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慢生型大豆根瘤菌的遗传多样性研究 被引量:11
1
作者 冯瑞华 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2000年第2期176-181,共6页
采用选择性扩增片断长度多态性 (简称AFLP)DNA指纹技术对来自泰国北部的 2 45株慢生型大豆根瘤菌进行遗传多样性的研究 .通过AFLP图谱揭示出该地区的慢生型大豆根瘤菌有较显著的遗传多样性 .从 2 45株中选择出 92个代表株用计算机进行... 采用选择性扩增片断长度多态性 (简称AFLP)DNA指纹技术对来自泰国北部的 2 45株慢生型大豆根瘤菌进行遗传多样性的研究 .通过AFLP图谱揭示出该地区的慢生型大豆根瘤菌有较显著的遗传多样性 .从 2 45株中选择出 92个代表株用计算机进行的树状图分析结果表明 ,所分析的菌株在 82 %的相似性水平上聚类成 8个群 .对这 92个代表株的部分菌株和慢生型大豆根瘤菌的参比菌株进行多聚酶链反应 (PCR)扩增的 16SrDNA的 4种限制性内切酶长度多态 (简称 16SrDNAPCR RFLP)分析 ,得出 2个不同的 16SrDNAPCR RFLP类型的菌株 ,分别与慢生型大豆根瘤菌的参比菌株Bradyrhizobiumjaponicum和Bradyrhizobiumelkanii相同 .图 1表 2参 展开更多
关键词 AFLP 慢生型大豆根瘤菌 遗传多样性
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胡枝子属根瘤菌的多相分类研究 被引量:7
2
作者 姚竹云 陈文新 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期287-295,共9页
采用了数值分类、全细胞可溶性蛋白电泳分析、DNAG+Cmol%和DNA相关性的测定以及16SrDNAPCRRFLP分析等多相分类技术对来源于不同地区的16种寄主的胡枝子根瘤菌进行了系统的分类研究。数值分类的结果表明... 采用了数值分类、全细胞可溶性蛋白电泳分析、DNAG+Cmol%和DNA相关性的测定以及16SrDNAPCRRFLP分析等多相分类技术对来源于不同地区的16种寄主的胡枝子根瘤菌进行了系统的分类研究。数值分类的结果表明,在67%的相似性水平上,全部供试菌可以分为快生型根瘤菌和慢性型根瘤菌两大群,在80%的相似性水平上又可分为四个亚群。在此基础上,对各亚群的胡枝子根瘤菌进行了DNA相关性的测定,以进一步证实和确定它们的分类地位,并通过16SrDNAPCRRFLP分析对各亚群的系统发育关系进行了初步研究。 展开更多
关键词 胡枝子 根瘤菌 多相分类 数值分类 DNA相关性
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辽宁营口地区锦鸡儿与树锦鸡儿根瘤菌遗传多样性研究 被引量:4
3
作者 严雪瑞 陈文峰 +3 位作者 陈文新 傅俊范 周如军 隋新华 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期44-48,共5页
对锦鸡儿与树锦鸡儿根瘤菌进行研究,以了解其系统发育地位及遗传多样性。通过分离、纯化、回接结瘤测定共获得了31株待测菌,并采用16S rDNA PCR RFLP及BOX-PCR等方法对这些菌进行了研究。结果表明,31株待测菌的系统发育地位全部源于中... 对锦鸡儿与树锦鸡儿根瘤菌进行研究,以了解其系统发育地位及遗传多样性。通过分离、纯化、回接结瘤测定共获得了31株待测菌,并采用16S rDNA PCR RFLP及BOX-PCR等方法对这些菌进行了研究。结果表明,31株待测菌的系统发育地位全部源于中间根瘤菌属(Mesorhizobium spp.),并产生5种不同的rDNA图谱组合。BOX-PCR研究中,待测菌株呈现出较高的多样性,在80%相似性水平上,将待测菌归于17个不同的类型当中。 展开更多
关键词 锦鸡儿 树锦鸡儿 根瘤菌 遗传多样性 16Srdna pcr rflp BOX-pcr
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攀西地区葛藤根瘤菌的RFLP遗传多样性 被引量:2
4
