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基于γ-H2AX生物标志物DNA遗传毒性检测方法的研究进展 被引量:7
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作者 黄鹏程 周长慧 常艳 《中国新药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期418-424,共7页
DNA双链断裂(DNA double strand breaks,DSBs)是细胞DNA损伤类型中最严重的一种。DSBs可以激活细胞的DNA损伤应答(DNA damage response,DDR)机制,从而使组蛋白H2AX迅速磷酸化(磷酸化的H2AX组蛋白被称为γ-H2AX)。随后,γ-H2AX聚集在双... DNA双链断裂(DNA double strand breaks,DSBs)是细胞DNA损伤类型中最严重的一种。DSBs可以激活细胞的DNA损伤应答(DNA damage response,DDR)机制,从而使组蛋白H2AX迅速磷酸化(磷酸化的H2AX组蛋白被称为γ-H2AX)。随后,γ-H2AX聚集在双链断裂处,形成由大量γ-H2AX聚集成的灶点(foci)。检测细胞中的γ-H2AX灶点数目就可以用于评价DNA双链断裂情况,进而可以用来评价遗传毒性因子的致突变能力。目前,国内外有多种对γ-H2AX灶点的检测方法,包括蛋白质印迹法(Western blotting)、免疫荧光染色显微镜检测法、全细胞酶联免疫反应(Whole-cell ELISA)检测法和流式细胞术检测法等,每种方法各有优缺点。本文将重点阐述近几年国内外γ-H2AX检测方法的新进展,并总结对比不同方法之间的操作步骤、统计参数及优缺点,分析γ-H2AX检测方法在遗传毒理方面的应用前景。 展开更多
关键词 Γ-H2AX dsbs 生物标志物 遗传毒理
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基于CRISPR/Cas系统的基因编辑工具及其改进策略 被引量:2
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作者 辛圆 田开仁 +1 位作者 乔建军 财音青格乐 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期72-85,共14页
CRISPR/Cas系统自发现以来持续推动着生命科学领域的进步。与此同时,CRISPR/Cas介导的基因编辑技术也在不断发展壮大。基于DSBs修复的CRISPR/Cas基因编辑技术、碱基编辑器和先导编辑器等新型基因编辑工具的开发为生物学基础研究铺平了... CRISPR/Cas系统自发现以来持续推动着生命科学领域的进步。与此同时,CRISPR/Cas介导的基因编辑技术也在不断发展壮大。基于DSBs修复的CRISPR/Cas基因编辑技术、碱基编辑器和先导编辑器等新型基因编辑工具的开发为生物学基础研究铺平了道路。虽然这些工具为生物技术带来了革命性变化,但基因编辑效率偏低、产物纯度不高、脱靶效应频繁等问题也随之而来。不断开发精确、高效和安全的CRISPR/Cas基因编辑工具仍是当前和未来的生命科学研究热点。概述了CRISPR/Cas基因编辑工具的发展、构成及原理,总结了CRISPR/Cas基因编辑系统提升编辑效率、扩展编辑范围和降低脱靶效应的通用策略及不同CRISPR/Cas基因编辑工具的改进方法,并就CRISPR/Cas基因编辑工具未来的研究方向进行展望。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 基因编辑效率 dsbs 碱基编辑器 先导编辑器
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The Role of DNA Damage Repair and Chk2 Protein in Hyper-radiosensitivity of Lung Adenocarcinoma A549 Cells 被引量:4
3
作者 吴红革 陈其田 +3 位作者 张用 伍钢 孟睿 程晶 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2012年第5期750-754,共5页
To explore the role of the Chk2 protein expression and DNA double strand breaks (DSBs) repair in low dose hyper-radiosensitivity (HRS)/increased radioresistance (IRR) of non-small cell lung cancer,A549 cells were subj... To explore the role of the Chk2 protein expression and DNA double strand breaks (DSBs) repair in low dose hyper-radiosensitivity (HRS)/increased radioresistance (IRR) of non-small cell lung cancer,A549 cells were subjected to irradiation at the dosage ranging from 0.05-2 Gy.Clonogenic survival was measured by using fluorescence-activated cell sorting (FACS) plating technique.Percentage of cells in M-phase after low doses of X-irradiation was evaluated by phospho-histone H3-FITC/PI and Western blotting