应用BioMod集成多种模型研究物种的空间分布——以铁杉在中国的潜在分布为例 被引量：20

1

作者 毕迎凤 许建初 +5 位作者 李巧宏 Antoine Guisan Wilfried Thuiller Niklaus E.Zimmermann 杨永平 杨雪飞 《植物分类与资源学报》 CSCD 北大核心 2013年第5期647-655,共9页

新型统计方法和多源、多尺度空间信息数据的产生促进了物种空间分布模型的快速发展。不同的物种空间分布模型在生态学理论的运用以及前提假设上存在差异。选用不同的模型方法和输入数据会带来预测结果的不确定性。对比并集成多个物种空... 新型统计方法和多源、多尺度空间信息数据的产生促进了物种空间分布模型的快速发展。不同的物种空间分布模型在生态学理论的运用以及前提假设上存在差异。选用不同的模型方法和输入数据会带来预测结果的不确定性。对比并集成多个物种空间分布模型,同时利用多组输入数据可降低预测的不确定性,提高物种分布模拟的精度。本文以中国特有种铁杉(Tsuga chinensis)为例,运用基于R语言开发的BioMod软件包对比9个物种空间分布模型对铁杉的模拟效果。最后以曲线下面积(ROC)为权重集成9个模型的模拟结果,产生和筛选最佳的铁杉潜在空间分布图。研究发现随机森林模型(RF)的模拟效果最好,其次是多元适应回归样条函数模型(MARS)和广义相加模型(GAM),模拟效果最差的是表面分布区分室模型(SRE)。模型集成结果显示,最适宜铁杉分布的区域集中在中国的西南及四川盆地周围,其次零星分散于华南和台湾部分地区。这一结果与前人对铁杉自然分布的描述和研究结果较为吻合。研究进一步表明,通过模型的集成能有效地降低由于单个模型所带来的模拟结果不确定性,从而提高模拟的精度和效果。 展开更多

关键词 物种空间分布模型 铁杉 模型集成 分布区 biomod

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基于BIOMOD的青海湖流域高原鼠兔分布模拟 被引量：13

2

作者 吴艺楠 马育军 +2 位作者 刘文玲 李小雁 王佩 《动物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期390-402,共13页

随着统计模型及空间信息数据的不断发展和完善,物种分布模型已经成为全球变化背景下研究大尺度物种分布情况的重要工具。高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原特有的关键物种,在青藏高原生态系统中占有重要地位。通过采集高原鼠兔的... 随着统计模型及空间信息数据的不断发展和完善,物种分布模型已经成为全球变化背景下研究大尺度物种分布情况的重要工具。高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是青藏高原特有的关键物种,在青藏高原生态系统中占有重要地位。通过采集高原鼠兔的分布点数据及环境变量数据,基于R语言中BIOMOD包中的7个模型对其在青海湖流域的分布进行了模拟。结果表明,高原鼠兔主要分布于青海湖西岸和北岸、天峻县周边及布哈河流域上游,影响高原鼠兔分布的主要环境因子为距道路距离、距居民点距离、最暖月最高气温、NDVI标准差、最冷季和最干季降水量。BIOMOD组合模型中,推进式回归树模型(GBM)和最大熵模型(MAXENT)的模拟效果最好,广义线性回归模型(GLM)结果较差。而优化后的结果显示,模拟结果的集成和筛选能有效提高模型的精度和效果。 展开更多

关键词 物种分布模型 biomod 高原鼠兔

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基于BIOMOD的黄河源区高原鼠兔潜在分布及其影响因子 被引量：11

3

作者 杜嘉星 孙义 +5 位作者 向波 陈建军 秦彧 侯秀敏 于红妍 宜树华 《草业科学》 CAS CSCD 2019年第4期1074-1083,I0002,共11页

高原鼠兔(Ochotona curzoniae)在黄河源区广泛分布,是高寒草地生态系统中的关键种。认识高原鼠兔的空间分布及其影响因子对了解草地退化的原因、"黑土滩"的形成和高原鼠兔对栖息地的选择以及在生态系统中的作用有重要意义。... 高原鼠兔(Ochotona curzoniae)在黄河源区广泛分布,是高寒草地生态系统中的关键种。认识高原鼠兔的空间分布及其影响因子对了解草地退化的原因、"黑土滩"的形成和高原鼠兔对栖息地的选择以及在生态系统中的作用有重要意义。本研究使用无人机获取黄河源区的高原鼠兔存在/不存在数据,使用BIOMOD物种分布集成预测平台,用10种不同模型对该区域的高原鼠兔潜在分布进行预测。结果表明,应用BIOMOD能降低预测的不确定性和误差,提高预测的精度,随机森林(random forest, RF)能较好地预测该区域的高原鼠兔分布。本研究为预测高原鼠兔潜在分布提供了新的方法,研究结果可为当地高原鼠兔防治提供相应的科学依据。 展开更多

