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家蚕bHLH转录因子Bmsage可溶性表达、纯化与结构分析
被引量:
3
1
作者
何华伟
位曙光
+5 位作者
王叶菁
刘莉娜
李珍珍
赵朋
常怀普
赵萍
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1395-1407,共13页
碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,...
碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,然而当前对其性质和结构了解不多。为研究其性质、结构和生物学功能,构建了NusA、MBP、SUMO、Trx和His融合标签的Bmsage重组原核表达载体,通过改变诱导温度和IPTG浓度,确定了Bmsage在大肠杆菌中可溶性表达的最佳载体和表达条件,进而通过镍柱亲和层析纯化获得了Bmsage,利用圆二色光谱研究了其二级结构。结果表明,NusA与MBP标签可显著增强Bmsage在大肠杆菌中的可溶性表达,但难以与Bmsage分离。SUMO标签有一定的助溶效果,并且能够与Bmsage有效分离。其他标签对Bmsage可溶性表达的效果不明显。圆二色光谱分析表明Bmsage含有α-helix结构,推测SUMO标签可能促进了Bmsage折叠形成类天然的结构。这些工作为深入研究Bmsage的性质、结构与功能建立了基础,同时也为其他类似蛋白的表达纯化提供了参考。
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关键词
碱性螺旋-环-螺旋
bmsage
MBP
NUSA
SUMO
纯化
原文传递
家蚕丝腺发育相关基因Bmsage缺失突变体的RNA-seq分析
被引量:
1
2
作者
辛虎虎
张登攀
+3 位作者
矫鹏
陈瑞婷
陆喦
缪云根
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期854-863,共10页
Bmsage是在家蚕丝腺中特异表达的基因,之前的研究明确其对丝素重链基因fib-H转录具有调控作用。在开展Bmsage功能的研究中,运用CRISPR/Cas9基因敲除系统,获得了Bmsage缺失的纯合突变体家蚕,其表型特征是幼虫的丝腺异常发育,缺失中部丝...
Bmsage是在家蚕丝腺中特异表达的基因,之前的研究明确其对丝素重链基因fib-H转录具有调控作用。在开展Bmsage功能的研究中,运用CRISPR/Cas9基因敲除系统,获得了Bmsage缺失的纯合突变体家蚕,其表型特征是幼虫的丝腺异常发育,缺失中部丝腺和后部丝腺。以Bmsage缺失型家蚕及正常型家蚕产下后5 d的卵为材料,应用RNA-seq测序技术在转录水平上获得194个差异表达基因。对Bmsage缺失型家蚕突变体胚胎期的这些差异表达基因进行GO功能注释,结果显示:Bmsage基因缺失后,对家蚕生理功能的影响主要集中在一些细胞组分,如与肌肉功能相关的肌球蛋白基因和肌钙蛋白基因都明显上调表达,与碳水化合物代谢相关的基因如多种凝集素基因和糖苷酶基因,除个别下调表达外,其余均上调表达;排在前10的GO term中,出现较多的是与几丁质分解代谢相关的几丁质酶基因和多种丝氨酸蛋白酶抑制剂基因。KEGG信号通路分析显示:差异基因主要与一些糖类、脂类和氨基酸的代谢的信号通路相关,其中又以糖类代谢为主,如半乳糖代谢、糖胺聚糖降解及氨基糖和核苷酸糖代谢,所以Bmsage可能参与了多个糖类代谢途径;在差异基因中,与丝腺发育关系最大的是几丁质酶基因、β-N-乙酰葡糖胺糖苷酶基因和丝氨酸蛋白酶抑制剂基因,以及一些转运RNA基因(如TRNAE-CUC、TRNAN-GUU、TRNADGUC和TRNAV-GAC)。因此推测Bmsage可能通过复杂的调控网络,参与了丝腺组织的分化与形成过程。
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关键词
家蚕
丝腺
分化与发育
bmsage
基因
基因敲除
RNA-seq测序
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职称材料
题名
家蚕bHLH转录因子Bmsage可溶性表达、纯化与结构分析
被引量:
3
1
作者
何华伟
位曙光
王叶菁
刘莉娜
李珍珍
赵朋
常怀普
赵萍
机构
西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验室
西南大学生物技术学院重庆市蚕丝纤维新材料工程技术研究中心
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第10期1395-1407,共13页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)(No.2012CB114602)
国家自然科学基金(Nos.31402139
+4 种基金
31572465)
重庆市基础科学与前沿技术研究专项(Nos.cstc2015jcyj A00040
