信息.文章对建立在RNA水平上克隆植物未知差异表达基因的几种关键技术及其研究进展进行了综述,阐述了各技术的原理、技术路线、优缺点及相应的改进方法,并对它们在植物抗逆研究中的应用现状及前景作了展望. 展开更多
关键词 差异表达 基因克隆 DDRT-PCR SSH RDA-PCR RAP-PCR
下载PDF
低温胁迫下龙眼碳酸酐酶基因(CA)的克隆与表达分析 被引量:12
9
作者 陈虎 何新华 +3 位作者 罗聪 杨丽涛 黄杏 胡颖 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期243-252,共10页
应用蛋白质组学研究低温胁迫下龙眼叶片蛋白质组变化时发现碳酸酐酶(CA)蛋白下调表达。利用RT-PCR方法克隆CA基因的全长cDNA,GenBank登录号JN033201,长度为1119bp,包括1个966bp的开放阅读框,编码321bp的氨基酸序列,同源性分析表明,12个... 应用蛋白质组学研究低温胁迫下龙眼叶片蛋白质组变化时发现碳酸酐酶(CA)蛋白下调表达。利用RT-PCR方法克隆CA基因的全长cDNA,GenBank登录号JN033201,长度为1119bp,包括1个966bp的开放阅读框,编码321bp的氨基酸序列,同源性分析表明,12个不同植物同源性为81%~88%。龙眼CA基因具有典型的CA结构域,并且非常保守。实时荧光定量分析结果表明,CA在龙眼根、茎、叶中都有表达,为组成型表达,在叶中的表达量最高,茎和根中的表达量最少。CA基因在低温胁迫下随着低温胁迫时间的延长而发生变化。将CA在大肠杆菌中表达,获得1个约40.5kD的外源蛋白。推测CA表达与低温胁迫有关。 展开更多
关键词 龙眼 低温胁迫 蛋白质组学 差异蛋白 碳酸酐酶 基因 克隆 表达
原文传递
分离基因的有效手段-mRNA差异显示技术 被引量:12
10
作者 邢少辰 林秀峰 《吉林农业科学》 CSCD 2004年第2期9-12,17,共5页
mRNA差异显示技术从开始应用至今已经有10年了。在此期间,此项技术也在不断发展完善。简要综述了差异显示技术的基本原理、优越性、存在的主要缺陷及其技术改进等方面的研究进展。
关键词 差异显示 基因 进展
下载PDF
运用银染mRNA差异显示方法分析杂交水稻红莲优6号基因表达差异 被引量:7
11
作者 张义平 陈学峰 熊建华 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 2003年第4期493-497,共5页
运用非同位素银染mRNA差异显示方法 ,分析红莲型杂交水稻组合基因表达差异。以杂交水稻及其亲本三系 (YTA、YTB、93 1 1 )三叶一心期叶片RNA为模板采用锚定引物 5′dT1 2MN 3′和随机引物组合 ,进行反转录差异显示PCR。经 5 .6%测序胶... 运用非同位素银染mRNA差异显示方法 ,分析红莲型杂交水稻组合基因表达差异。以杂交水稻及其亲本三系 (YTA、YTB、93 1 1 )三叶一心期叶片RNA为模板采用锚定引物 5′dT1 2MN 3′和随机引物组合 ,进行反转录差异显示PCR。经 5 .6%测序胶电泳分离后用银染方法显示差异DNA条带 ,在直观下 ,从凝胶中回收差异条带并进行再扩增 ,2 %琼脂糖电泳得到了DNA的单一带型。 展开更多
关键词 杂交水稻 红莲优6号品种 银染mRNA 差异显示 基因表达
下载PDF
Differential Gene Expression Between Wheat Hybrids and Their Parental Inbreds in Primary Roots 被引量:10
12
作者 倪中福 孙其信 +1 位作者 吴利民 解超杰 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第4期457-462,共6页
To provide an insight into the molecular basis of heterosis, differential display of mRNA was used to analyze the difference of gene expression between wheat (Triticum aestivum L.) heterotic hybrid A, nonheterotic hyb... To provide an insight into the molecular basis of heterosis, differential display of mRNA was used to analyze the difference of gene expression between wheat (Triticum aestivum L.) heterotic hybrid A, nonheterotic hybrid B and their parental inbreds in the primary roots. By using 5′ end random primers in combination with three