was used to detect protein expression of Chk2 and phospo-Chk2.DNA DSBs repair efficiency was also measured by induction and persistence of γ-H2AX.The results showed that the killing ability of irradiation with A549 cells increased at low conditioning dose below 0.3 Gy.Within the dose of 0.3 to 0.5 Gy,A549 cells showed a certain extent of radiation resistance.And when the dose was more than 0.5 Gy,survival fraction exhibited a negative correlation with the dosage.There was no difference between the 0.1 or 0.2 Gy dosage groups and the un-irradiated group in terms of the percentage of cells in M phase.But in the high dosage group (0.3-1.0 Gy),the percentage of cells in M phase was decreased markedly.In addition,the percentage of cells in M phase began to decrease two hours after irradiation.One hour after irradiation,there was no conspicuous activation of Chk2 kinase in 0.1 or 0.2 Gy group,but when the irradiation dose reached 0.3 Gy or higher,Chk2 kinase started to be activated and the activation level showed no significant difference among high dosage groups (0.4,0.5,1.0 Gy).Within 1 to 6 h,the DNA DSBs repair efficiency was decreased at 0.2 Gy but increased at 0.5 Gy and 1.0 Gy,which was in line with Chk2 activation.We are led to conclude that the mechanism of HRS/IRR in A549 cell line was probably due to early G2/M checkpoint arrest and enhanced DNA DSBs repair.In this regard,Chk2 activation plays a key role in G2/M checkpoint activation. 展开更多
关键词 early G2/M checkpoint CHK2 HRS/IRR DNA dsbs
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DSBs修复通路的选择及其影响因素 被引量:2
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作者 王宏波 曾蓉 +3 位作者 王宇鹏 蔡英桂 吴秀山 叶湘漓 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期3619-3625,共7页
DSBs(DNA双链断裂)是细胞DNA在内外各种因素影响下产生的一种严重损伤,也是包括肿瘤在内的多种疾病发生发展的重要原因之一。为修复该损伤,机体形成了包括同源重组(HR)、非同源末端连接(NHEJ)等在内的多种修复通路;在不同情况下,... DSBs(DNA双链断裂)是细胞DNA在内外各种因素影响下产生的一种严重损伤,也是包括肿瘤在内的多种疾病发生发展的重要原因之一。为修复该损伤,机体形成了包括同源重组(HR)、非同源末端连接(NHEJ)等在内的多种修复通路;在不同情况下,机体对修复通路的选择受到多种因素的影响。近年来的研究表明,包括细胞类型、末端切除、细胞周期、损伤原因、损伤位置等在内的诸多因素对修复通路的选择均起到了重要的作用。本综述介绍了DSBs修复的常见通路,并对DSBs修复通路的影响因素的最新研究进展进行了综述。 展开更多
关键词 dsbs 同源重组 非同源末端连接 修复通路
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Expression of Histone H2AX Phosphorylation and Its Potential to Modulate Adriamycin Resistance in K562/A02 Cell Line 被引量:1
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作者 周芬 梅恒 +1 位作者 吴秋玲 金润铭 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2011年第2期154-158,共5页
