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一类特殊超图与理想秘密共享方案 被引量:1
1
作者 吴春英 李顺东 《计算机工程》 CAS CSCD 2013年第7期205-208,共4页
在一般存取结构上,通过建立存取结构与超图之间的一一对应关系,提出基于特殊超图-非循环超图的一个秘密共享方案。采用向量空间构造法和(t,t)门限体制相结合的思想设计分发算法和重构算法。找出非循环超图的最大路径,增加图中2-区域的... 在一般存取结构上,通过建立存取结构与超图之间的一一对应关系,提出基于特殊超图-非循环超图的一个秘密共享方案。采用向量空间构造法和(t,t)门限体制相结合的思想设计分发算法和重构算法。找出非循环超图的最大路径,增加图中2-区域的顶点个数,并在图中不断添加耳朵来完成方案的构造。该方案的信息率可达到最大值1。 展开更多
关键词 理想秘密共享方案 存取结构 非循环超图 最长路径 2-区域 向量空间构造 (t t)门限体制
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HBV新型免疫原的设计、合成及免疫原性研究 被引量:29
2
作者 吴玉章 刘茂昌 +1 位作者 贾正才 邹丽云 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第10期919-923,共5页
目的 探讨如何将表位构建成有效免疫原。方法 以Pre S( 2 ) 蛋白两优势性B细胞表位和HBcAg两Th细胞表位为基础 ,设计、合成了 2种MAP多肽 ,以此两MAP肽为免疫原免疫兔和小鼠 ,观察体液免疫反应。结果 此两种MAP多肽均比Pre S( 2 ) ... 目的 探讨如何将表位构建成有效免疫原。方法 以Pre S( 2 ) 蛋白两优势性B细胞表位和HBcAg两Th细胞表位为基础 ,设计、合成了 2种MAP多肽 ,以此两MAP肽为免疫原免疫兔和小鼠 ,观察体液免疫反应。结果 此两种MAP多肽均比Pre S( 2 ) 蛋白诱发更高抗体滴度 ;Th细胞表位引入可显著增强反应强度。结论 增加肽抗原结构复杂性可提高其免疫原性 ,其表位排列以B细胞表位在赖氨酸核心外侧为佳 。 展开更多
关键词 乙型肝炎 HBV MAP B细胞表位 Th细胞表位
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传染性法氏囊病病毒YL051、YL052的分离及其VP2基因高变区序列的比较分析 被引量:16
3
作者 阳秀英 韦平 +4 位作者 周祥 磨美兰 韦天超 李康然 朱学勤 《广西农业生物科学》 CAS CSCD 2006年第2期101-106,共6页
应用鸡胚绒毛尿囊膜接种的方法,从一个疑患传染性法氏囊病的鸡群中分离到2株传染性法氏囊病病毒(IBDV)(分别命名为YL051和YL052);利用反转录-聚合酶链式反应技术扩增分离株VP2基因的高变区序列,并采用限制性内切酶分析技术和核... 应用鸡胚绒毛尿囊膜接种的方法,从一个疑患传染性法氏囊病的鸡群中分离到2株传染性法氏囊病病毒(IBDV)(分别命名为YL051和YL052);利用反转录-聚合酶链式反应技术扩增分离株VP2基因的高变区序列,并采用限制性内切酶分析技术和核苷酸序列测定技术,对分离株进行致病型鉴定及其基因差异的分析。结果表明:分离株YL051属IBDV的超强毒株(vvIBDV),而YL052株既具有强毒株的特征即七肽区(SWSASGS)和279D,但同时也具有284T的弱毒株特征,可能属于介于强毒株与弱毒株之间的一个中间型。与国内外参考毒株的序列比较分析发现:YL051与其他vvIBDV的核苷酸同源性达94%~97%;YL052则与经典毒株STC、疫苗株B87的核苷酸同源性均为94.3%。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 超强毒株 经典毒株 VP2基因高变区 序列分析
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安徽地区IBDV超强毒株的分离鉴定和VP2基因序列分析 被引量:11
4
作者 王桂军 魏建忠 +3 位作者 吴忆春 李郁 何长生 韦平 《畜牧与兽医》 北大核心 2006年第8期4-7,共4页
经鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种、易感鸡接种试验、电镜观察,从安徽地区疑似病鸡的法氏囊组织分离到3株传染性法氏囊病毒。分离株人工感染4周龄鸡,致死率分别为92%、83%、67%。接种9~10SPF鸡胚测得的鸡胚半数致死量(ELD50)分别为10-6.8/0.... 经鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)接种、易感鸡接种试验、电镜观察,从安徽地区疑似病鸡的法氏囊组织分离到3株传染性法氏囊病毒。分离株人工感染4周龄鸡,致死率分别为92%、83%、67%。接种9~10SPF鸡胚测得的鸡胚半数致死量(ELD50)分别为10-6.8/0.2mL、10-5.4/0.2mL、10-4.6/0.2mL。应用Nested-PCR分别对3株分离株VP2基因高变区进行克隆测序和序列分析,结果表明:3个分离株与国内外参考超强毒株的核苷酸同源性为97.2%~99.5%,氨基酸同源性为99.3%~100%,VP2高变区核苷酸和推导的氨基酸符合传染性法氏囊病病毒超强毒株特征。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 超强毒株 分离鉴定 VP2基因高变区
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基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病病原分型的初步研究 被引量:9
5
作者 李桂满 罗春蕊 +4 位作者 刘艳艳 姜黎黎 周晓芳 寸建萍 田炳均 《中国病毒病杂志》 CAS 2021年第4期271-274,共4页
目的评估基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原分型方法的准确性,建立快速简易的手足口病病原分型方法。方法用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对... 目的评估基于VP4/VP2结合区基因序列对手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)病原分型方法的准确性,建立快速简易的手足口病病原分型方法。方法用逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对2020年云南省曲靖市送检的49株已用VP1区基因序列分型的肠道病毒进行VP4/VP2结合区基因扩增并测序,获得VP4/VP2结合区分型结果。将VP4/VP2结合区基因分型结果与VP1区分型结果进行一致性评价,利用Mega 5.2软件对毒株基因组序列进行分析。结果49株肠道病毒经VP4/VP2结合区基因序列分型,共分出5个型别,包括肠道病毒(enterovirus,EV)-A组48株4个型别,EV-B组1株1个型别,未分离到EV-C、EV-D。与VP1区分型结果比较,EV-A、EV-B组病毒分型符合率100%,但EV-B组病毒只检测到1株。结论基于VP4/VP2结合区的手足口病病原分型方法对EV-A组病毒能准确分型,对EV-B、EV-C和EV-D组病毒的分型准确率有待积累更多病毒型别进一步研究。 展开更多
关键词 手足口病 VP4/VP2结合区 测序分型 肠道病毒 柯萨奇病毒
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内蒙古西部区酸粥中酵母菌的分离鉴定及优势菌分析 被引量:8
6
作者 白梅 王娟 +3 位作者 卿蔓君 包秋华 孙天松 张和平 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第9期1299-1304,共6页
从内蒙古地区采集28份酸粥样品,从中分离出40株酵母菌,并对其进行了分子生物学鉴定和生物多样性分析。26S rDNA D1/D2区域 (600bp左右)碱基序列分析结果表明,酸粥中的酵母菌有Issatchenkia orientalis、Saccharomyces cerevisiae、Geotr... 从内蒙古地区采集28份酸粥样品,从中分离出40株酵母菌,并对其进行了分子生物学鉴定和生物多样性分析。26S rDNA D1/D2区域 (600bp左右)碱基序列分析结果表明,酸粥中的酵母菌有Issatchenkia orientalis、Saccharomyces cerevisiae、Geotrichum sp.、Candida pararugosa、 Candida parapsilosis、Trichosporon asahii、Trichosporon coremiiforme、Clavispora lusitaniae和Candida tropicalis。经过分析,Issatchenkia orientalis(75%,Frequency percentage)为酸粥中的优势菌。 展开更多