one-base-anchored primers, it was found that 22.5% and 22.9% of 877 total displayed cDNAs were differentially expressed between hybrid A, B and their parents, respectively. Both quantitative and qualitative differences in gene expression between hybrids and their parental inbreds were obvious, indicating that the patterns of gene expression in hybrids alter significantly as compared to their corresponding parents. On the other hand, by using MADS-box gene specific 5′ end primer for DDRT-PCR, we found that nearly all of the displayed cDNA fragments were polymorphic between hybrids and their parents, and major difference occurred in qualitative level, in which hybrid specific-expressed and silenced genes are the major two patterns, suggesting that MADS-box gene may be important for manifestation of differential gene expression and wheat heterosis. In comparison with our previous results by using seedling leaves, it is indicated that differential gene expression between hybrids and parents is dependent on the tissues tested, and more differentially expressed genes were observed in the primary roots than in the seedling leaves. Therefore, it is concluded that the expressions of both randomly displayed cDNAs and transcription factor genes, such as MADS-box, alter significantly between hybrids and their parents, which might be responsible for the observed heterosis. 展开更多
关键词 differential display gene expression HETEROSIS WHEAT primary roots
下载PDF
天王补心丹加减干预睡眠剥夺大鼠能量代谢机制的生物信息学分析 被引量:11
13
作者 黄晓宇 谢光璟 黄攀攀 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第22期172-180,共9页
目的:使用基因芯片测序技术测定睡眠剥夺大鼠模型被天王补心丹干预前后,能量代谢相关差异基因功能表达谱的变化,为睡眠剥夺的防治提供可能思路及理论依据。方法:采用多平台水环境法对大鼠进行睡眠剥夺造模后随机分为天王补心丹组和模型... 目的:使用基因芯片测序技术测定睡眠剥夺大鼠模型被天王补心丹干预前后,能量代谢相关差异基因功能表达谱的变化,为睡眠剥夺的防治提供可能思路及理论依据。方法:采用多平台水环境法对大鼠进行睡眠剥夺造模后随机分为天王补心丹组和模型组,天王补心丹组按照20 g·kg-1的剂量灌服天王补心丹水煎剂,模型组给予等体积纯水,连续灌胃14 d。取肝、心、下丘脑为样本,高通量测序获取差异基因,采用基因本体(GO)数据库与京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路富集分析,并构建与lncRNA的共表达网络,应用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测其中3个差异性显著的能量代谢关键基因神经肽Y(NPY),双特异性磷酸酶1/丝裂原活化蛋白激酶磷酸酶1(DUSP1/MKP-1),α-L-艾杜糖醛酸酶(IDUA)的mRNA表达水平。结果:得到321个差异基因,其中表达上调231个,下调90个,主要促进脂代谢、糖代谢与蛋白代谢进程;参与纤维蛋白原、维生素B6与星形胶质细胞源性神经营养因子(MANF)的合成表达;涉及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK),p53基因(p53),环磷酸腺苷(cAMP)等信号通路。与模型组比较,天王补心丹组IDUA表达水平明显增加(P<0.05),NPY和DUSP1表达水平显著降低(P<0.01)。结论:天王补心丹从多方面干预睡眠剥夺大鼠的能量代谢机制,通过下调NPY,DUSP1的mRNA表达水平,可能激活参与p38 MAPK信号通路,影响脂质代谢。 展开更多
