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题名玉米子粒脂肪含量的全基因组关联分析
被引量:4
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作者
董青松
代力强
吴律
施婷婷
王丕武
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机构
吉林农业大学
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出处
《玉米科学》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期58-63,共6页
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基金
吉林省农委资助项目(2012)
农业部“948”项目(2013-Z47)
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文摘
利用分子标记对控制玉米脂肪合成的关键基因进行定位,从分子水平上阐明其遗传机理,提高高油玉米的育种效率。以吉林省80份核心玉米自交系为关联群体,2014年和2015年分别在吉林农业大学试验地进行田间试验,将自交收获的果穗晾晒脱粒后用NIRFlex N-500近红外光谱仪测定其子粒脂肪含量。同时使用Illumina PE150测序仪对80份玉米自交系进行全基因组重测序,共获得1 490 007个高质量的SNP用于后续的关联分析。结果表明,玉米子粒脂肪含量的变异范围为2.83%-6.81%,广义遗传力为63.3%。经过两年1点的全基因组关联分析共筛选得到10个SNP位点与子粒的脂肪含量显著关联(P〈0.000 001),解释的表型贡献率为0.65%-34.5%,其中位于染色体框4.01的SNP标记表型贡献率最高为34.5%。在显著性SNP位点(P〈0.000 001)的连锁不平衡区域(5.2 kb)内共挖掘出6个候选基因,分别预测编码MYB转录因子、果胶酯酶、谷氨酰胺合成酶和3种无特征功能的假定蛋白,可能与脂肪的合成代谢密切相关,可为高油玉米材料的分子标记辅助选择及克隆调控玉米子粒脂肪含量的关键基因提供参考。
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关键词
玉米
脂肪
全基因组重测序
全基因组关联分析
候选基因
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Keywords
Maize
Fat content
Whole genome resequencing
Genome-wide association analysis
candidategenes
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分类号
S513.033
[农业科学—作物学]
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题名高血压遗传机理研究
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作者
梁承宇
黄尚志
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机构
中国医学科学院基础医学研究中国协和医科大学基础医学院
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出处
《基础医学与临床》
CSCD
1997年第6期11-16,共6页
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文摘
高血压遗传机理研究梁承宇黄尚志*(中国医学科学院基础医学研究中国协和医科大学基础医学院,北京,100005)AbstractHypertensionisamajorpublichealthproblemandaleadingcauseofdeatha...
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关键词
高血压
遗传机理
病理
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Keywords
Hypertension Genetics candidategenes Linkage analysis
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分类号
R544.102
[医药卫生—心血管疾病]
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题名HBV感染慢性化的易感基因
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作者
任倩(综述)
张红星
周钢桥(审阅)
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机构
安徽医科大学研究生院
军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京蛋白质组学研究中心蛋白质组学国家重点实验室
蛋白质药物国家工程研究中心
国家蛋白质科学中心(北京)
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出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
2013年第4期214-219,共6页
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基金
资助项目:国家自然科学基金杰出青年科学基金(No.81125017)和面l:项目(No.81222027、30901707和30901231)
北京市科技新星计划(No.20108006)
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文摘
乙型肝炎病毒(hepatitis Bvirus,HBV)感染慢性化是HBV感染中一种较常见的情形。多项遗传流行病学研究已证明,造成HBV感染慢性化的因素除了HBV本身等因素外,还与机体的遗传易感性有关。研究HBV感染慢性化的宿主遗传易感性具有重要的意义,现有研究已发现人类白细胞抗原(humanleucocyte antigen,HLA)、细胞因子(eytokine)及其受体等众多HBV感染慢性化的易感基因。
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关键词
乙型肝炎病毒
HBV感染慢性化
遗传易感性
候选基闶
单核苷酸多态性
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Keywords
hepatitis B virus
persistent HBV infection
genetic susceptibility
candidategene
single nucleotide polymorphism
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分类号
R512.62
[医药卫生—内科学]
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