关键词 酸粥 酵母菌 鉴定 26SrDNAD1/D2区域
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传染性法氏囊病病毒X毒株不同代次的致病性及VP_2可变区序列分析 被引量:4
7
作者 刘伯华 李健强 +3 位作者 刘湘涛 韩雪清 薛登民 赵启祖 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期1-5,共5页
分别以传染性法氏囊病病毒 ( IBDV) X毒株细胞适应的第 5代、第 1 1代和第 1 7代毒感染 38日龄非免疫雏鸡进行致病性试验 ,确定 X毒株的毒力 ,并比较 3个代次毒的致病性差异 ,进而利用 RT-PCR扩增其VP2 基因可变区 ,测定其核苷酸序列 ,... 分别以传染性法氏囊病病毒 ( IBDV) X毒株细胞适应的第 5代、第 1 1代和第 1 7代毒感染 38日龄非免疫雏鸡进行致病性试验 ,确定 X毒株的毒力 ,并比较 3个代次毒的致病性差异 ,进而利用 RT-PCR扩增其VP2 基因可变区 ,测定其核苷酸序列 ,从分子生态学角度研究了非鸡胚源细胞传代培养对 IBDV X毒株毒力和抗原性的影响。结果表明 ,IBDV X毒株表现为中等毒力 ,在 Vero细胞上传代后 ,其毒力有所减弱。VP2 可变区氨基酸序列有 3个位置发生了替换 ,即第 5代毒氨基酸残基 2 62位为半胱氨酸 ,而第 1 1代毒和第 1 7代毒则变为酪氨酸 ( Cys→ Tyr) ;第 5代毒的 2 90位为缬氨酸 ,而第 1 1代和第 1 7代毒则变为蛋氨酸 ( Val→Met) ;第 5代毒和第 1 1代毒的 31 6位为赖氨酸 ,而第 1 7代毒则变为精氨酸 ( Lys→Arg)。 2 90位氨基酸替换导致该区域二级结构的改变 ,并对 IBDV的抗原性有显著影响。上述结果提示 ,这些氨基酸残基可能对维持IBDV的毒力和抗原性是必要的。通过毒株间 VP2 可变区序列的比较和系统发生树的分析 ,证明 IBDV X毒株与 Bursin-2疫苗毒关系很近。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 X毒株 致病性 VP2可变区 序列分析
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Pre-S_(2)蛋白B细胞表位的精细特异性 被引量:6
8
作者 吴玉章 朱锡华 张凌 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1994年第2期80-82,共3页
采用我室建立的短肽点免疫结合试验确定Pre-S_(2)蛋白B细胞表位的精细特异性。结果发现Pre-S_(2)蛋白的B细胞识别部位(14~24)可进一步区分为两个部分交叠的表位:14~21和18~24,从而绘出了Pre... 采用我室建立的短肽点免疫结合试验确定Pre-S_(2)蛋白B细胞表位的精细特异性。结果发现Pre-S_(2)蛋白的B细胞识别部位(14~24)可进一步区分为两个部分交叠的表位:14~21和18~24,从而绘出了Pre-S_(2)蛋白B细胞表位图谱。这对设计新一代疫苗及诊断试剂有指导意义。 展开更多
关键词 Pre-S(2) 蛋白 表位 合成肽 B细胞
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河北地区鸡IBDV分离株VP2高变区的序列分析 被引量:3
9
作者 张艳英 孙继国 +2 位作者 张文香 郑世学 张曼夫 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期24-27,共4页
以河北地区不同鸡IBDV基因组RNA为模板,采用RT-PCR/Nested-PCR的方法,得到其VP2高变区的cDNA片段后进行测序,并将其序列与本实验室已测定的周边省市及文献已报道的IBDV毒株相应区域进行了比较。结果表明,河北地区与周边省市间的IBDV毒... 以河北地区不同鸡IBDV基因组RNA为模板,采用RT-PCR/Nested-PCR的方法,得到其VP2高变区的cDNA片段后进行测序,并将其序列与本实验室已测定的周边省市及文献已报道的IBDV毒株相应区域进行了比较。结果表明,河北地区与周边省市间的IBDV毒株同源性极高,与欧洲细胞毒株Cu1和P2间具有很高的同源性,而与美国变异株VariantE的亲缘关系相距较远。 展开更多
关键词 IBDV VP2高变区 序列分析
