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直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统检测肺癌小活检标本EGFR基因突变的比较 被引量:10
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作者 赵婧雅 王笑影 +6 位作者 曾海英 黄洁 洪群英 叶欣 朱冠山 侯英勇 张新 《中国癌症杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期106-113,共8页
背景与目的:表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因的突变状态与肺癌患者应用EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)的疗效密切相关。目前,临床上缺乏统一的方法检测EGFR基因突变。... 背景与目的:表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因的突变状态与肺癌患者应用EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)的疗效密切相关。目前,临床上缺乏统一的方法检测EGFR基因突变。本研究旨在探讨直接测序法与蝎形探针扩增阻滞突变系统(scorpions amplification refractory mutation system,scorpions ARMS法)在检测肺癌临床活检小标本EGFR突变时敏感性的差异,以及相关靶向治疗疗效的分析。方法:采用直接测序法和ARMS法共同检测168例石蜡包埋肺癌标本,并随访评估其中行靶向治疗患者的临床疗效。结果:手术标本80例中,直接测序法与ARMS法所检出的突变阳性率分别为18.8%和25.0%,敏感性分别为71.4%和95.2%,差异无统计学意义(P>0.05)。而活检小标本88例中,直接测序法与ARMS法所检出的突变阳性率分别为19.3%和42.0%,敏感性分别为42.5%和92.5%,前者均显著低于后者(P<0.01)。靶向治疗疗效方面,直接测序法与ARMS法野生型患者客观缓解率(objectiveresponse rate,ORR)分别为26.3%和3.8%,前者明显高于后者(P<0.05),而在小活检标本中,直接测序法野生型患者ORR达32.0%。直接测序法野生型患者中位无进展生存期(progression-free survival,PFS)为4.0个月,明显长于ARMS法野生型患者的1.5个月(P<0.05)。结论:对活检小标本而言,ARMS法较直接测序法的敏感性更高,其检测结果与临床疗效的一致性更好,纤维支气管镜活检等小标本EGFR突变检测更适合用ARMS法。 展开更多
关键词 表皮生长因子受体 基因突变 活检标本 EGFR酪氨酸激酶抑制剂
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广州地区尖锐湿疣患者人乳头瘤病毒检测与基因分型 被引量:8
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作者 冯琼 肖青 邱秀 《中国热带医学》 CAS 2010年第2期142-143,152,共3页
目的分析广州地区尖锐湿疣(Condylomata acuminata,CA)患者人乳头瘤病毒(HPV)感染的型别特点,为临床防治提供参考依据。方法采用"中国生殖器疣的多中心临床流行病学研究"课题组所制定的标准检测技术———通用引物聚合酶链反... 目的分析广州地区尖锐湿疣(Condylomata acuminata,CA)患者人乳头瘤病毒(HPV)感染的型别特点,为临床防治提供参考依据。方法采用"中国生殖器疣的多中心临床流行病学研究"课题组所制定的标准检测技术———通用引物聚合酶链反应(PCR)及基于序列分析的基因分型方法,检测HPV型别。结果经PCR扩增分析153份CA患者活检标本中,93例HPVDNA阳性(60.8%);PCR阳性标本中,75例成功分型;单一型别感染率为47.1%,复合型别感染率为2.0%;高危型HPV16检出24例(15.7%),低危型HPV6和HPV11型分别检出27例(17.6%)和24例(15.7%)。结论本地区CA患者HPV感染以单一型别及HPV6、HPV11和HPV16型为主;感染高峰集中于40岁以下的性活跃期人群。 展开更多
关键词 尖锐湿疣 人乳头瘤病毒 型别分析 活检标本
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ADx-ARMS法与PCR-Sanger测序法检测非小细胞肺癌微小标本EGFR基因突变的比较 被引量:8