DNA repair processes play a role in the development of drug resistance which represents a huge obstacle to leukemia chemotherapy. Histone H2AX phosphorylation (ser139) (γH2AX) occurs rapidly at the onset of DNA d... DNA repair processes play a role in the development of drug resistance which represents a huge obstacle to leukemia chemotherapy. Histone H2AX phosphorylation (ser139) (γH2AX) occurs rapidly at the onset of DNA double strand break (DSB) and is critical to the regulation of DSB repair. If DNA repair is successful, cells exposed to anti-neoplastic drugs will keep entering the cycle and develop resistance to the drugs. In this study, we investigated whether γH2AX can be used as an indicator of tumor chemosensitivity and a potential target for enhancing chemotherapy. K562 and multi-drug resistant cell line K562/A02 were exposed to adriamycin (ADR) and γH2AX formed. Flow cytometry revealed that percentage of cells expressing γH2AX was increased in a dose-dependent manner and the percentage of K562/A02 cells was lower than that of K562 cells when treated with the same concentration of ADR. In order to test the potential of γH2AX to reverse drug resistance, K562/A02 cells were treated with PI3K inhibitor LY294002. It was found that LY249002 decreased ADR-induced γH2AX expression and increased the sensitivity of K562/A02 cells to ADR. Additionally, the single-cell gel electrophoresis assay and the Western blotting showed that LY249002 enhanced DSBs and decreased the expression of repair factor BRCA1. These results illustrate chemosensitivity can partly be measured by detecting γH2AX and drug resistance can be reversed by inhibiting γH2AX. 展开更多
关键词 γH2AX DNA dsbs LY249002 K562/A02 cells drug resistance
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Exposure to Long Magnetic Resonance Imaging Thermometry Does Not Cause Significant DNA Double-Strand Breaks on CF-1 Mice
6
作者 Christopher Brian Abraham Sepideh Dadgar +2 位作者 Wely B. Floriano Michael Campbell Laura Curiel 《Journal of Modern Physics》 2022年第6期839-850,共12页
The purpose of the study was to investigate if the high gradient strength and slew rate used for long MRI-thermometry monitoring could cause DNA double-stranded breaks (DSBs). To this end, an enzyme-linked immunosorbe... The purpose of the study was to investigate if the high gradient strength and slew rate used for long MRI-thermometry monitoring could cause DNA double-stranded breaks (DSBs). To this end, an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) was used to quantify &gamma;H2AX, a molecular marker for DSBs, in the blood of mice after a 6-hour exposure to magnetic resonance imaging (MRI). Fourteen CF-1 female mice were separated into 4 experimental groups: Untreated negative control, MRI-treated, MRI-Control, and exposed