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优化PCR体系结合毛细管电泳技术检测FMR1基因前突变与全突变 被引量:4
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作者 周雅 孙维 +5 位作者 肖冰 韩旭 龙飞 蒋雯婷 季星 陶炯 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期401-405,共5页
目的通过优化PCR并结合毛细管电泳,建立高扩增效率、高分辨率的FMR1基因CGG重复序列异常扩增检测体系。方法选择标准样本和经Southern印迹技术确定(CGG)n的正常、前突变、全突变男性和女性样本15例,进行PCR检测体系的优化。优化的PC... 目的通过优化PCR并结合毛细管电泳,建立高扩增效率、高分辨率的FMR1基因CGG重复序列异常扩增检测体系。方法选择标准样本和经Southern印迹技术确定(CGG)n的正常、前突变、全突变男性和女性样本15例,进行PCR检测体系的优化。优化的PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳等多种方法进行结果比较。结果经优化的PCR体系可以检测出(CGG)n大于260个拷贝的全突变男性和(CGG)n达到183个拷贝的前突变女性。毛细管电泳能够清晰分辨出相差1个CGG的两个等位基因,结果具有良好的可重复性。结论该PCR检测体系大幅度提高了普通PCR方法的扩增效率和分辨率,明显降低了对于Southern印迹技术的依赖,可以作为临床筛查FMR1基因突变的首选方法。 展开更多
关键词 脆性X综合征 FMR1基因 cgg重复序列 聚合酶链反应 毛细管电泳
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秦巴山区智力低下儿童FMR1基因突变研究 被引量:2
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作者 高晓彩 张蕊 +4 位作者 舒青 李楠 龚平原 李瑞林 张富昌 《西北大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期251-254,共4页
目的检测秦巴山区脆性X综合征儿童。方法利用分子生物学技术,对秦巴山区0~14岁智力低下儿童FMR1基因CpG岛甲基化与CGG重复多态性进行检测。结果在56名智力低下男童中,检测出了3例FMR1基因甲基化但CGG重复数在正常范围的患者。对此3... 目的检测秦巴山区脆性X综合征儿童。方法利用分子生物学技术,对秦巴山区0~14岁智力低下儿童FMR1基因CpG岛甲基化与CGG重复多态性进行检测。结果在56名智力低下男童中,检测出了3例FMR1基因甲基化但CGG重复数在正常范围的患者。对此3例患者及其家系人群体征检查观察到部分成员有脆性X综合征体征;此外,检测的智力低下和对照儿童FMR1基因CGG重复数均在正常范围(分别为16—40,18~37),两组无统计学差异(X^2=29.55,P=0.102)。结论检测出的3例智力低下患者有可能是FMR1基因发生了甲基化而CGG重复数正常的脆性X综合征患者,相对于CGG异常扩增而言,FMR1基因甲基化可能是形成该病症的重要原因。 展开更多
关键词 智力低下 脆性X综合征 FMR1基因 甲基化 cgg重复
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FMR1基因与卵巢功能下降的相关性研究进展 被引量:2
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作者 唐瑞怡 郁琦 《医学综述》 CAS 2021年第15期2917-2923,共7页
脆性X智力障碍1号基因(FMR1)与卵巢功能的相关性得到越来越多的关注,其前突变与早发性卵巢功能不全(POI)明确相关,但POI患者中FMR1前突变携带率存在人种差异,两者的相关性在西方国家人群中尤为明显,在亚洲人群中的研究受到质疑。我国PO... 脆性X智力障碍1号基因(FMR1)与卵巢功能的相关性得到越来越多的关注,其前突变与早发性卵巢功能不全(POI)明确相关,但POI患者中FMR1前突变携带率存在人种差异,两者的相关性在西方国家人群中尤为明显,在亚洲人群中的研究受到质疑。我国POI患者前突变的发生率稍高于健康女性,前突变可能与卵巢储备功能下降有关。FMR1前突变导致脆性X相关的POI相关机制主要与mRNA毒性有关,高浓度mRNA干扰卵泡发育,对颗粒细胞呈现毒性作用。未来开展卵巢功能下降患者的FMR1基因筛查可为其提供生育指导,具有临床应用价值。 展开更多
关键词 早发性卵巢功能不全 卵巢储备功能减退 脆性X智力障碍1号基因 cgg重复序列