关键词 天王补心丹 睡眠剥夺 能量代谢 生物信息学 差异基因
原文传递
Differential Gene Expression Between Hybrids and Their Parents During the Four Crucial Stages of Cotton Growth and Development 被引量:8
14
作者 ZHAO Yun-lei, YU Shu-xun, XING Chao-zhu, FAN Shu-li, SONG Mei-zhen and YE Wu-wei Cotton Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences(CAAS)/Key Laboratory of Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Anyang 455000, P.R.China 《Agricultural Sciences in China》 CSCD 2009年第2期144-153,共10页
The study aims to clarify the differential gene expression between cotton hybrids and their parents in order to better understand the molecular basis of cotton heterosis. The research focused on cotton heterotic and l... The study aims to clarify the differential gene expression between cotton hybrids and their parents in order to better understand the molecular basis of cotton heterosis. The research focused on cotton heterotic and lower heterotic hybrids and their parents during the four crucial stages, which were analyzed using a differential display technique. The results indicated that there were both quantitative and qualitative differences in gene expression amongst them. The quantitative differences include over- and under-expression of parental genes and the dominant expression of highly-expressed parental genes in hybrids. In contrast, the qualitative differences are the following: (i) Bands were observed in both parents but not in the F1 hybrid (BPnF1); (ii) bands occurred in either of the parents but not in the F1 hybrid (UPnF1); (iii) bands presented only in the F1 hybrid but not in either of the parents (UF1nP); and (iv) bands were detected in either of the parents and the F1 hybrid (UPF1). Overall, the major differences of gene expression occurred in the qualitative level and four related differential patterns were observed. Furthermore, the amount of differential patterns during the flowering stage was relatively higher than those of other stages. At this juncture, both the amount of