作者 谢徽 张小平 K.Lindstrom 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2009年第3期314-320,共7页
利用16S rDNA PCR-RFLP和16-23S IGS PCR-RFLP技术对分离自四川攀枝花的43株葛藤根瘤菌进行了遗传多样性研究。供试菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型。16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析结果表明,在... 利用16S rDNA PCR-RFLP和16-23S IGS PCR-RFLP技术对分离自四川攀枝花的43株葛藤根瘤菌进行了遗传多样性研究。供试菌株的16S rDNA用HaeⅢ、MspⅠ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有16种遗传图谱类型。16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析结果表明,在53%的相似性水平上,供试菌株与参比菌株分为两个分支,在81%的相似水平上所有菌株分为13个群。 展开更多
关键词 根瘤菌 葛藤 16S rdna pcr rflp 16—23S IGS pcr rflp 遗传多样性
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三叶草、猪屎豆和含羞草植物根瘤菌16S rDNA PCR-RFLP分析和数值分类研究 被引量:22
5
作者 刘晓云 陈文新 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期1-6,共6页
采用 16SrDNAPCR -RFLP分析和表型数值分类 ,对分离自三叶草 (Trifolium)、猪屎豆 (Crotalaria)和含羞草(Mimosa) 3属植物的根瘤菌进行了分类研究。 16SrDNAPCR -RFLP分析表明 ,在 80 %的相似性水平上 ,6 7株待测菌株和 18株参比菌株归... 采用 16SrDNAPCR -RFLP分析和表型数值分类 ,对分离自三叶草 (Trifolium)、猪屎豆 (Crotalaria)和含羞草(Mimosa) 3属植物的根瘤菌进行了分类研究。 16SrDNAPCR -RFLP分析表明 ,在 80 %的相似性水平上 ,6 7株待测菌株和 18株参比菌株归属到慢生根瘤菌属 (Bradyrhizobium)、中慢生根瘤菌属 (Mesorhizobium)、土壤杆菌属 (Agrobac terium)和根瘤菌属 (Rhizobium)与中华根瘤菌属 (Sinorhizobium) 4个系统发育分支。进一步对其中 5 6株待测菌株和14株参比菌株进行表型性状数值分类研究 ,在 84 %的相似性水平上 ,得到 6个独立的类群 :群Ⅰ、Ⅳ和Ⅵ为新群 ,没有与参比菌株聚在一起 ;群Ⅱ包含慢生大豆根瘤菌 (Bradyrhizobiumjaponicum) ;群Ⅲ含根瘤菌属 (Rhizobium) 2个已知的代表菌株 ;群Ⅴ含土壤杆菌属 (Agrobacterium) 2个已知种的代表菌株。以上结果表明 ,分离自这 3属植物的根瘤菌菌株具有表型和遗传型多样性 ,同时新发现分离自三叶草的根瘤菌的慢生和中慢生菌株 ;分离自含羞草的根瘤菌的慢生菌株和分离自猪屎豆的根瘤菌的快生菌株 。 展开更多
关键词 三叶草 猪屎豆 含羞草 植物根瘤菌 16Srdna pcr-rflp分析 数值分类 遗传型多样性
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铅锌矿区重金属污染对微生物数量及放线菌群落结构的影响 被引量:30
6
作者 李小林 颜森 +1 位作者 张小平 韦成健 《农业环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期468-475,共8页