to ionizing radiation positive control. Untreated negative control was used as a baseline for ELISA to quantify &gamma;H2AX. MRI-treated consisted of a 6-hour continuous magnetic resonance imaging (MRI) echo planar imaging (EPI) sequence with a slew rate of 192 mT/m/s constituting a significantly longer imaging time than routine clinical imaging. MRI-control mice were maintained under the same conditions outside the MRI scanner for 6-hours. Mice in the irradiation group served as a positive control of DSBs and were exposed to either 2 Gy, 5 Gy or 10 Gy of ionizing radiation. DSBs in the blood lymphocytes from the treatment groups were analyzed using the &gamma;H2AX ELISA and compared. Total protein concentration in lysates was determined for each blood sample and averaged 1 ± 0.35 mg/mL. Irradiated positive controls were used to test radiation dose-dependency of the &gamma;H2AX ELISA assay where a linear dependency on radiation exposure was observed (r<sup>2</sup> = 0.93) between untreated and irradiated samples. Mean and standard error mean of &gamma;H2AX formation were calculated and compared between each treatment group. Repeated measures 1-way ANOVA showed statistically significant differences between the means of irradiated controls and both the MRI-control and MRI-treated groups. There was no statistically significant difference between the MRI-treated samples and the MRI-control groups. Our results show that long MRI exposure at a high slew rate did not cause increased levels of &gamma;H2AX when compa 展开更多
关键词 γH2AX DNA Damage MRI Thermometry GADOLINIUM Double-Stranded Breaks (dsbs) ELISA Ionizing Radiation
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APOBEC3A的功能研究新进展 被引量:3
7
作者 吴小霞 《中国艾滋病性病》 CAS 北大核心 2016年第6期481-484,共4页
APOBEC3家族的脱氨酶功能导致ssDNA上的dC→dU,使DNA突变,从而引起基因组的不稳定性和癌症,因此APOBEC3家族成为人体内抑制反转录病毒及反转录元件等的重要因子。APOBEC3A只有一个锌离子结合域,是应答α干扰素时,在巨噬细胞和单核细胞... APOBEC3家族的脱氨酶功能导致ssDNA上的dC→dU,使DNA突变,从而引起基因组的不稳定性和癌症,因此APOBEC3家族成为人体内抑制反转录病毒及反转录元件等的重要因子。APOBEC3A只有一个锌离子结合域,是应答α干扰素时,在巨噬细胞和单核细胞大量表达的唯一APOBEC3成员。APOBEC3A在病毒抑制、DNA分解及细胞周期中的作用,使其成为该家族研究中的热点。若深入了解APOBEC3A的功能与作用机制,可能为基因治疗、疫苗研究、癌症治疗等带来新的机遇和希望。 展开更多
关键词 APOBEC3A 脱氨基 超突变 癌症 dsbs
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Study on DNA Damage Induced by Neon Beam Irradiation in Saccharomyces Cerevisiae
8
作者 陆栋 李文建 +8 位作者 吴鑫 王菊芳 马爽 刘青芳 何金玉 荆西刚 丁楠 戴中颖 周剑平 《Plasma Science and Technology》 SCIE EI CAS CSCD 2010年第6期753-756,共4页
