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鼠疫耶尔森菌DNA标识序列的鉴定及其应用研究 被引量：16
1
作者 韩延平 周冬生 +16 位作者 宋亚军 裴德翠 李敏 崔百忠 包静月 张秀清 童宗中 王津 郭兆彪 祁芝珍 金丽霞 翟俊辉 杜宗敏 王效义 汪建 黄培堂 杨瑞馥 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期307-309,共3页
目的　确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法　通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果　鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8... 目的　确定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,以用于鼠疫耶尔森菌的快速检测和鉴定。方法　通过芯片比较基因组杂交和PCR验证 ,鉴定鼠疫耶尔森菌DNA标识序列 ,针对标识序列设计特定的PCR引物。结果　鼠疫耶尔森菌基因组中存在 3个区段 ,共 2 8条基因 ,均是鼠疫耶尔森菌DNA标识序列。针对其中 3条基因设计PCR引物 ,能特异性扩增出鼠疫耶尔森菌 ,与来自其他非鼠疫耶尔森菌的DNA无交叉反应。结论　鼠疫耶尔森菌存在DNA标识序列 ,并能用于鼠疫耶尔森菌的快速检测与鉴定。 展开更多
关键词 耶尔森氏菌 鼠疫 dna芯片 标识序列
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基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定与系统进化分析 被引量：6
2
作者 冯震 杨燕 +4 位作者 张宁 蒋波 李芳 秦峰 杨美成 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1940-1944,共5页
目的:建立伯克霍尔德菌属典型菌株DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因序列鉴定方法,为该菌属污染物的鉴定和分类提供研究思路和方法依据。方法:选择伯克霍尔德菌属内的典型菌株,以gyrB基因为研究靶点,设计引物,特异性扩增gyrB基因片段,测定核酸序... 目的:建立伯克霍尔德菌属典型菌株DNA促旋酶亚基B(gyrB)基因序列鉴定方法,为该菌属污染物的鉴定和分类提供研究思路和方法依据。方法:选择伯克霍尔德菌属内的典型菌株,以gyrB基因为研究靶点,设计引物,特异性扩增gyrB基因片段,测定核酸序列,并进行聚类比对分析。结果:伯克霍尔德菌属内的典型菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定。结论:本文建立了基于gyrB基因的伯克霍尔德菌属核酸测序鉴定方法,菌株鉴定的gyrB基因特征序列可满足"种"水平的鉴定,为该菌属污染物的鉴定与风险排查提供方法依据。 展开更多
关键词 伯克霍尔德菌 菌种鉴定 dna促旋酶亚基B(gyrB)基因 dna特征序列 系统发育分析
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细菌DNA特征序列鉴定法在常见种属中的鉴定水平研究 被引量：5
3
作者 冯震 蒋波 +4 位作者 李芳 张宁 杨燕 秦峰 杨美成 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1924-1932,共9页
目的:开展细菌DNA特征序列鉴定法在药品质量控制中常见种属的鉴定水平研究,为药品全生命周期质量控制中的菌株鉴定与污染风险识别提供方法依据。方法:针对性地选择芽孢杆菌、库克氏菌、微球菌、柠檬酸杆菌、肠杆菌、肠球菌、假单胞菌、... 目的:开展细菌DNA特征序列鉴定法在药品质量控制中常见种属的鉴定水平研究,为药品全生命周期质量控制中的菌株鉴定与污染风险识别提供方法依据。方法:针对性地选择芽孢杆菌、库克氏菌、微球菌、柠檬酸杆菌、肠杆菌、肠球菌、假单胞菌、不动杆菌、鞘氨醇单胞菌和罗尔斯通氏菌共10个常见属中41个种72株的典型菌株,依据细菌DNA特征序列鉴定法,建立菌株鉴定的DNA特征序列,分析属内种间的菌株聚类关系,评价菌株DNA特征序列的鉴定水平。结果:10个属41个种典型菌株的DNA特征序列均具有特异性。结论:细菌DNA特征序列可满足"种"水平的鉴定,为药品质量控制中常见细菌的鉴定、分类与溯源提供研究思路和方法依据。 展开更多
关键词 菌种鉴定 dna特征序列 系统进化分析 药品质量控制 风险识别
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鼠疫菌质粒上标识基因的筛选
4
作者 董珊珊 郭英 +1 位作者 王鹏 宋志忠 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期490-494,共5页
目的筛选鼠疫菌质粒上保守、稳定、特异的DNA标识序列。方法选择32条源于鼠疫菌质粒上DNA序列，采用常规PCR技术，对云南家、野鼠两型共40株鼠疫菌、47株非鼠疫菌、鼠疫菌疫苗株EV76（阳性对照），进行了特异性验证试验和稳定性鉴定试... 目的筛选鼠疫菌质粒上保守、稳定、特异的DNA标识序列。方法选择32条源于鼠疫菌质粒上DNA序列，采用常规PCR技术，对云南家、野鼠两型共40株鼠疫菌、47株非鼠疫菌、鼠疫菌疫苗株EV76（阳性对照），进行了特异性验证试验和稳定性鉴定试验。结果筛选出4对相对保守、稳定、特异的DNA标识序列：YPMT1．05c，YPMT1，03c，YPMT1．42及YPMT1.04c。结论所筛选的4对鼠疫菌DNA标识序列，可用于鼠疫快速诊断。 展开更多
关键词 耶尔森菌 鼠疫 dna标识序列 筛选
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基于DSS标记特异性PCR鉴别冷背药材木槿皮基原植物及其混伪品 被引量：10
5
作者 刘亚男 华中一 +5 位作者 赵玉洋 金艳 彭华胜 蒋超 蒲婧哲 袁媛 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第17期133-139,共7页
目的:冷背药材作为宝贵的药材资源,但因其本身的特殊性和复杂性,导致其鉴别成为中药鉴定中的难题,因此亟需建立冷背药材的鉴别方法。该研究利用DNA特征序列(DSS)标记,建立一种冷背药材木槿皮基原植物木槿及其混伪品的特异性聚合酶链式反... 目的:冷背药材作为宝贵的药材资源,但因其本身的特殊性和复杂性,导致其鉴别成为中药鉴定中的难题,因此亟需建立冷背药材的鉴别方法。该研究利用DNA特征序列(DSS)标记,建立一种冷背药材木槿皮基原植物木槿及其混伪品的特异性聚合酶链式反应(PCR)鉴别方法。方法:基于叶绿体基因组序列分析获得木槿皮的候选DSS标记,使用DNA测序手段对DSS标记进行验证,基于得到的可靠DSS标记设计木槿皮基原植物特异性鉴别引物,对PCR反应条件进行优化,并进行耐受性和适用性的考察。结果:将扩增产物的测序结果与DSS比对后得到了1个可用于鉴定木槿的DSS标记,揭示了木槿正混伪品的区别特征,根据DSS标记设计出一对木槿正品特异性鉴别引物,使用该引物进行PCR扩增和凝胶电泳后木槿均出现约270 bp的单一明亮条带,而其4种混伪品均无此条带。结论:该研究得到的1个DSS标记可用于木槿的真伪鉴定,基于此DSS标记设计的特异性鉴别引物可准确、简便的鉴别木槿皮的基原植物及其混伪品,为木槿正伪品的分子鉴定提供了新的方法与思路。 展开更多
关键词 dna特征序列标记 木槿皮 混伪品 特异性聚合酶链式反应(PCR)
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