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脾气虚证免疫相关基因组学机制初探 被引量：38
1
作者 罗云坚 修宗昌 +2 位作者 黄穗平 周丹 林莉 《中国中西医结合杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期311-314,共4页
目的采用cDNA芯片技术,探讨脾气虚证免疫功能的异常变化,并揭示其发生的基因组学机制。方法分别提取脾气虚证慢性胃炎与溃疡性结肠炎患者(6例)以及健康人(3名)外周血白细胞总RNA ,mRNA微量扩增,制成杂交探针;脾气虚证慢性胃炎与溃疡性... 目的采用cDNA芯片技术,探讨脾气虚证免疫功能的异常变化,并揭示其发生的基因组学机制。方法分别提取脾气虚证慢性胃炎与溃疡性结肠炎患者(6例)以及健康人(3名)外周血白细胞总RNA ,mRNA微量扩增,制成杂交探针;脾气虚证慢性胃炎与溃疡性结肠炎患者分别用Cy3标记,健康人用Cy5标记。标记好的Cy3、Cy5探针等量混匀后与cDNA芯片杂交。扫描仪扫描芯片荧光信号,处理、分析数据。分别比较脾气虚证慢性胃炎与溃疡性结肠炎患者同健康人外周血白细胞中免疫相关基因表达水平的差异。结果脾气虚证慢性胃炎与溃疡性结肠炎患者外周血白细胞中CD9、CD16 4、PF4、RARB基因表达下调,IGKC、DEFA1、GNLY基因表达上调。结论脾气虚证发生有免疫相关基因组学基础,脾虚时机体免疫功能紊乱。 展开更多
关键词 脾气虚证 基因组学 免疫相关 溃疡性结肠炎 cdna芯片技术 机体免疫功能紊乱 人外周血白细胞 慢性胃炎 cdna芯片 基因表达水平 异常变化 总RNA mRNA 杂交探针 表达下调 RB基因 表达上调 患者 健康人 光信号 扫描仪 CD9 PF4
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淡色库蚊细胞色素P450抗性相关基因克隆与初步鉴定 被引量：14
2
作者 朱昌亮 李建民 +3 位作者 田海生 马磊 李秀兰 吴观陵 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第5期263-267,共5页
[目的 ]探讨淡色库蚊细胞色素P45 0与溴氰菊酯抗药性的关系。 [方法 ]采用一对昆虫细胞色素P45 0简并引物 ,以反转录 聚合酶链反应从淡色库蚊扩增特异片段 ,T/A直接克隆法筛选阳性克隆 ,对新序列进行cDNA芯片和逆Northern分析。 [结果 ... [目的 ]探讨淡色库蚊细胞色素P45 0与溴氰菊酯抗药性的关系。 [方法 ]采用一对昆虫细胞色素P45 0简并引物 ,以反转录 聚合酶链反应从淡色库蚊扩增特异片段 ,T/A直接克隆法筛选阳性克隆 ,对新序列进行cDNA芯片和逆Northern分析。 [结果 ]从淡色库蚊对溴氰菊酯敏感品系和抗性品系获得 112个阳性克隆 ,其中 2 4个阳性克隆测序后显示为细胞色素P45 0新序列 ,由GenBank登录上网 ;经国际细胞色素P45 0命名委员会鉴定分别属CYP4家族CYP4C、CYP4D、CYP4H和CYP4J等 4个亚家族 ;2 4个CYP4cDNA片段中 ,来自敏感品系的 2个片段(NYDS3和NYDS5 )和来自抗性品系的 4个片段 (NYDR6、NYDR9、NYDR15和NYDR17)在两品系间存在差别 ,cDNA芯片信号亮度值均是抗性品系大于敏感品系 ,倍数在 3 .1～ 9.7范围内 ;NYDR17仅与抗性探针杂交 ;逆Northern再鉴定 ,获得了与cDNA芯片一致的结果。 [结论 ]淡色库蚊CYP4与溴氰菊酯抗性相关 ;在淡色库蚊溴氰菊酯抗性机理中 ,可能存在P45 0基因点突变而导致的特异表达。 展开更多
关键词 淡色库蚊 杀虫剂抗性 细胞色素P450 基因克隆
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检测猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒和猪轮状病毒的cDNA芯片的构建 被引量：14
3
作者 滑翔 胡中凯 +10 位作者 黄小波 文心田 曹三杰 文翼平 伍锐 邓静 赵松 尹人杰 常晓霞 欧阳达 张仙 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2235-2242,共8页
猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)是三种常见的仔猪病毒性腹泻病原,作者拟构建可同时检测三种病原的cDNA基因芯片。分别根据PEDV基因(S、M)、TGEV基因(S、N)、PoRV基因(VP7、NSP4)的保守区设计引物... 猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)是三种常见的仔猪病毒性腹泻病原,作者拟构建可同时检测三种病原的cDNA基因芯片。分别根据PEDV基因(S、M)、TGEV基因(S、N)、PoRV基因(VP7、NSP4)的保守区设计引物扩增靶基因,进行PEDV-TGEV-PoRV的cDNA阵列设计,建立了扩增标记探针的多重PCR方法,并对所构建cDNA芯片的特异性、灵敏性、重复性进行了评价。确定了该cDNA芯片的阳性判断标准:SNR大于或等于2.0(或信号强度中位值大于等于1 500)。PEDV-TGEV-PoRV诊断cDNA芯片具有良好的特异性,该芯片不与猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、猪乙型脑炎病毒、猪伪狂犬病病毒发生交叉反应;芯片的最低检测质量浓度为20pg·μL-1;同一张芯片可重复使用至少7次。本研究为鉴别三种仔猪病毒性病的鉴别诊断提供了新的高通量检测技术。 展开更多
关键词 猪流行性腹泻病毒 猪传染性胃肠炎病毒 猪轮状病毒 cdna芯片 构建
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螯虾免疫相关基因的检出及丝氨酸蛋白酶抑制物基因分析 被引量：10
4
作者 曾勇 陆承平 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期318-324,共7页
通过对抑制性差减杂交和cDNA芯片技术分离的 2 0 1个阳性克隆的测序 ,得到螯虾 (Procambarusclarkii)免疫相关基因 4 8个 ,其中正向克隆中 4 2个 ,反向克隆 6个 ,除正向克隆中SNAP - 2 5 (synatosome-associatedproteinof2 5ku)已报道... 通过对抑制性差减杂交和cDNA芯片技术分离的 2 0 1个阳性克隆的测序 ,得到螯虾 (Procambarusclarkii)免疫相关基因 4 8个 ,其中正向克隆中 4 2个 ,反向克隆 6个 ,除正向克隆中SNAP - 2 5 (synatosome-associatedproteinof2 5ku)已报道外 ,其余均为新基因 ,均在GenBank登录。正向克隆中的同源基因有微管蛋白、超氧化物歧化酶前体、丝氨酸蛋白酶抑制物Ⅰ、精氨酸激酶、70kD伴侣蛋白同类物等。进一步用DotNorthernblot对克隆号PCI188进行鉴定 ,结果攻毒组的杂交信号是对照组的 3.2 4倍 ,与cDNA芯片结果相符。用快速扩增cDNA末端技术扩增克隆号PCI188基因的 5’端片段和 3’端片段 ,全长共 112 8bp ,编码的蛋白质有 2 77个氨基酸 ,分子量为 30 .2 7kD。与GenBank序列号X795 12软尾太平剌蛄 (P .le niusculus)的蛋白酶抑制物Ⅰ (为丝氨酸蛋白酶抑制物 )的基因同源性为 5 8.7% ,氨基酸同源性为 6 9.7%。该蛋白质有 5个重复的结构域 。 展开更多
关键词 螯虾 cdna芯片技术 免疫相关基因 丝氨酸蛋白酶抑制物
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多发性骨髓瘤的基因表达谱分析 被引量：12
5
作者 石奕武 胡维新 +3 位作者 汤立军 田菁燕 易伟峰 谭达人 《湖南医科大学学报》 CSCD 北大核心 2003年第3期201-205,共5页
目的 :研究MM患者与正常人骨髓基因的差异表达。方法 :应用cDNA芯片技术对 1 0例初诊多发性骨髓 (MM)患者和 1 0名正常骨髓的单个核细胞的mRNA进行检测。结果 :在 2 0 4 8条基因中共发现差异表达基因5 6 6条。在MM中 2 37条表达增加 ,3... 目的 :研究MM患者与正常人骨髓基因的差异表达。方法 :应用cDNA芯片技术对 1 0例初诊多发性骨髓 (MM)患者和 1 0名正常骨髓的单个核细胞的mRNA进行检测。结果 :在 2 0 4 8条基因中共发现差异表达基因5 6 6条。在MM中 2 37条表达增加 ,32 9条表达降低。结论 :MM的发生发展涉及多基因的改变 。 展开更多