关键词 高寒草地 草地退化 无人机 物种分布模型 biomod 随机森林

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基于组合物种分布模型的黄河源区鹅绒委陵菜适宜生境及其对气候变化的响应 被引量：8

4

作者 张欣雨 朱泽群 +8 位作者 袁雅欣 姬文翔 宋岑雨 陆洪伟 赵茜蕾 卞庆瑶 孙子墨 宜树华 孙义 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期254-267,共14页

鹅绒委陵菜(Potentilla anserina)是多年生蔷薇科草本植物,在黄河源区分布较为广泛,是青藏高原主要的野生经济植物之一。目前鲜有在区域尺度上刻画鹅绒委陵菜空间分布格局的研究,没有适宜的大范围开展高精度观测方法是主要限制因素之一... 鹅绒委陵菜(Potentilla anserina)是多年生蔷薇科草本植物,在黄河源区分布较为广泛,是青藏高原主要的野生经济植物之一。目前鲜有在区域尺度上刻画鹅绒委陵菜空间分布格局的研究,没有适宜的大范围开展高精度观测方法是主要限制因素之一。本研究利用无人机路径规划和信息提取系统(FragMAP)于2018–2020年在黄河源区获取了>3000个观测样本(航拍照片)。基于高分辨率(0.55 mm)航拍照片,人工识别鹅绒委陵菜出现与否作为基础数据(即0,1型数据集),利用BIOMOD物种分布集成预测平台,结合气候、地形、土壤3类环境数据预测黄河源区鹅绒委陵菜的分布特征,并在气候变化背景下模拟2050年和2070年源区内鹅绒委陵菜的空间分布特征。结果表明:1)组合物种分布模型能降低预测的不确定性,较好地模拟黄河源区鹅绒委陵菜的空间分布特征。2)鹅绒委陵菜在黄河源区的潜在分布主要集中在中部和东南部,影响其空间分布的主要因子为年降水量和海拔高度。3)在未来气候情景下,黄河源区鹅绒委陵菜极适宜生境面积呈先增加后降低的趋势。本研究在区域尺度上刻画了鹅绒委陵菜分布特征,为高寒草地经济作物的合理管理与利用、特色农业经济发展以及黄河源区生态恢复和高寒地区的生态建设提供必要的理论和实践基础。 展开更多

关键词 FragMAP 无人机 鹅绒委陵菜 biomod 组合模型

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基于无人机采集样本预测黄河源区小花草玉梅的时空分布

5

作者 赵茜蕾 斗尕杰布 +8 位作者 沈羽彤 扎西加措 孙子墨 唐凤霓 廖雅芳 刘坤博 党泽加 斗拉加 孙义 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期308-321,共14页

小花草玉梅(Anemone rivularis)是多年生草本植物,在黄河源区分布较为广泛,其过量分布会限制当地草地畜牧业发展,并导致生态系统稳定性和服务功能下降。目前尚没有在区域尺度上开展小花草玉梅时空分布的研究,基础分布数据集和高效、高... 小花草玉梅(Anemone rivularis)是多年生草本植物,在黄河源区分布较为广泛,其过量分布会限制当地草地畜牧业发展,并导致生态系统稳定性和服务功能下降。目前尚没有在区域尺度上开展小花草玉梅时空分布的研究,基础分布数据集和高效、高精度观测方法的缺失是主要限制因素之一。本研究利用自主开发的无人机路径规划和信息提取系统(FragMAP)在黄河源区布设404个样本采集点并获取小花草玉梅的基础分布数据,通过物种分布集成预测平台(BIOMOD)明晰关键的影响因素,模拟小花草玉梅的潜在分布,并预测未来不同气候情景下其在黄河源区的空间分布规律以及适宜生境的变化。结果表明:1)黄河源区小花草玉梅的空间分布主要受年均降水、土壤pH和年均温度等因素的影响。2)在当前气候情景下小花草玉梅主要分布于黄河源区东南部的红原县、阿坝县、玛曲县和若尔盖县等区域。3)在未来气候情景下,小花草玉梅的空间分布随着未来气温的升高呈扩大趋势。本研究首次在黄河源区刻画了小花草玉梅的分布特征并预测其在不同气候情境下的演变趋势,为高寒草地开展毒杂草的适时防控、合理管理和利用提供技术支持。 展开更多

