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益母草糖基转移酶基因的克隆及原核表达分析(英文) 被引量:4
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作者 徐德宏 谭朝阳 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期397-405,共9页
通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从益母草(Leonurus heterophyllus Sweet)叶片中克隆获得了一个编码糖基转移酶的基因(LhsUGT)。该基因cDNA全长为1562 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)... 通过cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)从益母草(Leonurus heterophyllus Sweet)叶片中克隆获得了一个编码糖基转移酶的基因(LhsUGT)。该基因cDNA全长为1562 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)为1368 bp,编码455个氨基酸残基,其分子量和等电点分别为50.47 k D和5.52。生物信息学分析结果显示:LhsUGT编码的酶蛋白含有3种二级结构,其中α螺旋占43.1%,β折叠片占17.5%,无规卷曲占39.4%,其C端还发现了一段高度保守的PSPG结构域,说明LhsUGT编码的酶蛋白属于植物糖基转移酶超家族;对LhsUGT的氨基酸序列进行BLAST同源比对,发现益母草与其它植物的糖基转移酶序列相似性为26.4%-68.0%;系统进化树分析表明,LhsUGT蛋白属于拟南芥糖基转移酶超家族的L组,故推测它可能具有催化简单酚类发生糖基化的功能;SDS-PAGE电泳显示,原核表达系统成功表达出分子量约为69 k D的LhsUGT重组蛋白,其N端含有一段17.9 k D的His标签,且在IPTG诱导5 h后达到最高表达量。本研究结果为进一步开展体外酶促反应、阐明益母草糖基转移酶的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 益母草 糖基转移酶基因 CDNA克隆 生物信息学分析 原核表达
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蜂巢小甲虫保幼激素环氧水解酶基因JHEH1和JHEH1-2生物信息学及表达分析
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作者 杨馨宇 顾一凡 +3 位作者 苏奕源 高景林 韩文素 李晓宇 《山东农业科学》 北大核心 2024年第6期103-112,共10页
保幼激素环氧水解酶(juvenile hormone epoxide hydrolase, JHEH)是调节昆虫保幼激素(juvenile hormone, JH)代谢的关键酶之一,是选择性杀虫剂的潜在靶标。本研究利用生物信息学方法对蜂巢小甲虫JHEH1和JHEH1-2基因编码蛋白的理化特性... 保幼激素环氧水解酶(juvenile hormone epoxide hydrolase, JHEH)是调节昆虫保幼激素(juvenile hormone, JH)代谢的关键酶之一,是选择性杀虫剂的潜在靶标。本研究利用生物信息学方法对蜂巢小甲虫JHEH1和JHEH1-2基因编码蛋白的理化特性、结构特征和系统进化进行分析,采用RT-qPCR技术检测并分析蜂巢小甲虫成虫不同发育时期卵巢(未出土,1日龄、2日龄和3日龄)和未出土成虫不同组织(卵巢、脂肪体、足、胸部、头)中JHEH1和JHEH1-2的相对表达量。结果表明,预测JHEH1编码460个氨基酸,等电点(pI)为8.06,蛋白分子式C_(2425)H_(3707)N_(603)O_(660)S_(16);JHEH1-2编码461个氨基酸,等电点(pI)为8.70,蛋白分子式C_(2420)H_(3713)N_(597)O_(656)S_(15);两者分子量均为52 kDa,均具有环氧水解酶的N端结构域。系统进化树分析表明,蜂巢小甲虫JHEH1与光肩星天牛Anpoploppor aglabripennis的JHEH聚为一支;JHEH1-2较为保守,其分支处于的置信度较低。RT-qPCR结果显示,蜂巢小甲虫JHEH1和JHEH1-2在成虫不同发育时期和各组织中均有表达,且在未出土成虫的卵巢中高表达(P<0.05),表明JHEH在卵巢发育过程中发挥重要作用。本研究可为后续深入研究JHEH基因对蜂巢小甲虫生长发育调控机制提供理论基础。 展开更多
关键词 保幼激素环氧水解酶 蜂巢小甲虫 保幼激素 生物信息学分析 基因表达
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狂犬病病毒感染小鼠脑组织中lncRNA表达谱分析 被引量:1
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作者 蒋天琪 翁锐强 +5 位作者 刘苏东 谢孟泽 杨松涛 王化磊 夏咸柱 赵平森 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2018年第7期685-690,共6页
目的通过RNA测序的方法研究狂犬病病毒(RABV)小鼠脑组织中lncRNA的表达谱和功能。方法用RABV CVS11株感染小鼠脑组织并提取总RNA,构建文库,上机测序分析获得CVS11毒株感染小鼠脑组织mRNA和lncRNA表达谱,并进行实时荧光定量PCR验证,通过G... 目的通过RNA测序的方法研究狂犬病病毒(RABV)小鼠脑组织中lncRNA的表达谱和功能。方法用RABV CVS11株感染小鼠脑组织并提取总RNA,构建文库,上机测序分析获得CVS11毒株感染小鼠脑组织mRNA和lncRNA表达谱,并进行实时荧光定量PCR验证,通过GO和KEGG分析差异表达lncRNA和mRNA的功能。结果与未感染组相比,CVS11感染组有88个lncRNA差异表达,2648个mRNA差异表达(FC≥2,P<0.05)。采用实时定量PCR验证差异表达,结果与RNA-seq结果相一致。GO分析差异表达的lncRNA共定位基因高度富集在如氮化合物的解毒,氮化合物的细胞解毒和硝基苯的代谢过程等生物过程中;KEGG分析差异表达的lncRNA靶点参与Toll样受体,NF-κB,MAPK,趋化因子,单纯疱疹和流感A感染等重要信号通路。结论 lncRNA在RABV感染期间参与调节免疫反应,因此可作为狂犬病预防和治疗的潜在靶点。通过高通量RNA测序研究感染小鼠脑组织中lncRNA和mRNA概况。 展开更多
关键词 小RNA测序 狂犬病病毒 lncRNA mRNA 表达谱变化 生物信息学分析
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