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非编码RNA和肿瘤放疗抵抗相关性的研究进展 被引量：1
1
作者 董娜 乔万佳 刘小军 《兰州大学学报（医学版）》 2023年第5期88-94,共7页
放疗抵抗是肿瘤疾病进展和死亡的重要原因之一。非编码RNA可在转录组学中广泛参与基因的表达,并可通过影响DNA损伤修复、诱导细胞周期、调控细胞凋亡、糖代谢、干细胞样特性等途径调节肿瘤的放疗敏感性。本文就非编码RNA影响肿瘤细胞放... 放疗抵抗是肿瘤疾病进展和死亡的重要原因之一。非编码RNA可在转录组学中广泛参与基因的表达,并可通过影响DNA损伤修复、诱导细胞周期、调控细胞凋亡、糖代谢、干细胞样特性等途径调节肿瘤的放疗敏感性。本文就非编码RNA影响肿瘤细胞放疗敏感性的分子机制作一综述。 展开更多
关键词 肿瘤 放射治疗 非编码rna 微rna 长链非编码rna 环状rna 核小rna 核仁小rna Piwi相互作用rna
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基于生物信息学构建肝细胞癌预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络 被引量：1
2
作者 袁浩桐 姜博文 +3 位作者 李真鹏 井媛旭 袁硕 杨超 《中国医科大学学报》 CAS 北大核心 2023年第5期413-419,共7页
目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RN... 目的应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA(circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA(miRNA)-mRNA调控网络。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RNA Interactome及circBank数据库中预测与circRNA相结合的miRNA,在miRDB、RNAInter及TargetScan数据中预测miRNA的靶基因,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。应用DAVID软件、STRING数据库、Cytoscape软件及GEPIA数据库对靶基因进行功能注释、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)构建及预后分析,最后确定肝癌预后相关circRNA-miRNA-核心靶基因调控网络。结果筛选出1个circRNA,为hsa_circRNA_0000301,与之结合的miRNA有4个,分别为hsamiR-377-3p、hsa-miR-767-3p、hsa-miR-1178-3p及hsa-miR-1228-3p。功能注释和通路富集分析显示靶基因主要参与泛素依赖性蛋白质分解代谢等过程,且在MAPK等多个信号通路中显著富集。通过PPI网络及预后分析筛选出3个预后相关核心靶基因,分别为EIF4E、PRKACB和NRAS。最后构建出含有1个circRNA,2个miRNA,3个靶基因的肝癌预后相关调控网络。结论本研究为深入挖掘肝癌发生的分子机制,寻找肝癌潜在的circRNA诊断标志物提供一定的研究依据。 展开更多
关键词 肝癌 环状rna 微rna 竞争性内源rna
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非编码RNA与白内障发病关系的研究进展 被引量：2
3
作者 韩笑言 卢奕 杨晋 《眼科新进展》 CAS 北大核心 2020年第8期797-800,共4页
白内障是我国乃至全世界首要致盲眼病,其发病机制仍未明确,也尚无有效药物治疗方式。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类不具备蛋白编码功能的RNA。已有研究证明ncRNA与人类疾病的发生发展密切相关,其中ncRNA与眼科疾病的研究也日... 白内障是我国乃至全世界首要致盲眼病,其发病机制仍未明确,也尚无有效药物治疗方式。非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)是一类不具备蛋白编码功能的RNA。已有研究证明ncRNA与人类疾病的发生发展密切相关,其中ncRNA与眼科疾病的研究也日益增多。本文主要就微小RNA、长链非编码RNA和环状RNA在白内障中的研究进展进行总结,发现对微小RNA与白内障关系的研究较多,而长链非编码RNA和环状RNA在白内障发病机制中的研究近2年才逐渐开展,因此需要眼科医生进一步深入探究,从而为白内障的防治提供新思路与新方法。 展开更多
关键词 白内障 非编码rna 微小rna 长链非编码rna 环状rna
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吉非替尼获得性耐药非小细胞肺癌细胞中差异表达环状RNA分析 被引量：4
4
作者 代谊 黄羽棠 +3 位作者 黄家凤 温纯洁 周宏灏 吴兰香 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2017年第11期1128-1135,共8页
目的 :建立吉非替尼获得性耐药非小细胞肺癌细胞株,并筛选和分析耐药前后差异表达的环状RNA(circular RNA,circ RNA)。方法:利用吉非替尼敏感性非小细胞肺癌细胞株H292(简称为H292_S),采用逐步加药法建立吉非替尼获得性耐药株(命名为H29... 目的 :建立吉非替尼获得性耐药非小细胞肺癌细胞株,并筛选和分析耐药前后差异表达的环状RNA(circular RNA,circ RNA)。方法:利用吉非替尼敏感性非小细胞肺癌细胞株H292(简称为H292_S),采用逐步加药法建立吉非替尼获得性耐药株(命名为H292_R)。CCK-8法检测吉非替尼对2种细胞增殖的抑制作用;RNA测序(RNA sequencing,RNA-seq)法筛选2种细胞中差异表达的circRNA;实时荧光定量PCR法验证RNA-seq结果,并结合统计学和生物信息学方法对差异circRNA来源基因的生物学功能进行分析。结果:吉非替尼对H292_S和H292_R细胞增殖的半数抑制浓度分别为(108.63±0.32)nmol/L和(982.37±2.62)nmol/L,2者间差异有统计学意义(P值均<0.05),耐药细胞H292_R对吉非替尼的耐药指数为9.04。2种细胞中存在36个差异表达circRNA,其中耐药细胞中24个circRNA表达上调(P值均<0.05),12个circRNA表达下调(P值均<0.05);GO富集分析发现,异常表达的circRNA主要涉及调节细胞生长增殖、蛋白转运和基因转录等生物学过程;KEGG通路分析发现,异常circRNA的信号通路主要涉及细胞质DNA感受通路、核因子κB(nuclear factor-kappa B,NF-κB)、胞吞和凋亡等通路。实时荧光定量PCR法验证2种细胞中差异表达circRNA hsa_circ_0000567和hsa_circ_0000620的表达水平差异,结果显示耐药细胞中这2个circRNA水平均明显上调(P值均<0.05),与RNA-seq结果相符。结论:筛选出吉非替尼获得性耐药相关的差异表达circRNA,这有助于更深入地阐明非小细胞肺癌耐药的机制,并可能为其早期诊断提供生物学标志。 展开更多