采集四川省汉源县富泉乡万顺铅锌矿区5个不同重金属浓度的土壤样品,进行了微生物数量及放线菌多样性的研究。经分离、纯化得到43株不同的放线菌,然后对其进行BOXAIR-PCR和16SrDNAPCR-RFLP分析。结果表明,铅锌矿区重金属复合污染对土壤... 采集四川省汉源县富泉乡万顺铅锌矿区5个不同重金属浓度的土壤样品,进行了微生物数量及放线菌多样性的研究。经分离、纯化得到43株不同的放线菌,然后对其进行BOXAIR-PCR和16SrDNAPCR-RFLP分析。结果表明,铅锌矿区重金属复合污染对土壤微生物数量有较大的影响,随着铅锌矿区重金属污染程度的加剧,土壤微生物的总数下降。相关性分析表明,重金属含量与细菌数量呈极显著负相关(P<0.01),与放线菌数量、真菌数量呈显著负相关(P<0.05)。供试菌株的16SrDNA用HaeⅢ、HinfⅠ和TaqⅠ酶切后具有32种遗传图谱类型。BOXAIR-PCR的聚类结果表明在86%的水平上,所有菌株分为10个遗传类型,结果基本与16SrDNAPCR-RFLP聚类差异不大。来源于高重金属的含量样品的菌株基本聚在一起,可能是重金属含量影响了放线菌的分布。同时,16SrDNA序列聚类分析结合系统发育树分析表明链霉菌属是汉源铅锌矿区主要的放线菌属并且具有遗传多样性。 展开更多
关键词 铅锌矿区 微生物数量 放线菌 BOX-AIR 16Srdnapcr-rflp
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用AFLP技术和16SrDNA PCR-RFLP分析毛苜蓿根瘤菌的遗传多样性 被引量:12
7
作者 冯瑞华 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第4期339-345,共7页
采用选择性扩增片断长度多态性 (简称AFLP)DNA指纹技术对采自我国云南省与西藏交界的高山地区的野生型豆科植物毛苜蓿根际土样分离的 2 91株毛苜蓿 (Medicagoedge worthii)根瘤菌进行遗传多样性的研究。从AFLP图谱中 ,揭示出毛苜蓿根瘤... 采用选择性扩增片断长度多态性 (简称AFLP)DNA指纹技术对采自我国云南省与西藏交界的高山地区的野生型豆科植物毛苜蓿根际土样分离的 2 91株毛苜蓿 (Medicagoedge worthii)根瘤菌进行遗传多样性的研究。从AFLP图谱中 ,揭示出毛苜蓿根瘤菌有较显著的遗传多样性 ,从 2 91株中选择出 90个代表株用计算机进行树状图的分析。结果表明 ,所分析的菌株在 79%的相似性水平上聚类成 3个群。对这 90个代表株进行多聚酶链反应 (PCR)扩增的 1 6SrDNA的 4种限制性内切酶长度多态 (简称 1 6SrDNAPCR RFLP)分析 ,得出 2个不同的 1 6SrDNAPCR RFLP类型的菌株。分别选出这 2个类型的代表菌株与各种根瘤菌的参比菌株进行 1 6SrDNAPCR RFLP分析 ,再进行树状图的分析 ,初步得出了它们在根瘤菌系统分类中的地位。分析结果表明 :毛苜蓿根瘤菌与根瘤菌属中的Rhizobiummongolense的相似性很高。 展开更多
关键词 AFLP 16Srdna 毛苜蓿根瘤菌 遗传多样性 牧草
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自然发酵酸菜中乳杆菌的分离鉴定与多态性分析 被引量:15
8
作者 张杨 孟祥晨 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2009年第2期19-22,共4页
以自然发酵的东北酸菜汁液为实验样品,对其中的乳杆菌进行了分离纯化,共得到乳杆菌34株;使用生理生化实验对其中的10株乳杆菌进行了鉴定;并采用16S rDNA PCR-RFLP方法对这10株乳杆菌进行了遗传多态性的分析。结果表明它们分属5个遗传型。
关键词 酸菜 乳杆菌 分离鉴定 16S rdna pcrrflp 遗传多态性
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毛乌素沙地中间锦鸡儿根瘤菌遗传多样性及16S rDNA全序列分析 被引量:9
9
作者 高丽锋 邓馨 +1 位作者 王洪新 胡志昂 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第6期649-656,共8页