Yeast strain Saccharornyces cerevisiae was irradiated with different doses of 85 MeV/u 20 Ne 10+ to investigate DNA damage induced by heavy ion beam in eukaryotic microorganism. The survival rate, DNA double strand b... Yeast strain Saccharornyces cerevisiae was irradiated with different doses of 85 MeV/u 20 Ne 10+ to investigate DNA damage induced by heavy ion beam in eukaryotic microorganism. The survival rate, DNA double strand breaks (DSBs) and DNA polymorphic were tested after irradiation. The results showed that there were substantial differences in DNA between the control and irradiated samples. At the dose of 40 Gy, the yeast cell survival rate approached 50%, DNA double-strand breaks were barely detectable, and significant DNA polymorphism was observed. The alcohol dehydrogenase II gene was amplified and sequenced. It was observed that base changes in the mutant were mainly transversions of T-G and T-C. It can be concluded that heavy ion beam irradiation can lead to change in single gene and may be an effective way to induce mutation. 展开更多
关键词 neon ion beam irradiation YEAST dsbs MUTATION
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氚水β射线照射对大鼠胚胎脑细胞增殖的影响 被引量:2
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作者 王明明 司原 +2 位作者 肖林林 陈光福 张伍魁 《辐射防护》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期259-264,共6页
采用流式细胞术、MTT方法、细胞色素C还原法、逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)及脉冲电场凝胶电泳方法(PFGE),分别检测大鼠受0~3.7×106Bq/mL氚水(HTO)作用后神经元细胞的凋亡、增殖抑制、超氧阴离子(O2-)释放、p53基因表达与DNA断... 采用流式细胞术、MTT方法、细胞色素C还原法、逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)及脉冲电场凝胶电泳方法(PFGE),分别检测大鼠受0~3.7×106Bq/mL氚水(HTO)作用后神经元细胞的凋亡、增殖抑制、超氧阴离子(O2-)释放、p53基因表达与DNA断裂损伤,观察氚水β射线照射对体外培养大鼠胚胎脑细胞的损伤效应。结果显示,随着氚水放射性浓度的增大,神经元细胞的凋亡率、增殖抑制率与p53mRNA表达量均增大,DNA断裂损伤程度随之加重,而O2-释放量随之减少。这说明氚水β辐射能使神经元细胞DNA双链断裂、促进其p53基因表达引发细胞凋亡及减少O2-释放来抑制增殖。 展开更多
关键词 胚胎脑细胞 氚水β辐射 P53基因 DNA双链断裂 凋亡 增殖
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同源重组修复蛋白RAD54B在肿瘤中的研究进展
10
作者 邱世岳 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期1070-1072,共3页
同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)是哺乳动物细胞中最为精确的DNA损伤修复方式。其中,RAD54B蛋白参与DNA损伤后的细胞周期调节和HRR的关键阶段,现已发现RAD54B基因缺陷与多种肿瘤的发生和预后相关。为更全面了解RAD5... 同源重组修复(homologous recombination repair,HRR)是哺乳动物细胞中最为精确的DNA损伤修复方式。其中,RAD54B蛋白参与DNA损伤后的细胞周期调节和HRR的关键阶段,现已发现RAD54B基因缺陷与多种肿瘤的发生和预后相关。为更全面了解RAD54B,该文就其蛋白结构、参与HRR途径中的功能以及其与肿瘤的相关进展作一综述。 展开更多
关键词 肿瘤 RAD54B dsbs HRR 文献综述
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卵母细胞和胚胎发育中的DNA双键断裂损伤
11
作者 孙绪磊 冷义福 +2 位作者 胡淑敏 张学奎 徐嘉君 《实用妇科内分泌电子杂志》 2016年第20期194-195,共2页
在体细胞中,DNA双键断裂(DNA doubled-strand breaks,DSBs)是目前已知DNA损伤中最为严重的一种。进一步的研究发现,DSBs能够引起哺乳动物卵母细胞凋亡,导致生殖能力下降。针对DSBs后机体进行的DNA损伤应答通路的研究在生殖领域也成为热... 在体细胞中,DNA双键断裂(DNA doubled-strand breaks,DSBs)是目前已知DNA损伤中最为严重的一种。进一步的研究发现,DSBs能够引起哺乳动物卵母细胞凋亡,导致生殖能力下降。针对DSBs后机体进行的DNA损伤应答通路的研究在生殖领域也成为热点。但是卵子发生和后期胚胎发育过程中,参与DSBs损伤修复机制的基因,是怎样突破染色体精确结构,最终完成DNA修复,维持基因组稳定或启动细胞凋亡过程的,这一复杂调控机制尚不十分明确,亟需进一步研究。 展开更多