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柯萨奇病毒A10型对利巴韦林耐药性的初步研究
10
作者 孙甜甜 宗彦君 +8 位作者 王蕊 李冀琛 刘莹 李晓亮 韩振志 于力恒 刘志军 孙强 张勇 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期337-345,共9页
近年来,全国范围内手足口病(Hand, foot, and mouth disease,HFMD)的感染率逐渐上升,其中柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)是主要病原体之一,利巴韦林是临床上治疗儿童手足口病的常用药物之一。为了评价利巴韦林在体外对CV... 近年来,全国范围内手足口病(Hand, foot, and mouth disease,HFMD)的感染率逐渐上升,其中柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)是主要病原体之一,利巴韦林是临床上治疗儿童手足口病的常用药物之一。为了评价利巴韦林在体外对CVA10的抑制效果,本研究中,我们随机选取了19条2009-2021年的不同地区和不同年代的有代表性的中国内地优势流行基因型C基因型的CVA10毒株,通过细胞毒性实验(Cell counting kit-8,CCK8)来检测利巴韦林在RD细胞上对CVA10的抑制率。将抑制率大于85%的CVA10定义为对利巴韦林敏感组,抑制率小于15%的CVA10定义为对利巴韦林耐药组。结果显示利巴韦林在0.78mmol/L浓度下可以对CVA10产生较好的抑制作用并且对细胞的毒性较低。19株CVA10中有4株表现出对利巴韦林耐药性,2株表现出对利巴韦林敏感性,剩余13株的敏感性在85%~15%之间。通过7日龄ICR乳鼠感染实验比较对利巴韦林敏感组和耐药组毒株的致病力差异,通过观察乳鼠临床评分、生存率、体重及组织取材的滴度测定结果均表明对利巴韦林敏感组CVA10在小鼠上的致病力比耐药组强。进一步使用MEGA 7.0软件对影响CVA10复制和翻译的2C区氨基酸序列进行差异性分析,以分析可能的耐药位点。结果显示对利巴韦林耐药组和敏感组CVA10的2C区的327位和328位氨基酸位点存在差异。本研究发现当前国内流行的CVA10存在广泛对利巴韦林耐药现象,其中部分CVA10对利巴韦林完全耐药。因此,有必要加强对CVA10耐药株的监测,以便更好地指导临床医生正确地选择抗病毒药物,为个体化的治疗提供理论依据。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A10型 利巴韦林 耐药性 2C区 差异位点
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Pre-S_(2)蛋白T细胞识别的精细特异性 被引量:3
11
作者 吴玉章 朱锡华 张凌 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1994年第2期75-79,共5页
本文采用合成交叠肽扫描的方法在6种不同H-2单倍型小鼠确定了d/y二种亚型Pre-S_(2)蛋白的T细胞识别部位。发现:(1)在所观察的6种同类系小鼠均存在对Pre-S_(2)蛋白反应的亚型特异性,这可能与Pre-S... 本文采用合成交叠肽扫描的方法在6种不同H-2单倍型小鼠确定了d/y二种亚型Pre-S_(2)蛋白的T细胞识别部位。发现:(1)在所观察的6种同类系小鼠均存在对Pre-S_(2)蛋白反应的亚型特异性,这可能与Pre-S_(2)蛋白分子C末端的多态性有关;(2)Pre-S_(2)蛋白的T细胞识别部位在5种同类系小鼠位于C末端32个氨基酸残基顺序内,在另一种同类系小鼠则位于N末端顺序,这与我们先前的理论观测结果相一致;(3)进一步分析发现:不同H2单倍型小鼠对Pre-S_(2)蛋白的T细胞识别是MHC分子依赖的;(4)24-55肽段的圆二色性表明该肽段内存在一个α-螺旋,可能是其作为T细胞识别部位的结构基础。以上结果对于设计新一代乙型肝炎疫苗有意义。 展开更多
关键词 合成肽 表位 T细胞 Pre-S(2) 蛋白
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猪繁殖与呼吸综合征病毒在我国的流行与进化 被引量:3
12
作者 张毅 陈斌 +6 位作者 邢坤 裴超信 李春 张睿 陈弟诗 邓飞 李丽 《畜禽业》 2016年第11期2-4,共3页