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脆性X综合征FMR1基因CGG重复序列与甲基化的检测 被引量:2
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作者 花茂方 刘小云 +3 位作者 王文 陈红 刘福民 严晓南 《中国优生与遗传杂志》 2012年第6期18-20,共3页
目的建立一种快速、可靠的脆性X综合征的群体筛查方法。方法应用热启动PCR和甲基化特异性PCR(MS-PCR)方法对62例智力低下儿童、12例父母外周血液以及5例高危胎儿的脐带血中FMR1基因CGG重复序列与甲基化状态进行检测。结果采用热启动PCR... 目的建立一种快速、可靠的脆性X综合征的群体筛查方法。方法应用热启动PCR和甲基化特异性PCR(MS-PCR)方法对62例智力低下儿童、12例父母外周血液以及5例高危胎儿的脐带血中FMR1基因CGG重复序列与甲基化状态进行检测。结果采用热启动PCR方法检测79例标本,77例标本的CGG重复数在21~40之间,与正常对照组无明显差异;2例标本未扩增出明显条带。采用MS-PCR方法检测出2例FMR1基因甲基化但CGG重复数在正常范围的患者。结论应用热启动PCR结合MS-PCR方法检测FMR1基因CGG重复数和甲基化,能提高诊断效率,可作为筛查脆性X综合征的首选方法。 展开更多
关键词 脆性X综合征 FMR1基因 cgg重复序列 甲基化
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脆性X综合征二例CGG重复序列及甲基化分析 被引量:2
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作者 黄文 罗仕玉 +4 位作者 杜倩 杨璞 谭虎 邬玲仟 段然慧 《中华儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期287-289,共3页
目的比较脆性X综合征男性胎儿不同组织中CGG重复扩增和甲基化情况。 方法分别于2013年8月、2012年5月采集1例全突变和1例前突变/全突变嵌合23周终止妊娠男性胎儿的不同组织样本,并提取基因组DNA。联合高GC含量PCR和甲基化敏感Souther... 目的比较脆性X综合征男性胎儿不同组织中CGG重复扩增和甲基化情况。 方法分别于2013年8月、2012年5月采集1例全突变和1例前突变/全突变嵌合23周终止妊娠男性胎儿的不同组织样本,并提取基因组DNA。联合高GC含量PCR和甲基化敏感Southern印迹技术,测量各组织中CGG重复数、分析甲基化水平,并通过实时PCR和Western印迹分析FMR1表达情况。 结果两例胎儿各组织间CGG重复数目一致,但嵌合胎儿各组织中CGG重复甲基化情况不同,1例脑、皮肤、睾丸和肾组织,均有1个约为540个CGG重复的主要全突变条带,完全甲基化。另1例脑区、皮肤、睾丸、肺、胃、肠道、肝、肾、心脏以及外周中血均检测到160、470和1 100个CGG重复的3条主要条带。检测出脑组织中前突变比例最低,相应FMPR表达最少。 结论明确了CGG重复扩增和甲基化的组织异质性。基于嵌合胎儿母亲为全突变,推测母源全突变CGG重复在三胚层分化前缩减。 展开更多
关键词 脆性X综合征 镶嵌现象 遗传异质性 cgg重复序列
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构建脆性X染色体综合征患者来源的诱导多能干细胞系
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作者 包勤敏 梁栋 +5 位作者 乔凤昌 王艳 马定远 张翠平 胡平 许争峰 《临床检验杂志》 CAS 2020年第3期164-170,共7页
目的构建脆性X综合征(FXS)患者来源的诱导多能干细胞(iPSCs)。方法采集2个FXS家系患者外周血并分离外周血单个核细胞(PBMC),用含4个重编程转录因子(OCT4、SOX2、KLF4和c-MYC)的仙台病毒感染PBMC,获得患者来源的iPSCs;采用细胞形态学、... 目的构建脆性X综合征(FXS)患者来源的诱导多能干细胞(iPSCs)。方法采集2个FXS家系患者外周血并分离外周血单个核细胞(PBMC),用含4个重编程转录因子(OCT4、SOX2、KLF4和c-MYC)的仙台病毒感染PBMC,获得患者来源的iPSCs;采用细胞形态学、免疫荧光染色等技术对iPSCs进行多能性鉴定;核型分析验证其基因组完整性;利用PCR扩增结合微流控毛细管电泳技术检测重编程前后CGG重复数。结果成功对2个脆性X家系患者的PBMC细胞进行了重编程。患者来源的iPSCs经过多能性验证试验证实,其表达多能性标志基因并具有向三胚层分化潜能;核型分析结果证实iPSCs核型正常;2例先证者细胞系重编程前后的CGG重复数差异无统计学意义。结论通过非整合重编程技术成功构建2个FXS患者来源iPSCs细胞系,为进一步研究FXS疾病提供多能干细胞资源。 展开更多