关键词 多发性骨髓瘤 基因表达谱 分析 cdna芯片技术 骨髓基因
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开放的差异基因表达技术研究进展 被引量：8
6
作者 池晓菲 舒庆尧 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期259-264,共6页
自 90年代早期发展以来 ,差异基因表达 (DGE)技术在许多领域得到了应用 .“开放”结构系统的DGE技术不需原始的生物学或序列信息 ,而且可应用于任何种群 .主要介绍 6项开放的DGE技术 :cDNA代表性差示分析 (cDNA RDA)、基因表达系统分析 ... 自 90年代早期发展以来 ,差异基因表达 (DGE)技术在许多领域得到了应用 .“开放”结构系统的DGE技术不需原始的生物学或序列信息 ,而且可应用于任何种群 .主要介绍 6项开放的DGE技术 :cDNA代表性差示分析 (cDNA RDA)、基因表达系统分析 (SAGE)、表达序列标签串联排列连接(TALEST) ,和早期的DGE技术差异显示 (DD)、随机引物聚合酶链反应 (AP PCR) ,以及一项受专利保护的技术———GeneCalling .通过几项重要的参数对这些技术进行了比较 ,认为DD虽然有其致命的弱点 ,但在目前仍然应用得非常广泛 .cDNA RDA能有效富增特异片段 ,扣除共有序列 ,如能和SAGE结合 ,将能进一步促进其发展 .TALEST和GeneCalling操作较简便 ,一次试验能获得大量的数据 ,但是分析这些数据比较麻烦 ,须借助另外的分析软件 .最后介绍了应用DGE技术取得的最新成果 . 展开更多
关键词 差异基因表达技术 研究进展 基因芯片 SAGE cdna-RDA 开放DGE技术
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用cDNA芯片检测大鼠心肌缺血预适应后基因表达谱的改变 被引量：10
7
作者 吕青兰 袁灿 +5 位作者 张华莉 陈广文 王尧玲 邓恭华 涂自智 肖献忠 《中国动脉硬化杂志》 CAS CSCD 2003年第3期189-193,共5页
为了检测缺血预适应后大鼠心肌基因表达谱的改变 ,采用cDNA芯片方法对缺血预适应后大鼠心肌基因谱的改变进行检测。结果发现 ,缺血预适应大鼠心肌中差异表达基因共 75项 ,其中表达上调基因 4 8项 ,表达下调基因 2 7项。采用逆转录—聚... 为了检测缺血预适应后大鼠心肌基因表达谱的改变 ,采用cDNA芯片方法对缺血预适应后大鼠心肌基因谱的改变进行检测。结果发现 ,缺血预适应大鼠心肌中差异表达基因共 75项 ,其中表达上调基因 4 8项 ,表达下调基因 2 7项。采用逆转录—聚合酶链反应进一步验证了cDNA芯片结果的可靠性 ,并初步分析了基因表达谱改变在缺血预适应诱导的心肌内源性保护作用中有一定意义。以上研究有助于从基因水平阐明缺血预适应诱导的心肌保护的分子机制 ,为临床防治缺血 再灌注损伤及缺血性心脏疾病提供新的思路。 展开更多
关键词 病理生理学 心肌缺血 基因表达谱 缺血预适应 大鼠 cdna芯片 差异表达
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基因芯片检测Ⅰ期低分化肺腺癌基因表达谱 被引量：6
8
作者 邢国宏 张进川 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期36-39,共4页
的　用基因芯片技术分析Ⅰ期低分化肺腺癌的异常基因表达。方法　提取肺癌组织及正常肺组织的mRNA ,分别用Cy5 dUTP或Cy3 dUTP标记 ,再与 8192点基因芯片杂交 ,用ScanArray40 0 0扫描仪及GenePix 3 .0分析软件处理杂交信号获取结果。... 的　用基因芯片技术分析Ⅰ期低分化肺腺癌的异常基因表达。方法　提取肺癌组织及正常肺组织的mRNA ,分别用Cy5 dUTP或Cy3 dUTP标记 ,再与 8192点基因芯片杂交 ,用ScanArray40 0 0扫描仪及GenePix 3 .0分析软件处理杂交信号获取结果。结果　肺癌组织与正常肺组织表达差异基因有 580条 ,涉及到细胞生长调节、细胞间信息转导等多个方面。其中癌组织中上调基因为 40 5条 ,下调基因 175条 ;差异极显著性基因 66条 ,表达上调 3 5条 ,下调 2 4条 ,另外有 7条为未知基因。结论　多基因参与Ⅰ期低分化肺腺癌发病 。 展开更多