猪繁殖与呼吸综合征病毒,引起猪繁殖与呼吸综合征,俗称"猪蓝耳病",是目前持续危害我国养猪业的病原之一。该病毒毒株极具多样性,1995年进入我国后,基因组和致病力不断进化,2006年高致病力毒株引起猪繁殖与呼吸综合征疫情大暴... 猪繁殖与呼吸综合征病毒,引起猪繁殖与呼吸综合征,俗称"猪蓝耳病",是目前持续危害我国养猪业的病原之一。该病毒毒株极具多样性,1995年进入我国后,基因组和致病力不断进化,2006年高致病力毒株引起猪繁殖与呼吸综合征疫情大暴发,造成巨大损失,疫情平息后仍呈地方性流行,时至今日,中低毒力毒株引起的免疫抑制以及高毒力毒株引起的猪只死亡,已是我国猪场面临的巨大难题。对猪繁殖与呼吸综合征病毒在我国的流行与进化进行归纳综述,旨在通过探讨病毒的流行规律,为生产中猪繁殖与呼吸综合征的预防与控制提供参考。 展开更多
关键词 猪繁殖与呼吸综合征病毒 Nsp2编码区 ORF5基因 流行病学 遗传进化
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中国脊髓灰质炎Ⅰ型病毒VP1/2A区变异的分子流行病学研究 被引量:3
13
作者 郑渡平 张礼璧 +4 位作者 方肇寅 杨辰夫 Mick N.Mulders Mark A.Pallansch Olen M.Kew 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第4期337-344,共8页
应用基因测序法对我国12个省24份脊髓灰质炎1型病毒标本散了VP1/2A片段的测序工作,并与疫苗株sabin 1型参考株的序列,我国台湾省和其他国家15株病毒的序列做了比较。由计算机PCGene程序分析处理,构建出两株关系树,初步揭示了我国大陆6... 应用基因测序法对我国12个省24份脊髓灰质炎1型病毒标本散了VP1/2A片段的测序工作,并与疫苗株sabin 1型参考株的序列,我国台湾省和其他国家15株病毒的序列做了比较。由计算机PCGene程序分析处理,构建出两株关系树,初步揭示了我国大陆6个基因型病毒之间,以及它们与台湾省和其他国家病毒之间的分子流行病学关系。 展开更多
关键词 脊髓灰质炎 Ⅰ型病毒 分子流行病学
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1株鸡传染性法氏囊病毒VP2基因的克隆及其分子流行病学分析 被引量:2
14
作者 冯金芳 何海汛 +1 位作者 孙国鹏 王选年 《河南农业科学》 CSCD 北大核心 2018年第1期109-113,133,共6页
为了解河南地区鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)的流行特征,研究了分离于河南新乡地区某发病鸡场的1株IBDV(XX511毒株)VP2基因的分子流行病学特征。根据Gen Bank公布的IBDV基因组序列信息,设计合成特异性引物,应用RT-PCR方法对分离于新乡某发... 为了解河南地区鸡传染性法氏囊病毒(IBDV)的流行特征,研究了分离于河南新乡地区某发病鸡场的1株IBDV(XX511毒株)VP2基因的分子流行病学特征。根据Gen Bank公布的IBDV基因组序列信息,设计合成特异性引物,应用RT-PCR方法对分离于新乡某发病鸡场的IBDV野毒株XX511的VP2高变区进行克隆及分析,并将XX511毒株的VP2高变区中与毒力相关的2个亲水区及七肽区与国内外其他参考毒株进行序列比对,绘制进化树。结果显示,XX511毒株与超强毒株D49706、AJ878898的VP2基因高变区氨基酸序列的同源性均为96.8%,与广东地区JQ911703毒株具有100%的同源性。与参照的经典毒株相比,XX511毒株在第一亲水区发生了1个氨基酸位点的突变。通过与国内外(包括河南地区)其他流行毒株的比对及进化分析发现,XX511毒株与2012年广东流行JQ911703毒株处于同一分支。 展开更多
关键词 鸡传染性法氏囊病毒 遗传进化 VP2高变区 七肽区 分子流行病学
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A new strategy for ionospheric remote sensing using the 130.4/135.6 nm airglow intensity ratios 被引量:2
15
作者 XiaoHan Yin JianQi Qin Larry J.Paxton 《Earth and Planetary Physics》 CAS CSCD 2023年第4期445-459,共15页