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作者 孙宇晶 刘畅 +5 位作者 龙彦 孙媛媛 陈克终 杨帆 王辉 赵晓涛 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第7期485-489,共5页
目的比较ADx-ARMS法和PCR-Sanger测序法检测肺癌微小标本EGFR基因突变的差异,评价微小标本用于非小细胞肺癌(NSCLC)患者EGFR突变检测的临床应用价值。方法收集2012~2013年95例NSCLC患者98份微小标本;用ADxARMS法和PCR-Sanger测序法检... 目的比较ADx-ARMS法和PCR-Sanger测序法检测肺癌微小标本EGFR基因突变的差异,评价微小标本用于非小细胞肺癌(NSCLC)患者EGFR突变检测的临床应用价值。方法收集2012~2013年95例NSCLC患者98份微小标本;用ADxARMS法和PCR-Sanger测序法检测上述标本EGFR基因18、19、20、21外显子基因突变,分析其与患者临床、病理特征的关联性。结果 ADx-ARMS法突变总检出率为51.0%(50/98),PCR-Sanger测序法突变总检出率为25.3%(24/95)。突变多见于女性(65.1%)、非吸烟(64.0%)、腺癌(51.9%)患者。EGFR-TKI疗效研究结果表明,ADx-ARMS法和PCR-Sanger测序法检测结果均为野生型患者的无进展生存期(PFS)为2.0个月,明显短于两种方法检测均为突变型和仅ADx-ARMS法检测为突变型患者的9.1个月和10.0个月(P〈0.01)。结论对于难以获得手术切除标本的患者,微小标本可作为其进行EGFR突变检测的适用材料;ADx-ARMS法较PCR-Sanger测序法更适用于微小标本的基因检测。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 表皮生长因子受体 酪氨酸激酶受体抑制剂 微小组织样本
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FISH检测宫颈上皮内瘤变及其旁组织中hTERC基因表达的变化及意义 被引量:2
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作者 曹志星 吕威 +7 位作者 赵晔 莫海波 谢亚峰 吴晓媚 李玉梅 周宾 范思格 陈细妹 《中国医学创新》 CAS 2014年第23期1-6,共6页
目的:检测宫颈活检组织中上皮内瘤变(CIN)及其旁组织中hTERC基因的表达情况,对比分析其阳性率的变化,试图找到基因水平上CIN手术治疗范围。方法:采用荧光原位杂交技术(FISH)检测63例宫颈活检标本中hTERC基因的表达变化情况。结果:宫颈... 目的:检测宫颈活检组织中上皮内瘤变(CIN)及其旁组织中hTERC基因的表达情况,对比分析其阳性率的变化,试图找到基因水平上CIN手术治疗范围。方法:采用荧光原位杂交技术(FISH)检测63例宫颈活检标本中hTERC基因的表达变化情况。结果:宫颈高级别上皮内瘤变(HSIL)区、瘤变边缘≤1 mm、1 mm<瘤变边缘≤2 mm、2 mm<瘤变边缘≤3 mm以及3 mm<瘤变边缘≤4 mm的hTERC基因阳性率分别为100%、92.31%、87.18%、64.10%和30.77%,其中,HSIL与瘤变边缘2 mm以内范围各点比较差异无统计学意义(P>0.05);HSIL与瘤变边缘2 mm以外范围各点比较差异有统计学意义(P<0.05);宫颈低级别上皮内瘤变(LSIL)区、瘤变边缘≤1 mm范围、1 mm<瘤变边缘≤2 mm、2 mm<瘤变边缘≤3 mm以及3 mm<瘤变边缘≤4 mm的hTERC基因阳性率分别为41.67%、25.00%、4.17%、4.17%和4.17%,其中,LSIL与瘤变边缘1 mm以内范围各点比较差异无统计学意义(P>0.05),而LSIL与瘤变边缘1 mm以外范围点比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:活检标本中,随着距瘤变区范围的增加,hTERC基因的阳性率明显下降,其中,距瘤变边缘>2 mm和>1 mm或许可以分别作为HSIL和LSIL基因水平上(更精确意义上的)CIN的手术治疗范围。 展开更多
关键词 荧光原位杂交 宫颈上皮内瘤变 HTERC基因 宫颈活检组织 手术治疗范围
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406例肺癌小活检标本中表皮生长因子受体基因的突变分析
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作者 陈剑 张燕 +3 位作者 王华 叶菊香 裴斐 张波 《中国实验诊断学》 2014年第12期1944-1947,共4页