关键词 基因芯片 检测 肺腺癌 基因表达谱
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cDNA芯片结合抑制性差减杂交技术构建对虾白斑综合征病毒表达基因和螯虾免疫相关基因文库 被引量：7
9
作者 曾勇 陆承平 朱建中 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期690-694,共5页
以克氏原螯虾做为对虾白斑综合征病毒(WSSV)的增殖模型,试验组接种WSSV,对照组接种PBS。分别以试验组为检测组(tester)、对照组为驱逐组(driver),进行正向抑制性差减杂交;以对照组为tester、试验组为driver,进行反向SSH。将获得的正、... 以克氏原螯虾做为对虾白斑综合征病毒(WSSV)的增殖模型,试验组接种WSSV,对照组接种PBS。分别以试验组为检测组(tester)、对照组为驱逐组(driver),进行正向抑制性差减杂交;以对照组为tester、试验组为driver,进行反向SSH。将获得的正、反向差减杂交产物克隆入质粒载体PinPointTM Xa-1T-Vector,再转化大肠杆菌DH5α,共构建了2个分别含1620和400个克隆的正、反向差减文库。经PCR扩增,1514个差减克隆得到产物,其中正向差减克隆1221个,反向差减克隆293个。获得的PCR产物经浓缩、变性处理,用自动点样仪点制于尼龙膜载体上,制成cDNA芯片,用cDNA芯片对SSH获得的差减克隆进行鉴定,共获得差异表达克隆278个,其中攻毒组高表达克隆255个;对照组高表达克隆23个。 展开更多
关键词 克氏原螯虾 白斑综合征病毒 表达基因 免疫相关基因 cdna芯片
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子宫内膜腺癌基因表达谱的初步研究 被引量：6
10
作者 周怀君 石一复 +1 位作者 李娟清 崔金全 《中华肿瘤杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期464-467,共4页
目的　探讨子宫内膜腺癌的候选基因。方法　采用包含有 4 0 96个cDNA克隆的基因芯片技术 ,分别对 2例子宫内膜腺癌组织及其相应正常组织进行基因表达谱的比较。结果　 2例标本共同表达的差异表达基因共 35 0条 ,其中Ratio >3的明显... 目的　探讨子宫内膜腺癌的候选基因。方法　采用包含有 4 0 96个cDNA克隆的基因芯片技术 ,分别对 2例子宫内膜腺癌组织及其相应正常组织进行基因表达谱的比较。结果　 2例标本共同表达的差异表达基因共 35 0条 ,其中Ratio >3的明显上调基因 33条 ,而Ratio <0 .3的明显下调基因 4 4条。结论　内膜腺癌的形成是由多基因异常引起多条传导通路异常致使细胞恶性转化的结果。 展开更多
关键词 子宫内膜腺癌 基因表达 基因芯片 候选基因 cdna克隆
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转ARL-1基因HepG2细胞耐药相关基因的筛选 被引量：5
11
作者 杨向东 唐大年 +1 位作者 王建 曹德良 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第12期1289-1295,共7页
