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叶绿素缺乏油菜突变体的LHCⅡ多肽组成、蛋白含量与cab基因转录研究 被引量:7
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作者 张年辉 杜林方 +2 位作者 赵云 林宏辉 梁厚果 《西北植物学报》 CAS CSCD 2004年第3期484-487,共4页
与野生型油菜相比 ,叶绿素缺乏油菜突变体 Cr35 2 9L HC 多肽组成并未发生改变 ,但其含量却都明显降低 .RNA印迹及点杂交结果都显示出 Cr35 2 9cab基因的转录增加 .这些结果表明 :该叶绿素缺乏突变体仅影响L HC 多肽的蛋白含量 ;并未影... 与野生型油菜相比 ,叶绿素缺乏油菜突变体 Cr35 2 9L HC 多肽组成并未发生改变 ,但其含量却都明显降低 .RNA印迹及点杂交结果都显示出 Cr35 2 9cab基因的转录增加 .这些结果表明 :该叶绿素缺乏突变体仅影响L HC 多肽的蛋白含量 ;并未影响其组成 ;突变体 L HC 蛋白量的减少并非 cab基因转录降低所致 .可见转录水平的调节仅对 L HC 在类囊体膜上的积累起有限作用 ; 展开更多
关键词 叶绿素缺乏突变体 油菜 捕光色素蛋白复合物 cab基因表达 质体信号
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Expression Profiles of <i>psbA, ALS, EPSPS</i>, and Other Chloroplastic Genes in Response to PSII-, ALS-, and EPSPS-Inhibitor Treatments in <i>Kochia scoparia</i> 被引量:2
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作者 Vijay K. Varanasi Shahniyar Bayramov +1 位作者 P. V. Vara Prasad Mithila Jugulam 《American Journal of Plant Sciences》 2017年第3期451-470,共20页
Kochia (Kochia scoparia L. Schrad.), also known as tumbleweed, is an economically important annual C4 broadleaf weed found throughout the US Great Plains. Several herbicides with different modes of action are used in ... Kochia (Kochia scoparia L. Schrad.), also known as tumbleweed, is an economically important annual C4 broadleaf weed found throughout the US Great Plains. Several herbicides with different modes of action are used in the management of kochia. The effect of commonly used herbicides on the expression of their target site(s) and photosynthetic/chloroplastic genes is poorly understood in weed species, including kochia. The objective of this research was to characterize the expression profiles of herbicide target-site genes, KspsbA, KsALS, and KsEPSPS upon treatment with PSII- (e.g. atrazine), ALS- (e.g. chlorsulfuron), and EPSPS- (e.g. glyphosate)-inhibitors, respectively, in kochia. Furthermore, the expression of genes involved in photosynthesis (e.g. KsRubisco, KsCAB, and KsPPDK) was also determined in response to these herbicide treatments. KspsbA was strongly upregulated (>200-fold) 24 h after atrazine treatment. Transcript levels of the KsALS or KsEPSPS genes were 7 and 3-fold higher 24 h after chlorsulfuron or glyphosate treatment, respectively. KsRubisco, a Calvin cycle gene important for CO2 fixation, was upregulated 7 and 2.6-fold 8 and 24 h after glyphosate and chlorsulfuron treatments, whereas