关键词 无人机 biomod 毒杂草 物种分布模型 FragMAP 适宜生境 组合模型

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以兴趣培养为导向,以国际高水平学术竞赛为依托的“拔尖创新人才”培养模式的研究 被引量：6

6

作者 刘成柏 吴永革 +2 位作者 陈妍 关树文 侯阿澧 《高校生物学教学研究（电子版）》 2019年第2期58-61,共4页

随着高校教学改革的不断深化,传统的生物学在课堂教学及实践教学等教学方式上已暴露出越来越多的弊端,难以满足学生科研兴趣的激发及创新思维和探索精神的培养,对于大学生科研实践能力的提高不利。吉林大学生命科学学院构建了以科研兴... 随着高校教学改革的不断深化,传统的生物学在课堂教学及实践教学等教学方式上已暴露出越来越多的弊端,难以满足学生科研兴趣的激发及创新思维和探索精神的培养,对于大学生科研实践能力的提高不利。吉林大学生命科学学院构建了以科研兴趣培养为导向,以开展国际高水平学术竞赛为依托,通过自主研究性的教学模式、自主创新性的教学方法、自主开展系统性科研训练等方面的探索与实践,并构建了“拔尖创新人才”培养模式,同时努力将iGEM、BIOMOD等国际竞赛打造成为拔尖人才国际化培养的有效平台。 展开更多

关键词 拔尖创新人才 iGEM biomod 科研兴趣培养 自主创新培养模式

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使用大熊猫数据评估Biomod2和MaxEnt分布预测模型的表现 被引量：41

7

作者 罗玫 王昊 吕植 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第12期4001-4006,共6页

物种分布模型是物种研究和保护者常用的工具.不同模型的预测结果可能相差很大,对研究者选择模型造成一定的难度.本研究使用大熊猫的实际分布数据评估了两种常见物种分布模型Biomod2和最大熵模型(MaxEnt)的表现,运用ROC曲线下面积(area u... 物种分布模型是物种研究和保护者常用的工具.不同模型的预测结果可能相差很大,对研究者选择模型造成一定的难度.本研究使用大熊猫的实际分布数据评估了两种常见物种分布模型Biomod2和最大熵模型(MaxEnt)的表现,运用ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)、真实技巧统计值(true skill statistics,TSS)、KAPPA统计量3种指标综合评估了两种模型预测结果的准确度.结果表明:当使用的物种分布数据和模拟重复次数足够多的时候,两者都能够给出相当准确的预测.相对于MaxEnt,Biomod2的预测准确度更高,尤其是在物种分布点稀少的情况下.然而,Biomod2使用难度较大,运行时间较长,数据处理能力有限.研究者应基于对预测结果的误差要求来选择模型.在误差要求明确且两个模型都能满足误差要求时,建议使用MaxEnt,否则应优先考虑使用Biomod2. 展开更多

关键词 物种分布模型 biomod2 MAXENT 大熊猫

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用组合模型综合比较的方法分析气候变化对朱鹮潜在生境的影响 被引量：37

8

作者 翟天庆 李欣海 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期2361-2370,共10页

气候变化的不确定性和物种与环境关系的不确定性使气候变化生物学的研究充满变数。为了降低不确定性,人们开始用组合模型综合比较的方法研究物种对气候变化的响应。以朱鹮(Nipponia nippon)为研究对象,介绍组合模型综合比较方法的特点... 气候变化的不确定性和物种与环境关系的不确定性使气候变化生物学的研究充满变数。为了降低不确定性,人们开始用组合模型综合比较的方法研究物种对气候变化的响应。以朱鹮(Nipponia nippon)为研究对象,介绍组合模型综合比较方法的特点。朱鹮曾经高度濒危,目前种群大小在迅速恢复中;然而其分布区依旧狭小,气候变化可能是朱鹮面临的新威胁。应用BIOMOD模型中的9种模型,选择了每年的最低温和最高温、温度的季节性变异、每年的总降水量和降水的季节性变异共5个气候因子,依据WorldClim气候数据的CGCM2气候模型的A2a排放情形,计算了朱鹮当前(1950—2000年)的适宜生境和2020年、2050年、2080年3个阶段的潜在生境范围。结果表明朱鹮潜在生境将逐渐北移,生境中心脱离现在的保护区。因此,制定朱鹮的长期保护策略是必要的。9个模型在预测结果上、变量权重上和拟合优度的指标上都有差异,反映了模型本身的不确定性。气候变化的生物学效应比较复杂,应用多个模型进行综合比较,可以尽可能地减少模型所导致的误差。 展开更多

