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橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅰ)——基础分析
被引量:
5
1
作者
梁素钰
李琳
+3 位作者
杜倩
王文帆
刘铁男
田松岩
《安徽农业科学》
CAS
2014年第9期2563-2564,2596,共3页
[目的]对开垦荒地种植橡胶草前后的土壤微生物细菌多样性进行454测序技术并对基础数据进行分析,探求利用边际土地进行战略能源作物种植的可行性.[方法]通过蛇形取样法对土壤样品采集、用试剂盒提取土壤微生物总DNA、选择细菌16SrDNA V3 ...
[目的]对开垦荒地种植橡胶草前后的土壤微生物细菌多样性进行454测序技术并对基础数据进行分析,探求利用边际土地进行战略能源作物种植的可行性.[方法]通过蛇形取样法对土壤样品采集、用试剂盒提取土壤微生物总DNA、选择细菌16SrDNA V3 ~ V1区,进行引物设计与PCR预扩增,采用454测序技术获得数据序列并优化,用R软件进行指数多样性等基础分析.[结果]样品总DNA无蛋白质和RNA污染,PCR预扩增出500 bp左右的细菌16S rDNA.454测序序列优化序列占有效序列的90%以上,在97%相似性水平下的指数多样性显示橡胶草种植后土壤细菌OTU数目较多;Shannon-Wiener曲线和稀释性曲线显示,当测序序列细菌超过15 000时曲线趋向平坦.[结论]试验测序数据可以反应样品中绝大多数微生物信息,此次取样的数量比较合理,细菌丰富度高.
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关键词
橡胶草(Taraxacum
kok-saghyz
Rodin)
454
测序
细菌
多样性
土壤微生物
下载PDF
职称材料
橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅱ)——高级分析
2
作者
梁素钰
李琳
+3 位作者
杜倩
刘铁男
王文帆
田松岩
《安徽农业科学》
CAS
2014年第8期2264-2266,共3页
[目的]研究橡胶草种植前后土壤微生物细菌的多样性。[方法]对大田种植橡胶草前后的土壤理化性质进行考察,并通过454测序技术对土壤微生物细菌多样的数据序列进行高级分析。[结果]橡胶草种植后土壤的全氮和全磷略高于种植前,有机质稍有...
[目的]研究橡胶草种植前后土壤微生物细菌的多样性。[方法]对大田种植橡胶草前后的土壤理化性质进行考察,并通过454测序技术对土壤微生物细菌多样的数据序列进行高级分析。[结果]橡胶草种植后土壤的全氮和全磷略高于种植前,有机质稍有下降。土壤细菌的OTU数在橡胶草种植前后相差不大。群落结构分析表明,橡胶草种植前后的细菌组成大致相同,但各物种所占比例有差异,大多数的细菌是不可培养的,其中与氮有关的菌属柱状区所占比例最大。PCA主成分分析表明橡胶草种植前后土壤微生物群落在细菌水平上相近,这个结果与群落分布柱状图相吻合。RDA分析表明,土壤pH值、有机质、土壤含水率、土壤全氮和全磷与细菌呈正相关,土壤容重与细菌呈负相关。[结论]试验测序数据表明,橡胶草种植前后的土壤微生物细菌在OUT水平上多样性丰富,在属的水平上群落结构组成相近,种植橡胶草后土壤理化性质发生了改变。
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关键词
橡胶草(Taraxacum
kok-saghyz
Rodin)
454
测序
细菌
多样性
土壤微生物
下载PDF
职称材料
题名
橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅰ)——基础分析
被引量:
5
1
作者
梁素钰
李琳
杜倩
王文帆
刘铁男
田松岩
机构
黑龙江省森林工程与环境研究所
出处
《安徽农业科学》
CAS
2014年第9期2563-2564,2596,共3页
基金
国家林业局948
编号2013-04SC2
+6 种基金
2011-4-51
黑龙江省财政
编号2011-02
黑龙江省森工总局
编号sgzjY2012010
黑龙江省博士后
编号LBH-Q10010
文摘
[目的]对开垦荒地种植橡胶草前后的土壤微生物细菌多样性进行454测序技术并对基础数据进行分析,探求利用边际土地进行战略能源作物种植的可行性.[方法]通过蛇形取样法对土壤样品采集、用试剂盒提取土壤微生物总DNA、选择细菌16SrDNA V3 ~ V1区,进行引物设计与PCR预扩增,采用454测序技术获得数据序列并优化,用R软件进行指数多样性等基础分析.[结果]样品总DNA无蛋白质和RNA污染,PCR预扩增出500 bp左右的细菌16S rDNA.454测序序列优化序列占有效序列的90%以上,在97%相似性水平下的指数多样性显示橡胶草种植后土壤细菌OTU数目较多;Shannon-Wiener曲线和稀释性曲线显示,当测序序列细菌超过15 000时曲线趋向平坦.[结论]试验测序数据可以反应样品中绝大多数微生物信息,此次取样的数量比较合理,细菌丰富度高.
关键词
橡胶草(Taraxacum
kok-saghyz
Rodin)
454
测序
细菌
多样性
土壤微生物
Keywords
Taraxacum
kok-saghyz
454
sequence
Bacteria
Diversity
Soil
microorganism
分类号
S576 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅱ)——高级分析
2
作者
梁素钰
李琳
杜倩
刘铁男
王文帆
田松岩
机构
黑龙江省森林工程与环境研究所
出处
《安徽农业科学》
CAS
2014年第8期2264-2266,共3页
基金
国家林业局948
编号2011-4-51
+5 种基金
黑龙江省财政
编号2011-02
黑龙江省森工总局
编号sgzjY2010020
黑龙江省博士后
编号LBH-Q10010
文摘
[目的]研究橡胶草种植前后土壤微生物细菌的多样性。[方法]对大田种植橡胶草前后的土壤理化性质进行考察,并通过454测序技术对土壤微生物细菌多样的数据序列进行高级分析。[结果]橡胶草种植后土壤的全氮和全磷略高于种植前,有机质稍有下降。土壤细菌的OTU数在橡胶草种植前后相差不大。群落结构分析表明,橡胶草种植前后的细菌组成大致相同,但各物种所占比例有差异,大多数的细菌是不可培养的,其中与氮有关的菌属柱状区所占比例最大。PCA主成分分析表明橡胶草种植前后土壤微生物群落在细菌水平上相近,这个结果与群落分布柱状图相吻合。RDA分析表明,土壤pH值、有机质、土壤含水率、土壤全氮和全磷与细菌呈正相关,土壤容重与细菌呈负相关。[结论]试验测序数据表明,橡胶草种植前后的土壤微生物细菌在OUT水平上多样性丰富,在属的水平上群落结构组成相近,种植橡胶草后土壤理化性质发生了改变。
关键词
橡胶草(Taraxacum
kok-saghyz
Rodin)
454
测序
细菌
多样性
土壤微生物
Keywords
Taraxacum
kok-saghyz
454
sequence
Bacteria
Diversity
Soil
microbe
分类号
S188 [农业科学—农业基础科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅰ)——基础分析
梁素钰
李琳
杜倩
王文帆
刘铁男
田松岩
《安徽农业科学》
CAS
2014
5
下载PDF
职称材料
2
橡胶草种植前后土壤微生物细菌多样性研究(Ⅱ)——高级分析
梁素钰
李琳
杜倩
刘铁男
王文帆
田松岩
《安徽农业科学》
CAS
2014
0
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职称材料
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