期刊文献+
共找到5篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
中国部分鸡种B-G基因SNP和Indel 被引量:5
1
作者 吴允 毕榆林 +8 位作者 张扬 郭晓敏 李志腾 万方 朱鹏飞 徐璐 常国斌 徐琪 陈国宏 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2016年第8期1338-1342,共5页
鸡的MHC基因家族中B-G基因与鸡抗病性有关,通过研究与抗病有关的B-G基因的多态性可以从根本上提高鸡抵抗疾病的能力,进而为抗病育种奠定基础。试验对25个鸡种基因组DNA进行目标捕获测序,以NCBI中Gallus gallus的B-G基因序列为参考,利用M... 鸡的MHC基因家族中B-G基因与鸡抗病性有关,通过研究与抗病有关的B-G基因的多态性可以从根本上提高鸡抵抗疾病的能力,进而为抗病育种奠定基础。试验对25个鸡种基因组DNA进行目标捕获测序,以NCBI中Gallus gallus的B-G基因序列为参考,利用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对,分析B-G基因外显子和内含子中的SNPs和Indels以及氨基酸的变化,最后制作进化树。结果表明,25个鸡种中外显子存在8个SNPs、19个Indels,内含子有67个SNPs、327个Indels;同时氨基酸序列也呈现出相应的多态性,中国地方鸡种也表现出丰富的遗传多样性。来航鸡、仙居鸡、隐性白羽鸡的B-G基因存在丰富的多态性;来航鸡在进化树上单独为一类,藏鸡、文昌鸡由于地理位置因素也分别为单独一类;现代肉鸡中罗斯与隐性白羽鸡聚为一类;不同类型的中国地方鸡种间同源性较小。中国地方鸡种B-G基因存在多源性进化以及丰富的遗传多样性,进而产生抗病性差异。 展开更多
关键词 b-g基因 SNPS INDELS 进化树
下载PDF
中国部分地方鸡种MHC B-G基因第二外显子的遗传多态性 被引量:3
2
作者 徐日福 李奎 +5 位作者 陈国宏 强巴央宗 张玉波 林丽 樊斌 刘榜 《动物学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第1期160-169,共10页
根据鸡主要组织相容性复合体BG基因序列设计特异性引物,在9个中国地方鸡种和1个国外引进鸡种基因组中扩增了包括其第一内含子和第二外显子在内、长度为401bp的DNA片段。经PCRSSCP分型筛选后,对该片段的核苷酸序列进行克隆测序和直接PCR... 根据鸡主要组织相容性复合体BG基因序列设计特异性引物,在9个中国地方鸡种和1个国外引进鸡种基因组中扩增了包括其第一内含子和第二外显子在内、长度为401bp的DNA片段。经PCRSSCP分型筛选后,对该片段的核苷酸序列进行克隆测序和直接PCR测序及比对分析,发现了31个MHCBG新等位基因;各等位基因主型所含有的亚型数及其在不同品种间的分布极不均衡。第二外显子核苷酸序列和其所编码的MHCBG抗原类IgV结构域氨基酸序列比较表明,在中国地方鸡种BG基因第二外显子的207bp序列中有37个多态性变异位点,其中简约性信息位点29个,单个位点的变异8个;等位基因间的遗传变异范围0.0013-0.1433;各变异位点的核苷酸变异指数0.206-1.462。该编码区核苷酸的异义替换率为9.26%±1.92%,高于同义替换率2.34%±0.90%。所估计的核苷酸转换数和颠换数随着遗传距离的增加而逐渐增加,当核苷酸转换数和颠换数达到平衡后,该片段核苷酸转换数的增加幅度逐渐高于颠换数。在其所编码的类IgV结构域氨基酸序列中,多态变异位点有22个,其中简约性信息位点6个,单变异位点16个;所估测的等电点为8.45,疏水性氨基酸占40.3%,亲水性氨基酸占29.9%;该序列具有明显的疏水性特点。等位基因间的系统发生分析表明,31个BG等位基因分为两个群,相同主型的等位基因首先聚类。 展开更多
关键词 中国 地方鸡种 bg基因 等位基因 遗传多态性
下载PDF
鸡MHC基因B-G区域的生物信息学分析 被引量:2
3
作者 余春林 徐亚欧 +3 位作者 杜华锐 李小成 辅宏璞 蒋小松 《四川畜牧兽医》 2010年第5期26-28,共3页
根据鸡主要组织相容性复合体(MHC)基因B-G区域外显子2的序列设计引物,采用直接测序的方法对该区域(207bp)进行序列测定,并对所获得核苷酸序列进行生物信息学分析。结果显示:该片段中碱基T、C、A、G的平均含量分别为22.0%、19.8%、24.8%... 根据鸡主要组织相容性复合体(MHC)基因B-G区域外显子2的序列设计引物,采用直接测序的方法对该区域(207bp)进行序列测定,并对所获得核苷酸序列进行生物信息学分析。结果显示:该片段中碱基T、C、A、G的平均含量分别为22.0%、19.8%、24.8%、33.4%,C+G含量为53.2%,T+A含量为46.8%,C+G含量高于T+A含量;同时检测到27个核苷酸变异位点,导致14个氨基酸位点的变异;16条序列进行单倍型构建获得16种单倍型,单倍型多样度达到了高的多样水平。试验结果表明,鸡MHC-B-F基因外显子2的序列表现出了高度的多态性,而且其序列的多态性更多地表现在氨基酸水平上。 展开更多