关键词 诱导多能干细胞 重编程 脆性X综合征 仙台病毒 cgg重复数
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应用PCR—DG GE方法检测脆性X位点FMR-1基因内CGG重复序列
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作者 陈听安 陆雪芬 +1 位作者 易咏红 何国强 《卒中与神经疾病》 1996年第2期65-69,共5页
脆性 X 综合征是一最常见的 X 性连锁的遗传性智力低下病,是因 X 染色体上脆性部位的FMR—1基因内一段不稳定的 CGG 重复序列的异常扩增所致。本文建立了多聚酶链反应—变性梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳(PCR—DGGE)方法,并成功地检测出83例... 脆性 X 综合征是一最常见的 X 性连锁的遗传性智力低下病,是因 X 染色体上脆性部位的FMR—1基因内一段不稳定的 CGG 重复序列的异常扩增所致。本文建立了多聚酶链反应—变性梯度聚丙烯酰胺凝胶电泳(PCR—DGGE)方法,并成功地检测出83例正常人 X 染色体脆性位点FMR—1基因内 CGG 重复序列片段。在上述83例正常人中发现有16个不同大小的等位基因,说明该重复序列的长度在中国人中具有丰富的多态性,最常见的等位基因大小为308bP,有29个CGG 重复。文章对 PCR 方法扩增该 CGG 重复序列片段成功的关键如在反应体系中加入 dGTP 类似物7—deaza—dGTP,DMSO 以及它们在反应体系中理想的浓度等进行了详细的讨论。由于该方法能显示800bP 以内的 DNA 片段,并能准确确定 FMR—1基因内 CGG 重复序列的 CGG 重复数.在用于脆性 X 综合征的女性携带者检出时特别有意义,可根据 CGG 重复数估计其后代受累的风险率及受累程度。该方法稳定可靠,简便宜行,适合推广应用于脆性 X 综合征患者及携带者的临床诊断和遗传咨询及筛查。 展开更多
关键词 脆性X综合征 FMR-1基因 cgg重复 PCR-DGGE
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30例脆性X携带者的产前诊断 被引量:3
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作者 黄文 薛瑾 +4 位作者 康怀兴 关新新 滕炎玲 邬玲仟 段然慧 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2019年第9期866-869,共4页
目的 对脆性X携带者孕妇及胎儿CGG重复数目和甲基化进行检测,为遗传咨询和产前诊断提供依据.方法 应用高GC含量PCR对30例行产前诊断的脆性X携带者孕妇绒毛膜、羊水、脐血的CGG重复数目进行检测,再行Southern印迹甲基化测定和重复数目验... 目的 对脆性X携带者孕妇及胎儿CGG重复数目和甲基化进行检测,为遗传咨询和产前诊断提供依据.方法 应用高GC含量PCR对30例行产前诊断的脆性X携带者孕妇绒毛膜、羊水、脐血的CGG重复数目进行检测,再行Southern印迹甲基化测定和重复数目验证.结果 在29例脆性X携带者(1例双胎妊娠)和1例FMR1基因嵌合缺失的产前诊断病例中,检出前突变3例、全突变9例、前突变/全突变嵌合1例,正常18例.结论 脆性X患者分型复杂,单一技术无法准确诊断,不同类型患者检测项目均会有所差异,需根据患者实际情况谨慎确定检测方案,进行规范的产前诊断. 展开更多
关键词 脆性X综合征 cgg重复序列 高GC含量PCR 产前诊断
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Prevalence of fragile X syndrome in males and females in Indonesia
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作者 Farmaditya EP Mundhofir Tri I Winarni +6 位作者 Willy Nillesen Bregje WM van Bon Marga Schepens Martina Ruiterkamp-Versteeg Ben CJ Hamel Helger G Yntema Sultana MH Faradz 《World Journal of Medical Genetics》 2012年第3期15-21,共7页