关键词 气候变化 朱鹮 组合模型 生境偏移 biomod模型

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人参潜在地理分布以及气候变化对其影响预测 被引量：40

9

作者 赵泽芳 卫海燕 +1 位作者 郭彦龙 顾蔚 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期3607-3615,共9页

本文以人参为研究对象,基于人参分布点位数据和22个气候环境因子数据,运用BioMod2平台10个物种分布模型对当前我国东北地区人参潜在生境分布进行预测.以受试者工作特征曲线(ROC)为权重集成10个模型的模拟结果,构建组合模型,并基于该模... 本文以人参为研究对象,基于人参分布点位数据和22个气候环境因子数据,运用BioMod2平台10个物种分布模型对当前我国东北地区人参潜在生境分布进行预测.以受试者工作特征曲线(ROC)为权重集成10个模型的模拟结果,构建组合模型,并基于该模型预测了IPCC第五次评估报告中RCP 8.5、RCP 6.0、RCP 4.5和RCP 2.6等4种排放情景下21世纪50和70年代人参潜在分布范围.结果表明:在基准气候条件下,人参适宜生境面积占研究区总面积的10.4%,此类地区主要分布于研究区东北部长白山地区以及小兴安岭东南部区域的森林地带.在未来不同的排放情景下研究区人参的适宜生境变化显著,总体上分布范围将有一定程度的缩小.同时参与建模的10种模型在统计学精度、预测结果以及变量权重上都有差异.模型精度计算结果表明,MAXENT模拟效果最好,GAM、RF和ANN次之,SRE模拟精度最低.本文构建的组合模型在一定程度上提高了现有物种分布模型的预测精度,从而使模拟效果更优. 展开更多

关键词 气候变化 BIO Mod2 组合模型 人参

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气候变化对我国特有濒危物种水杉野生种群分布的影响 被引量：20

10

作者 朱莹莹 徐晓婷 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期1629-1636,共8页

孑遗植物水杉(Metasequoia glyptostroboides)为我国特有裸子植物,国家一级保护植物。水杉野生种群仅在湖南、湖北和重庆交界之处分布。目前,虽然水杉在全球广泛栽培,但栽培水杉不能自然更新,而野生种群也存在自然更新不良、种群衰退现... 孑遗植物水杉(Metasequoia glyptostroboides)为我国特有裸子植物,国家一级保护植物。水杉野生种群仅在湖南、湖北和重庆交界之处分布。目前,虽然水杉在全球广泛栽培,但栽培水杉不能自然更新,而野生种群也存在自然更新不良、种群衰退现象。在未来气候变化条件下,水杉种群可能面临更加严峻的灭绝风险。因此,本研究根据文献和标本记载的水杉野生分布记录评估了未来气候变化对野生水杉分布的影响。采用多种物种分布模型,估计了当前气候条件下野生水杉的潜在分布分区,同时采用3种大气环流模型(CCSM4、CNRM-CM5、HadGEM2-ES)模拟的气候数据,估计了两种典型温室气体浓度增加情景下未来(2070年)野生水杉的适宜分布区。结果表明,当前气候条件下,水杉野生种群的潜在分布区与实际分布区一致,集中在湖北、重庆、湖南和贵州的交界处。到2070年,在不同的温室气体浓度增加情景下,我国水杉的潜在分布区有向现分布区的西北部迁移的倾向,但生境适宜度非常低(<0.5),成功迁移可能性极低。而现有野生分布区的适宜度也明显下降,潜在分布区消失殆尽,水杉原始种群保护工作可能面临严峻考验。 展开更多

关键词 水杉 物种分布模型 气候变化 biomod2

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基于组合物种分布模型(Ensemble Model)的厚朴适宜生境分布模拟 被引量：15