关键词 MHC bg基因 序列分析
下载PDF
Streptomyces sp.Tü 4128中新型抗生素bagremycins抗性基因bagJ的研究
4
作者 张玉琛 吴海珍 +3 位作者 鞠诚 祁双双 叶江 张惠展 《华东理工大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2017年第2期184-192,共9页
通过框内敲除鉴定了链霉菌Streptomyces sp.Tü4128中基因bagJ的功能。HPLC结果表明,敲除基因bagJ导致抗生素生产水平大幅降低;回补菌株恢复了抗生素的生产;过表达菌株大幅提高了抗生素的产量,证明基因bagJ在新型抗生素bagremycins... 通过框内敲除鉴定了链霉菌Streptomyces sp.Tü4128中基因bagJ的功能。HPLC结果表明,敲除基因bagJ导致抗生素生产水平大幅降低;回补菌株恢复了抗生素的生产;过表达菌株大幅提高了抗生素的产量,证明基因bagJ在新型抗生素bagremycins的生物合成中必不可少。抑菌圈实验表明基因bagJ敲除菌株较野生菌株对bagremycins更加敏感;BagJ在Streptomyces lividans TK64中异源表达后使该菌株对bagremycins的耐受性增强,证明bagJ是新型抗生素bagremycins的抗性基因。扫描电镜的结果证明了BagJ异源表达后导致Streptomyces TK64的菌丝形态发生了改变。其他抗生素的敏感性实验表明,BagJ可能是一个逆向转运蛋白。 展开更多
关键词 bagremycins STREPTOMYCES sp.Tü 4128 bagJ MFS家族 抗性基因
下载PDF
不同三磷酸腺苷结合盒转运体B1 G2677T基因型急性脑梗死患者应用阿托伐他汀的降脂疗效 被引量:3
5
作者 徐炳欣 李青华 +2 位作者 田英娜 赵艳 许自强 《中华行为医学与脑科学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期308-315,共8页
目的观察不同三磷酸腺苷结合盒转运体B1(ATP-binding cassette subfamily B member 1,ABCB1)G2677T基因型急性脑梗死患者应用阿托伐他汀的降脂疗效,为急性脑梗死患者个体化应用阿托伐他汀提供临床研究证据。方法自2021年3—12月连续纳... 目的观察不同三磷酸腺苷结合盒转运体B1(ATP-binding cassette subfamily B member 1,ABCB1)G2677T基因型急性脑梗死患者应用阿托伐他汀的降脂疗效,为急性脑梗死患者个体化应用阿托伐他汀提供临床研究证据。方法自2021年3—12月连续纳入许昌市中心医院神经内科收治的急性脑梗死患者131例,采用荧光染色原位杂交技术检测患者ABCB1 G2677T(rs2032582)基因多态性,并根据检测结果将患者分为GG、GT和TT共3组。3组患者均给予阿托伐他汀(20 mg/d)降脂治疗,记录治疗前及治疗2个月后3组患者血清高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)水平并分析其变化,记录3组患者药物不良反应发生情况。以血清LDL-C水平<1.8 mmol/L为降脂治疗有效,二元Logistic回归分析探索阿托伐他汀降脂疗效的影响因素。统计软件为SPSS 25.0。结果GG、GT和TT 3组分别有50例(38.17%)、49例(37.40%)和32例(24.43%)患者。治疗后GG、GT、TT 3组患者血清TC水平分别为(3.47±0.70)mmol/L、(3.59±1.09)mmol/L和(3.48±1.02)mmol/L,低于治疗前的(4.27±0.99)mmol/L、(4.02±0.98)mmol/L和(4.03±1.31)mmol/L,均差异有统计学意义(t=7.652,3.092,5.593,均P<0.01)。治疗后GG、GT、TT 3组患者血清LDL-C水平分别为(1.89±0.53)mmol/L、(2.07±0.92)mmol/L和(1.96±0.79)mmol/L,低于治疗前的(2.87±0.92)mmol/L、(2.56±0.89)mmol/L和(2.55±1.11)mmol/L,均差异有统计学意义(t=9.896,4.055,5.980,均P<0.001)。治疗前后GG组血清LDL-C水平差值为(-0.97±0.69)mmol/L,GT组和TT组分别为(-0.50±0.86)mmol/L和(-0.59±0.56)mmol/L,3组治疗前后血清LDL-C水平差值之间差异有统计学意义(F=5.614,P=0.005)。3组患者治疗前后TC、TG、HDL-C差值差异无统计学意义(F=2.783,0.490,1.677,均P>0.05)。二元Logistic回归分析显示,ABCB1 G2677T基因类型和熬夜是阿托伐他汀降脂治疗的独立影响因素,其中ABCB1 G2677T基因GT型患者降脂有效的概率� 展开更多
关键词 急性脑梗死 基因多态性 三磷酸腺苷结合盒转运体b1 g2677T基因 阿托伐他汀 降脂治疗
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部