hybrid-specific expression patterns at flowering stage and the silenced expression patterns at boll-forming stage in highly heterotic hybrids were found higher than those in the lower heterotic ones. It was concluded that significant differences of gene expression in leaves were present between cotton hybrid and its parents during the whole growing stages. Hence, these differences might be responsible for the observed cotton heterosis. 展开更多
关键词 COTTON HETEROSIS molecular mechanism gene expression differential display
下载PDF
基于基因表达综合数据库与中医传承辅助系统分析气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略 被引量:10
15
作者 宋洋 杨仁义 +5 位作者 周德生 傅馨莹 刘利娟 颜思阳 陆展辉 陈瑶 《世界中医药》 CAS 2021年第17期2562-2569,共8页
目的:利用GEO芯片数据及中医传承辅助系统,获取气虚血瘀型脑梗死的差异基因及中医药防治方剂,并分析其作用机制,为气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略提供理论依据。方法:采用生物信息学、数据挖掘、网络药理学等多学科交叉方法,对气虚... 目的:利用GEO芯片数据及中医传承辅助系统,获取气虚血瘀型脑梗死的差异基因及中医药防治方剂,并分析其作用机制,为气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略提供理论依据。方法:采用生物信息学、数据挖掘、网络药理学等多学科交叉方法,对气虚血瘀型脑梗死的中医药防治策略进行探讨。整合基因表达综合数据库(GEO)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、GeneCards、PubChem、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、WebGestalt、DAVID多数据库资源及Cytoscape、R语言软件工具,对气虚血瘀型脑梗死疾病靶点、中药靶点进行筛选,从蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集的角度,对中医传承辅助系统数据挖掘获取的气虚血瘀型脑梗死基础方的作用机制进行探讨。结果:获取2542个气虚血瘀型脑梗死疾病靶点,其中差异基因结果显示HIF1A、PIK3CA、PIK3R1、TP53、NFKB1、HSP90AA1、CREBBP、CASP8、IL6、TNF、ITGB等表达上调,APOE、IGF1、CXCL5、SRC、ADCY5、PTGS2等表达下调,可作为疾病诊断治疗的潜在靶点。58首气虚血瘀型脑梗死方剂的用药规律,包括频次、关联及新方组合,获得气虚血瘀型脑梗死基础方剂,由黄芪、川芎、当归、地龙、党参、西洋参、白术、桃仁、赤芍、枳实10味中药组成,具有益气活血、行气化痰的功效,其作用机制可能与调控差异基因以多组分、多功能、多途径的方式,主要通过HIF-1、TNF、NF-kappa B、Apoptosis、PI3K-AKT等通路发挥作用。结论:气虚血瘀型脑梗死的中医药防治当以差异基因靶点为中心,筛选出临床基础方,根据临床辨证施治加减中药,同时可采用多学科交叉方法对气虚血瘀型脑梗死的方剂从多组分、多途径、多靶点层面进行临床与实验验证。本研究为中医药治疗气虚血瘀型脑梗死提供了方法理论上的指导,对推 展开更多
关键词 气虚血瘀 脑梗死 基因表达综合数据库 差异基因 中医传承辅助系统 网络药理学
下载PDF
MDM2和p53在反应性及肿瘤性星形胶质细胞中的表达 被引量:8
16
作者 董燕燕 戚基萍 +3 位作者 王爱春 张春庆 李丹阳 王丹丹 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期109-111,共3页