11

作者 朱妮 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2019年第4期481-489,共9页

【目的】建立组合物种分布模型,模拟厚朴在我国南方的分布格局,探讨影响其生长环境因子的阈值,为厚朴的人工种植,野生资源保护等提供理论依据。【方法】基于公开发表的文献中精确的厚朴分布数据与23个环境因子变量,利用BIOMOD2建模平台... 【目的】建立组合物种分布模型,模拟厚朴在我国南方的分布格局,探讨影响其生长环境因子的阈值,为厚朴的人工种植,野生资源保护等提供理论依据。【方法】基于公开发表的文献中精确的厚朴分布数据与23个环境因子变量,利用BIOMOD2建模平台中的9个模型算法构建组合物种分布模型模拟厚朴的适宜生境分布。【结果】①厚朴在我国南方适宜生境面积为0.53×10^6 km^2,主要分布在四川东部、陕西南部、重庆东部、湖北西部、贵州、福建、江西、湖南等地区。②在组成组合物种分布模型的9个单模型算法中,推进式回归树模型(GBM)和随机森林(RF)的模拟效果最好,表面分室模型(SRE)与分类树分析模型(CTA)结果较差。组合物种分布模型的TSS为0.905,ROC值为0.975,说明组合模型能够在一定程度上提高模型的精度。【结论】厚朴在我国南方分布较为广泛,但是考虑植被类型限制时,其生境较为破碎,应该在其适宜生境区域加强物种保护。 展开更多

关键词 厚朴 物种分布模型 biomod2 组合物种分布模型

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薄片青冈潜在适生区及气候变化对其分布的影响 被引量：13

12

作者 郭恺琦 姜小龙 徐刚标 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第8期2563-2574,共12页

气候快速变化会影响森林的分布和群落组成。了解森林优势种的适宜分布范围及气候变化对其分布的影响,是进行森林资源保护和利用的基础。本研究基于物种分布模型,分析特有分布于东喜马拉雅的半常绿阔叶林重要组成树种——薄片青冈(Quercu... 气候快速变化会影响森林的分布和群落组成。了解森林优势种的适宜分布范围及气候变化对其分布的影响,是进行森林资源保护和利用的基础。本研究基于物种分布模型,分析特有分布于东喜马拉雅的半常绿阔叶林重要组成树种——薄片青冈(Quercus lamellosa Sm.)的分布动态。收集了54个薄片青冈现实分布点及8个与温度和降水有关的环境变量。采用5种物种分布模型(最大熵模型、人工神经网络、广义线性模型、广义加性模型和随机森林)构建组合模型模拟薄片青冈过去(末次盛冰期)、当前及未来(2041—2060、2081—2100)的潜在适宜分布区。使用R语言和ArcGIS计算物种分布面积和质心随时间的变化。结果表明:5种模型中,随机森林模拟效果最好,广义加性模型评分最低;组合模型的真实技巧统计值(TSS)和受试者工作特征曲线下面积(AUC)分别为0.987和0.999,说明模拟结果较好;年均温和温度季节性为影响薄片青冈潜在分布的主导环境因子;当前薄片青冈主要分布于东喜马拉雅-横断山脉区域;薄片青冈当前时期分布面积比末次盛冰期时少了约1/3;随着未来气候变化,薄片青冈适生区面积进一步减少;薄片青冈适生区的质心随着气候变暖而向北迁移,迁移速度与变暖程度呈正相关。本研究整合多模型的分析结果,获得了可靠的薄片青冈潜在分布范围;同时,通过阐述薄片青冈适生区的分布动态,为气候变化背景下半常绿阔叶林生态稳定的维护以及生物多样性保护提供参考资料。 展开更多

关键词 薄片青冈 biomod2 组合模型 适生区 质心

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基于Biomod2组合模型的中国野生芍药Paeonia lactiflora适宜生境分布 被引量：11

13

作者 毕雅琼 张明旭 +2 位作者 陈元 王爱祥 李旻辉 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期376-384,共9页