AIM: To investigate the prevalence of fragile X syndrome(FXS) in intellectually disabled male and female Indonesians.METHODS: This research is an extension of a previously reported study on the identification of chrom... AIM: To investigate the prevalence of fragile X syndrome(FXS) in intellectually disabled male and female Indonesians.METHODS: This research is an extension of a previously reported study on the identification of chromosomal aberrations in a large cohort of 527 Indonesians with intellectual disability(ID). In this previous study,87 patients had a chromosomal abnormality, five of whom expressed fragile sites on Xq27.3. Since FXS cannot always be identified by cytogenetic analysis, molecular testing of the fragile X mental retardation 1 CGG repeat was performed in 440 samples. The testing was also conducted in the five previously identified samples to confirm the abnormality. In total, a molecular study was conducted in 445 samples(162 females and 283 males).RESULTS: In the cohort of Indonesian ID population, the prevalence of FXS is 9/527(1.7%). The prevalence in males and females is 1.5%(5/329) and 2%(4/198), respectively. Segregation analysis in the families and X-inactivation studies were performed. We performed the first comprehensive genetic survey of a representative sample of male and female ID individuals from institutions and special schools in Indonesia. Our findings show that a comprehensive study of FXS can be performed in a developing country like Indonesia where diagnostic facilities are limited.CONCLUSION: The prevalence of FXS is equal in females and males in our study, which suggests that the prevalence of FXS in females could be underestimated. 展开更多
关键词 Fragile X syndrome INTELLECTUAL DISABILITY Fragile X MENTAL RETARDATION 1 cgg repeat Indonesia
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应用PCR结合毛细管电泳法对育龄妇女FMR1基因突变携带频率的研究 被引量:1
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作者 唐叶 杨岚 +2 位作者 肖建平 王峻峰 郭彩琴 《中国优生与遗传杂志》 2018年第10期14-16,共3页