关键词 癌 非小细胞肺 抗药性 肿瘤 基因表达调控 吉非替尼 环状rna rna测序
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舌鳞状细胞癌中环状RNA的表达谱特征 被引量：5
5
作者 邹艾灵 赵建江 +4 位作者 孙翔 贾搏 韩久松 邱小玲 褚洪星 《中山大学学报（医学版）》 CAS CSCD 北大核心 2018年第2期186-191,219,共7页
【目的】检测环状RNA(circRNA)在舌鳞状细胞癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化。【方法】利用高通量circRNA芯片检测技术,分析4对舌鳞状细胞癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱的差异,确定两种组织中2倍以上变化并有显著差异(P<0... 【目的】检测环状RNA(circRNA)在舌鳞状细胞癌组织及对应癌旁组织中表达谱的变化。【方法】利用高通量circRNA芯片检测技术,分析4对舌鳞状细胞癌组织及对应癌旁组织中circRNA表达谱的差异,确定两种组织中2倍以上变化并有显著差异(P<0.05)的circRNA为差异表达circRNA,通过将原始数据进行质控、过滤、归一化后,筛选出差异表达的circRNA,并对其进行功能分析。【结果】芯片筛选出差异表达circRNA 17 171条,其中癌灶组织相对于癌旁组织高表达的共9 982条,低表达的共7 189条。【结论】在舌鳞状细胞癌组织与对应癌旁组织中,circRNA表达谱发生了显著变化,部分差异表达的circRNA可能通过竞争性结合微小RNA调控舌鳞状细胞癌的发生发展。 展开更多
关键词 环状rna 舌鳞状细胞癌 circrna芯片
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环状RNA调控TBK1表达影响肿瘤发生发展
6
作者 朱俊畅 张雨萱 +4 位作者 葛彬洁 胡盼洁 唐嘉吕 蔡文品 季敬璋 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2021年第7期807-816,共10页
TANK结合酶1(TANK-binding kinase 1,TBK1)是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,在机体先天免疫调节、细胞选择性自噬、细胞凋亡、细胞再生中发挥重要作用,与肿瘤的发生密切相关.环状RNA(circle RNA,circRNA)是新型的闭合环状非编码RNA,其生物功能... TANK结合酶1(TANK-binding kinase 1,TBK1)是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,在机体先天免疫调节、细胞选择性自噬、细胞凋亡、细胞再生中发挥重要作用,与肿瘤的发生密切相关.环状RNA(circle RNA,circRNA)是新型的闭合环状非编码RNA,其生物功能及与肿瘤的联系受到国内外学者广泛关注.近年来,越来越多的研究发现,TBK1能与circRNA相互作用,对肿瘤的发生发展产生影响,这暗示了circRNA联合TBK1在肿瘤靶向治疗中的巨大潜力,为肿瘤精准治疗提供了新思路.本文总结了近10年来TBK1与circRNA在肿瘤中的研究,分析两者相互作用的模式,以期为肿瘤的靶向治疗提供新靶点. 展开更多
关键词 TBK1 环状rna 肿瘤
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小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化过程中环状RNA的表达谱研究 被引量：4
7
作者 占云燕 张皓 +1 位作者 杨国斌 樊明文 《口腔医学研究》 CAS 北大核心 2018年第4期371-374,共4页
目的:探讨环状RNA(circle RNA,circRNA)在小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化前后的表达差异,研究circRNA在成牙本质细胞发育过程中发挥的作用。方法:利用circRNA芯片技术检测矿化诱导组与未矿化组原代小鼠牙乳头细胞的circRNA表达谱,... 目的:探讨环状RNA(circle RNA,circRNA)在小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化前后的表达差异,研究circRNA在成牙本质细胞发育过程中发挥的作用。方法:利用circRNA芯片技术检测矿化诱导组与未矿化组原代小鼠牙乳头细胞的circRNA表达谱,经过对原始数据进行预处理,均一化后,找出差异表达的circRNA。根据表达差异倍数较高和样本间一致性较好的原则筛选circRNA。结果:与未矿化组相比,矿化诱导组小鼠牙乳头细胞中2倍以上表达,并且差异具有统计学意义(P≤0.01)的circRNA定义为差异表达的circRNA。在经矿化诱导的牙乳头细胞中,差异表达circRNA共4064条,其中上调表达3255条,下调表达809条。结论:circRNA芯片可用于筛选牙乳头细胞向成牙本质细胞分化过程中差异表达的circRNA,在小鼠牙乳头细胞向成牙本质细胞向分化过程中,circRNA表达谱发生了显著变化,说明circRNA在成牙本质细胞发育过程中发挥着重要的调控作用。 展开更多
关键词 成牙本质细胞向分化 环状rna 环状rna芯片
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