芍药Paeonia lactiflora是我国重要的药用资源,为了加强对芍药的野生资源保护和适宜性引种栽培,该研究基于野生芍药在中国的98个分布信息和20个当前环境因子数据,利用Biomod2平台和ArcGIS空间分析方法,分析了当前气候条件下野生芍药的... 芍药Paeonia lactiflora是我国重要的药用资源,为了加强对芍药的野生资源保护和适宜性引种栽培,该研究基于野生芍药在中国的98个分布信息和20个当前环境因子数据,利用Biomod2平台和ArcGIS空间分析方法,分析了当前气候条件下野生芍药的潜在适宜生境分布区,依据环境因子相关性和重要性筛选出影响野生芍药潜在适宜生境的主要环境因子。继而基于BCC-CSM2-MR全球气候模型,预测在SSP1-2.6、SSP2-4.5、SSP3-7.0、SSP5-8.5气候情景下,未来2021—2100年野生芍药的潜在适宜生境分布范围及中心变化。结果表明:通过集成表现较好的GBM、GLM、MaxEnt、RF模型所形成的组合模型,其TSS和AUC分别为0.85、0.95,较单一模型都有显著提高,可有效提高模型精度。20个环境因子中,年均温、昼夜温差月均值、温度的季节性、最暖季平均温、最湿月降雨量、降雨的季节性、最干季降雨量和海拔是影响适宜区分布的主要因子。目前野生芍药潜在适宜区分布在内蒙古、黑龙江、吉林、辽宁、河北、北京、陕西、山西、山东、甘肃、新疆、西藏、宁夏等省份,集中于内蒙古东北部、黑龙江中部、吉林北部。在未来气候情景下,野生芍药高适宜区持续缩减,潜在适宜生境主要呈现不同程度的丧失情况,但在SSP5-8.5条件下,到2061—2100年阶段,野生芍药低适宜区在中国西部的新疆、西藏、青海等省份的高原和山地地区出现部分新增。野生芍药分布中心呈现先向东北后向西南迁移的趋势,总适宜区分布范围相对稳定,保持在高纬度地带。该研究确定了野生芍药的潜在适宜生境分布变化,对未来加强生境保护与规范种植生产具有重要意义。 展开更多

关键词 野生芍药 biomod2平台 组合模型 适宜生境 气候变化

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延河流域典型物种分布预测模型比较研究 被引量：9

14

作者 曹剑侠 温仲明 李锐 《水土保持通报》 CSCD 北大核心 2010年第3期134-139,共6页

物种分布预测一直以来都是生态学研究的重要内容之一。应用生态学的发展为物种分布预测提供了众多强有力的模型,在推进物种分布预测进展的同时,也增加了合适模型选择的难度。评价和比较不同模型的预测效果,对于模型的选择和应用具有非... 物种分布预测一直以来都是生态学研究的重要内容之一。应用生态学的发展为物种分布预测提供了众多强有力的模型,在推进物种分布预测进展的同时,也增加了合适模型选择的难度。评价和比较不同模型的预测效果,对于模型的选择和应用具有非常重要的意义。以黄土丘陵区延河流域为研究区,采用R语言和BIOMOD程序包为平台,选择人工神经网络(artificial neural networks,ANN)等9个较常用的物种分布模型,比较它们在物种分布预测精度上的差异,为物种分布预测模型的选择提供依据,也为进一步预测未来气候变化情景下物种空间分布的变化奠定基础。研究结果表明,不同模型对不同物种的模拟精度差异明显。根据Kappa,TSS和Roc评价方法,9个模型对百里香(Thymus mongolicus)分布的预测精度最高;对铁杆蒿(Artemisia gmelinii)分布的模拟精度最差;而对其余物种分布的模拟精度均比较理想,其中以随机树RF模型最好。 展开更多

关键词 物种分布预测 R—biomod 最优模型

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玛曲县高原鼠兔地理分布预测及其对气候变化的潜在响应 被引量：9

15

作者 花蕊 周睿 +4 位作者 包达尔罕 张飞宇 周富斐 唐庄生 花立民 《草原与草坪》 CAS CSCD 2020年第3期1-8,共8页

高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是高寒草地生态系统中的关键物种,对于维系草地生物多样性有着重要的作用。认识高原鼠兔的空间分布及其影响因子,对了解其栖息地的选择和在生态系统中的作用有重要意义。利用甘肃省玛曲县当前高原鼠兔90个... 高原鼠兔(Ochotona curzoniae)是高寒草地生态系统中的关键物种,对于维系草地生物多样性有着重要的作用。认识高原鼠兔的空间分布及其影响因子,对了解其栖息地的选择和在生态系统中的作用有重要意义。利用甘肃省玛曲县当前高原鼠兔90个分布点数据和27个环境因子数据以及BIOMOD2软件包中的10个物种分布模型,预测了当前和RCP(Representative Concentration Pathways)2.6、RCP4.5、RCP6.0和RCP8.5等4种排放情景下未来2050s和2070s时间段玛曲县高原鼠兔潜在分布范围。结果发现,在10个模型中,随机森林(Random Forest,RF)表现最佳,表面分布区分室模型(Surface Range Envelop,SRE)最差;在气候因子中最湿季平均气温(Bio8因子)重要值最高,对高原鼠兔栖息地的选择影响最为显著。 展开更多