目的检测MDM2和p53蛋白在星形胶质细胞反应性增生与星形胶质细胞瘤中的表达,探讨二者在胶质瘤形成和发展中的作用及其相关性。方法应用组织芯片和免疫组化染色技术检测正常脑组织、星形胶质细胞反应性增生、低级别(Ⅰ-Ⅱ级)和高级别(Ⅲ... 目的检测MDM2和p53蛋白在星形胶质细胞反应性增生与星形胶质细胞瘤中的表达,探讨二者在胶质瘤形成和发展中的作用及其相关性。方法应用组织芯片和免疫组化染色技术检测正常脑组织、星形胶质细胞反应性增生、低级别(Ⅰ-Ⅱ级)和高级别(Ⅲ-Ⅳ级)星形胶质细胞瘤中MDM2和p53蛋白的表达情况。结果正常脑组织中MDM2和p53蛋白均呈阴性表达;反应性增生组、低级别肿瘤组及高级别肿瘤组中MDM2蛋白的阳性率分别为32.7%(16/49)、59.2%(29/49)、80.0%(40/50);p53蛋白的阳性率分别为27.3%(12/49)、57.1%(28/49)、82.0%(41/50)。二者阳性表达率均随着病变恶性程度的增加而升高,MDM2和p53在各实验组间的比较差异均有统计学意义(P<0.05);且MDM2和p53表达密切相关(P<0.05)。结论MDM2和p53在星形胶质细胞反应性增生及星形胶质细胞瘤中均呈不同程度的过度表达,且随着病变恶性程度的增加表达水平增高,MDM2扩增和p53突变是胶质瘤发生的早期事件,二者的联合检测可能会对星形胶质细胞反应性增生与低级别胶质细胞瘤的鉴别诊断以及星形胶质细胞瘤的早期诊断提供一定的依据。 展开更多
关键词 星形细胞瘤 诊断 鉴别 基因表达 基因 p53 基因 MDM2
下载PDF
基于大数据的前列腺癌生物信息学分析 被引量:9
17
作者 李志标 唐福才 +2 位作者 卢泽潮 黄伟娜 何朝辉 《中山大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期857-865,共9页
【目的】利用生物信息学的方法,对GEO和TCGA两个基因组学数据库进行分析,探究与前列腺癌相关的差异基因及相关的调控网络。【方法】综合GEO数据库的前列腺癌基因表达芯片数据(GSE46602、GSE55945)和TCGA数据库的RNA-seq数据,利用GEO2R及... 【目的】利用生物信息学的方法,对GEO和TCGA两个基因组学数据库进行分析,探究与前列腺癌相关的差异基因及相关的调控网络。【方法】综合GEO数据库的前列腺癌基因表达芯片数据(GSE46602、GSE55945)和TCGA数据库的RNA-seq数据,利用GEO2R及R语言的edgeR包进行基因差异分析,获得共同的显著差异基因,结合R语言的clusterProfiler包进行GO功能分析及KEGG通路分析,同时利用string网站进行蛋白互作网络分析,筛选出前列腺癌中调节蛋白表达量的关键基因,再结合TCGA临床随访数据分析关键节点基因的临床预后价值。【结果】获得共同差异基因共278个,其中表达上调100个,表达下调178个,它们与上皮细胞的调节增殖、含苯化合物的代谢过程等功能以及谷胱甘肽代谢和粘着斑等信号通路密切相关。蛋白互作网络分析结果得出3个重点蛋白表达模块以及12个关键节点基因。在这些关键基因中,EDN3、EDNRB和AMACR与前列腺癌患者的生存率密切相关。【结论】通过对前列腺癌基因芯片和RNA-seq数据的生物信息学分析,我们发现EDN3、EDNRB与AMACR很可能在前列腺癌的发生发展过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 前列腺癌 生物信息学 GEO TCGA 差异基因
下载PDF
基于人类全基因表达谱技术对“肾精亏虚证”原发性骨质疏松患者差异基因表达分析 被引量:9
18
作者 辛华 谢晚晴 +2 位作者 蒋宁 孙丽 郑洪新 《中国骨质疏松杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期1180-1185,共6页
目的基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,检测肾精亏虚证骨质疏松患者和同龄健康状态老年人血液中的差异基因表达,探讨肾精亏虚证骨质疏松症的发病机制,为中医药防治该病证提供可能的作用靶点。方法从辽宁中医药大学附属医院和上... 目的基于人类全基因表达谱芯片高通量测序技术,检测肾精亏虚证骨质疏松患者和同龄健康状态老年人血液中的差异基因表达,探讨肾精亏虚证骨质疏松症的发病机制,为中医药防治该病证提供可能的作用靶点。方法从辽宁中医药大学附属医院和上海中医药大学附属龙华医院门诊肾精亏虚证原发性骨质疏松症患者群中随机选择16例患者,男女各半,年龄60岁以上,作为OP组(OP group);同龄健康状态老年人24例,男女各半,年龄60岁以上,作为对照组。采用人类全基因表达谱芯片检测两组人群的差异基因表达,并对差异显著的基因表达进行荧光定量PCR验证。结果在肾精亏虚证OP患者中共有602个基因呈现差异性表达,其中上调基因579个,下调基因23个(FC≥1.5或FC≤0.667,q-value≤5%)。表达上调超过3倍的基因有7个,分别为S100P、SNX3、DEFA1、MMP9、ANXA3、IL1R2、PLSCR1;表达下调超过2倍的基因有3个,分别为CX3CR1、SPON2、GNLY。对以上10个差异显著的基因进行RT-PCR验证,结果与基因芯片检测结果一致。结论肾精亏虚证OP患者与同龄健康老年人比较,差异基因表达上调或下调显著,这些基因通过调控免疫应答、防御应答、趋化因子信号转导通路等方面在肾精亏虚证OP的发病过程中可能发挥着重要的作用。 展开更多
关键词 肾精亏虚 骨质疏松 高通量 差异基因
下载PDF
基于转录组学探讨糖止丸调控PI3K/Akt改善T2DM大鼠肝脏胰岛素抵抗的效应机制 被引量:3