背景与目的:醛糖还原酶相似基因1(aldose-reductaselikegene-1,ARL-1)在原发性肝癌中高表达,与肝癌细胞对化疗药物耐药有关。本研究拟建立转染ARL-1的人肝癌细胞株,观察转染ARL-1的HepG2细胞对含醛基抗肿瘤药物耐药性的改变,利用基因表... 背景与目的:醛糖还原酶相似基因1(aldose-reductaselikegene-1,ARL-1)在原发性肝癌中高表达,与肝癌细胞对化疗药物耐药有关。本研究拟建立转染ARL-1的人肝癌细胞株,观察转染ARL-1的HepG2细胞对含醛基抗肿瘤药物耐药性的改变,利用基因表达谱芯片筛选HepG2细胞转染ARL-1后差异表达耐药相关基因。方法:采用脂质体转染PBK/ARL-1质粒到HepG2细胞,获得高表达ARL-1的单克隆细胞株;RT-PCR、流式免疫荧光和免疫组化鉴定高表达ARL-1的HepG2细胞;应用MTT法和细胞凋亡分析研究HepG2细胞和转染ARL-1的HepG2细胞对含醛基抗肿瘤药物阿霉素(ADM)和丝裂霉素(MMC)的耐药性,以5-氟尿嘧啶(5-FU)(不含醛基)为对照;将Cy3和Cy5两种荧光染料分别标记两种细胞的cDNA探针,与人肝癌基因表达谱芯片进行杂交与扫描,观察转染ARL-1基因HepG2与对照组HepG2细胞在基因表达谱方面的差异,筛选耐药相关基因,并运用RT-PCR和Westernblot对部分差异表达相关基因进行初步证实。结果:与对照组HepG2细胞相比,转染ARL-1基因HepG2细胞高表达ARL-1蛋白,明显增强对含醛基的抗肿瘤药物如ADM、MMC的耐药性,分别提高2.6倍和3.47倍,用5-FU处理两组细胞,则未发现有明显的耐药差异(ADM组t=6.39,P<0.05;MMC组t=30.06,P<0.01;5-FU组t=0.684,P>0.05);芯片扫描结? 展开更多
关键词 转ARL-1基因 HEPG2 相关基因 筛选 耐药性 肝癌 癌细胞
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细胞周期蛋白E2基因的过度表达与胃腺癌细胞迁徙的关系 被引量：5
12
作者 王建华 于丽莉 陈诗书 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期137-143,共7页
从基因芯片筛选出差异表达的基因中一个细胞周期蛋白 (cyclin)E2基因 ,深入研究周期蛋白E2在高转移性胃腺癌细胞系RF 4 8细胞中的生物学作用 .首先通过合成硫代磷酸化修饰的反义、正义和错配寡核苷酸片段 ,使用半定量RT PCR和Western印... 从基因芯片筛选出差异表达的基因中一个细胞周期蛋白 (cyclin)E2基因 ,深入研究周期蛋白E2在高转移性胃腺癌细胞系RF 4 8细胞中的生物学作用 .首先通过合成硫代磷酸化修饰的反义、正义和错配寡核苷酸片段 ,使用半定量RT PCR和Western印迹方法分别检测被 3种寡核苷酸转染的RF 4 8细胞在 1～ 5d内周期蛋白E2基因及它可能调控下游靶基因之一FGFR基因和蛋白质的表达 ,检测寡核苷酸转染的RF 4 8细胞周期和凋亡细胞 ,观察寡核苷酸转染RF 4 8细胞的软琼脂集落形成、运动能力和体外侵袭能力 .结果表明 ,修饰的反义寡核苷酸在有效地抑制RF 4 8细胞中周期蛋白E2表达上调后 ,RF 4 8细胞的迁徙能力被显著降低 ,其增殖、运动能力没有变化 .周期蛋白E2基因的主要作用并不是促细胞分裂 ,也与细胞的增殖、运动能力无关 ,周期蛋白E2基因的过度表达与胃腺癌的迁徙性存在相关性 ,其触发肿瘤的侵袭性可能通过某种机制调控其下游靶基因之一成纤维细胞生长因子受体 (FGFR) 展开更多
关键词 细胞周期 周期蛋白 E2基因 基因过表达 胃腺癌细胞 细胞迁徒 基因芯片 相关性
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钙磷脂结合蛋白Ⅱ在人肝细胞癌中的表达 被引量：1
13
作者 朱晓静 张建平 +6 位作者 刘悦芳 徐凛峰 张慧林 李玉华 陈汐敏 冯振卿 管晓虹 《南京医科大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2006年第8期663-666,731,F0006,共6页