cstc2015jcyj BX0035)
中央高校基本科研业务费(No.XDJK2013A019)
西南大学博士基金(No.SWU112111)资助~~
文摘
碱性螺旋-环-螺旋(Basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子在生命活动过程中发挥着重要的调控作用。Bmsage是家蚕丝腺中高量表达的一类bHLH转录因子,不仅参与了丝腺细胞在胚胎期的发育调控,而且对蚕丝蛋白的合成也有至关重要的调控作用,然而当前对其性质和结构了解不多。为研究其性质、结构和生物学功能,构建了NusA、MBP、SUMO、Trx和His融合标签的Bmsage重组原核表达载体,通过改变诱导温度和IPTG浓度,确定了Bmsage在大肠杆菌中可溶性表达的最佳载体和表达条件,进而通过镍柱亲和层析纯化获得了Bmsage,利用圆二色光谱研究了其二级结构。结果表明,NusA与MBP标签可显著增强Bmsage在大肠杆菌中的可溶性表达,但难以与Bmsage分离。SUMO标签有一定的助溶效果,并且能够与Bmsage有效分离。其他标签对Bmsage可溶性表达的效果不明显。圆二色光谱分析表明Bmsage含有α-helix结构,推测SUMO标签可能促进了Bmsage折叠形成类天然的结构。这些工作为深入研究Bmsage的性质、结构与功能建立了基础,同时也为其他类似蛋白的表达纯化提供了参考。
关键词
碱性螺旋-环-螺旋
bmsage
MBP
NUSA
SUMO
纯化
Keywords
basic helix-loop-helix
bmsage
MBP
Nus A
SUMO
purification
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
家蚕丝腺发育相关基因Bmsage缺失突变体的RNA-seq分析
被引量:
1
2
作者
辛虎虎
张登攀
矫鹏
陈瑞婷
陆喦
缪云根
机构
浙江大学动物科学学院蚕蜂研究所
出处
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第5期854-863,共10页
基金
国家重点基础研究发展计划"973"项目(No.2012CB1146-01)
国家自然科学基金项目(No.31372374/C1703)
文摘
Bmsage是在家蚕丝腺中特异表达的基因,之前的研究明确其对丝素重链基因fib-H转录具有调控作用。在开展Bmsage功能的研究中,运用CRISPR/Cas9基因敲除系统,获得了Bmsage缺失的纯合突变体家蚕,其表型特征是幼虫的丝腺异常发育,缺失中部丝腺和后部丝腺。以Bmsage缺失型家蚕及正常型家蚕产下后5 d的卵为材料,应用RNA-seq测序技术在转录水平上获得194个差异表达基因。对Bmsage缺失型家蚕突变体胚胎期的这些差异表达基因进行GO功能注释,结果显示:Bmsage基因缺失后,对家蚕生理功能的影响主要集中在一些细胞组分,如与肌肉功能相关的肌球蛋白基因和肌钙蛋白基因都明显上调表达,与碳水化合物代谢相关的基因如多种凝集素基因和糖苷酶基因,除个别下调表达外,其余均上调表达;排在前10的GO term中,出现较多的是与几丁质分解代谢相关的几丁质酶基因和多种丝氨酸蛋白酶抑制剂基因。KEGG信号通路分析显示:差异基因主要与一些糖类、脂类和氨基酸的代谢的信号通路相关,其中又以糖类代谢为主,如半乳糖代谢、糖胺聚糖降解及氨基糖和核苷酸糖代谢,所以Bmsage可能参与了多个糖类代谢途径;在差异基因中,与丝腺发育关系最大的是几丁质酶基因、β-N-乙酰葡糖胺糖苷酶基因和丝氨酸蛋白酶抑制剂基因,以及一些转运RNA基因(如TRNAE-CUC、TRNAN-GUU、TRNADGUC和TRNAV-GAC)。因此推测Bmsage可能通过复杂的调控网络,参与了丝腺组织的分化与形成过程。
关键词
家蚕
丝腺
分化与发育
bmsage
基因
基因敲除
RNA-seq测序
Keywords
Bombyx mori
Silk gland
Differentiation and development
bmsage
gene
Gene knockout
RNA-seq
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S881.2 [农业科学—特种经济动物饲养]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
家蚕bHLH转录因子Bmsage可溶性表达、纯化与结构分析
何华伟
位曙光
王叶菁
刘莉娜
李珍珍
赵朋
常怀普
赵萍
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
原文传递
2
家蚕丝腺发育相关基因Bmsage缺失突变体的RNA-seq分析
辛虎虎
张登攀
矫鹏
陈瑞婷
陆喦
缪云根
《蚕业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
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职称材料
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