19
作者 李钦 梁永林 +2 位作者 史晓伟 刘轩 朱向东 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期99-109,共11页
目的:探讨糖止丸基于差异基因调控磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路改善2型糖尿病(T2DM)肝脏胰岛素抵抗(IR)的效应及可能的分子机制。方法:采用高脂(HFD)饲料喂养联合链脲佐菌素(STZ)腹腔注射方法制备T2DM大鼠模型。实验... 目的:探讨糖止丸基于差异基因调控磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)信号通路改善2型糖尿病(T2DM)肝脏胰岛素抵抗(IR)的效应及可能的分子机制。方法:采用高脂(HFD)饲料喂养联合链脲佐菌素(STZ)腹腔注射方法制备T2DM大鼠模型。实验分为空白组、模型组、盐酸二甲双胍组(0.18 g·kg^(-1))、糖止丸高(1.08 g·kg^(-1))、中(0.54 g·kg^(-1))、低(0.27 g·kg^(-1))剂量组。收集大鼠血清、肝脏和胰腺组织,苏木素-伊红(HE)染色肝脏、胰腺病理组织观察;检测空腹血糖值(FBG),进行口服葡萄糖耐量(OGTT)实验;酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测大鼠空腹血清胰岛素(FINS)、糖化血红蛋白(GHb)水平;计算胰岛素抵抗稳态模型指数(HOMA-IR)、β细胞功能稳态指数(HOMA-β)、胰岛素敏感指数(ISI);生化法测定大鼠血清甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)含量。转录组学获得肝脏组织差异表达mRNA并富集差异表达通路。实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)检测肝脏组织环腺苷酸应答元件结合蛋白3样蛋白2抗体(CREB3l2)、B细胞淋巴瘤-2(Bcl-2)、Toll样受体2(TLR2)、周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(CDNK1A)、DNA损伤诱导转录因子4样蛋白(DDIT4)mRNA表达;蛋白免疫印迹法(Western blot)检测磷酸化(p)-PI3K、p-Akt、葡萄糖转运蛋白4(GLUT4)、胰岛素受体(INSR)、胰岛素受体底物2(IRS2)蛋白表达。结果:药效学实验结果显示,与模型组比较,糖止丸各剂量组不同程度修复肝脏和胰腺组织;降低血糖(P<0.01);促使血清FINS、GHb水平和HOMA-IR降低(P<0.05,P<0.01),HOMA-β、ISI升高(P<0.05,P<0.01);TC、TG、LDL-C水平降低(P<0.05,P<0.01),HDL-C水平升高(P<0.05,P<0.01)。转录组学实验结果确证PI3K/Akt信号通路在空白组与模型组及糖止丸高剂量组与模型组中均显著表达;CDNK1A、DDIT4、CREB3l2、Bcl-2、TLR2是糖止丸干预T2DM的显著差异 展开更多
关键词 糖止丸 磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt) 2型糖尿病(T2DM) 差异基因 胰岛素抵抗 转录组学
原文传递
喉癌中STK15基因扩增及表达的研究 被引量:6
20
作者 叶燕 李福才 +6 位作者 王淑云 李婵媛 袁海明 赵旭 富伟能 徐振明 孙开来 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期326-329,共4页
目的研究喉癌中STK15基因扩增、mRNA和蛋白表达增高在喉癌发生、发展中的作用。方法应用差异PCR方法检测40例喉鳞状细胞癌及癌旁正常对照组织STK15基因扩增的情况;应用逆转录PCR方法检测同批标本STK15mRNA表达情况;用免疫组织化学方法分... 目的研究喉癌中STK15基因扩增、mRNA和蛋白表达增高在喉癌发生、发展中的作用。方法应用差异PCR方法检测40例喉鳞状细胞癌及癌旁正常对照组织STK15基因扩增的情况;应用逆转录PCR方法检测同批标本STK15mRNA表达情况;用免疫组织化学方法分析STK15蛋白表达。结果肿瘤组织中STK15基因扩增率为35%(14/40);STK15mRNA表达增高占67.5%(27/40);STK15蛋白表达的阳性率为72.5%(29/40);将扩增与表达的结果与喉癌患者的临床各项指标进行统计学分析,STK15基因扩增、STK15mRNA表达增高与肿瘤的分化程度显著相关(P<0.05);STK15蛋白表达与肿瘤的分化程度和病理分级显著相关(P<0.05)。结论喉癌中STK15基因扩增、mRNA和蛋白表达水平增高,导致中心体复制异常、染色体不稳定,可能在喉癌的发生及恶性进展中起一定作用。 展开更多
关键词 喉鳞状细胞癌 STK15基因 差异-聚合酶链反应 基因扩增
原文传递
上一页 1 2 42 下一页 到第
使用帮助 返回顶部