it downregulated 8 and 24 h after atrazine treatment. The transcript levels of KsPPDK remained unchanged after glyphosate treatment but increased 1.8-fold and decreased 2-fold at 24 h after chlorsulfuron and atrazine treatments, respectively. KsCAB remained unchanged after chlorsulfuron treatment, but was downregulated after glyphosate and atrazine treatments. The results show that herbicide treatments not only affect the respective target-site gene expression, but also influence the genes involved in the critical photosynthetic pathway. 展开更多
关键词 Kochia scoparia L. Schrad. C4 Herbicide Stress gene expression PSBA ALS EPSPS Photosynthesis Rubisco PPDK cab
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茶树叶片黄化变异相关的CAB基因家族鉴定及关键基因挖掘
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作者 钟思彤 张亚真 +6 位作者 游小妹 陈志辉 孔祥瑞 林郑和 伍慧妮 金珊 陈常颂 《茶叶科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期175-192,共18页
捕光叶绿素a/b结合蛋白(Light-harvesting chlorophyll a/b binding protein,CAB)基因家族成员在植物叶片黄化变异中具有重要作用。本研究利用铁观音(Camellia sinensis Tieguanyin)基因组数据对CAB基因家族进行了筛选,并进行了生物信... 捕光叶绿素a/b结合蛋白(Light-harvesting chlorophyll a/b binding protein,CAB)基因家族成员在植物叶片黄化变异中具有重要作用。本研究利用铁观音(Camellia sinensis Tieguanyin)基因组数据对CAB基因家族进行了筛选,并进行了生物信息学和表达模式分析;进一步以不同黄化、绿叶茶树品种(系)为材料,通过基因克隆和qRT-PCR,分析CABs基因的表达特性,结合叶色参数和叶绿素SPAD值的相关性分析筛选出与茶树黄化变异相关的关键CAB基因。结果表明,共鉴定到25个CAB基因家族成员,其氨基酸长度为167~337个,蛋白分子质量为18.5~37.1 kDa,大部分CAB成员属于稳定性蛋白和疏水性蛋白,并且亚细胞定位预测在叶绿体上;根据进化关系25个CAB家族成员分为13个亚家族,Lhcb1亚族的成员数量最多;启动子分析显示,CAB家族成员启动子中包含大量的光响应元件,还有其他与植物生长发育、激素和逆境胁迫响应相关的元件。从茶树中克隆Lhcb1亚家族成员,通过序列比对筛选出CAB1、CAB6和CAB7基因;表达分析显示,CAB1、CAB6和CAB7基因都具有组织表达特异性,在芽、叶和果实中表达量较高,并能响应多种逆境胁迫。qRT-PCR分析发现,CAB1、CAB6和CAB7基因在黄、绿茶树的叶片中具有一致的表达特性:与正常绿叶相比,黄化叶片中的CABs基因表达均显著下调;通过与叶色参数和叶绿素SPAD值的相关性分析,发现CAB1、CAB6和CAB7表达量与叶色参数a、b、L值以及叶绿素SPAD值均呈极显著相关(P<0.01),其中CAB1的基因表达量与叶色相关参数和叶绿素SPAD值的相关性最显著;烟草亚细胞定位结果显示,CAB1在细胞核、细胞膜和叶绿体上均有分布。以上研究初步解析了茶树CAB家族成员的基本特征,挖掘出与茶树叶色变异紧密相关CAB基因,后续可作为候选关键基因进行深入研究,以期为茶树叶色变异的分子调控机制的研究提供理论基础。 展开更多
关键词 茶树 捕光叶绿素a/b结合蛋白 叶色黄化变异 基因克隆 表达分析
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绿竹cab-BO2基因的克隆及其表达载体的构建 被引量:7
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作者 高志民 李雪平 +1 位作者 岳永德 彭镇华 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第3期431-435,共5页