野生豆科植物中间锦鸡儿是毛乌素沙地的优势种。从蛋白质和DNA水平分析与其共生的根瘤菌的遗传多样性。在蛋白质水平上 ,2 4株中间锦鸡儿根瘤菌和 9株参比菌株分为 2组 ,A组包含 95 8%供试中间锦鸡儿根瘤菌 ,参比菌株聚为B组 ,菌株GH7... 野生豆科植物中间锦鸡儿是毛乌素沙地的优势种。从蛋白质和DNA水平分析与其共生的根瘤菌的遗传多样性。在蛋白质水平上 ,2 4株中间锦鸡儿根瘤菌和 9株参比菌株分为 2组 ,A组包含 95 8%供试中间锦鸡儿根瘤菌 ,参比菌株聚为B组 ,菌株GH72不与其余供试根瘤菌聚类。应用 1 6SrDNAPCR RFLP方法将供试菌株分为 2 2种基因型 ,中间锦鸡儿根瘤菌组成 1 2种 ,其余 1 0种由参比菌株构成 ,表明中间锦鸡儿根瘤菌具高水平遗传多样性。选取代表菌株GH2 0 0 1进行 1 6SrDNA全序列测定 ,与已知相关根瘤菌菌株 1 6SrDNA进行同源性比较 ,构建系统发育树状图。GH2 0 0 1位于Rhizobium分支 ,与且Agrobacteriumradiobacter、Ag .rubi、Rhizobiumgiardinii、R .mongolense、R .yanglingense、R .galegae和R .huautlense的序列同源性分别达到 99%、98 3 %、96 3 %、95 5 %、95 6 %、95 2 %和 95 7%。 展开更多
关键词 毛乌素沙地 中间锦鸡儿 根瘤菌 遗传多样性 蛋白质 16Srdna pcrrflp
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黄土高原地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育 被引量:11
10
作者 张红侠 冯瑞华 +2 位作者 李俊 关大伟 曹凤明 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期1466-1473,共8页
【目的】研究黄土高原地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育。【方法】采用BOX-PCR、16S rDNAPCR-RFLP、16S-23S IGS PCR-RFLP和16S rRNA基因序列分析方法对分离自我国黄土高原地区4个省的15个地区的130株大豆根瘤菌及部分参比菌株进... 【目的】研究黄土高原地区大豆根瘤菌的遗传多样性和系统发育。【方法】采用BOX-PCR、16S rDNAPCR-RFLP、16S-23S IGS PCR-RFLP和16S rRNA基因序列分析方法对分离自我国黄土高原地区4个省的15个地区的130株大豆根瘤菌及部分参比菌株进行了遗传多样性和系统发育分析。【结果】BOX-PCR反映的菌株多样性最丰富,形成的遗传群最多,16S rDNA PCR-RFLP方法在属、种水平上聚群较好,16S-23S IGSPCR RFLP反映的多样性介于BOX-PCR和16S rDNA PCR-RFLP之间,能够较好地反映出属、种和亲缘关系很近的菌株间的差异,3种方法聚类分析结果基本一致,可将所有供试菌株分为两大类群,中华根瘤菌属(Sinorhizobium)和慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)。从系统发育来看,供试的快生大豆根瘤菌为费氏中华根瘤菌(Sinorhizobium fredii),慢生大豆根瘤菌为日本慢生大豆根瘤菌(Bradyrhizobium japonicum)和辽宁慢生根瘤菌(Bradyrhizobium liaoningense)。【结论】我国黄土高原地区大豆根瘤菌具有较丰富的遗传多样性,S.fredii优势种,慢生大豆根瘤菌仅占10%,同时,分离到2株B.liaoningense。 展开更多
关键词 大豆根瘤菌 BOX-pcr 16S rdna pcr-rflp 16S-23S rdna IGS pcr-rflp 遗传多样性 系统发育
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中国北方地区甘草根瘤菌表型及遗传多样性研究 被引量:11
11
作者 谷峻 陈文新 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期1321-1327,共7页
