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浅析基于生物信息学分析CLDN7基因在胃癌中的表达及临床意义
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作者 刘江伟 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2023年第1期63-66,共4页
Claudin蛋白家族成员CLDN7的表达异常导致紧密连接的结构和功能发生破坏,从而促进肿瘤细胞的生成、浸润和转移,本研究通过生物信息学分析CLDN7在胃癌中的表达及临床意义。方法 从胃腺癌癌症基因组图谱(TCGA-STAD)的数据集中获取RNA转录... Claudin蛋白家族成员CLDN7的表达异常导致紧密连接的结构和功能发生破坏,从而促进肿瘤细胞的生成、浸润和转移,本研究通过生物信息学分析CLDN7在胃癌中的表达及临床意义。方法 从胃腺癌癌症基因组图谱(TCGA-STAD)的数据集中获取RNA转录数据及临床数据,比较不同分组组间CLDN7的表达水平。使用Cox回归分析和Kaplan-Meier法评估CLDN7的表达对胃癌预后的意义。使用GEPIA数据库分析并筛选与CLDN7存在共表达关系的基因并对CLDN7及CLDN7共表达的基因进行GO和KEGG富集分析。使用基因集富集分析(GSEA)分析与CLDN7表达相关的标志基因集。使用CIBERSORT分析CLDN7与免疫细胞疫细胞的组分及其组分之间的差异。结果 CLDN7在胃癌中高表达并与胃癌的恶性程度呈负相关。CLDN7在65岁以上的STAD患者中表达明显上调。胃癌中CLDN7的表达与多种免疫细胞及免疫相关基因存在负相关性。结论 CLDN7在高级别分化胃癌的早期的生长、浸润和转移中起到了促进作用。CLDN7的表达可能被多种免疫细胞释放的炎症因子所调控,是胃癌潜在的免疫治疗靶点基因。 展开更多
关键词 cldn7 胃癌 TCGA
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结肠癌组织中CLDN7基因的表达及临床意义 被引量:1
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作者 张学辉 于洪亮 +1 位作者 杨维良 王夫景 《临床外科杂志》 2011年第8期531-533,共3页
目的探讨结肠癌组织中CLDN7基因的表达及临床意义。方法采用RT—PCR和免疫组化法检测40例结肠癌组织(实验组)及40例正常结肠黏膜组织(对照组)中CLDN7基因mRNA和蛋白的表达,比较两组间的差异,分析CLDN7的表达与结肠癌临床病理特征... 目的探讨结肠癌组织中CLDN7基因的表达及临床意义。方法采用RT—PCR和免疫组化法检测40例结肠癌组织(实验组)及40例正常结肠黏膜组织(对照组)中CLDN7基因mRNA和蛋白的表达,比较两组间的差异,分析CLDN7的表达与结肠癌临床病理特征的关系。结果结肠癌组织中CLDN7 mRNA阳性表达率为30.0%(12/40),明显低于正常结肠黏膜(P〈0.05)。结肠癌组织中CLDN7的免疫组化染色阳性表达率为22.5%(9/40),也明显低于正常结肠黏膜(P〈0.05);CLDN7表达与肿瘤组织的分化程度、浸润深度、淋巴结转移及临床分期等均有明显相关性(P〈0.05)。结论CLDN7在结肠癌组织中表达减低,且CLDN7的表达与结肠癌临床分期、淋巴结转移及分化程度关系密切。 展开更多
关键词 结肠癌 cldn7 RT—PCR 免疫组织化学
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脑胶质瘤中CLDN-7基因甲基化状态及蛋白表达的研究 被引量:3
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作者 刘正 徐培坤 +1 位作者 朱立新 成金民 《安徽医药》 CAS 2013年第1期53-55,共3页
目的探讨脑胶质瘤血浆中CLDN-7基因的甲基化状况及蛋白表达的关系。方法采用巢式PCR、亚硫酸氢盐测序PCR(BSP)及免疫组织化学技术方法,检测56例脑胶质瘤血清标本中CLDN-7基因启动子区CpG岛的甲基化状态,分析其甲基化程度、蛋白表达和临... 目的探讨脑胶质瘤血浆中CLDN-7基因的甲基化状况及蛋白表达的关系。方法采用巢式PCR、亚硫酸氢盐测序PCR(BSP)及免疫组织化学技术方法,检测56例脑胶质瘤血清标本中CLDN-7基因启动子区CpG岛的甲基化状态,分析其甲基化程度、蛋白表达和临床资料之间的相关性。结果脑胶质瘤患者血清中CLDN-7基因启动子区甲基化率为35.3%(18/51),按WHO病理分级,其中低级别(Ⅰ~Ⅱ级)组胶质瘤中基因启动子区甲基化率25.0%(9/36)低于高级别(Ⅲ~IV级)组甲基化率60.0%(9/15),两者之间存在显著差别(P<0.05);甲基化蛋白表达阳性率为55.6%(10/18),未甲基化的蛋白阳性表达率为84.8%(28/33)。结论 CLDN-7基因启动子区CpG岛中存在甲基化现象,与脑胶质瘤发生有关;基因的甲基化率与蛋白表达呈负相关关系。 展开更多
关键词 紧密连接蛋白-7 CPG岛 甲基化 脑胶质瘤
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胰腺癌中CLDN-7的表达及临床意义
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作者 马勇 苏阿德 +2 位作者 陈志涛 俞泽元 焦作义 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期120-127,共8页
目的:探讨紧密连接蛋白claudin-7(CLDN-7)在胰腺癌中的表达情况,以及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:应用Oncomine、GEPIA和GEO数据库综合分析CLDN-7 m RNA在胰腺癌中的表达水平,应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析胰腺癌中... 目的:探讨紧密连接蛋白claudin-7(CLDN-7)在胰腺癌中的表达情况,以及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法:应用Oncomine、GEPIA和GEO数据库综合分析CLDN-7 m RNA在胰腺癌中的表达水平,应用Kaplan-Meier Plotter数据库分析胰腺癌中CLDN-7的表达水平与生存预后的关系;选取兰州大学第二医院普外科2015年至2018年手术切除的44例胰腺癌患者的癌组织及31例癌旁组织标本,采用免疫组织化学染色法检测CLDN-7蛋白的表达水平,并分析其与临床病理特征以及预后的关系;GO分析和KEGG通路富集分析CLDN-7可能参与的信号通路及发挥的主要功能,并且在TCGA和GEPIA数据库中进行验证。结果:数据库及收取的临床样本分析均显示,CLDN-7在胰腺癌组织中显著高表达,其高表达与胰腺癌患者临床预后有关联,并且CLDN-7的表达水平是影响胰腺癌患者术后总体生存时间的独立因素(均P<0.05);GO分析和KEGG通路富集分析证实,CLDN-7参与胰腺癌患者DNA损伤修复、糖代谢等;TCGA和GEPIA数据库验证显示,胰腺癌中CLDN-7的表达与DNA损伤修复相关基因POLD4、SMUG1、NTHL1及糖代谢的相关基因ALDOA、TALDO1、PGLS的表达呈现出明显的正相关性(均P<0.01)。结论:CLDN-7在胰腺癌中高表达且标志着更差的临床预后,并与胰腺癌的DNA损伤修复及肿瘤内糖代谢相关。 展开更多
关键词 cldn-7 胰腺癌 预后
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