We demonstrate here that global-scale determination of a key ionospheric parameter,the peak height of the F_(2)region(h_(m)F_(2)),can be obtained by making a simple ratio measurement of the atomic oxygen 130.4 and 135... We demonstrate here that global-scale determination of a key ionospheric parameter,the peak height of the F_(2)region(h_(m)F_(2)),can be obtained by making a simple ratio measurement of the atomic oxygen 130.4 and 135.6 nm emissions in the far-ultraviolet nightglow with a nadir-viewing system such as a pair of photometers suitable for flight on a CubeSat.We further demonstrate that measurements from an altitude that is within the typical range of nighttime h_(m)F_(2)250−450 km can provide the ratios that are needed for retrieval of the h_(m)F_(2).Our study is conducted mostly through numerical simulations by using radiative transfer models of the two emissions coupled with empirical models of the atmosphere and ionosphere.Modeling results show that the relationship between the h_(m)F_(2)and the intensity ratio is sensitive to the altitude from which the emissions are observed,primarily because of the distinctly different degrees of resonant scattering of the two emissions in the atmosphere.A roughly quadratic relationship can be established for observations from an orbit of~400 km,which enables h_(m)F_(2)retrieval.Parametric analysis indicates that the relationship can be affected by the ambient atmospheric conditions through resonant scattering and O2 absorption.For typical nighttime conditions with h_(m)F_(2)250−450 km,retrieval of the h_(m)F_(2)from synthetic observations shows that the typical errors are only a few kilometers(up to~20 km),depending on the accuracy of the ambient conditions predicted by the empirical models.Our findings pave the way for use of the 130.4/135.6 nm intensity ratios for global-scale monitoring of the nighttime ionosphere at mid to low latitudes. 展开更多
关键词 nighttime ionosphere far-ultraviolet remote sensing 130.4/135.6 nm airglow intensity ratio peak height of the F_(2)region(h_(m)F_(2)) TIMED observation