【目的】了解中国北方地区甘草根瘤菌的生物多样性。【方法】采用表型数值分类、16SrDNAPCR-RFLP分析和BOX-PCR指纹图谱分析的方法对北方地区的甘草根瘤菌进行表型、遗传多样性分析。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中约85%的相似... 【目的】了解中国北方地区甘草根瘤菌的生物多样性。【方法】采用表型数值分类、16SrDNAPCR-RFLP分析和BOX-PCR指纹图谱分析的方法对北方地区的甘草根瘤菌进行表型、遗传多样性分析。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中约85%的相似水平上产生2个表观群,有11株菌未与已知参比菌株聚群。16SrDNAPCR-RFLP分析表明,供试的20株菌共产生14种遗传型,表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明与甘草共生的根瘤菌的基因组也具有多样性。【结论】在中国北方地区与甘草共生的根瘤菌在Sinorhizobium、Rhizobium和Mesorhizobium属中均有分布。 展开更多
关键词 根瘤菌 数值分类 16S rdna pcr-rflp BOX—pcr指纹图谱
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泸州老窖不同窖龄窖泥中己酸菌遗传多样性及系统发育 被引量:11
12
作者 杨菁瑾 唐雪 +3 位作者 杨先超 刘汉军 唐玉明 陈强 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2015年第2期181-188,共8页
【目的】研究泸州老窖窖泥中己酸菌的遗传多样性和系统发育地位,筛选优良高产己酸菌株,为提高新窖酒品质提供优质菌株资源。【方法】采用BOXAIR-PCR、16SrDNA PCR-RFLP和代表菌株16SrDNA序列分析技术等对不同窖龄窖泥中乙酸菌的多样性... 【目的】研究泸州老窖窖泥中己酸菌的遗传多样性和系统发育地位,筛选优良高产己酸菌株,为提高新窖酒品质提供优质菌株资源。【方法】采用BOXAIR-PCR、16SrDNA PCR-RFLP和代表菌株16SrDNA序列分析技术等对不同窖龄窖泥中乙酸菌的多样性进行分析。【结果】从不同窖龄窖泥样品中分离获得了43株产己酸细菌;BOXAIR-PCR分析结果表明,在82.2%的相似性水平处,供试菌株形成了8个BOX遗传群;16SrDNA PCR-RFLP将43株供试菌株分为8个遗传群;代表菌株16SrDNA序列系统发育分析表明,供试菌株分布于3个系统发育分支。【结论】泸州老窖窖泥中己酸菌具有丰富的遗传多样性,这些菌株主要分布于梭菌属(Clostridium)、芽孢杆菌属(Bacillus)和假单胞菌属(Pseudomonas),其中芽孢杆菌属(Bacillus)为优势属。 展开更多
关键词 窖泥 己酸菌 遗传多样性
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华北及西北地区岩黄芪根瘤菌的表型及遗传多样性 被引量:8
13
作者 刘洋 隋新华 陈文新 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期1088-1094,共7页
选用分离自河北、内蒙古等5省区的岩黄芪根瘤菌30株及17株已知参比菌株,进行了营养利用、抗生素抗性、耐逆性及生理生化反应等12 5项表型性状研究,所得数值分类树状图表明不同宿主及不同地域的岩黄芪根瘤菌的表型多样性。通过对其中部... 选用分离自河北、内蒙古等5省区的岩黄芪根瘤菌30株及17株已知参比菌株,进行了营养利用、抗生素抗性、耐逆性及生理生化反应等12 5项表型性状研究,所得数值分类树状图表明不同宿主及不同地域的岩黄芪根瘤菌的表型多样性。通过对其中部分菌株进行16 S r DNA PCR- RFL P及BOX- PCR指纹图谱分析,聚类结果表明供试岩黄芪根瘤菌具有遗传多样性。 展开更多
关键词 岩黄芪根瘤菌 多样性 数值分类 16S rdna pcrrflp BOX—pcr指纹图谱
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药用植物内生芽孢杆菌的多样性和系统发育研究 被引量:10
14
作者 陈兰 张小平 Kristina Lindstrom 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期432-438,共7页