目的探讨肺癌小活检标本中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因的突变情况。方法采用蝎形探针扩增阻滞突变系统(Scorpions ARMS)检测406例肺癌小活检标本中EGFR基因第18、19、20和21外显子的突变情况。结果在... 目的探讨肺癌小活检标本中表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因的突变情况。方法采用蝎形探针扩增阻滞突变系统(Scorpions ARMS)检测406例肺癌小活检标本中EGFR基因第18、19、20和21外显子的突变情况。结果在406例肺癌小活检标本中,检测到190例存在EGFR突变(占46.8%),其中80例为第19外显子框内多核苷酸缺失、88例为第21外显子L858R突变、4例为第21外显子L861Q突变、9例为第18外显子G719X突变、2例为第20外显子S768I突变、1例为第20外显子T790M突变;此外,发现6例存在双位点突变。肺腺癌EGFR突变率为55.5%(186/335),鳞状细胞癌突变率为5.8%(3/52),5例腺鳞癌中有1例检测到EGFR基因突变,其它类型肺癌均未检测到EGFR基因突变(0/14)。女性患者EGFR基因突变率(62.4%)明显高于男性患者(32.1%,P<0.01),非吸烟患者EGFR基因突变率(59.8%)明显高于吸烟患者(24.7%,P<0.01)。结论 EGFR基因突变多见于女性、非吸烟和肺腺癌患者;Scorpions ARMS是检测活检小标本EGFR基因突变的可靠方法。 展开更多
关键词 肺肿瘤 表皮生长因子 受体 基因突变 小活检标本
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竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应法和DNA直接测序法检测KRAS G12D突变的对比分析
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作者 郑晴晴 贾伟平 +3 位作者 张蓉 胡承 罗彦丽 常英 《上海医学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期820-823,I0001,共5页
目的对比分析竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应(castPCR)法和DNA直接测序法检测肠镜活组织检查标本KRAS G12D突变的差异。方法应用活组织检查钳收集肠镜下结直肠腺瘤和结直肠癌组织,抽提组织DNA,分别采用castPCR法和DNA直接测序... 目的对比分析竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应(castPCR)法和DNA直接测序法检测肠镜活组织检查标本KRAS G12D突变的差异。方法应用活组织检查钳收集肠镜下结直肠腺瘤和结直肠癌组织,抽提组织DNA,分别采用castPCR法和DNA直接测序法获得KRAS G12D的突变情况。结果腺瘤组和腺癌组castPCR法检测的KRAS G12D突变率均显著高于同组DNA直接测序法(P值均<0.05),两组间castPCR法和DNA直接测序法检测的KRAS G12D突变率的差异均无统计学意义(P值均>0.05)。腺瘤组两种检测方法的突变型符合率为55.6%,野生型符合率为100.0%,阴性符合率为100.0%,总体符合率为87.5%,一致性检验Kappa值为0.643 5;腺癌组两种检测方法的突变型符合率为50.0%,野生型符合率为100.0%,阴性符合率为100.0%,总体符合率为85.0%,一致性检验Kappa值为0.583 3。提示两种方法检测阴性的一致性程度均较高,但检测阳性的一致性程度一般。Mutation Detector分析结果显示,castPCR法能够检测出突变量<1%的突变,灵敏度高达0.1%。检测突变量分析结果显示,当KRAS G12D突变量≥4%时,castPCR法和DNA直接测序法检测KRAS G12D均为阳性;当突变量<4%时,仅castPCR法能够检测出KRAS G12D为阳性。提示castPCR法能够检测出DNA直接测序法检测不出的KRAS G12D突变,较DNA直接测序法效率高。结论 castPCR法能够高效地检测肠镜活组织检查标本中低突变量的KRAS G12D,其临床实用价值较DNA直接测序法高。 展开更多
关键词 竞争性等位基因特异的TaqMan聚合酶链反应 肠镜活组织检查标本 KRAS G12D
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肺癌组织样本和血液样本EGFR基因检测对比研究