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CDKN2A和CDKN2B区域间的基因多态性与汉族人群颅内动脉瘤性别差异性的关联分析 被引量:2
16
作者 欧阳嶷 阎雪晶 +1 位作者 刘颖 张婧 《中国血液流变学杂志》 CAS 2020年第1期16-21,F0002,共7页
目的 研究CDKN2A-CDKN2B区域的基因多态性与汉族人群颅内动脉瘤(intracranial aneurysm,IA)的相关性.方法 收集500例中国汉族IA病例作为研究对象,通过病例对照的关联分析方法 和分层分析方法 ,从遗传学角度探讨存在于IA患者的性别差异... 目的 研究CDKN2A-CDKN2B区域的基因多态性与汉族人群颅内动脉瘤(intracranial aneurysm,IA)的相关性.方法 收集500例中国汉族IA病例作为研究对象,通过病例对照的关联分析方法 和分层分析方法 ,从遗传学角度探讨存在于IA患者的性别差异与上述基因多态性是否存在关联.结果 位于9p21.3的CDKN2A-CDKN2B区域4个与血管疾病相关的SNP位点(rs1333040、rs2891168、rs2383207和rs10757278)中,rs1333040与汉族人群IA发病密切相关,其风险性主要来源于T等位基因(χ2=6.278,P=0.012,OR=1.378,95%CI 1.072~1.771).应用Logistic回归校正性别、年龄及饮酒、吸烟等危险因素后,发现rs1333040位点的T/T基因型及T等位基因是IA的独立危险因素,其患病风险率增加至1.796倍.亚组分析显示rs2891168的A/A基因型与前循环分布区的IA密切相关(P=0.025).在按性别进行统计的亚组分析中,rs1333040 T/T基因型与汉族男、女IA发病均密切相关,但与女性IA的关联程度更高.结论 遗传因素和性别在IA的发生中具有一定的影响作用. 展开更多
关键词 CDKN2A-CDKN2B区域 颅内动脉瘤 基因多态性 性别差异
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2021年宁夏回族自治区银川市流感样病例人鼻病毒感染情况及基因分型研究 被引量:1
17
作者 苏艳艳 王新宁 +6 位作者 曹慜 李龙山 司冰倩 裴建新 吴忠兰 马学平 张银豪 《疾病监测》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期812-818,共7页
目的了解2021年宁夏回族自治区银川市流感样病例人鼻病毒(HRV)感染情况及基因型别,为呼吸道感染有关疾病防治及控制提供依据。方法选取2021年1—12月银川市2家国家流感监测哨点医院具有呼吸道感染症状的鼻咽拭子样本,通过实时荧光定量... 目的了解2021年宁夏回族自治区银川市流感样病例人鼻病毒(HRV)感染情况及基因型别,为呼吸道感染有关疾病防治及控制提供依据。方法选取2021年1—12月银川市2家国家流感监测哨点医院具有呼吸道感染症状的鼻咽拭子样本,通过实时荧光定量反转录聚合酶链式反应法检测,对筛选的HRV阳性样本VP4/VP2区基因扩增测序,使用Mafft软件进行序列比对,MEGA 11.0软件构建亲缘关系进化树,DNA Star软件分析核苷酸和氨基酸同源性。结果1100份样本中,HRV的总检出率为8.00%(88/1100),其中单一HRV感染阳性率为7.64%(84/1100),合并其他病毒感染阳性率为0.36%(4/1100)。对扩增的57例VP4/VP2基因序列分析,其中A种40例、B种4例、C种13例,涉及28个血清型,A16血清型感染病例最多。HRV-A序列之间的核苷酸(氨基酸)同源性为73.10%~100.00%(78.40%~100.00%),HRV-B为78.50%~98.30%(89.20%~100.00%),HRV-C为68.90%~100.00%(76.10%~100.00%)。结论HRV是引起2021年银川市急性上呼吸道感染患者主要的病毒性病原之一,感染率较高,呈现以HRV-A感染为主,HRV-C次之的多个血清型共流行特点。 展开更多
关键词 人鼻病毒 VP4/VP2基因区 血清型
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鸡传染性法氏囊病分子流行病学研究