【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】... 【目的】了解药用植物内生芽孢杆菌的生物多样性。【方法】采用数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、BOX-PCR指纹图谱和16S rDNA序列分析技术对分离于几种药用植物的内生芽孢杆菌和已知参比菌株进行表型、遗传多样性及系统发育研究。【结果】供试菌株在数值分类聚类分析中在84%的相似水平上产生13个表观群。16S rDNA PCR-RFLP分析表明供试菌株表现出丰富的遗传多样性。BOX-PCR指纹图谱分析进一步证明药用植物的内生芽孢杆菌的基因组也具有多样性,聚群的结果与数值分类有较好一致性。用软件在Genbank中进行所得序列的同源性检索,并构建系统发育树。由16S rDNA序列分析可知,供试的代表菌株SCAU11与球形芽孢杆菌(Bacillus sphaericus)亲缘关系最近,SCAU78和SCAU25为枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的两个亚种,代表菌株SCAU39与巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)的亲缘关系最近。【结论】研究结果表明药用植物内生芽孢杆菌具有明显的表型和遗传多样性。 展开更多
关键词 芽孢杆菌 多样性 数值分类 16S DNA pcr-rflp BOX-pcr指纹图谱 系统发育
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八门湾红树林土壤芽胞杆菌分离与多样性分析 被引量:11
15
作者 崔莹 黄惠琴 +3 位作者 刘敏 孙前光 朱军 鲍时翔 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期229-235,共7页
【目的】了解八门湾红树林海漆林区土壤中可培养芽胞杆菌资源的多样性。【方法】采用水浴处理与直接涂布相结合的方法选择性分离土壤中的芽胞杆菌;利用16S rDNA PCR-RFLP与16S rDNA序列分析技术研究可培养芽胞杆菌资源的遗传多样性和系... 【目的】了解八门湾红树林海漆林区土壤中可培养芽胞杆菌资源的多样性。【方法】采用水浴处理与直接涂布相结合的方法选择性分离土壤中的芽胞杆菌;利用16S rDNA PCR-RFLP与16S rDNA序列分析技术研究可培养芽胞杆菌资源的遗传多样性和系统发育关系。【结果】16S rDNA PCR-RFLP酶切图谱UPGMA聚类分析表明,在100%的相似性水平上,分离的155株芽胞杆菌分属21个遗传类群,显示了较为丰富的遗传多样性;由21种遗传类型代表菌株的16S rDNA序列分析结果得知,这些芽胞杆菌主要分布在Bacillaceae和Paenibacillaceae科下的Bacillus、Halobacillus、Virgibacillus和Paenibacillus 4个属,其中Bacillus为优势属;有8株芽胞杆菌的16S rDNA序列与数据库中相应模式菌株的最大相似性在95.1%-99.0%之间。【结论】八门湾红树林土壤可培养芽胞杆菌有着较为丰富的遗传多样性,并存在新的芽胞杆菌物种资源。 展开更多
关键词 红树林 芽胞杆菌 多样性 16S rdna pcrrflp 系统发育
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西北部分地区苦马豆根瘤菌的遗传多样性 被引量:9
16
作者 徐琳 徐佳洁 +2 位作者 刘巧莉 谢瑞美 韦革宏 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期69-75,共7页
苦马豆(Sphaerophysa salsula)是荒漠区重要的豆科植物。为了研究其共生根瘤菌的多样性,本试验采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析方法,对西北部分地区的苦马豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析。结果表明,57株供试菌株共... 苦马豆(Sphaerophysa salsula)是荒漠区重要的豆科植物。为了研究其共生根瘤菌的多样性,本试验采用16S rDNA PCR-RFLP和16S rDNA全序列分析方法,对西北部分地区的苦马豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析。