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作者 邓会岩 刘畅 +5 位作者 贾迎 李芳 尹丹静 檀紫瑞 苏冰 刘月平 《癌变.畸变.突变》 CAS 2023年第1期21-25,共5页
目的:研究肺腺癌患者不同样本EGFR基因检测结果的异同,以更精准地反映患者体内EGFR突变情况。方法:收集2016年7月—2017年12月收治的Ⅲ~Ⅳ期经病理确诊为肺腺癌患者175例,175例均有血浆样本,其中119例同时有活检组织样本,12例同时有胸... 目的:研究肺腺癌患者不同样本EGFR基因检测结果的异同,以更精准地反映患者体内EGFR突变情况。方法:收集2016年7月—2017年12月收治的Ⅲ~Ⅳ期经病理确诊为肺腺癌患者175例,175例均有血浆样本,其中119例同时有活检组织样本,12例同时有胸水沉渣细胞样本。采用突变扩增系统(ARMS)-聚合酶链式反应(PCR)方法对收集到的活检组织样本、胸水沉渣细胞样本和血液样本进行EGFR基因检测,分析不同类型样本间结果的差异,以及与患者临床病理指标的关系。结果:联合检测的EGFR基因突变总阳性率较单纯血液样本阳性率提高了8.6%,较单纯组织样本提高了3.1%。EGFR突变在不同的性别(χ^(2)=3.451,P=0.045)、肿瘤直径(χ^(2)=8.911,P=0.002)、T分期(χ^(2)=17.567,P=0.000)、淋巴结转移(χ^(2)=18.511,P=0.000)、转移站数(χ^(2)=3.341,P=0.047)和远处转移(χ^(2)=10.874,P=0.001)组间的差异有统计学意义。将血液和组织两组样本EGFR突变率进行比较,差异有统计学意义(P=0.000)。在患者临床病理指标与生存时间的分析中,肿瘤直径[95%CI(0.151,0.725),P=0.006]、淋巴结转移[95%CI(0.180,0.865),P=0.020]、远处转移[95%CI(0.097,0.612),P=0.003]均是影响患者无进展生存期的重要因素。结论:肺癌患者血液样本、活检组织样本、胸水沉渣细胞样本在EGFR检测过程中的联合应用能够获得更高的检出率,可为临床更多地筛选出适合EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)治疗的人群。对于女性患者、肿瘤直径≥3 cm、T4期、淋巴结转移且超过3站、远处转移患者检测到血液EGFR基因突变的几率更高。其中肿瘤直径≥3 cm、淋巴结转移、远处转移患者的无进展生存期更短。 展开更多
关键词 肺腺癌 EGFR基因 血液样本 活检组织样本 胸水沉渣细胞样本 对比研究
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纤支镜活检和痰液标本FHIT基因检测对肺癌诊断的意义
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作者 李殿明 夏雪梅 +2 位作者 刘超 陈余清 蔡映云 《实用医学杂志》 CAS 2008年第21期3671-3673,共3页
目的:明确检测肺癌手术标本、纤支镜活检和痰液标本FHIT基因转录本缺失在肺癌诊断中的意义。方法:应用RT-PCR法检测41例肺癌手术标本癌组织和9例良性肺疾病肺组织手术标本以及80例肺癌和30例良性肺疾病纤支镜活检标本及全部的160例患者... 目的:明确检测肺癌手术标本、纤支镜活检和痰液标本FHIT基因转录本缺失在肺癌诊断中的意义。方法:应用RT-PCR法检测41例肺癌手术标本癌组织和9例良性肺疾病肺组织手术标本以及80例肺癌和30例良性肺疾病纤支镜活检标本及全部的160例患者痰液标本FHIT基因转录本缺失,并与病理组织学、刷检细胞学和痰液细胞学检查结果比较。结果:肺癌组织FHIT基因转录本缺失的阳性率[70.7%(29/41)]高于癌旁正常组织(5/41)和良性肺疾病组织(0/9)(P<0.005);纤支镜活检标本FHIT基因转录本缺失阳性率[70.0%(56/80)]高于良性肺疾病(2/30)(P<0.005);痰液FHIT基因转录本缺失联合痰液细胞学检查诊断肺癌的敏感性(73.6%)高于单独痰液细胞学(47.1%)或痰液中FHIT基因转录本缺失(52.1%)(均P<0.005)。与单独痰液细胞学相比,两者联合检测使诊断肺癌的敏感性由原来的47.1%提高至73.6%(P<0.005),阴性预测值由原来的37.9%提高至54.9%(P>0.05),特异性不变。结论:在肺癌组织中检测FHIT基因转录本缺失可能成为肺癌诊断的分子标志物之一。痰液中FHIT基因转录本缺失检测为肺癌无创诊断提供了一个新的辅助指标。 展开更多
关键词 肺肿瘤 逆转录聚合酶链反应 FHIT 纤支镜活检 痰标本
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