关键词 dsbs DNA损伤修复 卵母细胞 胚胎发育
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DNA双链断裂损伤焦点的定量计算和分析方法研究进展
12
作者 尤培蒙 黎晨 +3 位作者 王晨曦 何俊霞 肖文媛 赵晋 《西北民族大学学报(自然科学版)》 2019年第2期54-58,共5页
细胞核在各种原因的影响下形成的病灶数是衡量细胞DNA双链断裂损伤的公认指标.如何准确进行细胞核聚焦计数和分析焦点的相关特征与DSBs的关系仍是国内外学界研究的热点,目前应用较广泛的算法偏重于自动化和智能化.文章就DNA双链断裂损... 细胞核在各种原因的影响下形成的病灶数是衡量细胞DNA双链断裂损伤的公认指标.如何准确进行细胞核聚焦计数和分析焦点的相关特征与DSBs的关系仍是国内外学界研究的热点,目前应用较广泛的算法偏重于自动化和智能化.文章就DNA双链断裂损伤焦点的定量计算和分析方法的研究进展,从不同算法工具的特点和比较及算法应用过程中相关问题的解决等方面进行了阐述,为正确选择算法工具进行DNA损伤病灶数的量化提供参考意见. 展开更多
关键词 DNA双链断裂 细胞免疫荧光技术 病灶量化 图像分析
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HDAC4 与肿瘤放射敏感性及其放疗增敏靶点治疗的研究
13
作者 骆婉婷 乐珍 周妍 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2021年第10期4-6,共3页
组蛋白去乙酰基酶 4(histone deacetylase4,HDAC4)属于Ⅱa 类组蛋白去乙酰基酶,是 DNA 损伤修复的关键辅助因子。研究发现当肿瘤细胞受到放射后,HDAC4 在核内的 DNA 双链断裂(DNAdouble-strand breaks,DSBs)处集聚形成 foci,促进辐射后 ... 组蛋白去乙酰基酶 4(histone deacetylase4,HDAC4)属于Ⅱa 类组蛋白去乙酰基酶,是 DNA 损伤修复的关键辅助因子。研究发现当肿瘤细胞受到放射后,HDAC4 在核内的 DNA 双链断裂(DNAdouble-strand breaks,DSBs)处集聚形成 foci,促进辐射后 DSBs 修复,降低肿瘤放射的敏感性。在 DSBs 修复中,HDAC4 与转录因子-肌细胞增强因(myocyte enhancer factor2,MEF2)-2 相互作用调节促进 p53 结合蛋白 1(p53 binding protein 1,53BP1)在 DSBs 位点聚集形成 foci, 53BP1 为 DSBs 的主要修复蛋白之一,进而参与辐射后 DNA 损伤的修复。本文综述 HDAC4 与 IR 后 DSBs 修复的相关机制,以及该靶点在肿瘤放射治疗中的研究进展。 展开更多
关键词 HDAC4 MEF2 53BP1 dsbs 修复 放射增敏
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ZFNs、TALENs和CRISPR-Cas基因组靶向编辑技术及其在植物中的应用 被引量:16
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作者 廖鹏飞 聂旺 +3 位作者 余雅心 童普国 李绍波 朱友林 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期442-451,共10页
锌指核酸酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)、转录激活子样效应因子核酸酶(transcription activator-like effectors nucleases,TALENs)和RNA介导的CRISPR-Cas系统是当今三种主要的基因组靶向编辑技术,ZFNs和TALENs由特异性的DNA结合蛋白... 锌指核酸酶(zinc-finger nucleases,ZFNs)、转录激活子样效应因子核酸酶(transcription activator-like effectors nucleases,TALENs)和RNA介导的CRISPR-Cas系统是当今三种主要的基因组靶向编辑技术,ZFNs和TALENs由特异性的DNA结合蛋白融合一个非特异性的核酸酶FokⅠ组成,DNA结合蛋白特异识别并结合靶DNA序列,然后在FokⅠ的作用下引起靶位点的DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs);而CRISPR-Cas系统,则是由小分子向导RNA通过碱基互补配对与靶基因组序列结合,而引导Cas核酸酶切割靶位点而引起DSBs。DSBs通过真核细胞DNA修复机制(非同源末端连接和同源重组)进行修复,从而实现基因组靶向编辑。本综述着重介绍这三种技术的基本结构及其基因组靶向编辑的原理和特点,对三种技术在植物中的应用进展进行介绍并对其进一步的发展提出了展望。 展开更多
关键词 基因组靶向编辑技术 ZFNs TALENs CRISPR/Cas 基因打靶 DNA双链断裂(dsbs)
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DNA双链断裂损伤反应及它的医学意义 被引量:7
15
作者 宋宜 孙志贤 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第9期929-934,共6页
