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我国南北大豆产区慢生大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育研究
被引量：
8
1
作者
张伟涛
杨江科
+1 位作者
袁天英
周俊初
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期127-131,共5页
利用16S rRNA基因RFLP、16S rRNA基因序列分析以及16S-23S rRNA IGS PCR RFLP技术对分离自我国南北大豆产区的慢生大豆根瘤菌进行了群体遗传多样性和系统发育研究。16S rRNA基因PCR RFLP分析以及16S rRNA基因序列分析结果表明:所有供试...
利用16S rRNA基因RFLP、16S rRNA基因序列分析以及16S-23S rRNA IGS PCR RFLP技术对分离自我国南北大豆产区的慢生大豆根瘤菌进行了群体遗传多样性和系统发育研究。16S rRNA基因PCR RFLP分析以及16S rRNA基因序列分析结果表明:所有供试慢生大豆根瘤菌可分为B.japonicum和B.elkanii两个类群,其中属于B.japonicum的为优势种群,占供试菌株的91%,属于B.elkanii的仅占9%,多样性水平较低。16S-23S rRNA IGS PCRRFLP研究结果表明:属于B.japonicum的慢生根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,在69%的相似性水平上可分为群Ⅰ和群Ⅱ两大类群。群I的菌株以分离自黑龙江和河北等北部区域的菌株为代表,群Ⅱ的菌株以分离自广西和江苏等南部地域的菌株为代表,反映出明显的地域特征。两群菌株在系统发育上均与USDA6、USDA110和USDA122等B.japonicum的模式或代表菌株有差异。
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关键词
慢生大豆根瘤菌
16
S
rrna
rflp
16
S-23S
rrna
IGS
PCR
rflp
遗传多样性
系统发育
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职称材料
浅色黄姑鱼线粒体16S rRNA基因片段序列特征分析
被引量：
9
2
作者
童馨
杜博
+4 位作者
喻达辉
龚世园
郭奕惠
黄桂菊
李莉好
《海洋水产研究》
CSCD
北大核心
2007年第3期85-91,共7页
PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR...
PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR-RFLP分析结果显示,两个种群的100个样品中98%的个体为其中一种单倍型,只有2%的个体呈另一种单倍型,表明这两个种群的遗传多样性较低。两个单倍型平均碱基组成为:T22.0%,C26.3%,A29.8%,G21.9%,GC含量平均为48.2%。与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对,得到429个比对位点,其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入/缺失位点。聚类分析显示,浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近,与形态分类相符。
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关键词
浅色黄姑鱼
线粒体
16
S
rrna
基因
序列分析
rflp
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职称材料
题名
我国南北大豆产区慢生大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育研究
被引量：
8
1
作者
张伟涛
杨江科
袁天英
周俊初
机构
华中农业大学农业微生物学国家重点实验室
华中科技大学生命科学技术学院
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第1期127-131,共5页
基金
国家"973项目"(001CB1089)
华中科技大学人才引进基金
农业微生物国家重点实验室开放基金~~
文摘
利用16S rRNA基因RFLP、16S rRNA基因序列分析以及16S-23S rRNA IGS PCR RFLP技术对分离自我国南北大豆产区的慢生大豆根瘤菌进行了群体遗传多样性和系统发育研究。16S rRNA基因PCR RFLP分析以及16S rRNA基因序列分析结果表明:所有供试慢生大豆根瘤菌可分为B.japonicum和B.elkanii两个类群,其中属于B.japonicum的为优势种群,占供试菌株的91%,属于B.elkanii的仅占9%,多样性水平较低。16S-23S rRNA IGS PCRRFLP研究结果表明:属于B.japonicum的慢生根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,在69%的相似性水平上可分为群Ⅰ和群Ⅱ两大类群。群I的菌株以分离自黑龙江和河北等北部区域的菌株为代表,群Ⅱ的菌株以分离自广西和江苏等南部地域的菌株为代表,反映出明显的地域特征。两群菌株在系统发育上均与USDA6、USDA110和USDA122等B.japonicum的模式或代表菌株有差异。
关键词
慢生大豆根瘤菌
16
S
rrna
rflp
16
S-23S
rrna
IGS
PCR
rflp
遗传多样性
系统发育
Keywords
Soybean
bradyrhizobia
16
S
rrna
gene
rflp
16
S-23S
rrna
IGS
PCR
rflp
gene
tic
diversity
Phylogeny
分类号
S182 [农业科学—农业基础科学]
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职称材料
题名
浅色黄姑鱼线粒体16S rRNA基因片段序列特征分析
被引量：
9
2
作者
童馨
杜博
喻达辉
龚世园
郭奕惠
黄桂菊
李莉好
机构
华中农业大学水产学院
中国水产科学研究院南海水产研究所
出处
《海洋水产研究》
CSCD
北大核心
2007年第3期85-91,共7页
基金
广东省科技计划重点项目(2004A20105002)资助
文摘
PCR扩增100个浅色黄姑鱼个体的线粒体16SrRNA基因片段序列,得到大约620bp的扩增产物。将其中5个个体的扩增产物进行测序和同源比对,得到468bp可供比对分析的片段。比对结果表明,5条序列包括两个单倍型,两个单倍型之间有1个碱基突变。PCR-RFLP分析结果显示,两个种群的100个样品中98%的个体为其中一种单倍型,只有2%的个体呈另一种单倍型,表明这两个种群的遗传多样性较低。两个单倍型平均碱基组成为:T22.0%,C26.3%,A29.8%,G21.9%,GC含量平均为48.2%。与GenBank中石首鱼科7属9种的11条同源序列比对,得到429个比对位点,其中包括69个简约信息位点、55个单突变子和16个插入/缺失位点。聚类分析显示,浅色黄姑鱼与黄姑鱼亲缘关系较近,与形态分类相符。
关键词
浅色黄姑鱼
线粒体
16
S
rrna
基因
序列分析
rflp
Keywords
Nibea
coibor
Mitochondrial
16
S
rrna
gene
Sequence
analysis
rflp
分类号
Q244 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
我国南北大豆产区慢生大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育研究
张伟涛
杨江科
袁天英
周俊初
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
8
下载PDF
职称材料
2
浅色黄姑鱼线粒体16S rRNA基因片段序列特征分析
童馨
杜博
喻达辉
龚世园
郭奕惠
黄桂菊
李莉好
《海洋水产研究》
CSCD
北大核心
2007
9
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