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华细辛实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
被引量:
3
1
作者
赵晓冰
潘磊
+3 位作者
柳威
林懋怡
李宏庆
刘忠
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期174-179,共6页
选择合适的内参基因是准确分析目标基因表达水平变化的重要条件。选取SAND-1、ACT、18Sr RNA、CYP2、GAPDH、TUB 6个常用的内参基因作为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR技术,通过ge Norm、Norm Finder、Best Keeper、Delta CT等软件...
选择合适的内参基因是准确分析目标基因表达水平变化的重要条件。选取SAND-1、ACT、18Sr RNA、CYP2、GAPDH、TUB 6个常用的内参基因作为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR技术,通过ge Norm、Norm Finder、Best Keeper、Delta CT等软件分析和评价6个候选内参基因在华细辛营养生长期、花期和花后期等不同生长阶段的根、根茎、叶片、叶柄等不同组织中的表达稳定性,筛选适宜华细辛不同生长阶段不同组织基因表达水平分析的内参基因。结果表明,18S r RNA在华细辛所有样品中表达最为稳定,是进行华细辛基因表达水平分析的适宜的内参基因。研究结果可为华细辛重要活性成分生物合成途径相关基因的功能分析,以及基因差异表达的研究提供有效的校正工具,确保基因表达分析结果的准确性与可靠性。
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关键词
华细辛
内参基因
GENORM
Norm
FINDER
Best
KEEPER
delta
ct
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职称材料
题名
华细辛实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
被引量:
3
1
作者
赵晓冰
潘磊
柳威
林懋怡
李宏庆
刘忠
机构
华东师范大学生命科学学院
上海交通大学药学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第11期174-179,共6页
基金
国家自然科学基金项目(81373962
31570325)
文摘
选择合适的内参基因是准确分析目标基因表达水平变化的重要条件。选取SAND-1、ACT、18Sr RNA、CYP2、GAPDH、TUB 6个常用的内参基因作为候选内参基因,利用实时荧光定量PCR技术,通过ge Norm、Norm Finder、Best Keeper、Delta CT等软件分析和评价6个候选内参基因在华细辛营养生长期、花期和花后期等不同生长阶段的根、根茎、叶片、叶柄等不同组织中的表达稳定性,筛选适宜华细辛不同生长阶段不同组织基因表达水平分析的内参基因。结果表明,18S r RNA在华细辛所有样品中表达最为稳定,是进行华细辛基因表达水平分析的适宜的内参基因。研究结果可为华细辛重要活性成分生物合成途径相关基因的功能分析,以及基因差异表达的研究提供有效的校正工具,确保基因表达分析结果的准确性与可靠性。
关键词
华细辛
内参基因
GENORM
Norm
FINDER
Best
KEEPER
delta
ct
Keywords
Asarum
sieboldii
reference
gene
GeNorm
NormFinder
BestKeeper
delta
ct
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S567.239 [农业科学—中草药栽培]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
华细辛实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
赵晓冰
潘磊
柳威
林懋怡
李宏庆
刘忠
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
3
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职称材料
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参考文献
引证文献
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