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作者 白文霞 鲍恩东 +1 位作者 侯继波 何孔旺 《动物科学与动物医学》 2004年第8期51-53,共3页
15个江苏省IBDV分离株,对其VP2高变区进行RT-PCR扩增、测序,得到约560bp长的片段。分析比较15个IBDV分离株与参考毒株的VP2高变区(AccI-SpeI)推断的氨基酸序列,构建进化树。氨基酸序列分析以及进化树分析表明,15个IBDV分离株是超强毒株... 15个江苏省IBDV分离株,对其VP2高变区进行RT-PCR扩增、测序,得到约560bp长的片段。分析比较15个IBDV分离株与参考毒株的VP2高变区(AccI-SpeI)推断的氨基酸序列,构建进化树。氨基酸序列分析以及进化树分析表明,15个IBDV分离株是超强毒株。而且目前vvIBDVs在亚洲各个国家流行,且与欧洲国家的vvIBDVs的进化关系很近。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病毒 VP2高变区 超强毒株 变异毒株 古典毒株 致弱毒株
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传染性法氏囊病病毒NN1107广西株的分离鉴定及遗传进化分析 被引量:1
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作者 李军 陶立 +5 位作者 兰美益 陈泽祥 韦志锋 秦若甫 彭昊 杨威 《动物医学进展》 CSCD 北大核心 2012年第4期63-67,共5页
为研究从广西南宁市某鸡场疑似患传染性法氏囊病的鸡群中分离鉴定出的一株传染性法氏囊病病毒NN1107株的分子特征,通过反转录-聚合酶链反应特异扩增后进行克隆、序列分析。NN1107株VP2基因高变区(vVP2)的克隆测序和序列比较结果显示,序... 为研究从广西南宁市某鸡场疑似患传染性法氏囊病的鸡群中分离鉴定出的一株传染性法氏囊病病毒NN1107株的分子特征,通过反转录-聚合酶链反应特异扩增后进行克隆、序列分析。NN1107株VP2基因高变区(vVP2)的克隆测序和序列比较结果显示,序列符合超强毒传染性法氏囊病病毒(vvIBDV)的分子特征;其与广西vvIBDV毒株的核苷酸同源性在96%~99.6%之间。根据vVP2核苷酸序列同源性绘制的遗传进化树结果显示,NN1107株属于vvIBDV毒株群,与2004年、2005年、2007年和2010年流行毒株BH09、NNTZ(3)、NN07122、HP1001的亲缘关系最近,与疫苗株B87(in)、Bursine-2、FW2512株的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 传染性法氏囊病病毒 超强毒株 VP2基因高变区 遗传进化
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遗传高风险乳腺癌患者BRCA1/2编码区SNP突变频率及其与肿瘤临床病理特征相关研究 被引量:1
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作者 胡泓 周文斌 《中国卫生标准管理》 2019年第16期126-128,共3页
目的探讨遗传高风险乳腺癌患者BRCA1/2编码区SNP突变频率及其与肿瘤临床病理特征相关性。方法选取2016年9月-2018年3月我院收治的85例遗传高风险乳腺癌患者作为乳腺癌组,另外选取同期健康人员85例为健康对照组,检测其BRCA1/2编码区SNP... 目的探讨遗传高风险乳腺癌患者BRCA1/2编码区SNP突变频率及其与肿瘤临床病理特征相关性。方法选取2016年9月-2018年3月我院收治的85例遗传高风险乳腺癌患者作为乳腺癌组,另外选取同期健康人员85例为健康对照组,检测其BRCA1/2编码区SNP突变频率,分析遗传高风险乳腺癌患者BRCA1/2编码区SNP突变频率及其与肿瘤临床病理特征相关性。结果(1)34个SNP基因位点中,19个突变位点突变率>5%。乳腺癌患者共有22个基因位点的突变频率高于正常人群(P<0.05)。(2)rs80356892基因位点突变与遗传高风险乳腺癌患者是否有家族遗传性、肿瘤位置、淋巴结转移、ER阴性以及PR阴性有密切联系。结论BRCA1/2基因的有害突变可能是遗传性乳腺癌发生的原因之一,部分BRCA1/2基因编码区突变与遗传高风险乳腺癌临床病理特征有密切联系。 展开更多
关键词 遗传 高风险 乳腺癌 BRCA1/2编码区 SNP突变频率 临床病理特征
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