结果表明,57株供试菌株共产生了9种遗传图谱类型,对每种图谱类型的代表性菌株进行16S rDNA全序列分析的结果表明,它们分别归属于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)、根瘤菌属(Rhizobium)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)和Shinella kummerowiae。不同地域的菌株在多样性方面也有明显差异:分离自银川的苦马豆根瘤菌的Jaccard相似性系数较低;而来自民乐县和临泽县的菌株有着非常丰富的遗传多样性,其Simpson指数分别为0.826和0.710,Shannon-Wiener指数分别为1.831和1.530。以上结果为进一步确定西北地区豆科植物根瘤菌的系统分类地位提供了依据。 展开更多
关键词 Sphaerophysa salsula 系统发育 16S rdna pcr-rflp 16Srdna全序列 遗传多样性
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黑木相思根瘤菌遗传多样性 被引量:9
17
作者 窦雅静 陆俊锟 +3 位作者 康丽华 王胜坤 江业根 廖绍波 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1439-1448,共10页
【目的】研究分离自广东、福建、江西等15个地点的174株黑木相思(Acacia melanoxylon)根瘤菌的遗传多样性。【方法】采用16S rDNA限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)和16S rDNA基因、持家基因(r... 【目的】研究分离自广东、福建、江西等15个地点的174株黑木相思(Acacia melanoxylon)根瘤菌的遗传多样性。【方法】采用16S rDNA限制性片段长度多态性分析(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)和16S rDNA基因、持家基因(recA、atpD、glnII)系统发育分析的方进行研究。【结果】16S rDNAPCR-RFLP分析中,在70%的相似性水平上,所有供试菌株分成9个类群;16S rDNA基因和持家基因系统发育分析结果基本一致,34株代表菌株主要分布在α-变形菌纲(Alpha-Proteobacteria)的慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、根瘤菌属(Rizobium)、中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium),并与Bradyrhizobium liaoningense、Bradyrhizobium betae、Bradyrhizobium cytisi、Rizobium multihospitium、Mesorhizobium plurifarium亲缘关系较近。【结论】供试菌株被鉴定到属的水平,Bradyrhizobium、Rhizobium或Mesorhizobium为优势菌群,证明了黑木相思根瘤菌具有丰富的遗传多样性。 展开更多
关键词 黑木相思 根瘤菌 遗传多样性 16S rdnapcr-rflp 持家基因
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西部某些根瘤菌的数值分类和16SrDNA PCR-RFLP分析 被引量:7
18
作者 阚凤玲 陈文新 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期1-8,共8页
选用 6 1株分离自我国西北地区的野豌豆、棘豆、苜蓿和草木樨根瘤菌和 4株已知参比菌株 ,进行了营养利用、抗生素抗性和耐逆性等 1 3 2个表型性状研究 ,通过MINTS软件分析 ,得到了数值分类树状图 ,发现全部供试菌株在 79%的相似性水平... 选用 6 1株分离自我国西北地区的野豌豆、棘豆、苜蓿和草木樨根瘤菌和 4株已知参比菌株 ,进行了营养利用、抗生素抗性和耐逆性等 1 3 2个表型性状研究 ,通过MINTS软件分析 ,得到了数值分类树状图 ,发现全部供试菌株在 79%的相似性水平上 ,分为 5个群。对 5 7株未知菌株和 1 0株参比菌株进行了 1 6SrDNAPCR RFLP分析 ,发现共具有 2 0个遗传图谱类型 ,聚类分析树状图表明所有菌株共分为 5个系统发育分支 ,与数值分类结果有较好的一致性。 展开更多