目的确定FMR1基因CGG重复序列正常型、中间型和前突变型在无锡地区育龄妇女中的分布情况。方法应用PCR技术对我院产前诊断中心育龄妇女(18~49岁)120例外周血样本进行FMR1基因的CGG重复序列进行检测。用GeneMapper4.0软件分析毛细管电... 目的确定FMR1基因CGG重复序列正常型、中间型和前突变型在无锡地区育龄妇女中的分布情况。方法应用PCR技术对我院产前诊断中心育龄妇女(18~49岁)120例外周血样本进行FMR1基因的CGG重复序列进行检测。用GeneMapper4.0软件分析毛细管电泳结果,用SPSS11.0软件进行数据分析。结果 120例受检者中无前突变及全突变检出。共检测到2例灰区携带者,其余118例(CGG)n重复数范围为21~44,其中(CGG)n重复数为28和29的占所有受检者的最高。结论本文为首次在无锡地区普通育龄期妇女开展的FMR1基因突变携带频率的研究,为今后筛查试验的可行性提供数据。 展开更多
关键词 FMR1基因 cgg重复序列 产前诊断 脆性X综合征
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FMR-1基因中CGG重复序列扩增条件的优化 被引量:1
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作者 马云 何淑雅 +3 位作者 Nanbert Zhong 李斌元 喻长顺 苏娇 《现代生物医学进展》 CAS 2007年第1期12-14,共3页
目的:优化PCR扩增条件,建立一种有效检测脆性X综合征的方法。方法:在常规PCR的基础上,采用耐高温酶替代法、碱基替代法,同时加入有机溶剂DMSO等,对表型正常的人群进行FMR1基因CGG重复序列检测。结果:改良PCR法可以提高G C富集区扩增效率... 目的:优化PCR扩增条件,建立一种有效检测脆性X综合征的方法。方法:在常规PCR的基础上,采用耐高温酶替代法、碱基替代法,同时加入有机溶剂DMSO等,对表型正常的人群进行FMR1基因CGG重复序列检测。结果:改良PCR法可以提高G C富集区扩增效率,并取得了较好的效果。结论:建立了一种扩增FMR-1基因中CGG重复序列的可行方法。 展开更多
关键词 FMR-1基因 cgg重复序列 PCR
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人极低密度脂蛋白受体基因CGG重复序列多态性的检测 被引量:1
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作者 邵华 周新 胡波 《基础医学与临床》 CSCD 2000年第4期27-30,共4页
极低密度脂蛋向受体(VLDL-R)基因5'非编码区起始密码子上游19bp处存在CGG三核苷酸重复序列。文献报道,一股正常人中该基因CGG的重复次数为 5~11次,呈多态性分布,且有民族差异。目前尚无我国人群的资料。为... 极低密度脂蛋向受体(VLDL-R)基因5'非编码区起始密码子上游19bp处存在CGG三核苷酸重复序列。文献报道,一股正常人中该基因CGG的重复次数为 5~11次,呈多态性分布,且有民族差异。目前尚无我国人群的资料。为了解中国汉族人群VLDL-R基因CGG重复序列的分布情况,采用聚合酶链反应(PCR)、变性聚丙烯酸胺凝胶电泳和银染等技术,对湖北地区 160例正常汉族人的该重复序列进行了分析,共检出重复次数分别为5、8、9及11的4种等位基因和5/5、5/8、8/8、819、9/9、5/9、8/11及5/11等八种基因型。VLDL-R基因CGG重复序列在中国汉族人及其他国家人群中的分布不尽相同。 展开更多
关键词 VLDL-R基因 cgg重复序列 多态性 基因
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新生儿脆性X综合征筛查对本地区CGG重复数情况分析
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作者 马会卿 郝秀双 +2 位作者 刘晓玲 郭志娟 杨灵敏 《河北医药》 CAS 2020年第4期621-623,共3页
目的对新生儿进行脆性X综合征的筛查,统计FMR1基因CGG不同重复数的分布情况。方法采集共992名新生儿的脐带血,提取DNA用于脆性X综合征检测。采用CGG重复区域全长PCR扩增及重复引物PCR的方法扩增样本,并通过毛细管电泳平台进行分型检测... 目的对新生儿进行脆性X综合征的筛查,统计FMR1基因CGG不同重复数的分布情况。方法采集共992名新生儿的脐带血,提取DNA用于脆性X综合征检测。采用CGG重复区域全长PCR扩增及重复引物PCR的方法扩增样本,并通过毛细管电泳平台进行分型检测。综合两种体系的结果计算样本的CGG重复数。结果992名新生儿脆性X综合征筛查筛查中一次成功检出986例,包括野生型984例、中间型1例、全突变1例。野生型中最常见的CGG重复数为29与30,另外发现了较高频率的36重复。不同重复数的分布在性别间差异无统计学意义(P=0.415)。结论通过全长扩增加重复引物扩增的方法可以有效、准确检测出FMR1基因CGG重复数,结合两种方法的结果计算样本的CGG重复数,提高了检测的灵敏度并实现了CGG重复数的准确判读。此检测体系操作较为简便,检测准确,适合用于新生儿脆性X综合征筛查。 展开更多
关键词 脆性X综合征 cgg重复数