目的:应用抑制差减杂交技术(supressionsubtractivehybridization,SSH)结合cDNA芯片筛选人肝细胞癌中差异表达基因。进一步探讨所筛选出的钙磷脂结合蛋白(annexinⅡ)在肝细胞中的表达及作用。方法:以肝癌组织和非肿瘤肝组织进行SSH,构... 目的:应用抑制差减杂交技术(supressionsubtractivehybridization,SSH)结合cDNA芯片筛选人肝细胞癌中差异表达基因。进一步探讨所筛选出的钙磷脂结合蛋白(annexinⅡ)在肝细胞中的表达及作用。方法:以肝癌组织和非肿瘤肝组织进行SSH,构建正、反向差减杂交文库,差减片断的PCR产物制备cDNA芯片,筛选出肝癌组织中差异表达基因。进一步应用荧光实时定量技术验证芯片结果,免疫组化方法分析annexinⅡ在肝细胞癌和正常肝组织中的表达。结果:成功构建了肝细胞癌差减杂交文库。芯片结果显示annexinⅡ在肝细胞癌中高表达并经荧光实时定量技术证实。免疫组化结果表明annexinⅡ在肝细胞癌和癌旁肝硬化组织中高表达,在正常肝组织中不表达(P<0.05)。在低分化肝细胞癌中annexinⅡ的表达有增高趋势。结论:SSH方法构建的肝细胞癌差减杂交文库富含肝细胞癌差异表达基因。肝细胞癌中高表达基因annexinII可能与肝细胞的恶性转化,肝癌细胞的转移和侵袭能力有关。 展开更多
关键词 肝细胞癌 抑制差减杂交技术 cdna芯片 钙磷脂结合蛋白 免疫组化
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邻苯二甲酸二酯诱导果蝇脑组织基因差异表达谱的研究 被引量：4
14
作者 马建红 吕立夏 厉曙光 《环境与职业医学》 CAS 北大核心 2005年第2期91-94,共4页
[目的]获得邻苯二甲酸二(2- 乙基己基)酯[di(2 -ethylhexyl)phthalate ,DEHP]诱导果蝇脑组织的基因差异表达谱。[方法]设喂饲0 .2 %DEHP浓度的果蝇为实验组,乳化剂为对照组,2周后断头进行总RNA抽提,DNaseΙ消化去除DNA污染;用Oligotex... [目的]获得邻苯二甲酸二(2- 乙基己基)酯[di(2 -ethylhexyl)phthalate ,DEHP]诱导果蝇脑组织的基因差异表达谱。[方法]设喂饲0 .2 %DEHP浓度的果蝇为实验组,乳化剂为对照组,2周后断头进行总RNA抽提,DNaseΙ消化去除DNA污染;用OligotexmRNAMiNiKit(QIAGEN)得到纯的mRNA ;合成双链cDNA ;采用体外转录的方法获得大量cRNA与Affymetrix的果蝇表达谱芯片进行杂交,计算机扫描处理数据。[结果]差异表达的基因片段共计3 5个:①上调的基因有2 0个,包括CYP6A2、CYP6A8、CYP6W1、CYP4P1、UGT3 6Bb、GST、羧酸酯酶、转甲基酶、氧化还原酶、EST10、JHEH1、KEAP1、CG690 8、CG1942、CG10 5 60、CG115 2 9、CG10 5 5 3、CG12 83、CG12 5 0 5等;②下调的基因有15个,包括MST5 7Da、MST5 7Db、ACP95EF、OS E、OS C、PBPRP3、PBPRP1、A10、CG1862 8、CG113 91、CG182 84、CG842 4、CG5 2 90、CG13 947、CG15 2 63等。差异表达基因中大多数与信号传导、细胞代谢、生长、发育、组织分化及转录因子等功能相关,尚有一些基因功能未知。[结论]运用高通量基因芯片技术获得DEHP诱导果蝇脑组织的基因差异表达谱,为从分子水平系统研究DEHP的毒性机制提供有益的线索。 展开更多
关键词 基因差异表达谱 邻苯二甲酸二酯 脑组织 邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯 果蝇 AFFYMETRIX DEHP DNASEI 双链cdna 差异表达基因 基因芯片技术 mRNA 表达谱芯片 计算机扫描 氧化还原酶 总RNA MiNi cRNA 体外转录 基因片段 羧酸酯酶
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免疫调节肽对卵巢癌skov3细胞凋亡及相关基因表达的影响 被引量：6
15
作者 郑欣 何晓光 +5 位作者 张文晓 杨浩然 魏彩 顾芳 任明强 秦宜德 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2012年第7期758-762,共5页