关键词 西部 根瘤菌 数值分类 16Srdnapcr-rflp分析 表型性状
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四川白三叶根瘤菌遗传多样性及系统发育研究 被引量:7
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作者 潘明洪 凌瑶 +2 位作者 景文 马洪平 彭燕 《草业学报》 CSCD 北大核心 2014年第5期143-152,共10页
为阐明四川部分地区野生白三叶根瘤菌的遗传多样性及系统发育地位,对分离自四川雅安、康定、泸定、西昌、成都和乐山6个地区白三叶根瘤的69株菌进行系统研究。采用16SrDNA限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymor... 为阐明四川部分地区野生白三叶根瘤菌的遗传多样性及系统发育地位,对分离自四川雅安、康定、泸定、西昌、成都和乐山6个地区白三叶根瘤的69株菌进行系统研究。采用16SrDNA限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP)和16SrDNA基因、持家基因(recA、atpD、glnII)、结瘤基因(nodC)、固氮基因(nifH)系统发育分析的方法进行了研究。结果表明,16SrDNA PCR-RFLP中所有供试菌株产生了4种酶切图谱类型,表现出较为丰富的遗传多样性。持家基因与16SrDNA基因系统发育分析结果基本一致,9株代表菌株主要分布在α-变形菌纲(Alpha-Proteobacteria)的根瘤菌属(Rhizobium),并与豌豆根瘤菌三叶草生物型(R.leguminosarumbv.trifolii)ATCC 14480T的亲缘关系较近。PCR可扩增出nodC和nifH基因片段,但从属于土壤杆菌属(Agrobacterium)的菌株LS1105中则扩增不出这两个基因。所有供试菌株被鉴定到了种的水平,证实了68株为白三叶根瘤菌,并通过不同采样地点菌株之间的比较,发现白三叶与根瘤菌的共生关系因地理分布不同而具有多样性,对于丰富白三叶根瘤菌资源及其开发利用具有重要意义。 展开更多
关键词 白三叶 根瘤菌 遗传多样性 16S rdna pcr-rflp 持家基因 系统发育
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我国豇豆和绿豆根瘤菌的数值分类及16S rDNA PCR_RFLP研究 被引量:5
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作者 张勇法 王风芹 陈文新 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期861-868,共8页
对分离自中国14个不同省(自治区)的79株豇豆和绿豆根瘤菌及12株参比菌株进行了唯一碳、氮源利用,抗生素抗性,抗逆性和酶活性等128个表型性状的测定,并用MINTS软件进行聚类分析。表型性状测定结果发现,所有菌株都有极其广泛的碳、... 对分离自中国14个不同省(自治区)的79株豇豆和绿豆根瘤菌及12株参比菌株进行了唯一碳、氮源利用,抗生素抗性,抗逆性和酶活性等128个表型性状的测定,并用MINTS软件进行聚类分析。表型性状测定结果发现,所有菌株都有极其广泛的碳、氮源利用谱,大多数菌株可在较宽的pH(pH5.0-11.0)值范围内生长,大部分菌株能在37℃高温条件下生长,个别菌株能耐受60℃高温较长时间(20-45min)的热激。聚类分析结果表明,全部供试菌株在63.5%的相似性水平上分为两大群:一个群为慢生菌群,另一群为快生和中慢生菌群;在79%的相似性水平上分为7个亚群。在数值分类的基础上,又将参比菌株增加到22株,对79株待测菌株进行了16S rDNA PCR-RFLP分析,16S rDNA PCR产物经Hae Ⅲ、HinfⅠ、MspⅠ和AluⅠ4种内切酶酶切共产生34种遗传图谱类型,经GelComparⅡ软件聚类后,在79%的相似性水平上也可划分为7个亚群,与数值分类的结果有很好的一致性。 展开更多
关键词 豇豆 绿豆 根瘤菌 数值分类 16S rdna pcr-rflp 多样性
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