关键词 高原鼠兔 biomod2 物种分布模型 气候变化

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基于组合模型的丹参潜在地理分布研究 被引量：9

16

作者 高瑜 李佳颖 +1 位作者 刘宇哲 孟繁蕴 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期571-579,共9页

利用丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)的地理分布数据和28个环境变量,基于Biomod2平台利用9个物种分布模型,模拟丹参在我国的空间分布,统计其适生区面积,并确定影响丹参分布的环境变量。结果显示:我国中部、东部的大部分地区适宜丹参生... 利用丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)的地理分布数据和28个环境变量,基于Biomod2平台利用9个物种分布模型,模拟丹参在我国的空间分布,统计其适生区面积,并确定影响丹参分布的环境变量。结果显示:我国中部、东部的大部分地区适宜丹参生长,其中山东、湖北、陕西、安徽等地为丹参最适宜分布区;丹参在我国的总适生区面积为2.44×10^(7) km^(2),其中湖南省的适生区面积最高,其次是四川省和湖北省;在当前环境条件下,温度与潜在蒸散量等是影响丹参分布的主导环境因子;推进式回归树模型GBM和随机森林模型RF在9个模型中表现最好。研究结果表明湖北省北部、河南省南部和安徽省的中南部最适宜种植丹参。 展开更多

关键词 组合模型 丹参 biomod2平台 植物保护

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连翘潜在地理分布预测模型的比较 被引量：8

17

作者 杨洋 卫海燕 +4 位作者 王丹 尚忠慧 毛亚娟 杨贺雨 顾蔚 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期2562-2568,共7页

连翘（Forsythia suspense （Thunb.） Vahl.）为大宗药材，也是常见观赏植物和水土保持植物。本文基于连翘的119个地理分布点数据和气候、土壤、地形共12个指标，利用BioMod2程序包提供的广义线性模型（GLM）、随机森林模型（RF）、... 连翘（Forsythia suspense （Thunb.） Vahl.）为大宗药材，也是常见观赏植物和水土保持植物。本文基于连翘的119个地理分布点数据和气候、土壤、地形共12个指标，利用BioMod2程序包提供的广义线性模型（GLM）、随机森林模型（RF）、推进式回归树模型（GBM/BRT）及人工神经网络模型（ANN）对连翘的潜在地理分布区进行预测。结果表明：4种模型预测均成功，效果最好的是RF模型，AUC（0.95）、TSS（0.81）、KAPPA（0.68）值均较高，温度对连翘生长的敏感程度高于降水，连翘的潜在地理分布区位于陕西、山西、湖北、河南、辽宁的山地与河流沿岸区域。综合4种模型得出，连翘适宜生境为海拔250～2200 m，年均温12.1～17.3 ℃、年降水量400～1000 mm。研究结果为连翘的人工栽培提供指导。 展开更多

关键词 连翘 物种分布模型 biomod2 潜在地理分布

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基于组合模型预测蛇足石杉在中国的适生区 被引量：6

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作者 陈勤 孔梦盈 +1 位作者 孙奇芳 管毕财 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期492-501,共10页

蛇足石杉是国家二级重点保护野生植物,目前面临生物资源骤减的威胁。该研究基于蛇足石杉在中国的分布数据和气候数据构建组合模型,预测蛇足石杉当前和未来(2070)气候情景下在中国的适生区,通过ERDAS和ArcGIS计算适生区面积及质心变化,... 蛇足石杉是国家二级重点保护野生植物,目前面临生物资源骤减的威胁。该研究基于蛇足石杉在中国的分布数据和气候数据构建组合模型,预测蛇足石杉当前和未来(2070)气候情景下在中国的适生区,通过ERDAS和ArcGIS计算适生区面积及质心变化,探究气候变化对蛇足石杉适生区的影响,为蛇足石杉的保护提供理论依据。结果显示:(1)组合模型AUC值大于0.9,预测结果极好。(2)影响蛇足石杉适生区的主要生物气候变量是最湿月降水量、温度季节性、最冷季均温和最暖月最高温。(3)蛇足石杉当前总适生面积226.99×10^(4) km^(2),中、高适生区面积154.51×10^(4) km^(2),质心均位于湖南省西部。(4)蛇足石杉未来总适生面积变化不大,中、高适生区面积剧烈收缩,在RCP2.6、RCP4.5、RCP6.0及RCP8.5情景下分别净收缩14.34%、23.31%、31.63%和47.08%,总适生区质心和中、高适生区质心均向西北方向转移。研究表明,蛇足石杉中、高适生区受气候变化影响很大,未来随着排放水平升高将逐渐转变为低适生区和非适生区。 展开更多