目的研究免疫调节肽(PGPIPN)对人卵巢癌细胞株skov3凋亡及相关基因表达的影响。方法体外培养卵巢癌skov3细胞,分别使用10-6、10-5、10-4、10-3、10-2g/L的PGPIPN孵育skov3细胞48 h,观察量效关系;通过cDNA芯片技术筛选凋亡相关基因;实时... 目的研究免疫调节肽(PGPIPN)对人卵巢癌细胞株skov3凋亡及相关基因表达的影响。方法体外培养卵巢癌skov3细胞,分别使用10-6、10-5、10-4、10-3、10-2g/L的PGPIPN孵育skov3细胞48 h,观察量效关系;通过cDNA芯片技术筛选凋亡相关基因;实时荧光定量PCR法检测Bax、Bcl-xl、Caspase-3 mRNA水平的表达量;Western blot法检测Bax、Bcl-xl、Caspase-3蛋白表达量。结果与对照组相比,Bax和Caspase-3的表达随着PGPIPN浓度升高而升高(P<0.05);Bcl-xl的表达随着PGPIPN浓度升高而降低(P<0.05)。结论 PGPIPN通过促进细胞中Bax及抑制Bcl-xl的表达来调控skov3细胞的凋亡,该过程可能和Caspase的活化相关。 展开更多
关键词 免疫调节肽 cdna芯片 BAX BCL-XL Caspase-3
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应用cDNA芯片分析79个新基因的人胚组织表达谱 被引量：4
16
作者 马淑华 王敦成 +2 位作者 邹宗亮 沈倍奋 王升启 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第4期532-536,共5页
大规模cDNA测序和生物信息学技术相结合 ,得到来自于商品化的人胚肾cDNA文库 79个代表新基因的表达序列标签 (EST) .随后 ,采用高速度机械手制备这些cDNA的基因芯片 ,用于鉴定 79个新基因的ESTs在2 0周、 2 6周两个胚胎时期 6种组织中... 大规模cDNA测序和生物信息学技术相结合 ,得到来自于商品化的人胚肾cDNA文库 79个代表新基因的表达序列标签 (EST) .随后 ,采用高速度机械手制备这些cDNA的基因芯片 ,用于鉴定 79个新基因的ESTs在2 0周、 2 6周两个胚胎时期 6种组织中的基因表达状况 ,以研究这些EST片段代表的新基因功能提供线索 .通过芯片杂交及结果分析 ,得到同一个组织两个不同时相 8个差异表达的基因 。 展开更多
关键词 cdna芯片 新基因 表达序列标签 差异表达RNA分析 人胚组织表达谱
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cDNA芯片技术杂交效率的优化 被引量：2
17
作者 马淑华 王升启 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期153-157,共5页
目的　cDNA芯片杂交影响因素很多 ,如固定于玻片的DNA片段的浓度、溶解DNA片段的点样液、荧光探针浓度及纯度杂交液、杂交温度、杂交时间和Cy3与Cy5荧光素标记探针等 ,本实验针对其中重要影响因素进行优化筛选 ,以提高杂交效率。方法　... 目的　cDNA芯片杂交影响因素很多 ,如固定于玻片的DNA片段的浓度、溶解DNA片段的点样液、荧光探针浓度及纯度杂交液、杂交温度、杂交时间和Cy3与Cy5荧光素标记探针等 ,本实验针对其中重要影响因素进行优化筛选 ,以提高杂交效率。方法　通过逐一改变cDNA杂交技术重要影响因素的实验条件 ,平行设置多组实验 ,从中筛选出最佳实验数据。结果与结论　重复实验结果表明 ,杂交效率较高的条件为 :浓度约为 0 5 0 μg·μL- 1 DNA片段 ,溶于 1×MicroSpottingSolution(ArrayItTM)中 ,与纯化后的荧光标记在 0 5 %SDS 10×SSC甲酰胺杂交液 ,在 4 展开更多
关键词 cdna芯片 杂交效率 基因表达分析 生化标本 检测
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cDNA芯片表面核酸固定化的优化 被引量：4
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作者 马淑华 王升启 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2002年第1期154-158,共5页