捕光叶绿素a/b结合蛋白基因是绿色植物光合系统中的重要基因,其编码的蛋白与色素所形成的蛋白复合体在光化学反应、光保护等方面都起着重要的作用。采用RT-PCR技术和与RACE-PCR技术,从绿竹中克隆到捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的全长cDNA... 捕光叶绿素a/b结合蛋白基因是绿色植物光合系统中的重要基因,其编码的蛋白与色素所形成的蛋白复合体在光化学反应、光保护等方面都起着重要的作用。采用RT-PCR技术和与RACE-PCR技术,从绿竹中克隆到捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的全长cDNA编码区,命名为cab-BO2(GenBank登记号:EF088668)。该基因编码区长为792bp,编码263个氨基酸。通过加酶切位点的方法,将基因的编码区直接构建到载体pBI121多克隆位点。经过酶切检测,获得了包含35S启动子、cab基因、GUS报告基因和NOS终止区域的植物表达载体。 展开更多
关键词 绿竹(Dendrocalamopsis oldhami) 捕光叶绿素a/b结合蛋白基因 cab-BO2基因 植物表达载体
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绿竹光系统Ⅰ捕光叶绿素a/b结合蛋白基因的cDNA全长克隆及分析 被引量:6
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作者 李雪平 彭镇华 +1 位作者 高志民 牟少华 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期643-648,共6页
为了从分子水平研究竹子光合作用的机理,采用RT-PCR及RACE方法从绿竹中分离了cab家族的一个基因,命名为BoLhca4-1(GenBank注册号为EF690303)。BoLhca4-1的cDNA序列全长931 bp,含有一个735 bp的开放阅读框,编码了一个244 aa的蛋白,分子... 为了从分子水平研究竹子光合作用的机理,采用RT-PCR及RACE方法从绿竹中分离了cab家族的一个基因,命名为BoLhca4-1(GenBank注册号为EF690303)。BoLhca4-1的cDNA序列全长931 bp,含有一个735 bp的开放阅读框,编码了一个244 aa的蛋白,分子量大小约为26.8 ku。序列分析结果表明,BoLhca4-1是光系统Ⅰ的一个捕光叶绿素复合蛋白基因,编码肽链与禾本科植物水稻的cab蛋白有着很高的同源性,达到86.1%。系统进化树分析表明,BoLhca4-1编码蛋白与水稻的cab蛋白亲缘关系较近。另外,对绿竹不同组织中BoLhca4-1基因的表达进行RT-PCR检测发现,其在叶片中的表达量较鞘和茎中要高。 展开更多
关键词 绿竹 光系统Ⅰ 捕光叶绿素a/b结合蛋白 基因克隆 表达分析
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祝氏麻鸡(Gallus gallus)终端父本CAB39L基因克隆和生物信息学及组织表达分析
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作者 柴睿堂 祝春三 +2 位作者 李和鸣 黄永欢 杨秀荣 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期393-399,共7页
为了探究钙结合蛋白样39(calcium binding protein 39 like,CAB39L)的蛋白结构及其基因的组织表达规律,本研究以祝氏麻鸡(Gallus gallus)终端父本为试验材料,克隆CAB39L基因并进行生物信息学分析和组织表达分析。通过克隆获得CAB39L基因... 为了探究钙结合蛋白样39(calcium binding protein 39 like,CAB39L)的蛋白结构及其基因的组织表达规律,本研究以祝氏麻鸡(Gallus gallus)终端父本为试验材料,克隆CAB39L基因并进行生物信息学分析和组织表达分析。通过克隆获得CAB39L基因的CDS(conding sequence)全长序列,应用实时定量PCR检测CAB39L基因在祝氏麻鸡终端父本各组织中的表达水平。结果表明:祝氏麻鸡终端父本CAB39L基因的编码区长度为1005 bp,共编码334个氨基酸;与参考序列(索引号:NM_001006272)进行序列比对,存在两处同义突变(c.852G>T,c.874T>C)。物种间同源性分析显示,祝氏麻鸡终端父本CAB39L基因与原鸡(Gallus gallus)、雉鸡(Phasianus colchicus)、中国家鹅(Anser cygnoiders domesticus)、鸽(Columba livia)、人(Homo sapiens)、黑猩猩(Pan troglodytes)、家鼠(Mus musculus)、猴子(Macaca mulatta)、斑马鱼(Danio rerio)CAB39L基因的相似性分别为99.8%、97.5%、93.7%、92.6%、83.6%、83.6%、83.5%、82.5%、75.4%;系统进化树分析显示,祝氏麻鸡终端父本与原鸡的亲缘关系最近,其次是与雉鸡的亲缘关系比较近,与斑马鱼的亲缘关系最远,这表明CAB39L基因在禽类和非禽类之间有明显的遗传距离。CAB39L蛋白的等电点为7.69,为碱性蛋白;亲疏水性分析显示该多肽链氨基酸序列的平均亲疏水性为-0.320,为亲水蛋白;蛋白功能结构域预测结果显示该蛋白只含有Mo25结构域,且不属于跨膜蛋白和分泌蛋白。实时定量PCR结果显示,CAB39L基因在睾丸中的表达量最高,这表明CAB39L基因可能与公鸡睾丸组织的生长发育或功能有关,进而影响公鸡的生长情况。本研究结果为进一步研究鸡CAB39L基因的生物功能奠定了理论基础。 展开更多
关键词 祝氏麻鸡 cab39L基因 克隆 生物信息学 组织表达分析
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