关键词 蛇足石杉 biomod2 物种分布模型 适生区 质心变化

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基于多模型集合预测尖萼红山茶物种分布 被引量：5

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作者 陈思斯 刘想 +1 位作者 童鑫玥 管毕财 《生态科学》 CSCD 2020年第2期58-66,共9页

气候是影响生物多样性和物种分布的一个重要因素,近年来由于温室气体的大规模排放,气候正在快速的发生变化,对植物的分布影响巨大。研究采用山茶科山茶属尖萼红山茶(Camellia edithae Hance.)作为研究对象,通过实地考察和网上查阅获取... 气候是影响生物多样性和物种分布的一个重要因素,近年来由于温室气体的大规模排放,气候正在快速的发生变化,对植物的分布影响巨大。研究采用山茶科山茶属尖萼红山茶(Camellia edithae Hance.)作为研究对象,通过实地考察和网上查阅获取其分布数据,从世界气候网站和兰州寒区旱区科学数据中心获取环境变量,结合R语言、Erdas和ArcGIS等软件对其当前和将来(2070)的分布区进行模拟并得出置信度和计算其面积变化和质心变化。研究结果表明,AUC值均大于0.9,属于非常好的预测,影响其分布的主要因子是Bio01(年平均温度)、Bio04(温度季节变化)、Bio15(降水量变异系数)和Bio03(昼夜温差与年温差比值)。在四种二氧化碳排放情景下(RCP2.6、RCP4.5、RCP6.0及RCP8.5)所进行的预测均表明尖萼红山茶的分布面积均有收缩,且收缩面积随着碳排放程度的加剧而增加,且最大收缩面积占总面积的80%。通过对该物种质心变化的预测中发现,其总体呈现向北部迁移的趋势。通过本次的预测发现气候变化在未来可能对尖萼红山茶的生存威胁很大。 展开更多

关键词 尖萼红山茶 biomod2 物种分布模型 面积变化 质心变化

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基于Biomod2组合模型的我国山杨潜在分布区研究 被引量：1

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作者 高明龙 铁牛 +6 位作者 张晨 李凤滋 乌雅瀚 罗奇辉 王子瑞 刘磊 萨如拉 《南京林业大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期247-255,共9页

【目的】通过探究环境变化对山杨(Populus davidiana)分布的影响,为山杨资源的保护和开发提供理论支撑。【方法】根据山杨的134条地理分布数据,结合18个气候、土壤及地形因子,基于Biomod2软件包构建组合模型,模拟我国山杨潜在分布区在未... 【目的】通过探究环境变化对山杨(Populus davidiana)分布的影响,为山杨资源的保护和开发提供理论支撑。【方法】根据山杨的134条地理分布数据,结合18个气候、土壤及地形因子,基于Biomod2软件包构建组合模型,模拟我国山杨潜在分布区在未来3种气候条件模式下的空间分布格局变化,并确定影响山杨分布的主要环境变量。【结果】我国山杨当前潜在适生分布区主要位于400 mm等降水线两侧较高纬度或较高海拔地区,总面积约为1560340.9 km^(2),约占我国陆地面积的16.2%,其中大兴安岭、长白山、太行山、秦岭、祁连山南麓、横断山、云贵高原等地区为山杨高度适生区;在未来气候条件下,山杨适生区整体呈向西南方向收缩趋势,生境适宜度总体呈下降趋势;影响山杨分布主要环境变量为最热月最高气温、年降水量和海拔;基于5个最优单一模型构建的组合模型比单一模型对山杨适生区预测结果更好,训练集平均受试者工作特征曲线下面积和真实技巧统计值分布为0.91和0.73,预测准确度较高。【结论】我国山杨空间分布格局主要受水热条件影响,海拔也是影响山杨分布的重要因素。在未来气候条件下,山杨分布区面积将随气候变暖的程度逐渐减少。以山杨作为用材林和生态公益林树种进行造林时,造林地点应选择未来生境适宜度变化不大的地区,以降低未来由于气候变化造成的损失。 展开更多

关键词 山杨 biomod2软件包 组合模型 潜在分布区 气候变暖

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