DNA损伤应激反应是维持基因组稳定性的基石.细胞在长期进化中形成了由损伤监视、周期调控、损伤修复、凋亡诱导等在内的自稳平衡机制.一方面,借助感应、识别并启动精细而复杂的修复机制修复损伤;另一方面,通过DNA损伤应激活化的细胞周... DNA损伤应激反应是维持基因组稳定性的基石.细胞在长期进化中形成了由损伤监视、周期调控、损伤修复、凋亡诱导等在内的自稳平衡机制.一方面,借助感应、识别并启动精细而复杂的修复机制修复损伤;另一方面,通过DNA损伤应激活化的细胞周期检查点机制,延迟或阻断细胞周期进程,为损伤修复提供时间,使细胞能安全进入新一轮细胞周期;损伤无法修复时则诱导细胞凋亡.DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)是真核基因组后果最严重的损伤类型之一,其修复不利,同肿瘤等人类疾病的发生发展密切相关.新进展揭示:DSBs损伤反应信号分子ATM-Chk2-p53、H2AX等的组成性活化,是肿瘤形成早期所激活的细胞内可诱导的抗癌屏障,其信号网络的精确、精细调控在基因组稳定性维持中发挥重要作用.此外,HIV病毒整合进入宿主细胞基因组的过程也依赖于宿主细胞中ATM介导的DSBs损伤反应信号转导;ATM特异性的小分子抑制剂在抗HIV感染中显示重要的功能意义.文中重点讨论调控DSBs损伤应激反应信号网络的主要研究进展,及其在肿瘤发生、发展及抗HIV感染中的新医学意义. 展开更多
关键词 DNA损伤反应 DNA双链断裂(dsbs) ATM P53 DNA损伤检查点
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DNA链断裂检测技术的进展 被引量:6
16
作者 夏璐 丘冠英 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1997年第1期31-35,共5页
DNA链损伤特别是DNA双链段裂 (dsb)的检测方法是研究DNA辐射损伤的一个关键因素 .已发展的检测DNAdsb的方法很多 ,但各种检测法均有其一定的优越性和适用范围 ,近年来应用较多并日益受到重视的新方法有原位杂交法 ,彗星试验 (单细胞电泳... DNA链损伤特别是DNA双链段裂 (dsb)的检测方法是研究DNA辐射损伤的一个关键因素 .已发展的检测DNAdsb的方法很多 ,但各种检测法均有其一定的优越性和适用范围 ,近年来应用较多并日益受到重视的新方法有原位杂交法 ,彗星试验 (单细胞电泳法 ) 展开更多
关键词 DNA DNA链断裂 检测技术
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植物DNA双链断裂修复机制及其在重离子诱变和基因编辑中的作用
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作者 隆静 陈婧敏 +3 位作者 刘霄 张一凡 周利斌 杜艳 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期55-67,共13页
在自然界中,植物会遭受各种环境或内源因素导致的DNA损伤,其中DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)的影响最为严重,如果修复不当,将导致基因组不稳定、基因突变甚至细胞死亡。一方面,植物进化出了强大且有序的损伤修复机制,以确保... 在自然界中,植物会遭受各种环境或内源因素导致的DNA损伤,其中DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs)的影响最为严重,如果修复不当,将导致基因组不稳定、基因突变甚至细胞死亡。一方面,植物进化出了强大且有序的损伤修复机制,以确保其存活及正常繁衍;另一方面,基于修复过程的容错性及致突变性,T-DNA插入、基因编辑、物理诱变等技术广泛应用于动植物品种改良。相较于哺乳动物,植物DSBs修复通路及其分子机制报道较为有限。本文综述了植物对DSBs损伤的响应、主要修复途径及关键因子,介绍了通路机制尚未完全解析的替代末端连接(alternative end joining,Alt-EJ)的最新研究进展;此外,探讨了重离子束引起的植物DSBs修复特征和多途径选择,以及基于不同DSBs修复途径的基因编辑技术的研究进展,旨在为深入了解植物DSBs损伤响应及修复的分子机制和研发高效生物育种技术提供参考。 展开更多
关键词 植物dsbs损伤修复 同源重组 非同源末端连接 重离子束 基因编辑
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重离子束辐射诱导细胞双链断裂(DSBs)损伤及修复机理的研究进展
18
作者 任军乐 郭晓鹏 +3 位作者 雷彩荣 张苗苗 柴冉 陆栋 《辐射研究与辐射工艺学报》 CAS CSCD 2023年第3期1-10,共10页
重离子束辐射能引发细胞DNA双链断裂,被认为是构成基因组不稳定因素之一。现有研究表明:同源末端连接、同源重组、单链退火和选择性末端连接在修复DNA双链断裂方面发挥着重要的作用,但是影响DNA双链断裂修复途径选择的因素目前仍不清楚... 重离子束辐射能引发细胞DNA双链断裂,被认为是构成基因组不稳定因素之一。现有研究表明:同源末端连接、同源重组、单链退火和选择性末端连接在修复DNA双链断裂方面发挥着重要的作用,但是影响DNA双链断裂修复途径选择的因素目前仍不清楚。本文对近年重离子辐射细胞产生的DNA损伤特征和修复途径方面的新发现进行了综述,并从类型和分布、染色质状态、DNA末端结构、DNA末端切除、细胞周期方面解释了细胞DNA双链断裂修复途径的选择机制。这对细胞DNA损伤修复的研究具有重要意义,为重离子辐射技术在生物学效应研究方面提供了参考。 展开更多
关键词 重离子束辐射 DNA损伤 簇状dsbs DNA损伤修复
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Role of deubiquitinating enzymes in DNA double-strand break repair 被引量:6
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作者 Yunhui LI Jian YUAN 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2021年第1期63-72,共10页