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脆性X染色体综合征的临床检测方法研究
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作者 魏婷婷 周东蕊 +4 位作者 张红琳 付文忠 张仁敏 杜彩贺 胡芳 《南京晓庄学院学报》 2011年第3期63-66,共4页
目的是建立一种简便、快捷的脆性X染色体综合征的临床检测方法.在常规PCR的基础上,采用热启动法,同时加入PCR增强剂Btaine、DMSO,对20例表型正常人群外周血样本进行FMR1基因(CGG)n重复序列检测.结果表明,改良后的FMR1基因PCR扩增技术能... 目的是建立一种简便、快捷的脆性X染色体综合征的临床检测方法.在常规PCR的基础上,采用热启动法,同时加入PCR增强剂Btaine、DMSO,对20例表型正常人群外周血样本进行FMR1基因(CGG)n重复序列检测.结果表明,改良后的FMR1基因PCR扩增技术能够高效扩增CG富集区,采用该方法我们检测了20例外周血样本均获得目标片段,PCR扩增产物片段长度400~500bp(相当于n=20~53).因此,该方法简便、快速、经济而且重复性好,可用于群体普查和门诊快速筛查脆性X染色体综合征. 展开更多
关键词 脆性X染色体综合征 FMR1基因 cgg重复序列 PCR
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脆性X综合征遗传学诊断方法研究进展
15
作者 蒋祝 谭建新 +2 位作者 谭娟 罗春玉 许争峰 《检验医学》 CAS 2024年第2期107-113,共7页
脆性X综合征(FXS)是导致智力障碍和发育障碍的主要单基因病之一,呈X连锁不完全显性遗传。FXS的病因是FMR1基因内(CGG)n重复序列的不稳定扩展及其上游CpG岛的异常甲基化,进而导致脆性X智力低下蛋白(FMRP)减少或缺乏,FMRP的水平直接关系... 脆性X综合征(FXS)是导致智力障碍和发育障碍的主要单基因病之一,呈X连锁不完全显性遗传。FXS的病因是FMR1基因内(CGG)n重复序列的不稳定扩展及其上游CpG岛的异常甲基化,进而导致脆性X智力低下蛋白(FMRP)减少或缺乏,FMRP的水平直接关系到临床表型的严重程度。临床表现和基因检测是诊断FXS的主要依据。然而,FMR1基因分子结构和遗传模式的特殊性使得FXS的分子诊断和遗传咨询面临挑战。因此,如何简便而准确地进行FMR1基因检测一直是临床关注的焦点。文章针对FXS遗传学诊断方法的研究进展进行综述,旨在促进FXS的规范诊断,为临床提供帮助。 展开更多
关键词 FMR1基因 (cgg)n重复 脆性X综合征 基因诊断
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不良孕产史孕妇FMR1基因CGG重复次数分布特征 被引量:1
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作者 赵绍杰 钱芳波 +4 位作者 马凤英 鲁静洁 杭晨 王晓临 孙慧 《中国计划生育学杂志》 2021年第8期1753-1756,共4页
目的:探究FMR1基因CGG重复次数与孕产妇不良孕产史关系,比较不良孕产史孕妇与正常孕妇FMR1基因(CGG)n重复数分布差异性。方法:收集2018年8月-2020年10月就诊于本院有不良孕产史的108例孕妇作为不良孕史组,无不良孕产史孕妇217例为对照... 目的:探究FMR1基因CGG重复次数与孕产妇不良孕产史关系,比较不良孕产史孕妇与正常孕妇FMR1基因(CGG)n重复数分布差异性。方法:收集2018年8月-2020年10月就诊于本院有不良孕产史的108例孕妇作为不良孕史组,无不良孕产史孕妇217例为对照组。收集两组孕妇外周静脉血全血磁珠DNA提取法提取基因组DNA,利用脆性X-FMR1基因AmplideX检测技术进行CGG重复序列数检测,比较分析CGG重复序列。结果:两组FMR1基因检测未检出全突变病例,CGG重复次数的变异范围为n=24~58,其中FMR1基因CGG重复等位基因杂合子数225例,占总数69.2%,最常见杂合子为30/29,占总等位基因中的11.4%;最大频率等位基因(CGG)n=30(30.1%),其次为37、31、29、36。正常范围(n=6~34)、正常范围高线(n=35~44次),两组(CGG)n重复数占比无差异(P>0.05);对照组FMR1基因灰区携带率为0.43%(1例),不良孕史组前突变携带率为0.93%(1例),两组存在差异(P<0.05)。结论:FMR1基因CGG重复序列前突变与孕妇不良孕产史可能存在相关性。 展开更多
关键词 不良孕产史 孕妇 FMR1基因 (cgg)n重复序列分布
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