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3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段的序列比较
被引量：
11
1
作者
陈子安
杜晓东
+1 位作者
王庆恒
邓岳文
《广东海洋大学学报》
CAS
2007年第4期3-10,共8页
对裸体方格星虫(Sipunculus nudus)、可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)和澳洲管体星虫(Siphonosoma australe)的线粒体16S rRNA、COI和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨。采用PCR方法得到总长度...
对裸体方格星虫(Sipunculus nudus)、可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)和澳洲管体星虫(Siphonosoma australe)的线粒体16S rRNA、COI和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨。采用PCR方法得到总长度分别为531～544bp(16S)、652～675bp(COI)和406～453bp(Cytb)的线粒体片段。片段碱基A+T比例较高(16S rRNA基因58.3%,COI基因56.9%,Cytb基因59.5%)。16S rRNA片段存在169个碱基变异位点(其中包括167个简约信息位点)和44个碱基插入/缺失,种内个体间变异较小;COI片段有512个碱基(333个简约信息位点)存在变异,79个碱基插入/缺失;Cytb片段存在347个碱基(318个简约信息位点)变异位点,16个碱基插入/缺失。数据分析结果支持3种星虫和环节动物的分类地位较近,与软体动物较远的分类观点。此外,裸体方格星虫与澳洲管体星虫之间亲缘关系较近(D=0.3159、0.3156、0.2361)。认为3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cytb基因在种间存在明显的多态性,证实了三种基因序列均普遍适用于星虫种及以上阶元的系统学分析。
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关键词
星虫
线粒体
16
S
rrna
基因
co
Ⅰ基因
CYT
B基因
基因序列
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职称材料
福建华溪蟹线粒体DNA COI和16S rRNA基因序列的遗传多样性
被引量：
6
2
作者
石林波
张小燕
+3 位作者
汪雁
王云龙
周宪民
邹节新
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期671-675,共5页
目的探讨福建华溪蟹(Sinopotamon fukienense)的遗传多样性。方法采用PCR结合DNA测序技术,测定S.fukienense的线粒体COI和16SrRNA基因序列的组成。经比对获得639bp长度的COI基因序列和526bp的16SrRNA基因序列,以对比分析S.fukienense的...
目的探讨福建华溪蟹(Sinopotamon fukienense)的遗传多样性。方法采用PCR结合DNA测序技术,测定S.fukienense的线粒体COI和16SrRNA基因序列的组成。经比对获得639bp长度的COI基因序列和526bp的16SrRNA基因序列,以对比分析S.fukienense的遗传多样性。结果 S.fukienense基于COI基因核苷酸多样性(Pi)为0.048 4,高于其基于16SrRNA基因核苷酸多样性(Pi)为0.021 6。同时,S.fukienense基于COI基因单倍型间的平均遗传距离(P)为0.048,大于其基于16SrRNA基因单倍型间的平均遗传距离(P)0.026。结论 COI序列在分析S.fukienense遗传异变时的作用更优于16SrRNA基因序列。
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关键词
福建华溪蟹
co
I基因序列
16
S
rrna
基因序列
遗传多样性
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职称材料
题名
3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段的序列比较
被引量：
11
1
作者
陈子安
杜晓东
王庆恒
邓岳文
机构
广东海洋大学水产学院
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2007年第4期3-10,共8页
基金
广东省自然科学基金(B0609144)
文摘
对裸体方格星虫(Sipunculus nudus)、可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)和澳洲管体星虫(Siphonosoma australe)的线粒体16S rRNA、COI和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行比较,并对其系统发生进行了初步探讨。采用PCR方法得到总长度分别为531～544bp(16S)、652～675bp(COI)和406～453bp(Cytb)的线粒体片段。片段碱基A+T比例较高(16S rRNA基因58.3%,COI基因56.9%,Cytb基因59.5%)。16S rRNA片段存在169个碱基变异位点(其中包括167个简约信息位点)和44个碱基插入/缺失,种内个体间变异较小;COI片段有512个碱基(333个简约信息位点)存在变异,79个碱基插入/缺失;Cytb片段存在347个碱基(318个简约信息位点)变异位点,16个碱基插入/缺失。数据分析结果支持3种星虫和环节动物的分类地位较近,与软体动物较远的分类观点。此外,裸体方格星虫与澳洲管体星虫之间亲缘关系较近(D=0.3159、0.3156、0.2361)。认为3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cytb基因在种间存在明显的多态性,证实了三种基因序列均普遍适用于星虫种及以上阶元的系统学分析。
关键词
星虫
线粒体
16
S
rrna
基因
co
Ⅰ基因
CYT
B基因
基因序列
Keywords
Sipuncu
l
a
mitochondria
l
DNA
16
S
rrna
gene
co
Ⅰ
gene
Cyt
b
gene
gene sequence
分类号
Q19 [生物学—普通生物学]
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职称材料
题名
福建华溪蟹线粒体DNA COI和16S rRNA基因序列的遗传多样性
被引量：
6
2
作者
石林波
张小燕
汪雁
王云龙
周宪民
邹节新
机构
南昌大学基础医学院淡水十足目甲壳动物与并殖吸虫研究室
南昌大学鄱阳湖环境与资源利用教育部重点实验室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第7期671-675,共5页
基金
国家自然科学基金项目(No.81060136
81160207)
+3 种基金
江西省教育厅科技计划(No.07078
12054)
南昌大学大学生创新性训练计划(No.2008013)
国家大学生创新性实验计划(No.091040308)联合资助~~
文摘
目的探讨福建华溪蟹(Sinopotamon fukienense)的遗传多样性。方法采用PCR结合DNA测序技术,测定S.fukienense的线粒体COI和16SrRNA基因序列的组成。经比对获得639bp长度的COI基因序列和526bp的16SrRNA基因序列,以对比分析S.fukienense的遗传多样性。结果 S.fukienense基于COI基因核苷酸多样性(Pi)为0.048 4,高于其基于16SrRNA基因核苷酸多样性(Pi)为0.021 6。同时,S.fukienense基于COI基因单倍型间的平均遗传距离(P)为0.048,大于其基于16SrRNA基因单倍型间的平均遗传距离(P)0.026。结论 COI序列在分析S.fukienense遗传异变时的作用更优于16SrRNA基因序列。
关键词
福建华溪蟹
co
I基因序列
16
S
rrna
基因序列
遗传多样性
Keywords
S.
fukienense
co
l
and
16
S
rrna
gene sequence
gene
tic
diversity
分类号
R38 [医药卫生—医学寄生虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
3种星虫线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段的序列比较
陈子安
杜晓东
王庆恒
邓岳文
《广东海洋大学学报》
CAS
2007
11
下载PDF
职称材料
2
福建华溪蟹线粒体DNA COI和16S rRNA基因序列的遗传多样性
石林波
张小燕
汪雁
王云龙
周宪民
邹节新
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
6
下载PDF
职称材料
已选择
0
条
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参考文献
引证文献
统计分析
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