DNA is the hereditary material in humans and almost all other organisms. It is essential for maintaining accurate transmission of genetic information. In the life cycle, DNA replication, cell division, or genome damag... DNA is the hereditary material in humans and almost all other organisms. It is essential for maintaining accurate transmission of genetic information. In the life cycle, DNA replication, cell division, or genome damage, including that caused by endogenous and exogenous agents, may cause DNA aberrations. Of all forms of DNA damage, DNA double-strand breaks(DSBs) are the most serious. If the repair function is defective, DNA damage may cause gene mutation, genome instability, and cell chromosome loss, which in turn can even lead to tumorigenesis. DNA damage can be repaired through multiple mechanisms. Homologous recombination(HR) and non-homologous end joining(NHEJ) are the two main repair mechanisms for DNA DSBs. Increasing amounts of evidence reveal that protein modifications play an essential role in DNA damage repair.Protein deubiquitination is a vital post-translational modification which removes ubiquitin molecules or polyubiquitinated chains from substrates in order to reverse the ubiquitination reaction. This review discusses the role of deubiquitinating enzymes(DUBs) in repairing DNA DSBs. Exploring the molecular mechanisms of DUB regulation in DSB repair will provide new insights to combat human diseases and develop novel therapeutic approaches. 展开更多
关键词 Deubiquitinating enzymes(DUBs) DNA double-strand breaks(dsbs) DNA repair Non-homologous end joining(NHEJ) Homologous recombination(HR)
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基于DSBs修复蛋白表达构建预测食管鳞癌放化疗预后的列线图模型 被引量:6
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作者 刘维 高辉 +2 位作者 李华 李东 张涛 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第8期1041-1047,共7页
目的探讨DNA双链断裂(DSBs)修复蛋白ATM、DNA-PKcs及P16表达水平与根治性放化疗食管鳞癌患者远期生存的关系,并建立列线图预测模型。方法收集2012-2017年收治的283例根治性放化疗食管鳞癌病例,按2:1随机分为建模组和验证组。免疫组化检... 目的探讨DNA双链断裂(DSBs)修复蛋白ATM、DNA-PKcs及P16表达水平与根治性放化疗食管鳞癌患者远期生存的关系,并建立列线图预测模型。方法收集2012-2017年收治的283例根治性放化疗食管鳞癌病例,按2:1随机分为建模组和验证组。免疫组化检测DSBs修复蛋白在肿瘤中的表达,Kaplan-Meier法计算生存率,Log-rank法进行单因素分析,Cox模型进行多因素分析,R软件构建列线图模型并进行内外部验证。结果建模组患者中位随访34个月,3、5年总生存率为35.1%和20.0%。多因素分析显示,ATM、DNA-PKcs或P16的表达与否,以及T、N分期均是患者OS的预后因素。建立列线图模型,预测建模组患者3、5年OS的一致性指数C-index为0.724,显著高于第七版AJCC临床分期的0.533(P <0.001)。对验证组患者进行验证,本模型和AJCC分期的C-index分别为0.792和0.550(P <0.001),均提示本模型比AJCC分期准确性更高。结论基于DSBs修复蛋白表达建立的列线图模型能较好地预测根治性放化疗食管鳞癌患者的远期生存,对指导个体化治疗有一定的临床意义。 展开更多
关键词 食管鳞癌 放化疗 dsbs修复蛋白 预后 列线图
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