cDNA芯片技术表面核酸固定化影响因素众多 ,其中涉及选择载体、固定于玻片的DNA片段浓度、玻片DNA片段的固定方法、玻片预处理方法、DNA片段的变性、溶解DNA片段的点样液等等 .针对这些因素进行了优化筛选实验 ,以便于提高cDNA芯片技术... cDNA芯片技术表面核酸固定化影响因素众多 ,其中涉及选择载体、固定于玻片的DNA片段浓度、玻片DNA片段的固定方法、玻片预处理方法、DNA片段的变性、溶解DNA片段的点样液等等 .针对这些因素进行了优化筛选实验 ,以便于提高cDNA芯片技术检测基因表达的效率 . 展开更多
关键词 cdna芯片核酸固定化 玻片 优化
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铜绿假单胞杆菌QS相关基因差异表达的研究 被引量：3
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作者 童一民 潘欣 +1 位作者 荣光华 戚中田 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期27-33,共7页
选取100个与铜绿假单胞杆菌(Pseudomonasaeruginosa)群感效应(quorum-sens-ing,QS)相关的基因,克隆这些基因片段于pMD-18T载体,测序鉴定,点样制备cDNA基因芯片。制备cy3-dCTP/cy5-dCTP标记的探针,与芯片杂交。初步研究了处于不同生长期... 选取100个与铜绿假单胞杆菌(Pseudomonasaeruginosa)群感效应(quorum-sens-ing,QS)相关的基因,克隆这些基因片段于pMD-18T载体,测序鉴定,点样制备cDNA基因芯片。制备cy3-dCTP/cy5-dCTP标记的探针,与芯片杂交。初步研究了处于不同生长期的铜绿假单胞杆菌基因的表达差异。指数中期和平台初期相比,有9个QS基因表达量显著增加,有6个基因表达量显著下降。利用芯片做针对铜绿菌假单胞杆菌药物的筛选妥布霉素(Tobramycin)给药后细菌基因发生差异表达。证明了该cDNA芯片用于药物筛选的可行性。在国内首次研制开发了QS相关基因的cDNA芯片。应用基因芯片技术建立的铜绿假单胞杆菌QS相关基因研究平台,为找到能较好抑制铜绿假单胞杆菌正常生长的药物研究提出新的解决方法。 展开更多
关键词 铜绿假单胞菌 群感效益 基因 cdna芯片 差异表达
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5个不同肺癌细胞株的基因差异表达谱 被引量：4
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作者 陈耀勇 李冰 +2 位作者 宋春林 付欣 邹东霆 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 2002年第24期14-17,共4页
目的 :希望获得细胞间基因表达的异同 ,对癌细胞的形成和发展中基因参与提供分析线索。方法 :选用 5个不同转移潜能及来源的体外培养肺癌细胞株H12 99,HLAMP ,PAa ,PGCL3和NiS作为研究对象 ,以永生化的支气管上皮细胞 16HBE为对照 ,采... 目的 :希望获得细胞间基因表达的异同 ,对癌细胞的形成和发展中基因参与提供分析线索。方法 :选用 5个不同转移潜能及来源的体外培养肺癌细胞株H12 99,HLAMP ,PAa ,PGCL3和NiS作为研究对象 ,以永生化的支气管上皮细胞 16HBE为对照 ,采用含有 80 0个基因探针的肺癌相关基因芯片LUs,研究了基因表达的差异。结果 :5个肺癌细胞株差异表达的基因共有 35 5个 ,但共同上调或下调的基因仅有 4个 ,基因表达的变化在不同细胞株之间明显表现出多态性。比较三个高转移细胞株和两个低转移细胞株 ,有 12个基因表达改变出现在高转移细胞株而在低转移株未见明显变化 ,其中有 3个已报道的转移相关基因和 9个未报道和转移相关的基因 ,这些基因大多是膜蛋白、细胞骨架蛋白或 /和细胞信号转导有关 ,基因功能复习提示和肿瘤转移有可能的关联性。结论 :cDNA芯片对于肺癌相关基因的筛选是一个非常有效的研究手段 ;对于临床诊断应用 ,需要在大规模数据收集的基础上建立必要的模式 ,通过多基因系统分析 ,才能获得有效的应用。 展开更多
关键词 肺癌细胞株 基因差异表达谱 cdna芯片 基因表达
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